单体型分析在肿瘤侯选基因研究中的应用

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)是第3代分子遗传标志,由其构成遗传组合称为单体型。它决定基因的功能单位和人群遗传变异的内在特征。单体型的存在可以极大地减少疾病关联研究的工作量,以单个SNP为中心进行复杂性状疾病的易感基因研究常欠说服力,而利用相邻的SNP信息关联构成的单体型分析就越来越受到欢迎。目前多应用统计学方法进行单体型构建,常用来推断单体型的软件较多,各有优缺点,研究者需结合课题选择最佳方法。单体型分析在肿瘤候选基因中的应用目前主要在肿瘤发病的相关性研究方面,随着研究的深入和技术的进步,单体型分析被越来越多地应用于肿瘤候选基因的筛选与鉴定。对侯选基因进行单体型分析可为疾病的诊断及个体化治疗提供新的手段,并可能发现新的预后预测指标。

DUSP10与SMAD7基因多态性与结直肠癌遗传易感性研究

目的探究DUSP10和SMAD7基因多态性与结直肠癌遗传易感性的相互关系。方法采取病例对照研究,以临床确诊结直肠癌患者276例作为病例样本,体健对照者385例作为对照样本,共661例外周血液样本,使用SequenomMassARRAY技术平台进行SNP分型。计算位点间的连锁程度是使用χ2检验与SNPStsts对数据进行统计及分析,而单体型的构建则应用SHEsis软件。结果基于χ2检验,在等位基因模型下,DUSP10rs908858位点、SMAD7rs1295692位点及rs11874392位点与结直肠癌的发生危险度明显相关,在进行遗传模型分析过程中,使用最佳模型-加性模型分析显示,DUSP10rs908858可减少结直肠癌的发病风险,而SMAD7rs11874392增高结直肠癌的发病风险;使用SHEsis软件分析发现,DUSP10基因上的9个SNP位点分别构成了2个单体域,在校正了年龄和性别后,分析发现DUSP10基因中的单体型"GTCAA"增加结直肠癌的患病风险。结论 DUSP10和SMAD7基因可能跟结直肠癌的发病风险有关。