肿瘤中长链非编码RNA LINC01503的表达及分子调控研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸的非编码RNA,在染色体修饰、转录调控以及转录后加工等水平调控基因的表达,从而影响肿瘤的发生发展,探究lncRNA在肿瘤中的分子调控机制是近几年来研究热点之一。现有研究证实LINC01503是一种在鳞状细胞癌研究中新近发现的长链非编码RNA,在结直肠癌、卵巢癌、肺癌及胶质瘤等诸多人类肿瘤中呈现显著高表达,其异常表达常与患者不良预后密切相关,并且能够通过ceRNA机制、上皮间质转化、参与多种相关信号通路以及表观遗传修饰等途径促进肿瘤细胞的恶性生物学行为,包括细胞增殖、迁移、侵袭和抗凋亡等;对LINC01503作用的研究有助于相关肿瘤的诊断、治疗及评估预后。本文就LINC01503在肿瘤中的表达及分子调控研究进展进行综述。

长链非编码RNA活化T细胞核因子非编码基因和长链非编码RNA小分子NF90相关RNA与三阴性乳腺癌预后的相关性分析

目的 探究长链非编码RNA(lncRNA)活化T细胞核因子非编码基因(NRON)和lncRNA小分子NF90相关RNA(snaR)与三阴乳腺癌(TNBC)预后的相关性。方法 2018年2月~2020年2月我院收治的TNBC病人100例,术中取其肿瘤组织及癌旁组织,根据3年随访预后情况将其分为预后良好组(72例)与预后不良组(28例)。采用实时定量荧光PCR(RT-qPCR)法检测肿瘤组织与癌旁组织lncRNA NRON、lncRNA snaR表达水平。Pearson法分析TNBC病人肿瘤组织lncRNA NRON与lncRNA snaR的相关性。多因素Cox回归分析TNBC病人预后的影响因素。受试者工作特征(ROC)曲线分析TNBC病人肿瘤组织lncRNA NRON和lncRNA snaR表达水平对预后的预测价值。结果 与癌旁组织相比,TNBC病人肿瘤组织lncRNA NRON表达水平显著下降(1.01±0.10比0.65±0.08,P<0.001),lncRNA snaR表达水平显著上升(1.03±0.13比2.42±0.30,P<0.001)。lncRNA NRON、lncRNA snaR表达水平与TNM分期、肿瘤分化程度有关(P<0.05)。与预后良好组相比,预后不良组TNBC病人肿瘤组织lncRNA NRON表达水平显著下降(0.69±0.09比0.55±0.05,P<0.001),lncRNA snaR表达水平显著上升(2.28±0.26比2.78±0.40,P<0.001)。Pearson法分析显示,TNBC病人肿瘤组织lncRNA NRON与lncRNA snaR表达水平呈负相关(r=-0.617,P<0.001)。多因素Cox回归分析结果显示,lncRNA NRON是TNBC病人预后的保护因素(P<0.05),lncRNA snaR是TNBC病人预后的危险因素(P<0.05)。lncRNA NRON和lncRNA snaR表达水平联合预测TNBC病人预后优于lncRNA snaR单独预测(Z_(二者联合-lncRNA snaR)=3.200,P=0.001)。结论 TNBC病人肿瘤组织中lncRNA NRON表达下调,lncRNA snaR表达上调,二者与TNBC病人预后有关,可能是TNBC预后预测的生物标志物。

人乳头瘤病毒16/18型感染乳腺癌患者病灶核因子κB相互作用的长链非编码RNA表达水平及其与乳腺癌分子分型和预后关系

目的 分析人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)16/18型感染乳腺癌患者病灶核因子κB相互作用的长链非编码RNA(NF-κB interacting long non-coding RNA,NKILA)表达情况及其与乳腺癌分子分型、预后的相关性。方法 选取2016年1月至2018年1月南通大学附属海安医院收治的334例乳腺癌患者(观察组)和50例乳腺良性疾病患者(对照组)作为研究对象,对观察组患者肿瘤组织、癌旁组织和对照组患者病灶组织标本进行NKILA表达检测,并检测血清指标水平。分析两组NKILA表达情况与血清学指标的相关性,比较不同HPV分型感染情况、不同分子分型、不同预后患者病灶NKILA表达差异。结果 观察组患者肿瘤组织NKILA相对表达量显著低于癌旁组织(P <0.05),癌旁组织NKILA相对表达量显著低于对照组(P <0.05)。HPV 16/18型感染组肿瘤组织NKILA相对表达量、NKILA高表达率均显著低于非HPV16/18型感染组(均P <0.05)。Luminal A型组、Luminal B型组患者肿瘤组织NKILA相对表达量、NKILA高表达率均显著高于人表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor-2,HER-2)过表达型组(均P <0.05),HER-2过表达型组肿瘤组织NKILA相对表达量显著高于三阴性组(P <0.05)。复发转移组肿瘤组织NKILA相对表达量、NKILA高表达率均低于未复发转移组(均P <0.05)。NKILA低表达组3年无复发转移率显著低于NKILA高表达组[24.7%(36/146)∶40.0%(58/145),P <0.05]。结论 相比乳腺癌旁组织和良性疾病病灶,乳腺癌患者病灶NKILA表达下降,且HPV 16/18型感染者、三阴性乳腺癌者和术后复发转移者病灶NKILA表达下降更为明显,NKILA低表达与患者术后复发转移相关。

宫颈癌组织长链非编码RNA XIST、小分子RNA miR-101-3p表达变化及其意义

目的观察宫颈癌组织长链非编码RNA(LncRNA)X染色体失活特异转录子(XIST)、小分子RNA miR-101-3p表达变化,并探讨其临床意义。方法选取91例宫颈癌患者的宫颈癌组织标本为观察组,癌旁正常组织(距离宫颈癌组织>5cm且经病例检查证实为正常组织)标本为对照组。采用实时荧光定量PCR法检测两组标本中的XIST、miR-101-3p表达,并分析其与宫颈癌临床病理参数的关系。结果观察组、对照组XIST表达量分别为8.97±3.56、7.01±3.82,miR-101-3p表达量分别为8.24±4.22、10.15±3.97。观察组XIST表达量高于对照组(P<0.05),miR-101-3p表达量低于对照组(P<0.05)。Pearson积矩相关分析结果显示宫颈癌组织miR-101-3p、XIST表达量呈负相关性(r=-0.716,P<0.05)。肿瘤最大径≥4 cm、FIGO分期Ⅲ+Ⅳ期、低分化、有淋巴结转移的宫颈癌组织中miR-101-3p表达量分别低于于肿瘤最大径<4 cm、FIGO分期Ⅰ+Ⅱ期、中高分化、无淋巴结转移的宫颈癌组织(P均<0.05),XIST表达量分别高于于肿瘤最大径<4 cm、FIGO分期Ⅰ+Ⅱ期、中高分化、无淋巴结转移宫颈癌组织(P均<0.05)。结论宫颈癌组织XIST表达升高、miR-101-3p表达降低。检测宫颈组织XIST、miR-101-3p有助于宫颈癌的病情判断。

长链非编码RNA HULC在胃癌中的表达及其分子机制

目的探讨长链非编码RNA HULC在胃癌中的表达及分子机制.方法取2012-12/2017-02医院收治胃癌患者42例,患者均行手术治疗,取患者癌组织与癌旁组织,采用实时荧光定量PCR技术测定癌症组织与癌旁组织中长链非编码RNA HULC表达水平,进一步分析与临床病理资料的关系.结果 42例胃癌组织中长链非编码RNA HULC表达水平高于癌旁组织(0.41±0.12 vs 0.20±0.10,P<0.05);胃癌组织中长链非编码R N A HULC表达与性别、年龄、肿瘤大小及肿瘤位置差异无统计学意义(P>0.05);长链非编码RNA HULC表达与胃癌的分化程度、淋巴结转移及TNM分期关系密切(P<0.05).多因素Logistic回归分析显示:长链非编码RNA HULC表达与胃癌的分化程度、淋巴结转移及TNM分期关系密切(P<0.05).结论在胃癌组织中长链非编码RNA HULC表达呈高表达,并且与临床病理资料具有紧密的联系,能判断胃癌肿瘤的恶性程度,指导临床治疗.

胃癌组织中长链非编码RNA FOXC2-AS1及清道夫受体B组1型分子的表达及临床意义

目的研究胃癌患者癌组织中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)FOXC2-AS1及清道夫受体B组1型分子(scavenger receptor class B typeⅠ,SCARB1)的表达及其临床意义。方法选择2016年5月至2017年9月湖南省郴州市第一人民医院收治的96例胃癌患者,采用实时荧光定量PCR检测癌组织中FOXC2-AS1和SCARB1的表达,以癌旁正常组织为对照,分析癌组织中FOXC2-AS1、SCARB1表达与临床病理特征的关系,Pearson法分析FOXC2-AS1与SCARB1的相关性。Kaplan-Meier法(Log-rank检验)分析不同FOXC2-AS1、SCARB1表达水平患者的预后差异。结果与癌旁正常组织相比,癌组织中FOXC2-AS1表达水平明显较高,SCARB1表达水平明显较低。不同肿瘤分期、病理分级癌组织中FOXC2-AS1、SCARB1的表达差异具有显著性(P<0.05)。癌组织中FOXC2-AS1和SCARB1的表达呈显著负相关(r=-0.663,P=0.000)。高FOXC2-AS1表达组患者3年总体生存率明显低于低FOXC2-AS1表达组患者,低SCARB1表达组患者3年总体生存率明显低于高SCARB1表达组患者(P<0.05)。结论胃癌组织中FOXC2-AS1表达升高,SCARB1表达降低,二者均与肿瘤TNM分期、病理分级有关,可作为判断胃癌预后的肿瘤标志物。

非编码RNA作为肿瘤分子标记物的研究进展

非编码RNA是一类不能编码蛋白质的RNA,其异常表达和调控与肿瘤密切相关,有望成为人类研究肿瘤的突破口。随着研究的不断推进,与人类健康和疾病相关的分子生物标记物微小RNA、长链非编码RNA最终必将得到充分的开发和利用。

血清长链非编码RNA核富集转录体1及可溶性细胞间黏附分子1水平与冠状动脉慢血流现象的关系

目的 探讨血清长链非编码RNA核富集转录体1(NEAT1)及可溶性细胞间黏附分子1(sICAM-1)水平与冠状动脉慢血流现象(CSFP)的关系。方法 选择2020年8月至2022年2月在四川省遂宁市中心医院疑诊为冠状动脉粥样硬化性心脏病而行冠状动脉造影检查的患者,以其中造影未见明显病变的110例为研究对象,将心肌梗死溶栓试验(TIMI)血流分级2级及以下且无冠状动脉狭窄、诊断为CSFP的70例患者作为CSFP组,以TIMI血流分级3级且无冠状动脉明显狭窄者40例作为对照组。利用荧光定量聚合酶链反应法检测血清NEAT1表达,酶联免疫吸附试验法检测血清sICAM-1表达。比较2组NEAT1及sICAM-1表达差异。Pearson线性相关分析方法分析血清NEAT1及sICAM-1水平与冠状动脉TIMI平均血流帧数的相关性。采用多因素Logistic回归方法分析CSFP的危险因素。采用受试者工作特征曲线分析血清NEAT1、sICAM-1单独及联合检测对CSFP的诊断效能。结果 CSFP组血清NEAT1、sICAM-1表达水平高于对照组,差异均有统计学意义(均P<0.05)。Pearson相关性分析结果显示,血清NEAT1、sICAM-1表达与冠状动脉TIMI平均血流帧数呈显著正相关(r=0.456、0.503,均P<0.001)。血清NEAT1与sICAM-1的表达水平呈显著正相关(r=0.541,P<0.001)。有吸烟史、血清NEAT1、sICAM-1水平升高是CSFP的独立危险因素,白蛋白升高是CSFP的保护因素(均P<0.05)。血清NEAT1、sICAM-1单独及联合检测诊断CSFP的曲线下面积分别为0.698(95%置信区间:0.591~0.736)、0.789(95%置信区间:0.734~0.832)、0.836(95%置信区间:0.802~0.885),联合检测诊断CSFP的曲线下面积显著高于血清NEAT1、sICAM-1单独检测(Z=2.061、P=0.039,Z=6.403、P<0.001)。结论 CSFP患者血清NEAT1、sICAM-1水平升高。有吸烟史、血清NEAT1、sICAM-1水平升高是CSFP的独立危险因素,白蛋白升高是CSFP的保护因素。血清NEAT1、sICAM-1联合检测对CSFP具有较高的诊断价值。

长链非编码RNA RP11-497E19.1对胃癌细胞增殖和侵袭的影响及机制实验研究

目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)RP11-497E19.1对胃癌细胞增殖和侵袭的影响及其机制。方法:实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测胃癌HS-746T、BGC823、NCI-N87、SGC7901、AGS细胞和永生化胃上皮细胞GES-1中RP11-497E19.1表达水平,筛选表达最高的细胞进行后续实验。将HS-746T细胞分为si-NC组和si-RP11-497E19.1组,分别转染阴性对照寡核苷酸或RP11-497E19.1小干扰RNA。集落形成实验和Transwell实验分析转染HS-746T细胞的增殖、侵袭能力。双荧光素酶报告基因实验验证RP11-497E19.1与微小RNA(miR)-545-5p的靶向关系。RT-qPCR检测转染HS-746T细胞miR-545-5p的表达。Western blot检测转染HS-746T细胞间质表皮转化因子(c-Met)/胆绿素还原酶(BVR)/活化复制因子2(ATF-2)分子通路相关蛋白的表达。结果:与GES-1细胞比较,HS-746T、BGC823、NCI-N87、SGC7901、AGS细胞中RP11-497E19.1表达水平均上升,且HS-746T细胞RP11-497E19.1表达水平最高(均P<0.05)。与si-NC组比较,si-RP11-497E19.1组HS-746T细胞活力和细胞侵袭数降低(均P<0.05)。双荧光素酶报告基因实验证实RP11-497E19.1靶向结合miR-545-5p,可负向调控miR-545-5p表达(P<0.05)。与si-NC组比较,si-RP11-497E19.1组HS-746T细胞c-Met/BVR/ATF-2分子通路蛋白c-Met、BVR、p-ATF-2、锌指蛋白1(Snail1)、锌指蛋白2(Snail2)表达降低(均P<0.05)。结论:胃癌细胞中RP11-497E19.1呈高表达,沉默RP11-497E19.1通过靶向miR-545-5p/c-Met/BVR/ATF-2分子通路抑制胃癌HS-746T细胞的增殖及侵袭。

长链非编码RNA在肺癌中作用的研究进展

肺癌(lung cancer,LC)是全球病死率最高的恶性肿瘤,严重威胁人类的生命健康。目前传统的肺癌筛查方法不能满足提高患者生存率的迫切需要,因此,探索新的肺癌早期诊断及预后评估的生物学标志物十分重要。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是指长度超过200个核苷酸且不具有蛋白编码功能的小RNA,通过在转录、翻译和翻译后水平调控基因表达发挥多种生物学功能。近年来研究发现,多种lncRNA在肺癌中异常表达,通过影响肺癌细胞的增殖及死亡、肿瘤的侵袭与免疫逃逸、调控抗肿瘤治疗的敏感度等多种途径参与肿瘤细胞的生物学过程,为探究肺癌发生、发展及临床诊治提供了新的思路。本文就lncRNA与肺癌的关系、分子调控机制及可能的临床应用等研究进展进行综述。

肿瘤相关非编码小分子RNA概述

非编码小分子RNA（miRNA）是一类内生的、参与基因转录后水平调控的RNA。研究表明，miRNA具有调控细胞增殖、分化、凋亡、个体发育等生物学功能，并与肿瘤的发生密切相关。本文概述了miRNA的产生、生物学特性、在肿瘤发生过程中的作用以及在癌症诊疗中的应用价值。

长非编码RNA NRAV在泛癌中的表达和功能研究

LncRNA NRAV是近年来新发现的lncRNA分子,仅少数研究显示其表达水平与肺癌、胰腺导管腺癌的发展紧密相关,但NRAV在其它癌症中的表达情况和功能尚不清晰。通过生物信息学的方法分析NRAV在不同癌症中的差异表达情况及其与癌症患者生存期的关系,并以肝细胞癌(LIHC)作为重点研究对象,基于转录组数据筛选与NRAV共表达的mRNA并进行GO和KEGG功能富集分析,探究NRAV在LIHC中的调控机制与功能。结果显示,NRAV在7种癌症与癌旁组织中差异表达显著,其表达量与5种癌症患者的总生存期以及4种癌症患者的无病生存期显著相关。另外,筛选出的479个共表达靶基因主要富集在DNA修复、蛋白质结合、细胞周期等通路上。该文为进一步了解NRAV与泛癌尤其是肝细胞癌的发生发展关系提供初步依据。

非编码RNA在急性髓系白血病中的作用和临床意义

急性髓系白血病(AML)是一种细胞遗传学和分子异质性疾病,其特征是克隆性髓系前体细胞的分化停滞和恶性增殖。尽管治疗选择越来越多,但大多数患者在缓解后仍会复发和死亡,预后仍然不理想。因此,有必要探索新的治疗方法。研究发现非编码RNA (ncRNA),特别是微RNA (miRNA)、长链非编码RNA (lncRNA)和环状RNA (circRNA)被发现与AML的发生发展、预后及耐药有关。本文重点介绍ncRNA与AML的相关性的最新研究结果,为未来AML开发高度特异性的诊断工具和更强大的治疗策略奠定基础。

伤寒沙门菌长链非编码RNA AS-RpoH分子鉴定

目的:探讨伤寒沙门菌非编码RNA AS-RpoH的分子特性,为进一步研究其调控功能和机制奠定基础。方法:在AS-RpoH表达高峰区设计特异性探针,运用RNA印迹检测AS-RpoH的表达;通过PCR寻找AS-RpoH可能的转录起始位点和终止位点;在yhhk编码区设计特异性探针,运用RNA印迹分析yhhk的转录产物。结果:RNA印迹结果显示,AS-RpoH在沙门菌中确实存在,长约3 000 nt;PCR结果表明,AS-RpoH的转录终止位点位于rpo H基因起始密码子上游191~238 nt之间;而其转录起始位点可能位于yhh K上游;RNA印迹分析结果表明yhh K基因的转录产物与AS-RpoH的长度一致。结论:长链非编码RNA AS-RpoH在伤寒沙门菌中存在表达,可能为yhh K的3'非翻译区。

长链非编码RNA MIAT在不同分子亚型乳腺癌中的表达特点及与临床特征的关系研究

目的探究长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)MIAT在乳腺癌不同分子亚型中的表达情况,并分析其表达水平与乳腺癌临床病理特征之间的关系。方法收集2015年5月至2017年9月在我院确诊的212名乳腺癌患者的乳腺癌组织、癌旁组织与外周血,行实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,RT-PCR)检测组织与血浆中lncRNA MIAT表达水平。比较lncRNA MIAT在癌与癌旁组织中的表达水平,并分析其与乳腺癌分子分型、TNM分期、肿瘤直径、腋窝淋巴转移数目等临床病理特征之间的关系。结果 lncRNA MIAT在乳腺癌组织中的表达水平(4.23±1.06)明显高于癌旁组织(2.14±0.63),且差异具有统计学意义(P<0.05)。此外,癌组织与血浆中lncRNA MIAT表达水平与肿瘤分子分型、TNM分期、肿瘤直径、腋窝淋巴结转移数目等均显著相关(P <0.05),而与患者年龄、BMI、吸烟史、饮酒史、生育史、哺乳史等因素无关(P>0.05)。结论 lncRNA MIAT表达水平与乳腺癌分子分型、TNM分期、肿瘤直径及腋窝淋巴结转移数等均显著相关,对患者的预后评估具有潜在价值。

生物化学教学中加强小分子非编码RNA介绍的必要性

随着高通量测序技术的发展,越来越多的小分子非编码RNA(Small non-coding RNA,sncRNA)被人们发现,其介导的转录调控是生物体内一种新的调控模式。目前,micro RNA(miRNA)、small interfering RNA(siRNA)和PIWIinteracting RNA(piRNA)是sncRNA中研究最为透彻的三个成员。笔者在简述三者的生物合成及作用机制的基础上,建议在《生物化学》的教学中增加sncRNA知识的介绍。

长链非编码RNA在结直肠癌化疗耐药机制的研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)是一种内源性非编码RNA。化疗在结直肠癌(CRC)的治疗中担任重要的角色。多项研究表明,lncRNA通过不同机制导致CRC化疗耐药。因此,以lncRNA为靶点克服CRC化疗耐药的策略被提出。目前,已有研究证明一些化学药物和中药能靶向lncRNA逆转耐药性。该文主要综述了lncRNA在CRC化疗耐药机制的研究进展。

长链非编码RNA参与前列腺癌相关信号通路调控介导肿瘤发生进展的研究进展

前列腺癌(prostate cancer,PCa)属于一类恶性程度极高的泌尿系肿瘤,在全球新发癌症病例中前列腺癌位居第四位。由于前列腺癌具有高度异质性及耐药性,目前尚无治愈药物问世,阐明前列腺癌恶性进展的分子机制将对改善前列腺癌药物抗性,提升病人预后大有裨益。在前列腺癌发生发展的过程中各类信号通路起到了重要调控作用,包括胞内磷脂酰肌醇激酶-丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白激酶(PI3K-Akt)信号通路、雄激素受体(androgen receptor,AR)、无翼信号通路(WNT)、缺口信号通路(Notch)在内的多种信号通路失衡显著影响了前列腺癌的恶性进展,然而其深层的分子机制仍有待进一步阐述。长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类长度大于200 bp的RNA分子,在过去十多年随着测序技术的发展,lncRNA的重要作用逐渐被研究者所认知,在前列腺癌中多种lncRNA通过影响前列腺癌中关键信号通路发挥相应作用参与调控前列腺癌的进展。该文就lncRNA在前列腺癌相关信号通路发挥的作用及相应分子机制作一综述,以期给前列腺癌治疗提供新的思路与方案。

长链非编码RNA在骨肉瘤化疗耐药机制中的研究进展

骨肉瘤是骨科最常见的恶性肿瘤,初次确诊时往往伴有肺部转移,且耐药发生率较高。近年化疗方案的优化已经明显改善了骨肉瘤患者的预后,但化疗耐药性仍是临床医师面临的难题。长链非编码RNA(lncRNA)是骨肉瘤细胞耐药调节中的重要靶点,它从促进细胞自噬与凋亡、调控肿瘤细胞侵袭迁移、调节药物敏感性及细胞微环境等方面参与骨肉瘤细胞耐药的分子机制。因此,靶向调节lncRNA及相关信号因子水平有望改善骨肉瘤细胞的耐药性,但目前其具体分子机制尚未完全阐明,仍需要进一步探索。

长链非编码RNA的特异表达在糖尿病视网膜病变中的作用

糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)是糖尿病最常见的微血管并发症之一,高血糖的持续刺激会导致血管通透性增加、黄斑水肿、新生血管生成、纤维增殖膜等一系列病理变化,最终导致视功能丧失^([1])。现有的治疗包括视网膜激光光凝术、抗血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)治疗、玻璃体腔内注射长效激素以及玻璃体切割术在临床上证明有非常好的疗效,但也有部分患者治疗效果不尽如人意,因此需要寻找新的突破口对DR进行治疗。