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不同花色印度野牡丹转录组功能注释和分析
被引量:
3
1
作者
林艺华
吴小斌
+2 位作者
郑涛
林宗铿
陈振东
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期2133-2138,共6页
印度野牡丹(Melastoma malabathricum)属于野牡丹科野牡丹属,是双子叶有花植物,具有优良的观赏价值和药用价值,在未来的城乡绿化中具有较大的应用潜力和景观贡献力。本研究以粉色和白色的印度野牡丹为材料,采用RNA-seq转录组测序获得54 ...
印度野牡丹(Melastoma malabathricum)属于野牡丹科野牡丹属,是双子叶有花植物,具有优良的观赏价值和药用价值,在未来的城乡绿化中具有较大的应用潜力和景观贡献力。本研究以粉色和白色的印度野牡丹为材料,采用RNA-seq转录组测序获得54 725条Unigene,并分别通过Nr、SwissProt、KOG和KEGG 4个数据库分别进行同源比对和功能注释,其中有11 319条Unigenes在4个数据库中都注释到了相应的功能基因。GO注释到123 355个Unigenes分为3个本体49个功能组,KEGG注释到7 880条Unigenes涉及129种代谢途径,其中部分Unigene涉及花色素合成途径、类黄酮合成途径、类胡萝卜素等合成途径。这些研究结果为后续深入开展印度野牡丹花青素等物质代谢合成途径及相关基因研究奠定基础。
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关键词
印度野牡丹
花色
转录组
功能注释
原文传递
题名
不同花色印度野牡丹转录组功能注释和分析
被引量:
3
1
作者
林艺华
吴小斌
郑涛
林宗铿
陈振东
机构
福建省热带作物科学研究所
广东省生物工程研究所(广州甘蔗糖业研究所)
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期2133-2138,共6页
基金
福建省公益类科研院所专项(2014R1028-1)
福建省公益类科研院所项目(2017R1028-2)共同资助
文摘
印度野牡丹(Melastoma malabathricum)属于野牡丹科野牡丹属,是双子叶有花植物,具有优良的观赏价值和药用价值,在未来的城乡绿化中具有较大的应用潜力和景观贡献力。本研究以粉色和白色的印度野牡丹为材料,采用RNA-seq转录组测序获得54 725条Unigene,并分别通过Nr、SwissProt、KOG和KEGG 4个数据库分别进行同源比对和功能注释,其中有11 319条Unigenes在4个数据库中都注释到了相应的功能基因。GO注释到123 355个Unigenes分为3个本体49个功能组,KEGG注释到7 880条Unigenes涉及129种代谢途径,其中部分Unigene涉及花色素合成途径、类黄酮合成途径、类胡萝卜素等合成途径。这些研究结果为后续深入开展印度野牡丹花青素等物质代谢合成途径及相关基因研究奠定基础。
关键词
印度野牡丹
花色
转录组
功能注释
Keywords
Melastoma malabathricum
Flower color
Transcriptome
Functional annotation
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S685.11 [农业科学—观赏园艺]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同花色印度野牡丹转录组功能注释和分析
林艺华
吴小斌
郑涛
林宗铿
陈振东
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2017
3
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