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去甲肾上腺素转运体基因启动子多态性及单倍体型与高血压病血瘀证的相关性研究 被引量:6
1
作者 骆杰伟 陈慧 +3 位作者 吴小盈 陈宏毅 卢荔红 沈晓丽 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期458-462,共5页
目的探讨去甲肾上腺素转运体(SLC6A2)基因启动子2、3多态性及单倍体型与高血压病血瘀证的关系。方法收集高血压病血瘀证患者532例,高血压病非血瘀证患者298例,血压正常对照者512名,采外周静脉血提取DNA,采用PCR-RFLP法检测SLC6A2基因启... 目的探讨去甲肾上腺素转运体(SLC6A2)基因启动子2、3多态性及单倍体型与高血压病血瘀证的关系。方法收集高血压病血瘀证患者532例,高血压病非血瘀证患者298例,血压正常对照者512名,采外周静脉血提取DNA,采用PCR-RFLP法检测SLC6A2基因启动子2、3多态性,SHEsis软件构建单倍体数量。结果χ2分割显示高血压病血瘀证组的启动子2-GG频率低于非血瘀证组和对照组(P=0.001),重度血瘀组的启动子3-GG/GA频率高于其余组别(P<0.001)。Logistic回归分析显示,调整混杂因素后,启动子2-GC/CC型患高血压病血瘀证的相对危险度(OR)为1.535(95%CI:1.094~2.155,P=0.013);启动子3-AG/GG型患高血压病重度血瘀证的OR为1.925(95%CI:1.199~3.091,P=0.007);G-C单倍体(启动子3-2)患高血压病血瘀证的OR为2.127(95%CI:1.202~3.765,P=0.010),预测强度最大。结论携带SLC6A2基因启动子3-AG/GG型可能是高血压病重度血瘀证易患基因,启动子2-GC/GC、G-C单倍体可能是血瘀证易患因素之一。 展开更多
关键词 基因多态性 高血压病 血瘀证 去甲肾上腺素转运体 单倍体型
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LMP2/LMP7基因编码区多态性及单倍体型与胃癌易感无相关性 被引量:4
2
作者 曹邦伟 戴悦 +2 位作者 盖郁慧 柴庆波 汪欣 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2006年第36期3471-3476,共6页
目的:探讨中国汉族人群中肿瘤抗原递呈的限速基因LMP2/LMP7单核苷酸多态性与胃癌的遗传易感性关联.方法:提取145例胃癌患者及152例健康献血员外周血基因组DNA,用PCR-RFLP方法检测两组人群中LMP2-codon60/LMP7-codon145两个多态性位点的... 目的:探讨中国汉族人群中肿瘤抗原递呈的限速基因LMP2/LMP7单核苷酸多态性与胃癌的遗传易感性关联.方法:提取145例胃癌患者及152例健康献血员外周血基因组DNA,用PCR-RFLP方法检测两组人群中LMP2-codon60/LMP7-codon145两个多态性位点的基因型;并采用PHASE1.0软件构建这两个多态性位点的个体单倍体型,以非条件Logistic回归校正混杂因素,并进行多态性与胃癌患者风险关联的统计学分析.结果:PCR-RFLP检测结果显示:LMP2-codon60与LMP7-codon145处的多态性在中国人群中普遍存在,LMP2/LMP7多态性位点的各自的等位基因频率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律;最后的统计分析表明:在145例胃癌患者与152例健康对照人群中LMP2/LMP7两个多态性位点的基因型频率、以及所构建的4个单倍体型频率均没有统计学差异(P值均大于0.05).结论:在中国汉族人群中,LMP2/LMP7基因编码区两个位点的多态性以及单倍体型与胃癌易感无相关性. 展开更多
关键词 低分子量蛋白酶体 胃癌 单倍体型 易感
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中国人群中XRCC1基因单倍体型与结肠癌风险的相关性研究 被引量:6
3
作者 宋华宁 刘晓琳 +4 位作者 鄂云翔 李春慧 厚瑞萍 徐昌青 李岩 《齐齐哈尔医学院学报》 2008年第24期2957-2960,共4页
目的研究DNA修复基因XRCC1(X-ray repair cross-complementing group 1)编码区Arg194Trp及Arg399Gln多态位点所构成的单倍体型在中国汉族人群中的分布,并探讨与结肠癌发生的易感风险相关性。方法所有外周血样本DNA提取后,采用PCR-RFLP(... 目的研究DNA修复基因XRCC1(X-ray repair cross-complementing group 1)编码区Arg194Trp及Arg399Gln多态位点所构成的单倍体型在中国汉族人群中的分布,并探讨与结肠癌发生的易感风险相关性。方法所有外周血样本DNA提取后,采用PCR-RFLP(聚合酶链反应-限制性片段长度多态性)方法,检测207例中国汉族结肠癌患者与255例正常对照者XRCC1基因Arg194Trp及Arg399Gln的基因型,并利用PHASE1.0软件构建其单倍体型,以非条件Logistic回归校正混杂因素如性别、年龄、吸烟、饮酒等,进行单倍体型与结肠癌患者风险关联的统计学分析。结果PCR-RFLP检测结果显示XRCC1基因Arg194Trp与Arg399Gln多态性在本研究人群462例样本中均存在,XRCC1多态性位点的各自的等位基因频率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律;Trp-Gln单倍体型在本研究中结肠癌患者与健康正常人之间有显著的统计学差异:P<0.01;OR7.23,95%CI 3.52~18.25。结论在中国汉族人群中,XRCC1基因Trp-Gln单倍体型与结肠癌的发生有着显著的易感关联。 展开更多
关键词 XRCC1 结肠癌 单倍体型 易感性
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5-脂氧合酶激活蛋白(ALOX5 AP)基因单倍体型与心肌梗死易感性相关:人类基因组流行病学研究的荟萃分析 被引量:1
4
作者 吴艳 白永怿 +1 位作者 吴海英 惠汝太 《中国分子心脏病学杂志》 CAS 2009年第5期291-295,共5页
目的既往研究提示ALOX5AP基因变异与心肌梗死(Myocardial infarction,MI)相关,但这些研究大多样本较小,结论亦不一致。本文拟系统评价ALOX5AP基因变异与MI易感性的关系。对象与方法系统检索PubMed(1967.1~2009.5)、Embase(1967.1-2009... 目的既往研究提示ALOX5AP基因变异与心肌梗死(Myocardial infarction,MI)相关,但这些研究大多样本较小,结论亦不一致。本文拟系统评价ALOX5AP基因变异与MI易感性的关系。对象与方法系统检索PubMed(1967.1~2009.5)、Embase(1967.1-2009.5)数据库及维普(1989-2009)、CNKI(1979-2009)中文期刊数据库,并通过阅读相关综述及文章的参考文献进一步获取信息。对目前已发表的评估ALOX5AP基因变异与MI关系的候选基因关联研究进行荟萃分析。应用固定效应模型(Fixed-effect models)计算比值比(Odds ratio,OR)及其95%可信限(CI),用以描述ALOX5AP基因变异与MI的关系。结果共有5项探讨ALOX5AP基因HapA单倍体型(SG13S25G-SG13S114T-SG13S89G-SG13S32A)与MI关系的研究(合计MI病例2778人,对照2484人)及4项评估ALOX5AP基因HapB单倍体型(SG13S377A-SG13S1 14A-SG13S41A-SG13S35G)与MI关系的研究(合计MI病例1999人,对照1860人)纳入荟萃分析。5项关于HapA单倍体型的研究间无明显异质性(P=0.111,I^2=46.8%)。与非携带者相比,ALOX5AP基因HapA单倍体型携带者使MI的易感性增加24%(OR:1.24,95%可信限1.06-1.45,P=0.006)。4项关于HapB的研究亦无明显异质性(P=0.148,I^2=43.9%);与非携带者相比,ALOX5AP基因HapB单倍体型携带者使MI的易感性增加31%(OR:1.31,95%可信限1.01-1.70,P=0.04)。结论本研究提示ALOX5AP基因HapA、HapB单倍体型与MI的易感性增加有关。 展开更多
关键词 荟萃分析 5-脂氧合酶激活蛋白 单倍体型 心肌梗死
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基于半参数回归模型的多区域单倍体型与纵向性状关联分析
5
作者 胡艳玲 吴潇 +1 位作者 王起山 潘玉春 《上海交通大学学报(农业科学版)》 2010年第4期325-328,354,共5页
由于影响复杂性状的有些基因组单体型是有时间效应的,因此对复杂性状与基因组单体型的关联分析应该考虑时间效应。Zhang等提出的半参数模型不能直接应用于基因组单体型的分析。本文在Zhang等提出的分析纵向数据的半参数模型基础上,把模... 由于影响复杂性状的有些基因组单体型是有时间效应的,因此对复杂性状与基因组单体型的关联分析应该考虑时间效应。Zhang等提出的半参数模型不能直接应用于基因组单体型的分析。本文在Zhang等提出的分析纵向数据的半参数模型基础上,把模型的参数固定效应用来拟合单倍体型和其他固定协变量效应,时间效应通过二次可微函数来拟合,参数的估计按照Zhang等的方法,采用似然比检验来检验单倍体型效应。通过对我们升级的方法与一般的混合模型Haplo.stats和FAMHAP的htr模型进行模拟比较,证实对动态性状通过考虑多次采样数据的时间效应比对单次采样更能提高单倍体型效应的检出率。我们把这种半参数回归模型研究猪具有多胎的繁殖记录与MMP1和MMP10基因的单倍体型分析中。 展开更多
关键词 半参数回归模 多区域 单倍体型 纵向性状 关联分析
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入侵我国中南三省(区)草地贪夜蛾的单倍体型和群体遗传结构分析 被引量:13
6
作者 王佳丽 韦加奇 +2 位作者 孙志秀 徐汉虹 林菲 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期9-16,共8页
【目的】揭示入侵我国中南三省(区)的草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda种群间可能存在的遗传变异,探讨其入侵来源、入侵路线和扩散方式,为制定有效控制和阻击草地贪夜蛾的方案提供理论依据和遗传信息。【方法】利用分子标记技术从线粒体... 【目的】揭示入侵我国中南三省(区)的草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda种群间可能存在的遗传变异,探讨其入侵来源、入侵路线和扩散方式,为制定有效控制和阻击草地贪夜蛾的方案提供理论依据和遗传信息。【方法】利用分子标记技术从线粒体DNA和核DNA角度研究草地贪夜蛾种群的遗传多样性和种群结构。对采集自我国广东、广西和湖南3个省(区)的草地贪夜蛾,利用CO I和Tpi基因片段进行了单倍体型分析,利用9个微卫星标记分析种群间的遗传结构和遗传多样性。【结果】供试样品中,除了湖南张家界群体有2个样品为CO I玉米型单倍体型、1个样品为杂合型,其他群体的个体均为CO I水稻型单倍体型。基于SSR标记的群体遗传分析结果表明,被检测的群体遗传多样性较巴西等国家的美洲群体低,各群体遗传分化不明显。广东东莞群体与湖南张家界群体的遗传距离最近,与广西南宁群体的遗传距离较远。【结论】遗传距离与实际距离之间不一定呈正相关,通过遗传结构的分析有助于推测草地贪夜蛾扩散过程中,天气背景场、地理隔离和人为传播各自所起的作用。入侵湖南省张家界的草地贪夜蛾出现了低频率CO I玉米型和高频率的CO I水稻型单倍体型,说明虫源的非单一性;草地贪夜蛾在入侵地定殖时间较短,目前未形成明显的遗传分化。 展开更多
关键词 草地贪夜蛾 单倍体型 SSR标记 遗传多样性
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MHC单倍体型无特定病原体鸭的培育 被引量:2
7
作者 王兴童 孟兴 +2 位作者 佟相慧 陈洪岩 韩凌霞 《实验动物科学》 2018年第4期14-20,共7页
目的培育MHC单倍型无特定病原体单倍型鸭。方法以国家禽类实验动物种子中心培育并保存的无特定病原体(SPF)麻鸭为基础,根据位于主要组织相容性复合体(MHC)核心区域的鸭抗原处理相关转运体分子(TAP)双拷贝基因(Tap1和Tap2)的多态性,分别... 目的培育MHC单倍型无特定病原体单倍型鸭。方法以国家禽类实验动物种子中心培育并保存的无特定病原体(SPF)麻鸭为基础,根据位于主要组织相容性复合体(MHC)核心区域的鸭抗原处理相关转运体分子(TAP)双拷贝基因(Tap1和Tap2)的多态性,分别利用Tap1基因组短串联重复序列(STR)、TAP2的肽结合区序列以及Tap2全基因组序列的基因型分型,连续选育主要组织相容性复合体(MHC)单倍型SPF鸭。结果 F0代和F1代鸭的STR结果完全一致;F2和F3代鸭的Tap1和Tap2基因组序列完全纯合。连续6个世代的Tap2基因组序列分析,B3群鸭有2个位点发生突变,B1、B2和B4遗传学稳定。结论成功建立了4个MHC单倍体型SPF鸭群B1、B2、B3和B4,为深入开展鸭的免疫遗传学研究提供了实验动物支撑条件。 展开更多
关键词 主要组织相容性复合体 无特定病原体 单倍体型 抗原处理相关转运体
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MBL基因不同单倍体型启动活性的差异研究 被引量:2
8
作者 刘玮 张芳 +5 位作者 吴晓明 赵秋敏 张泮河 杨红 朱旭东 曹务春 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第12期969-969,共1页
关键词 MBL基因 单倍体型 甘露糖结合凝集素 感染性疾病 活性 启动 CA^2+ 免疫系统 依赖
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线粒体基因组单倍体型与药物性聋相关突变 被引量:2
9
作者 李琦 戴朴 黄德亮 《中华耳鼻咽喉头颈外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期474-476,共3页
人类线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)是独立于细胞核染色体外的基因组,存在大量的多态性位点,位于mtDNA复制控制区的D—loop序列因不编码蛋白,进化过程中选择压力相对较小,因而具有较其他区域更高的变异,有利于对亲缘关系... 人类线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)是独立于细胞核染色体外的基因组,存在大量的多态性位点,位于mtDNA复制控制区的D—loop序列因不编码蛋白,进化过程中选择压力相对较小,因而具有较其他区域更高的变异,有利于对亲缘关系较近的群体进行研究。mtDNA为严格的母系遗传,通过对mtDNA差异的分析可以重现人群的母系进化史。mtDNA的突变率较高, 展开更多
关键词 线粒体基因组 突变率 药物性聋 单倍体型 mtDNA DNA复制 母系遗传 人类线粒体
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APOA5及FADS1基因多态性以及单倍体型与血脂水平的关系 被引量:2
10
作者 狄春红 谭晓华 +3 位作者 王小波 吴茵茵 兰满 杨磊 《浙江预防医学》 2015年第11期1097-1102,共6页
目的分析载脂蛋白5(APOA5)基因的rs662799和rs964184位点,脂肪酸去饱和酶1(FADS1)基因的rs174547和rs174537位点在中国汉族人群中的分布频率及其对血脂水平和血脂异常发病风险的影响,并分析该4个位点构成的单倍体型与血脂异常发病... 目的分析载脂蛋白5(APOA5)基因的rs662799和rs964184位点,脂肪酸去饱和酶1(FADS1)基因的rs174547和rs174537位点在中国汉族人群中的分布频率及其对血脂水平和血脂异常发病风险的影响,并分析该4个位点构成的单倍体型与血脂异常发病风险相关性.方法收集汉族人群标本1275人.采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)检测该4个位点基因型.采用单因素方差分析比较各位点不同基因型血脂指标差异,二分类Logistic回归比较各型血脂异常发病风险的大小.采用基于R软件运行的Haplo-stats1.4.3.软件分析APOA5和FADS1基因单倍体型及其对血脂异常发病的相对危险度.结果rs662799的AG和GG基因型与AA基因型相比,rs964184的CG和GG相对于CC基因型的HDL-C水平明显降低.rs174547CC基因型相对于TC和TT基因型的HDL-C水平均明显降低,且rs174547CC基因型与低HDL-C血症的发生存在统计关联.rs662799GG基因型及rs964184GG基因型与高TG血症、混合型高脂血症和低HDL-C血症发生存在统计关联;rs662799AG基因型明显增加高TG血症的发生.与rs174547- rs174537-rs662799- rs964184位点TGAC单倍体型相比,TGGG单倍体型与高TG血症发生存在统计关联(OR=1.770,95%CI:1.033~3.035),CTGG单倍体型与混合型高脂血症(OR=2.239,95%CI:1.055~4.752)和低HDL血症(OR=1.823,95%CI:1.058~3.142)发生存在统计关联,CGAC单倍体型与低HDL血症发生存在统计关联(OR=1.702,95%CI:1.125~2.573).结论FADS1基因的rs174547与APOA5基因的rs662799和rs964184以及这两个基因多态性的单倍体型对中国汉族人群血脂水平均有显著影响. 展开更多
关键词 APOA5 FADS1 单倍体型 血脂水平 血脂异常
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江苏骨髓分库汉族造血干细胞捐献志愿者HLA-A、B、DRB1基因多态性和单倍型研究 被引量:16
11
作者 李维 唐荣才 +8 位作者 余梅贵 潘芹芹 缪扣荣 薛敏 赵星 樊甦 王晓艳 周小玉 汪承亚 《中国输血杂志》 CAS CSCD 2007年第4期276-281,共6页
目的分析中国造血干细胞捐献者资料库(简称江苏分库)汉族人群中HLA-A,B,DRB1基因多态性和单倍型的分布特征。方法用PCR-SSP和PCR-SSOP基因分型技术对江苏分库20 248名无关志愿者作HLA-A、B、DRB1低分辨基因分型,以直接计数法计算等位基... 目的分析中国造血干细胞捐献者资料库(简称江苏分库)汉族人群中HLA-A,B,DRB1基因多态性和单倍型的分布特征。方法用PCR-SSP和PCR-SSOP基因分型技术对江苏分库20 248名无关志愿者作HLA-A、B、DRB1低分辨基因分型,以直接计数法计算等位基因频率,应用Arlequin 3.01软件以最大似然法分析单倍型频率。结果江苏分库汉族志愿者HLA抗原频率分布符合Hardy-Weinberg平衡;共检出HLA-A位点等位基因18个,B位点等位基因34个,DRB1位点等位基因13个;A位点频率最高的是A*02(29.6%),B位点频率最高的是B*15(14.4%),DRB1位点频率最高的是DRB1*09(16.2%);频率最高的HLA-A,-B,-DRB1单倍型是A*30-B*13-DRB1*07(6.92%),频率最高的HLA-A、B单倍型是A*30-B*13(8.04%),频率最高的HLA-B,DRB1单倍型是B*13-DRB1*07(8.07%),频率最高的HLA-A、DRB1单倍型是A*02-DRB1*09(7.70%)。结论对江苏分库汉族人群HLA的分布状况的了解,有助于指导临床寻找HLA匹配的无关骨髓供者,为HLA与疾病相关研究和我国人群群体遗传学研究等提供了有意义的基础性资料。 展开更多
关键词 HLA 等位基因 单倍体型 基因频率 基因多态性 江苏分库 CMDP 汉族志愿者
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LMP2/LMP7基因单倍型与肠道结核感染易感的相关性研究 被引量:1
12
作者 张莹 孙秀静 徐有青 《山东医药》 CAS 2012年第48期29-31,34,共4页
目的探讨中国汉族人群中抗原递呈基因LMP2/LMP7单倍体型与肠道结核感染的遗传易感性关联。方法提取189例肠道结核感染患者及221例健康志愿者外周全血基因组DNA,采用PCR-RFLP的方法检测两组人群中LMP2-60/LMP7-145位于基因编码区的两个... 目的探讨中国汉族人群中抗原递呈基因LMP2/LMP7单倍体型与肠道结核感染的遗传易感性关联。方法提取189例肠道结核感染患者及221例健康志愿者外周全血基因组DNA,采用PCR-RFLP的方法检测两组人群中LMP2-60/LMP7-145位于基因编码区的两个多态性位点基因型;利用PHASE1.0软件构建两个多态性位点的个体单倍体型,以非条件Logistic回归校正混杂因素,并进行单倍体型与肠道结核感染易感风险关联的统计学分析。结果 LMP2-60/LMP7-145多态性在中国人群中均存在,LMP2/LMP7多态性位点各自的等位基因频率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律;肠道结核感染患者与健康对照人群中LMP2/LMP7两个多态性位点的基因型频率没有统计学差异(P>0.05);经校正混杂因素后,Logistic回归分析结果显示两个位点所构建的单倍体型LMP2(Cys)-LMP7(Lys)在两组间具有统计学差异(P=0.001、OR=4.02、95%CI 2.48~9.62)。结论在中国汉族人群中,LMP2/LMP7基因编码区两个多态位点的单倍体型与肠道结核的感染有着较强的遗传易感关联。 展开更多
关键词 低分子量蛋白酶体 肠道结核感染 单倍体型 易感
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1例8个月胎儿HLA-A,-B位点分型成功的报告
13
作者 伍新尧 蔡锐波 郭景元 《刑事技术》 1984年第1期25-27,共3页
HLA(Human Lenkocyte Antigens,人类白细胞抗原)是人类各种遗传标记系统中最复杂的一种。HLA在人出生时已发育成熟。按目前所发现的抗原计算,HLA-A,-B的单倍体型有255种,基因型可能有65,052种;如果把-A,-B-C,-DR位点都算进去,则可能有1,... HLA(Human Lenkocyte Antigens,人类白细胞抗原)是人类各种遗传标记系统中最复杂的一种。HLA在人出生时已发育成熟。按目前所发现的抗原计算,HLA-A,-B的单倍体型有255种,基因型可能有65,052种;如果把-A,-B-C,-DR位点都算进去,则可能有1,105,650种基因型。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 HLA-A 单倍体型 表现 遗传标记 结果 亲权鉴定 重复检查 中心血站 免疫室
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不同剂量ATG对haplo-HSCT治疗儿童重型地中海贫血血清免疫球蛋白水平的影响
14
作者 阳睿 彭珍 +2 位作者 蔡清明 陈郴 黄建勤 《湘南学院学报(医学版)》 2022年第4期39-42,共4页
目的 探讨不同剂量抗胸腺细胞球蛋白(ATG)对单倍体型造血干细胞移植(haplo-HSCT)治疗儿童重型地中海贫血血清免疫球蛋白水平的影响。方法 选取郴州市第一人民医院儿童医院于2020年6月—2022年6月收治的重型地中海贫血儿童40例作为研究对... 目的 探讨不同剂量抗胸腺细胞球蛋白(ATG)对单倍体型造血干细胞移植(haplo-HSCT)治疗儿童重型地中海贫血血清免疫球蛋白水平的影响。方法 选取郴州市第一人民医院儿童医院于2020年6月—2022年6月收治的重型地中海贫血儿童40例作为研究对象,根据HSCT预处理应用ATG剂量的不同分为,低剂量组(ATG总剂量≤6 mg/kg)和高剂量组(ATG>6 mg/kg)。比较两组感染发生率、移植物抗宿主病(GVHD)发生率、复发发生率、总生存率;比较移植前及移植后1个月(M1)、3个月(M3)、6个月(M6)、12个月(M12)两组血清免疫球蛋白Ig A、Ig G、Ig M水平差异。结果 低剂量组感染发生率、GVHD发生率以及复发发生率均显著低于高剂量组(P<0.05),且低剂量组的总生存率高于高剂量组(P<0.05);移植后免疫球蛋白Ig A、Ig G、Ig M水平:移植后1个月<移植后3个月<移植后6个月<移植后12个月<移植前,M1、M3时期低剂量组的Ig A、Ig G、Ig M水平高于高剂量组(P<0.05);M6时期低剂量组的Ig A、Ig G水平显著高于高剂量组(P<0.05)。结论 低剂量ATG能够缓解血清免疫球蛋白水平的下降速度,且安全性较高,复发性低,能够为临床使用剂量提供参考价值。 展开更多
关键词 单倍体型造血干细胞移植 ATG 儿童重地中海贫血 血清免疫球蛋白
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广西壮族人群HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1高分辨等位基因多态性和单倍型的研究 被引量:6
15
作者 裴永峰 余梅 +2 位作者 黄惠妮 陈洁润 李恒聪 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期1397-1405,共9页
目的:分析广西壮族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1等位基因和单倍型的特点。方法:采用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT),对广... 目的:分析广西壮族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1等位基因和单倍型的特点。方法:采用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT),对广西地区350名壮族非亲缘个体进行HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1测序分析,使用Arlequin软件(3.5.2.2)计算HLA等位基因频率、单倍型频率,使用MEGA v6.0软件构建系统发生树和用SPSS软件做主成分分析。结果:该人群5个位点,只有HLA-A和DRB1位点的等位基因分布偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。总共检出19种HLA-A等位基因,42种HLA-B等位基因,22种HLA-C等位基因,25种HLA-DRB1等位基因和15种HLA-DQB1等位基因。等位基因频率最高的分别是A*11:01(28.57%)、B*46:01(14.00%)、C*01:02(18.43%)、DRB1*16:02(15.71%)和DQB1*05:02(35.00%),最常见的5位点单倍型是A*33:03-C*03:02-B*58:01-DRB1*03:01-DQB1*02:01(6.86%),系统发生树结果表明该人群与南方汉族人群亲缘关系较近。结论:广西壮族人群HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1等位基因和单倍型有较高的遗传多态性。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 基因频率 单倍体型 广西壮族 多态性
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广西汉族人群HLA-A、-B、-DRB1高分辨等位基因和单倍型多态性的初步分析 被引量:5
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作者 裴永峰 黄惠妮 +2 位作者 李恒聪 陈洁润 吴国光 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期645-654,共10页
目的分析广西汉族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、-B、-DRB1等位基因和单倍型的分布特征。方法采用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)对广西地区1 64... 目的分析广西汉族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、-B、-DRB1等位基因和单倍型的分布特征。方法采用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)对广西地区1 644名汉族无关个体进行HLA-A、-B、-DRB1等位基因和单倍型多态性的分型,使用Arlequin软件(3.5.2.2)计算HLA等位基因频率、单倍型频率和连锁不平衡参数。使用MEGA v6.0软件构建系统发生树,并与其他部分中国汉族人群的基因频率进行比较。结果该人群HLA-A、-B、-DRB1等位基因分布均偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),3个位点分别检出37种HLA-A,70种HLA-B和37种HLA-DRB1等位基因。其中,等位基因频率分布最高的分别是A~*11∶01(28.86%)、B~*46∶01(14.26%)和DRB1~*15∶01(13.32%),最常见的单倍型是A~*33:03-B~*58∶01-DRB1~*03∶01(6.12%),A~*02∶07-B~*46∶01、A~*11∶01-DRB1~*15∶01和B~*58∶01-DRB1~*03∶01呈现最强的连锁不平衡。该人群与广西壮族人群亲缘关系最近,其多态性最接近的汉族是中国南方汉族。结论广西汉族人群HLA-A、-B、-DRB1等位基因和单倍型有较高的遗传多态性,将为中国人群在临床寻找HLA匹配的无关亲缘供者、法医学研究以及人类学研究等提供有价值的遗传学依据。 展开更多
关键词 基因频率 广西汉族 单倍体型 人类白细胞抗原 多态性
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Leber遗传性视神经病中突变类型对临床表达的影响
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作者 Spruijt L. Kolbach D.N. +1 位作者 De Coo R.F. 王大江 《世界核心医学期刊文摘(眼科学分册)》 2006年第8期27-28,共2页
PURPOSE: The aim of this research was to determine the molecular factors of influence on the clinical expression of Leber hereditary optic neuropathy (LHON), which might aid in counseling LHON patients and families. T... PURPOSE: The aim of this research was to determine the molecular factors of influence on the clinical expression of Leber hereditary optic neuropathy (LHON), which might aid in counseling LHON patients and families. The prevalence of LHON in the Dutch population was determined. DESIGN: Observational, retrospective population cohort study. METHODS: The clinical characteristics of LHON patients of 25 families, previously described in 1963, were reevaluated. The mutation and haplotype were determined in the DNA of one affected LHON patient per family. The genotype of their relatives could be deducted, enabling us to evaluate retrospectively the genotype-phenotype correlation. The prevalence of LHON was determined on the basis of anamnestic evaluation of patients in 1963 and by using population registers of that period. RESULTS: The LHON mutation does not influence disease penetrance (50% in male subjects; 10% to 20% in female subjects). More than half of the patients with the 14484 mutation exhibit a partial recovery of vision, regardless of the acuteness of disease onset (P=.001), whereas only 22% of the 11778 carriers and 15.4% of the 3460 carriers recovered. The recovery did not take place within the first year after onset and was uncommon after four years. The onset of LHON is in general very acute but might be more gradual in 11778 carriers and in children. The calculated prevalence of LHON in the Dutch population (1/39,000) is very likely an underestimation caused by a selection bias of familial cases in the original study. CONCLUSIONS: The LHON genotype influences the recovery of vision and disease onset but is unrelated to age, acuteness of onset, or gender. The genotype does not influence disease penetrance. Children might exhibit a slower onset of disease. 展开更多
关键词 遗传性视神经病 LEBER 突变类 外显率 基因突变 携带者 队列研究 单倍体型 疾病发作 观察性
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肿瘤坏死因子α的单核苷酸多态性与中国汉族人强直性脊柱炎的关联分析 被引量:16
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作者 陈蕊雯 段世伟 +7 位作者 蔡青 杨波 林懿 陈琦 冯国鄞 韩星海 贺林 孙树汉 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期120-124,共5页
目的 :在中国汉族强直性脊柱炎 (AS)患者中 ,检测 TNF- α基因中的单核苷酸多态性 (SNPs)。 方法 :在 1 0 7例 AS患者和 1 1 6名正常对照中 ,用直接测序法和实时动态荧光 PCR结合等位基因特异扩增 ,对 TNF- α基因中的 3个启动子上的 SN... 目的 :在中国汉族强直性脊柱炎 (AS)患者中 ,检测 TNF- α基因中的单核苷酸多态性 (SNPs)。 方法 :在 1 0 7例 AS患者和 1 1 6名正常对照中 ,用直接测序法和实时动态荧光 PCR结合等位基因特异扩增 ,对 TNF- α基因中的 3个启动子上的 SNPs(- 1 0 31 T/ C,- 86 3C/ A,- 85 7C/ T)和 2个内含子上的 SNPs(内含子 1的 +1 2 3C/ T和内含子 3的 +5 1 A/ G)进行基因分型 ,分析单个位点的等位基因和基因型频率是否与 AS相关。用单倍型推测软件计算上述位点单倍体型频率的分布 ,分析这些单倍体型是否与 AS的发病有关。 结果 :在 AS患者中 ,TNF- α的 - 85 7T和 - 86 3A的等位基因频率及它们的基因型频率显著性地超过健康对照组 ,经 Bonferroni校正后仍为阳性。对启动子上 3个 SNPs位点的两两和 3个位点组合的单倍体型频率分析表明 ,其在 AS患者和对照组中也均存在极其显著的差异 (P<0 .0 1 )。在 3个位点推测的单倍体型中 ,AS患者增加最显著的是TNF- 1 0 31 T/- 86 3C/- 857T单倍体型。 结论 :TNF-α基因上 2个 SNPs及单倍体型与中国汉族 展开更多
关键词 肿瘤坏死因子Α 单核苷酸多态性 中国 汉族人 强直性脊柱炎 基因 单倍体型
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PRDM16基因rs2651899、rs2236518、rs2282198位点多态性与超重肥胖的关系 被引量:7
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作者 詹芳芳 刘莉 +2 位作者 戚敏杰 卢明 平智广 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2015年第3期354-357,共4页
目的:研究PRDM16基因多态性及其单倍体型与超重肥胖发生风险的关系。方法:采用snapshot或连接酶检测技术检测275例超重肥胖者与253例正常体重者PRDM16基因rs2651899、rs2236518、rs2282198位点的基因型。利用SHEsis在线软件构建单倍... 目的:研究PRDM16基因多态性及其单倍体型与超重肥胖发生风险的关系。方法:采用snapshot或连接酶检测技术检测275例超重肥胖者与253例正常体重者PRDM16基因rs2651899、rs2236518、rs2282198位点的基因型。利用SHEsis在线软件构建单倍体型,分析其与超重肥胖的关系。结果:PRDM16基因rs2651899位点等位基因A在超重肥胖组和正常体重组的分布差异有统计学意义[OR(95%CI)=1.306(1.021~1.670),P=0.033]。单倍体型AAT、GAC、GCT在超重肥胖组和正常体重组的分布差异有统计学意义[AAT:OR(95%CI)=1.554(1.118—2.162),P=0.008;GAC:OR(95%CI)=0.623(0.394—0.984),P=0.041;GCT:OR(95%CI)=0.682(0.481—0.967),P=0.031]。结论:PRDM16基因rs2651899位点的等位基因A以及单倍体型AAT可能是超重肥胖发生的危险因素,单倍体型GAC、GCT可能是超重肥胖发生的保护因素。 展开更多
关键词 PRDM16基因 单核苷酸多态性 单倍体型 肥胖 超重
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ABCA1基因多态性与血浆载脂蛋白A1水平的关系 被引量:4
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作者 李亚 王玉明 +1 位作者 王丹 贺勇 《第四军医大学学报》 CAS 北大核心 2008年第11期1018-1020,共3页
目的:探讨汉族人群腺苷三磷酸结合盒转运体A1(ABCA1)基因单核苷酸多态性(SNP)与血浆载脂蛋白A1(apoA1)水平的关系.方法:选取ABCA1基因R219K,V825I,M883I和R1587K等4个编码区SNPs,采用PCR-限制性片断长度多态性分析技术确定376名健康个... 目的:探讨汉族人群腺苷三磷酸结合盒转运体A1(ABCA1)基因单核苷酸多态性(SNP)与血浆载脂蛋白A1(apoA1)水平的关系.方法:选取ABCA1基因R219K,V825I,M883I和R1587K等4个编码区SNPs,采用PCR-限制性片断长度多态性分析技术确定376名健康个体基因型;用THES-IAS程序分析SNPs的连锁不平衡关系及单倍型.结果:受检人群中,4种SNPs各自不同基因型个体间apoA1水平差异均未见统计学意义(P>0.05).R219K与M883I,V825I与M883I以及V825I与R1587K两两间存在连锁不平衡(P<0.01).以V825I和R1587K构建的两位点单倍型中,IK单倍型携带者apoA1水平较VR单倍型携带者显著降低(P<0.05).结论:ABCA1基因V825I和R1587K多态性与汉族人群血浆apoA1水平变化有关,但这种关联取决于该两个SNPs间形成的单倍型. 展开更多
关键词 ABCA1基因 载脂蛋白A1 单倍体型 连锁不平衡
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