猪细小病毒HN-3株VP2基因克隆与抗原性分析

参考GenBank公布的NADL-2株序列，设计出1对引物。利用该引物扩增了猪细小病毒HN-3株VP2主要抗原基因，将其克隆到pGEM-TEasy载体上；测序获得1438bp核苷酸序列，并推导出其氨基酸序列。共编码475氨基酸，与NADL-2株相应的序列进行比较分析，两者核苷酸同源性为99．4％，氨基酸同源性为99．3％。应用DNAStar软件对氨基酸的抗原表位进行了预测，共有11个抗原表位，分别在氨基酸N端的11～24，81～108，121～135，139～148，150～172，221～239，241～259，316～342，344～352，390～405和426～439区段，此序列具有较好的免疫原性。