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HLA-Ⅱ类基因单倍型与中国北方汉族人皮肌炎多发性肌炎的相关性研究 被引量:3
1
作者 韩秀萍 翟宁 +1 位作者 耿龙 宋芳吉 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第9期614-616,共3页
目的 :探讨HLA DRB1、DQB1基因单倍型与中国北方地区汉族人皮肌炎 多发性肌炎的相关性。方法 :采用聚合酶链反应 序列特异性引物 (PCR SSP)技术 ,检测中国北方汉族皮肌炎 多发性肌炎患者的HLA DRB1、DQB1等位基因。结果 :与 10 0例正... 目的 :探讨HLA DRB1、DQB1基因单倍型与中国北方地区汉族人皮肌炎 多发性肌炎的相关性。方法 :采用聚合酶链反应 序列特异性引物 (PCR SSP)技术 ,检测中国北方汉族皮肌炎 多发性肌炎患者的HLA DRB1、DQB1等位基因。结果 :与 10 0例正常对照组比较 ,在 5 2例皮肌炎 多发性肌炎患者中HLA DRB1 0 4 0x DQB1 0 30 1、DRB1 0 4 0x DQB1 0 4 0 1单倍型频率明显增高 ,经统计学检验两组差别有显著意义 ,P值分别为 0 0 30 7、0 0 0 33。HLA DRB1 15 0x DQB1 0 6 0 2单倍型频率明显降低 ,P值为 0 0 2 0 1。在 38例皮肌炎组中 ,HLA DRB1 0 4 0x DQB1 0 30 1、DRB1 0 4 0x DQB1 0 4 0 1、DRB1 0 70x DQB1 0 2 0 1、DRB1 12 0x DQB1 0 30 3单倍型频率明显增高 ,P值分别为 0 0 2 92、0 0 0 15、0 0 4 5 0、0 0 192 ,两组差别有统计学意义。在 14例多发性肌炎患者中HLA DRB1 0 70x DQB1 0 30 1单倍型频率明显增高 ,P值为 0 0 14 1。结论 :特异单倍型可能是决定皮肌炎 多发性肌炎发病及皮肌炎、多发性肌炎异质性的重要因素。 展开更多
关键词 皮肌炎 多发性肌炎 HLA-DRB1 DQB1基因 PCR-SSP
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β_2肾上腺能受体基因单倍型与心力衰竭的关系 被引量:2
2
作者 侯旭敏 方唯一 范维琥 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期153-156,共4页
目的研究β2肾上腺能受体(β2-adrenergic receptor,β2AR)基因单倍型与慢性心力衰竭的关系。方法选取南方汉族92例心衰患者和80名健康对照,进行外周静脉血的DNA抽提,通过聚合酶链反应扩增后,进行β2AR基因的测序,对所得出的单核苷酸多... 目的研究β2肾上腺能受体(β2-adrenergic receptor,β2AR)基因单倍型与慢性心力衰竭的关系。方法选取南方汉族92例心衰患者和80名健康对照,进行外周静脉血的DNA抽提,通过聚合酶链反应扩增后,进行β2AR基因的测序,对所得出的单核苷酸多态性位点进行单倍型分析。结果发现β2AR基因有4个单核苷酸多态性位点,分别为:16Arg/Gly2、7Gln/Glu、87Leu A/G、178Arg A/C;其中病例组中16G-27C-87G单倍型频率明显降低,两组间的差异有显著性(P<0.01);而其他的单倍型在两组间的差异无显著性(P>0.05)。结论南方汉族人群中β2AR基因多态性与心衰密切相关,其中16G-27C-87G单倍型可能为保护性连锁单倍型,是心衰的抗病单倍型。 展开更多
关键词 心力衰竭 β2肾上腺能受体 基因
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含易感基因的HLA单倍型与终末期肾功能衰竭易感性的关系 被引量:1
3
作者 韩志明 肖露露 于立新 《山东医药》 CAS 北大核心 2011年第18期21-22,共2页
目的探讨含易感基因的人类白细胞抗原(HLA)单倍型与终末期肾功能衰竭(ESRD)易感性的关系。方法应用人口遗传学软件Arlequin统计分析ESRD组和对照组HLA两个位点单倍型频率,通过χ2检验筛选两组具有统计学差异的单倍型,计算其优势比(OR)... 目的探讨含易感基因的人类白细胞抗原(HLA)单倍型与终末期肾功能衰竭(ESRD)易感性的关系。方法应用人口遗传学软件Arlequin统计分析ESRD组和对照组HLA两个位点单倍型频率,通过χ2检验筛选两组具有统计学差异的单倍型,计算其优势比(OR)。结果 ESRD组和对照组均表达出易感基因HLA-B*75-A位点单倍型5条、易感基因HLA-DR*04-B位点单倍型22条、易感基因HLA-DR*17-B位点单倍型16条;两组单倍型频率相比,ESRD组中频率显著升高(Pc<0.05)的单倍型是B*75-DR*04、B*13-DR*04、B*46-DR*04、B*58-DR*04。结论单倍型B*75-DR*04由独立易感基因B75、DR4组成,具有集合易感意义,可能为与ESRD易感关联的HLA单倍型。 展开更多
关键词 终末期肾功能衰竭 人类白细胞抗原 基因
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血管紧张素转换酶1基因单倍型与血浆酶活性及血压的关系 被引量:1
4
作者 孔祥东 杨宇霞 《陕西医学杂志》 CAS 北大核心 2005年第8期921-924,共4页
目的:探讨中国汉族群体血管紧张素转换酶1(ACE1)活性、ACE1基因连锁不平衡状态及与高血压间相互关系。方法:检测204例汉族个体ACE1基因4个常见多态位点的分布,估计基因连锁不平衡状态和单倍型结构,并检测血浆酶活性,同时对295例高血压... 目的:探讨中国汉族群体血管紧张素转换酶1(ACE1)活性、ACE1基因连锁不平衡状态及与高血压间相互关系。方法:检测204例汉族个体ACE1基因4个常见多态位点的分布,估计基因连锁不平衡状态和单倍型结构,并检测血浆酶活性,同时对295例高血压患者与198例血压正常人中进行关联分析。结果:ACE1基因多态间存在高度连锁不平衡(P<0.0001),4个多态存在于常见的7个单倍型中,最常见的单倍型为A(A-A-T-I)和B(C-T-C-D)。ACE1基因各位点多态性在个体中的分布与血浆中ACE1活性有关。单个位点除A-240T外,其余各位点均未见与高血压关联,单倍型D的频率在高血压患者中高于对照组。结论:本组研究群体中,T-240位点可能与高血压易感位点连锁不平衡。 展开更多
关键词 血管紧张素转换酶1 基因 血浆 酶活性 高血压
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中国北方地区汉族人皮肌炎/多发性肌炎与HLA-Ⅰ类基因单倍型的相关性研究
5
作者 韩秀萍 翟宁 +2 位作者 耿龙 潘静坤 宋芳吉 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期403-404,409,共3页
目的 :探讨HLA A、B基因单倍型与中国北方地区汉族人皮肌炎 多发性肌炎的相关性。方法 :采用聚合酶链反应 序列特异性引物 (PCR SSP)技术 ,检测中国北方汉族皮肌炎 多发性肌炎患者的HLA A、B等位基因。结果 :与 2 72例正常对照组比较 ,... 目的 :探讨HLA A、B基因单倍型与中国北方地区汉族人皮肌炎 多发性肌炎的相关性。方法 :采用聚合酶链反应 序列特异性引物 (PCR SSP)技术 ,检测中国北方汉族皮肌炎 多发性肌炎患者的HLA A、B等位基因。结果 :与 2 72例正常对照组比较 ,在 5 2例皮肌炎 多发性肌炎患者中HLA A2B5 1、A2B5 6、A32B1 3、A32B6 0单倍型频率明显增高 ,经统计学检验两组差别有显著意义 ,P值分别为 0 0 380、0 0 30 9、0 0 30 9和 0 0 2 5 3。在 38例皮肌炎组中 ,HLA A2B1 8、A2B5 1、A2B5 6、A31B1 3、A32B1 3和A2 6B1 3单倍型频率明显增高 ,且P值均小于 0 0 5 (0 0 4 0 6、0 0 336、0 0 1 4 4、0 0 4 0 6、0 0 1 4 1、0 0 4 0 6 ) ,两组差别有统计学意义。在 1 4例多发性肌炎患者中HLA A2 4B76、A32B6 0单倍型频率明显增高 ,P值均为 0 0 4 90。结论 :特异单倍型可能是决定皮肌炎 多发性肌炎发病及皮肌炎。 展开更多
关键词 皮肌炎 多发性肌炎 HLA-A、B基因 PCR-SSP
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DYS413基因座单倍型在山西汉族人群中的频率分布 被引量:1
6
作者 王永在 贠克明 +4 位作者 徐晓莉 张更谦 王艳 郭大玮 王英元 《中国法医学杂志》 CSCD 2003年第5期301-302,共2页
关键词 DYS413基因 山西 汉族人群 频率分布 法医物证学
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单倍型异基因造血干细胞移植治疗难治急性型成人T细胞白血病-淋巴瘤1例并文献复习
7
作者 朱佳琳 唐博 +5 位作者 尹玥 许蔚林 王倩 欧晋平 王文生 董玉君 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2022年第23期4294-4298,共5页
目的:探讨成人T细胞白血病-淋巴瘤(adult T cell leukemia-lymphoma,ATL)的临床特征及治疗。方法:回顾分析我院1例ATL的临床病理特征、治疗转归,并进行相关文献复习。结果:患者女性,44岁,祖籍福建,以皮疹、腹胀及水肿为首发表现,影像学... 目的:探讨成人T细胞白血病-淋巴瘤(adult T cell leukemia-lymphoma,ATL)的临床特征及治疗。方法:回顾分析我院1例ATL的临床病理特征、治疗转归,并进行相关文献复习。结果:患者女性,44岁,祖籍福建,以皮疹、腹胀及水肿为首发表现,影像学检查提示全身多发代谢增高肿大淋巴结、脾大,腋窝淋巴结、腹壁皮肤活检提示外周T细胞淋巴瘤;经预治疗及多次化疗后效果欠佳,行HTLV I-RNA检测为阳性,诊断ATL急性型明确,后选择其子作为供者行单倍型异基因造血干细胞移植,移植后随访15个月至2022年04月仍存活。结论:由于北方地区HTLV-1感染率较低,遇到化疗效果欠佳的外周T细胞淋巴瘤时需考虑到ATL可能,尽早行相关病毒学检测以尽快明确诊断。单倍型异基因造血干细胞移植可以为ATL患者改善长期预后带来希望。 展开更多
关键词 成人T细胞白血病-淋巴瘤 HTLV-1 基因造血干细胞移植
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马凡综合征FBN1基因单倍型连锁分析
8
作者 贾静 伍严安 +2 位作者 薛士杰 陈发林 陈同 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期255-258,共4页
目的 探讨FBN1基因微卫星检测对Marfan综合征 (MFS)症状前诊断的应用价值。方法 应用 15号染色体FBN1基因侧翼区的 4个微卫星为遗传标记 ,联合运用荧光标记引物的聚合酶链反应和毛细管电泳技术 ,对 4个MFS家系及 4 0名正常人进行单倍... 目的 探讨FBN1基因微卫星检测对Marfan综合征 (MFS)症状前诊断的应用价值。方法 应用 15号染色体FBN1基因侧翼区的 4个微卫星为遗传标记 ,联合运用荧光标记引物的聚合酶链反应和毛细管电泳技术 ,对 4个MFS家系及 4 0名正常人进行单倍型分离分析。结果 所测定的 4个微卫星的单倍型分离分析结果与该 4个MFS家系中患者的发病情况相符。结论 所测定的 4个MFS家系 ,证实其致病基因与FBN1连锁。所采用的毛细管电泳技术检测PCR扩增产物简便、易行。 展开更多
关键词 马凡综合征 FBN1基因连锁分析 毛细管电泳 常染色体显性遗传病
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JAK2基因单倍型46/1对中国人群骨髓增殖性肿瘤易感性的影响
9
作者 赵天倚 陈韵 +2 位作者 尹艳春 邢述 付学奇 《吉林大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期396-400,共5页
从91例骨髓增殖性肿瘤(MPNs)患者及1 028例健康志愿者(均为中国人)外周血中提取基因组DNA,应用等位基因特异性PCR(ASP)技术,检测作为蛋白质酪氨酸激酶JAK2单倍型46/1标签的rs12343867和rs10974944位点的基因型,并结合临床资料,应用SNPst... 从91例骨髓增殖性肿瘤(MPNs)患者及1 028例健康志愿者(均为中国人)外周血中提取基因组DNA,应用等位基因特异性PCR(ASP)技术,检测作为蛋白质酪氨酸激酶JAK2单倍型46/1标签的rs12343867和rs10974944位点的基因型,并结合临床资料,应用SNPstats软件进行统计学分析.实验结果表明:MPNs患者JAK2单倍型46/1出现的几率明显高于健康志愿者(P<0.000 1);MPNs患者的JAK2单倍型46/1更易在JAK2V617F突变阳性MPNs患者(n=70)中出现(P<0.000 1);具有JAK2单倍型46/1的中国人群患MPNs的风险增加显著,该结果与测试欧美人群的结果一致. 展开更多
关键词 JAK2基因46/1 中国人群 JAK2V617F 骨髓增殖性肿瘤 等位基因特异性PCR
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基因组多态性、单核苷酸多态性和“国际人类基因组单倍型图谱计划”
10
《现代临床医学生物工程学杂志》 2003年第6期535-539,共5页
关键词 基因组多态性 核苷酸多态性 国际人类基因图谱计划 基因组测序
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云南汉族异常血红蛋白Hb G-Taipei患者临床表型及基因型分析 被引量:2
11
作者 蒋璐西 葛世军 +5 位作者 番云华 杨必清 易薇 黄铠 褚嘉祐 杨昭庆 《临床检验杂志》 CAS 2020年第9期665-669,共5页
目的探讨云南德宏地区汉族异常血红蛋白Hb G-Taipei患者的临床表型和分子遗传学特征。方法收集云南德宏地区3个家系中7例汉族Hb G-Taipei突变携带者的外周血样本,血液学常规检测血细胞参数,血红蛋白电泳分析不同类型的血红蛋白,常见α/... 目的探讨云南德宏地区汉族异常血红蛋白Hb G-Taipei患者的临床表型和分子遗传学特征。方法收集云南德宏地区3个家系中7例汉族Hb G-Taipei突变携带者的外周血样本,血液学常规检测血细胞参数,血红蛋白电泳分析不同类型的血红蛋白,常见α/β地贫突变检测及基因DNA测序检测β珠蛋白基因(HBB)及珠蛋白突变,采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术分析HBB基因簇单倍型特征及β链基因突变的源流。结果3个家系共检测出7例异常血红蛋白Hb G-Taipei(HBB:c.68 A>G,Glu>Gly)患者,均有Hb D异常血红蛋白电泳条带,其中1例先证者为突变纯合子,其Hb D带比例(96.3%)较杂合子患者(37.0%~40.2%)明显升高。在1个家系中检测出Hb G-Taipei/-α3.7复合突变类型。Hb G-Taipei杂合子临床表现大多为无症状,有1例合并缺铁者表现为轻度小细胞低色素贫血;1例纯合子未表现出贫血表型。-α3.7突变与Hb G-Taipei的复合突变表现为无明显贫血症状。无亲缘关系的患者之间存在相同HBB基因簇单倍型[------+]。结论Hb G-Taipei突变产生异常Hb D血红蛋白电泳条带,患者临床表现为从无症状到轻度贫血。Hb G-Taipei杂合子或纯合子与静止型α地贫共遗传时均不呈现明显贫血表型。云南德宏地区汉族人群中的Hb G-Taipei突变可能具有共同的来源。 展开更多
关键词 Hb G-Taipei 基因 基因突变 β珠蛋白基因
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中国四个少数民族九个Y-STR位点基因频率和单倍型研究 被引量:18
12
作者 于亮 黄小琴 +3 位作者 史荔 史磊 俞建昆 褚嘉祐 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期337-340,共4页
目的通过对中国满族、维吾尔族、壮族、柯尔克孜族4个少数民族群体共117个男性样本9个Y-STR位点的多态性分析,得到其相关位点的多态信息。方法对所有样本的9个YSTR位点进行PCR扩增,产物在ABIPRISMTM377DNASequencer上进行电泳,结果用Gen... 目的通过对中国满族、维吾尔族、壮族、柯尔克孜族4个少数民族群体共117个男性样本9个Y-STR位点的多态性分析,得到其相关位点的多态信息。方法对所有样本的9个YSTR位点进行PCR扩增,产物在ABIPRISMTM377DNASequencer上进行电泳,结果用Genotyper2.0软件进行分型。计算基因频率、多样性、遗传距离。结果在这9个位点上满族有43个等位基因,32种单倍型;维吾尔族43个等位基因,33种单倍型;柯尔克孜族有31个等位基因,15种单倍型;壮族有34个等位基因,23种单倍型。其中满族和维吾尔族的遗传距离最小,仅为0.02530。而柯尔克孜族和壮族的遗传距离最大,达到了0.34590。结论4个民族均有较高的单倍型多样性。研究不同民族群体的遗传多样性对了解他们的起源、迁移以及相互关系有重要的意义。 展开更多
关键词 中国 少数民族 Y-STR 位点基因 基因 基因频率
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西安地区造血干细胞捐献者HLA-A、B、DR等位基因多态性分析 被引量:6
13
作者 刘孟黎 张艳 刘晟 《中国输血杂志》 CAS CSCD 2005年第6期470-473,共4页
目的了解西安地区造血干细胞捐献者HLA-A,B,DR位点基因多态性和单倍型的分布特征。方法采用序列特异性引物扩增法及序列特异性寡核苷酸探针反向杂交法对西安地区7016名造血干细胞捐献者样本进行HLA-A,B,DR位点分型分析。结果西安地区HLA... 目的了解西安地区造血干细胞捐献者HLA-A,B,DR位点基因多态性和单倍型的分布特征。方法采用序列特异性引物扩增法及序列特异性寡核苷酸探针反向杂交法对西安地区7016名造血干细胞捐献者样本进行HLA-A,B,DR位点分型分析。结果西安地区HLA-A,B,DR位点基因频率最高的分别为A*2,A*11,A*24;B*13,B*46,B*15(62);DRB1*15,DRB1*9,DRB1*4。HLA-A与HLA-DR单倍型频率较高的为A2DR9,A2DR15,A2DR12;HLA-B与HLA-DR单倍型频率较高的为B13DR7,B46DR9,B52DR15,而存在显著连锁不平衡的为A30DR7和B54DR4等。结论西安地区人群HLA-A,B,DR基因频率和HLA-A、B分别与HLA-DR构成的单倍型频率分布有一定的趋势。 展开更多
关键词 HLA基因 基因频率 多态状 基因 西安
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单倍型异基因造血干细胞移植患者的护理 被引量:3
14
作者 李青 王海燕 +4 位作者 何丽莉 梁朝阳 陈影 叶琼梅 樊雪茹 《中国实用护理杂志》 北大核心 2011年第34期27-28,共2页
目的探讨单倍型异基因造血干细胞移植中护理的特点。方法总结了8例单倍型异基因造血干细胞移植过程中心理、饮食、并发症、专科护理、移植术后健康指导等方面的护理。结果经过积极的治疗与护理,8例患者好转出院。结论早发现、早处理是... 目的探讨单倍型异基因造血干细胞移植中护理的特点。方法总结了8例单倍型异基因造血干细胞移植过程中心理、饮食、并发症、专科护理、移植术后健康指导等方面的护理。结果经过积极的治疗与护理,8例患者好转出院。结论早发现、早处理是确保移植术顺利进行的关键,术后恢复期护理在移植过程中也同样重要。 展开更多
关键词 基因造血干细胞 移植 护理
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中国北方高发区人群ABCB1基因多态性与食管鳞状细胞癌发病风险的关系 被引量:3
15
作者 孙立坤 徐昌青 《山东医药》 CAS 2018年第22期1-4,共4页
目的分析中国北方高发区人群ABCB1基因多态性与食管鳞状细胞癌(简称鳞癌)发病风险的关系。方法选择安阳肿瘤医院175例食管鳞癌患者(观察组)及安阳地区175例健康志愿者(对照组)。采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术检测两组外周血... 目的分析中国北方高发区人群ABCB1基因多态性与食管鳞状细胞癌(简称鳞癌)发病风险的关系。方法选择安阳肿瘤医院175例食管鳞癌患者(观察组)及安阳地区175例健康志愿者(对照组)。采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术检测两组外周血ABCB1 rs1045642、rs3789243、rs4148737基因型。采用Phase V2.1构建3个基因型的8个单倍型,采用条件logistic回归模型分析ABCB1基因型和单倍型与食管癌发病风险的关系。结果 ABCB1 rs1045642、rs3789243、rs4148737多态性与食管癌发病风险在观察组和对照组差异无统计学意义。ABCB1 rs1045642 C-rs3789243 T-rs4148737 A单倍型明显降低食管癌的发病风险(P=0.018,OR=1.774,95%CI:1.104~2.850),其余7个单倍型在观察组和对照组差异均没有统计学意义。结论安阳地区ABCB1 rs1045642、rs3789243、rs4148737多态与食管鳞癌发病风险没有明显相关性,但是rs1045642 C-rs3789243 T-rs4148737 A单倍型可能是食管鳞癌的保护因素。 展开更多
关键词 食管癌 ABCB1基因 多耐药基因 基因多态性 基因 安阳地区
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帘蛤科两种经济贝类种群的ITS-1序列遗传多样性分析 被引量:6
16
作者 吴琪 潘鹤婷 潘宝平 《天津师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2007年第1期20-23,共4页
利用核糖体DNA转录间隔区ITS-1序列对硬壳蛤(Mercenaria mercenaria)的养殖群体和青蛤(Cyclinasinensis)的野生种群遗传多样性进行了分析.经过PCR扩增、连接与测序后,得到硬壳蛤ITS-1的长度为718~724 bp,青蛤的为665~683 bp,序列用Clu... 利用核糖体DNA转录间隔区ITS-1序列对硬壳蛤(Mercenaria mercenaria)的养殖群体和青蛤(Cyclinasinensis)的野生种群遗传多样性进行了分析.经过PCR扩增、连接与测序后,得到硬壳蛤ITS-1的长度为718~724 bp,青蛤的为665~683 bp,序列用ClustalX1.83多重比对后,在725 bp组成的同源片段中有714个碱基序列为保守位点,通过DNAsp软件分析,该种群的核酸多态性指数Pi为0.00302,每位点Eta为0.00304,并检测出4个单倍型(Haplotype)序列.青蛤在由695 bp组成的同源片段中有644个碱基序列为保守位点,该种群的Pi为0.03071,每位点Eta为0.0378,共测出6个单倍型(Haplotype)序列.利用PAUP4.10软件计算出每个种群内单倍型序列间的相对遗传距离,其中,硬壳蛤的遗传距离仅为0.0014~0.0056,说明其DNA遗传多样性的丰度较低;而野生青蛤种群的遗传距离为0.0036~0.0105,说明其遗传多样性比较丰富.文章还初步讨论了双壳类遗传多样性变动的因素及种质保护等问题. 展开更多
关键词 帘蛤科 硬壳蛤 青蛤 ITS-1序列 遗传多样性 单倍型基因
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利用线粒体DNA控制区序列分析细鳞鲑种群的遗传结构 被引量:32
17
作者 夏颖哲 盛岩 陈宜瑜 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期48-54,共7页
细鳞鲑(Brachymystaxlenok)是我国重要的经济鱼类,由于过度捕捞、环境污染及其他因素的影响,其种群已处于濒危状态。研究细鳞鲑种群的遗传结构对于探讨这一物种的形成与演化及其有效保护等问题具有十分重要的意义。本文测定了我国东部... 细鳞鲑(Brachymystaxlenok)是我国重要的经济鱼类,由于过度捕捞、环境污染及其他因素的影响,其种群已处于濒危状态。研究细鳞鲑种群的遗传结构对于探讨这一物种的形成与演化及其有效保护等问题具有十分重要的意义。本文测定了我国东部水系的细鳞鲑7个种群71个个体的线粒体DNA控制区序列片段(835bp),发现43个变异位点,共计15个单倍型。AMOVA分析结果表明,不同的地理区域之间存在显著的遗传分化(63.55%),而区域内和种群内的遗传变异分别只有24.17%和12.28%。采用邻接法(NJ)构建分子系统树,结果表明,单倍型被分成3个与各自的地理区域相对应的族群,各地理区域之间没有共享的单倍型。细鳞鲑的这种独特的遗传结构与其进化历史(例如地理隔离造成基因流的长期中断)和生物学特性(例如有限的散布能力和基因交换能力)有密切的关系。根据上述研究结果,我们建议对这3个遗传分化显著的地理区域加以保护,并按照不同的水系来保护种群,避免不同区域的种群之间发生基因交流。 展开更多
关键词 遗传变异 基因 Brachymystax lenok
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Origin of celiac disease:How old are predisposing haplotypes?
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作者 Giovanni Gasbarrini Olga Rickards +6 位作者 Cristina Martínez-Labarga Elsa Pacciani Filiberto Chilleri Lucrezia Laterza Giuseppe Marangi Franco Scaldaferri Antonio Gasbarrini 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2012年第37期5300-5304,共5页
We recently presented the case of a first century AD young woman, found in the archaeological site of Cosa, showing clinical signs of malnutrition, such as short height, osteoporosis, dental enamel hypoplasia and crib... We recently presented the case of a first century AD young woman, found in the archaeological site of Cosa, showing clinical signs of malnutrition, such as short height, osteoporosis, dental enamel hypoplasia and cribra orbitalia, indirect sign of anemia, all strongly suggestive for celiac disease (CD). However, whether these findings were actually associated to CD was not shown based on genetic parameters. To investigate her human leukocyte antigen (HLA) class Ⅱ polymorphism, we extracted DNA from a bone sample and a tooth and genotyped HLA using three HLA-tagging single nucleotide polymorphisms for DQ8, DQ2.2 and DQ2.5, specifically associated to CD. She displayed HLA DQ 2.5, the haplotype associated to the highest risk of CD. This isthe first report showing the presence of a HLA haplotype compatible for CD in archaeological specimens. 展开更多
关键词 Celiac disease Human leukocyte antigen hap-Iotype Ancient DNA Single nucleotide polymorphisms MALABSORPTION
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Bioinformatic Tools for Polyploid Crops
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作者 Fabian Grandke Soumya Ranganathan +2 位作者 Andrzej Czech Jom R. de Haan Dirk Metzler 《Journal of Agricultural Science and Technology(B)》 2014年第8期593-601,共9页
Polyploidy is common among agriculturally important crops. Popular genetic methods and their implementations cannot always be applied to polyploid genetic data. We give an overview about available tools and their limi... Polyploidy is common among agriculturally important crops. Popular genetic methods and their implementations cannot always be applied to polyploid genetic data. We give an overview about available tools and their limitations in terms of levels of ploidy, auto- and allo-ploidy. The main classes of tools are genotype calling, linkage mapping and haplotyping. The usability of the tools is discussed with a focus on their applicability to data sets produced by state of the art technologies. We show that many challenges remain until the toolset for polyploidy provides similar functionalities as those which are already available for diploids. Some tools have been developed over a decade ago and are now outdated. In addition, we discuss necessary steps to overcome this shortage in the future. 展开更多
关键词 POLYPLOID molecular breeding genotyping HAPLOTYPING linkage mapping bioinformatics quantitative genetics PHASING
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两例罕见β~0-地中海贫血突变Codon41(-C)的鉴定 被引量:1
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作者 蒋璐西 番云华 +5 位作者 易薇 杨必清 葛世军 黄铠 褚嘉祐 杨昭庆 《中国优生与遗传杂志》 2018年第11期14-17,13,共5页
目的分析2例中国人中罕见的β地中海贫血突变类型。方法对来自云南的两例无亲缘关系、血液学表型与常见地中海贫血基因突变检测结果不符的疑似β地中海贫血样本,采用聚合酶链反应(PCR),Sanger DNA测序和TA克隆测序进行HBB基因突变的鉴定... 目的分析2例中国人中罕见的β地中海贫血突变类型。方法对来自云南的两例无亲缘关系、血液学表型与常见地中海贫血基因突变检测结果不符的疑似β地中海贫血样本,采用聚合酶链反应(PCR),Sanger DNA测序和TA克隆测序进行HBB基因突变的鉴定;采用PCR-限制酶切片段长度多态(PCR-RFLP)技术分析β株蛋白基因簇的单倍型和突变源流;建立检测罕见基因突变的单管四引物扩增阻滞PCR(Tetra-primerARMS-PCR)方法,调查云南428例随机傣族样本中罕见基因突变的携带率。结果来自云南地中海贫血流行区的1例汉族和1例傣族患者分别呈现轻度和中度小细胞低色素贫血表型,HbA2和胎儿血红蛋白HbF增高;DNA分析检出罕见β地中海贫血突变Codon41(-C)(HBB:c.126delC),2贫血病例的基因型均为突变杂合子;该突变首次在中国人中报道,其β珠蛋白基因簇单倍型与泰国人中报道的相似;在同一地区的428例傣族样本中未检测到该突变,突变携带率<0.23%。结论 Codon41(-C)是中国人中罕见的地中海贫血突变,可能与泰国傣族人中的突变具有共同源流,可疑患者需要进行基因检测以避免漏诊或误诊,地贫流行区的携带者应进行遗传咨询以减少重症地贫患儿出生。 展开更多
关键词 Β地中海贫血 基因突变 基因 Tetra-primer ARMS-PCR β珠蛋白基因
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