垂穗披碱草细胞质基因变异性分析

利用PCR产物单克隆测序的方法,对3个垂穗披碱草材料的叶绿体基因组非编码区序列trnL-F和线粒体基因nad 4片段进行了变异分析。结果表明:在同一个个体中可以检出1个以上的trnL-F和nad 4变异型,不同变异型在不同材料中占比不同;在3个垂穗披碱草材料的38个克隆序列中共检测到7种trnL-F变异型,7种变异型中共检测到13个突变位点,共有14个突变,变异型突变以碱基转换为主(92.3%),变异型1为3个材料的共享类型,在3个材料所测克隆中占比分别为53.3%、100%和61.1%;在3个材料的62个克隆序列中共检测到17种nad 4变异型,17种变异型中检测到变异位点55个,变异型突变以碱基转换(58.2%)和碱基颠换为主(34.5%),变异型2为3个材料的共享类型,在3个材料所测克隆中占比分别为68.4%、15.0%和13.0%,另外有11个变异型为2个材料所共享类型。

应用高分辨溶解曲线(HRM)技术分析猪微卫星多态性

为了验证利用高分辨熔解曲线（high-resolution melting curve analysis,HRM）技术对猪微卫星标记进行基因分型的可行性和可靠性,使用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）方法对5个微卫星（SSRs）位点多态性进行检测,再使用HRM技术对这5个微卫星（SSRs）位点进行基因分型测定,最后对1个微卫星的所有基因型进行单克隆测序。结果表明：在样本测试中,使用HRM技术分辨出S0107和SW1953位点均有8种基因型,SW72位点有6种基因型,SW29位点有5种基因型,SW2155位点有4种基因型,其结果与利用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳方法检测的结果完全吻合,并且SW72位点的所有基因型克隆测序结果与HRM检测一致。这些结果提示,HRM分析技术可作为筛选猪微卫星标记多态性和对其进行基因分型的有效手段。