单亲鉴定案例STR选择探讨和PI值计算方法评价

作者对STR位点的个体识别能力(DP)、杂合度(H)、非父排除率(PE)、多态信息含量(PIC)等进行统计学分析,探寻了适合中国人群单亲子鉴定、且有利于国内外DNA实验室数据交流的STR位点,并对现行的PI值计算方法进行了评价。

单亲鉴定的风险与应对

目的分析单亲鉴定的风险并提出应对策略。方法首先使用无关个体对和近亲对的STR分型模拟单亲鉴定,分析存在的风险;然后计算代表性商品化试剂盒的单亲累积排除概率,度量风险大小;最后提出风险应对策略。结果单亲鉴定存在无关个体和近亲被错判为生父或生母的风险。使用含20~29个常染色体STR基因座的单个检测系统进行单亲鉴定易出现近亲错判。选择性加做基因座和比较近亲关系指数与亲权指数有助于识别近亲冒充,降低错判风险。结论为应对单亲鉴定的错判风险,建议根据鉴定情形检验合适类型和数量的遗传标记,同时比较近亲关系指数与亲权指数,并在鉴定意见中注明近亲干扰风险。

STR-typer 10G/F试剂在单亲鉴定中的应用

目的观察和分析STR-typer 10G/F试剂盒在单亲鉴定中的作用。方法随机抽样湖北地区汉族个体206人静脉血样,Chelex-100法提取基因组DNA。采用STR-typer 10G/F试剂盒进行复合扩增,分型并计数基因型并计算基因频率、基因座杂合度(H)、标准三联体非父排除率(PE3)和二联体非父排除率(PE2)。结果 9个STR基因座等位基因数9～14个,基因型分布观察值与Hardy-Weinberg平衡理论值的差异均无显著性(P>0.05),杂合度在0.75以上,平均非父排除率0.57～0.75;STR-typer 10G/F试剂盒累积非父排除率(PE3)0.999 973,合并使用Identifiler Plus系统,累积非父排除率可达0.999 999 967 6。结论 STR-typer 10G/F系统多态性程度基本接近Identifiler Plus系统,在单亲鉴定时,可作为Identifiler试剂盒的有效补充。

Identifiler^TM系统在单亲血缘关系鉴定中的突变观察与分析

微卫星（STR）基因座是一类广泛存在于真核生物基因组的短串联重复序列，因其高度多态性和在遗传过程中遵循孟德尔遗传定律等特点，现在被广泛用于个体识别及血缘关系鉴定中。根据孟德尔遗传定律，子代的遗传基因一半来自母亲，一半来自父亲，在进行父、母、子女三联体鉴定中，可存在子女与父母之间的基因差异．表明可能存在突变。在此对单亲血缘关系鉴定的890案例分析，15例有一个STR基因座不符合遗传规律，增加母亲进行检测，以期了解点突变对血缘鉴定结果的影响。

X-染色体STR联合常染色体STR用于判定近亲间的亲子鉴定1例

作为一种优秀的遗传标记因子,短串联重复序列(STR)因丰富的长度多态性被广泛地应用于个体识别和亲子鉴定。在过去的20年里,许多商业化的STRs试剂盒被开发出来用于法医DNA鉴定,扩充标记位点为发展的趋势之一,更多的位点意味着更大的识别能力。现行的《亲权鉴定技术规范》中鉴定意见是以不考虑双胞胎和近亲为前提[1],然而,亲子鉴定中难免会遇到近亲之间的鉴定[2],以及父亲或者母亲一方缺失的案例,增加性染色体的鉴定将会有助于增加证据强度[3-4]。

Identifiler体系在276例单亲亲权鉴定中的应用分析

目的探讨Identifiler体系在单亲亲权鉴定案例中的应用价值。方法采用荧光标记STR-PCR复合扩增、毛细管电泳基因分型技术,应用3100 Avant遗传分析仪对276例单亲亲权鉴定的个体进行15个短串联重复串联序列(STR)基因座的基因分型。结果在276例的单亲亲权鉴定中,认定亲权关系199例,占72.10%,其中亲权指数(CPI)≥2 000,父权相对机会(RCP)≥99.95%有183例,13例CPI<2 000,3例出现一个基因座单步突变;排除亲权关系77例,占27.90%,其中2例只出现1～2个不符合遗传规律基因座,通过加测母亲样本,排除指标均大于3个。结论应用Identifiler体系的15个STR基因座对常规单亲亲权案例能成功地开展鉴定分析工作,但当CPI<2 000或有1～2不符合遗传规律基因座时,须增加检测基因座和加测母亲样本,以提高亲权指数或增加排除指标,规避可能的错误鉴定结论。

微卫星DNA标记在蓝狐单亲亲权鉴定中的应用

主要探讨微卫星DNA标记在蓝狐（Alopex lagopus）单亲亲权鉴定中的可行性,为蓝狐育种的系谱精确鉴定提供依据。选择15个多态信息含量较高的微卫星DNA位点,以6窝蓝狐（母本6只,子代61只）为试验材料,计算15个基因座位的等位基因频率、杂合度（H）、多态信息含量（PIC）、非父排除概率（EP）、累积非亲排除概率（CCE）、亲权指数（PI）和亲权相对机会（RCP）。结果表明：15个微卫星位点的累积非亲排除概率值（CCE）为0.999996。单亲鉴定的PI值为850.5213966160,RCP为99.8826%99.9999%。说明所选的15个微卫星位点可用于蓝狐单亲亲权鉴定,其判定成功率和准确率较高,结果可靠。

单亲亲子鉴定的分析研究

目的从理论和实际应用方面客观评价13～15个STR位点应用于单亲亲子鉴定的准确性。方法依据中国人群基因频率资料,计算单亲亲子鉴定的非父排除率及单亲亲子鉴定的亲子关系概率,并选择有明确排除结论的104例排除案例,分析统计其中父-子二联体出现的排除指标数。结果对于单亲亲子鉴定,选用13～15个STR位点,联合非父排除率为0.9805～0.9906;亲子关系概率均大于99.73%。104例二联体排除案例中,有3例的排除指标数小于2,未发现排除指标为零的现象。结论若应用ProfilerPlus和CofilerPlus试剂盒的13个STR位点进行日常单亲亲子鉴定工作,存在微弱漏判非父的风险,必要时增加检测指标数。不排除案例的单亲亲子鉴定,其亲子概率均可达国际认定标准。

2种体系在单亲亲权鉴定中的应用分析

目的分析比较Identifiler与Sinofiler 2种体系在单亲亲权鉴定中的应用价值。方法 Chelex-100法提取全血基因组,采用Identifiler和Sinofiler 2种体系对15个STR基因座进行检测,判定基因型,计算其父权指数(PI)值与累计父权指数(CPI)值,根据亲子鉴定判断标准判定结果。结果 Identifiler体系检测126例单亲亲权鉴定案例,其中75例CPI≥10 000,30例CPI<10 000,2例出现单基因座突变;19例排除亲权关系,排除位点均≥4;Sinofiler体系共检测114例单亲亲权鉴定案例,其中82例CPI≥10 000,12例CPI<10 000,1例出现单基因座突变;19例排除亲权关系,2例排除位点为3个,17例排除位点≥4。结论 2种体系单独应用于单亲亲权鉴定均存在局限性。

祖孙双单亲鉴定的系统效能分析

目的推导祖孙双单亲排除率(PEGDS)公式,并以随机模拟法进行验证。方法本研究首先建立PEGDS的定义,并在此基础上自行推导PEGDS的数学公式,依据19个基因座上的数据计算PEGDS的公式值。其次以随机模拟法设计实验,计算19个基因座上计算PEGDS的模拟值。最后,以模拟值对比公式值的方式,对公式进行实验验证。结果推导出PEGDS公式,经模拟实验验证与之符合。AGCU EX20系统的祖孙双单亲累积排除率(CPEGDS)为1-3.10310×10-9。祖孙双单亲鉴定的系统效能近似等于三联体鉴定,远高于二联体鉴定。结论本文公式可应用于祖孙双单亲鉴定的系统效能计算。

单亲亲子鉴定及其法律问题思考——附275例单亲鉴定分析

目的 探讨单亲鉴定及其有关的法律及社会问题。 方法 对 1998年 1月至 2 0 0 2年 12月2 75例单亲鉴定进行回顾分析 ,对案例的数量、来源、鉴定事由、鉴定结论等作统计分析。 结果 单亲鉴定近3年明显增多 ,占亲子鉴定总数的三成。案例来源以自诉为主 ,占 95 .2 7%。鉴定事由中 ,怀疑妻子有婚外性关系为主 ,占 88.36 %。 2 75例单亲鉴定中 ,排除亲生关系 39例 ,占 14.18%。结果表明 ,非婚生子女只占少数。 结论 自诉单亲鉴定存在法律盲区 ,但在维护家庭稳定具有一定作用。受理单亲鉴定宜取慎重态度 ,有关的社会及法律问题需要解决。

Identifiler & STRtyper-10F/G系统在单亲亲子鉴定中的应用分析

目的应用AmpFISTR IdentifilerTM和STRtyper-10F/G PCR扩增试剂盒,检测195例亲子鉴定案例,分析2个系统在单亲亲子鉴定中的应用价值。方法采用Chelex-100法提取全血基因组DNA,通过IdentifilerTM和STRtyper荧光标记试剂盒对24个STR基因座进行检测,判定基因分型。结果 195例单亲亲子鉴定中,认定亲生血缘关系182例（93.33%）,累计PI值大于或等于10 000,RCP〉99.999 9%。排除亲生血缘关系13例（6.67%）,排除STR位点数5~16范围。在IdentifilerTM检测系统中,1个案例的vWA出现一步突变,1/182（0.55%）,其他基因座检测结果均符合遗传规律。结论应用Identifiler和STRtyper系统的24个STR基因座进行DNA亲权鉴定,能准确地提高亲子鉴定判断结果,有效力地避免错误判性发生。

应用STR基因座及mtDNA D-Loop区遗传标记联合进行中国德昌水牛单亲亲权鉴定

为了研究短串联重复序列(STR)基因座在亲权鉴定中的亲子关系相对概率及mtDNA D-Loop区遗传标记在单亲亲权鉴定中的应用,试验采用PCR技术扩增3头水牛BM2934、BM1862、ETH225、BM1818、INRA035、BM2113、CSRM60、TGLA227共8个STR基因座DNA,STR扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳检测并计算单亲亲权指数(PI)和亲子关系相对概率(RCP),同时扩增3头水牛mtDNA D-Loop区基因片段并进行测序分析。结果表明:2头嫌疑后代中c1与母水牛m亲子关系概率为99.960 6%,两者mtDNA D-Loop区基因序列一致率为100%;微卫星基因座与mtDNA D-Loop区遗传标记检测结果一致,嫌疑后代c1为母水牛m的后代。说明STR基因座与mtDNA D-Loop区遗传标记均可用于单亲亲权鉴定,两种方法相结合提高了亲权鉴定的稳定性、准确性、灵敏度,鉴定范围更广,样品要求更低。

家系基因型重建法在单亲祖孙关系鉴定中的应用研究

目的对有参考个体参与的单亲祖孙关系鉴定中家系基因型重建方法的应用及计算思路的选择进行探索研究。方法依据河北汉族人群38个常染色体短串联重复序列遗传学数据,用计算机模拟8000个祖孙家系,选择生母及不同数量父辈个体作为参考样本进行单亲祖孙关系鉴定,应用家系基因型重建法的三种不同计算思路:期望值法、最小概率值法及改良的最小概率值法计算祖孙关系指数(grandparent index, GI),通过诊断实验设定累积祖孙关系指数(combined grandparent index,CGI)界值,并用60例实际案例进行验证。结果父辈参考个体数目显著影响单亲祖孙关系的判定,随着参考个体数目的增加,判定的准确性增加。若以104、10-4作为认定与排除的界值,即使只有1个父辈参考个体,期望值法获得的判定准确度也在90%以上,2个父辈个体参与时准确度达99.8%,而最小概率值法的灵敏度较低,假阴性率较高,改良的最小概率值法介于二者之间。60例实际案例验证结果显示,以期望值法计算CGI值,除有一个单参考个体真家系不能判定外,其余家系均被准确认定或排除。结论在单亲祖孙关系鉴定中,生母及父辈个体参与鉴定时,应用家系基因型重建法可以有效利用更多被检个体的遗传信息,提高鉴定效力;在讨论的三种计算思路内,期望值法能更准确的估计亲缘关系成立的可能性,其效力和安全性均足以满足该类鉴定需求。

寻亲单亲亲子鉴定误判纠错1例

1案例1.1简要案情韦某(被检父),其子多年前被拐卖,后寻找到一男孩(为智力障碍患者),经委托某鉴定机构认定二人具有生物学亲子关系。但经过一段时间相处产生怀疑,故委托本鉴定中心对其进行重新鉴定;因韦某妻子多年前已失踪,无法获得孩子母亲的数据,故只能进行二联体亲子鉴定。

Identifiler体系在单亲血缘关系鉴定中应用价值的研究

目的 研究 16基因位点Identifiler体系在单亲血缘关系法医鉴定中的应用价值。 方法 对无关个体中随机抽样组成的假设父—子二联体 10 0例、正常人群中已知真父—子二联体 10 0例及已知非父—子二联体 10 0例、实际单亲血缘关系亲子鉴定案 2 2 8例、特意省去母亲的二联体鉴定案 136例 ,应用Identifiler体系的 16基因位点进行检测 ,得出每案例的RCP值 ,将检测结果同应用其他体系检测的结果比对 ,同三联体检测结果比对 ,同真实情况比对 ,计算出单独使用Identifiler体系在单亲血缘关系法医鉴定中的正确率。 结果 对 2 2 8例单亲鉴定案应用Identifiler体系检测的结果 ,同应用ProfilerPlus和Cofiler两个体系再加用 2 4个其他位点银染检测 (共 37个位点 )的结果完全相同 ;对无关个体 10 0例及真父—子二联体 10 0例及非父—子二联体 10 0例 ,用Identifiler体系检测的结果同调查核实的真实情况完全相符 ;对 136例特意省去母亲的二联体案 ,用Identifiler体系检测的结果同原实际检案中三联体检测的结果完全相同。 结论 单独使用Identifiler体系完全可以解决法医亲子鉴定中的单亲血缘关系鉴定问题。

随机模拟法进行单亲累积亲权指数分析

目的以随机模拟法进行大量单亲累积亲权指数(CPI)统计分析。方法针对Identifiler、PP18D、PP21、AGCU EX20、AGCU 21+1等5个试剂盒,使用自主研发软件,随机模拟100万组单亲组合并计算单亲PI,统计各试剂盒单亲极低CPI比率(R_(VLCPI))、各基因座的PI中位数(M_(PI))和39个基因座的平均单基因座单亲PI(PI_(solo)),并推导增加检测的基因座个数(N)的计算公式。结果 Identifiler、PP18D、AGCU EX20、PP21、AGCU EX20&AGCU 21+1的R_(VLCPI)分别为24.9%、6.5%、1.4%、0.7%、0.000 1%。在各试剂盒的基因座存在包含关系的前提下,R_(VLCPI)和常染色体基因座数成负相关。PI_(solo)为1.843 2。M_(PI)与PE_(duo)呈显著的正相关(r=0.956,P<0.001)。增加检测的基因座个数公式为N=「log_(1.843 2)(10 000/P)■。结论本文结果和公式对单亲鉴定案具有一定的应用价值。

亲子鉴定DNA检验结果分析1例

1案例资料 1.1简要案情2011年6月15日,本市警方发现1具高度腐败无名男性尸体,为确定尸源,提取该无名尸体肋软骨、张某（嫌疑为其子）及母亲血样进行亲缘鉴定。

SNP辅助判断3个STR基因座突变亲子鉴定案件1例

1案例1.1案情因户口申报需要,自称孩子父亲的男子(被检父)和孩子(男孩)要求做亲子鉴定,经询问孩子母亲已去世。采集二人指血备检。1.2检验过程1.2.1STR检验采用Chelex-100法提取DNA,先后采用HumDNA Typing试剂盒(深圳华大法医科技有限公司)、GoldenEye_22NC试剂盒(基点认知公司)、GlobalFiler试剂盒(美国AB公司)、GoldenEye_26Y试剂盒(基点认知公司)、HumDNA Typing(炎黄Y)试剂盒(深圳华大法医科技有限公司)进行STR检验。