多数据库联合探究TEKT2在卵巢癌中的作用

为了探讨筑丝蛋白2(tektin 2,TEKT2)在卵巢癌(ovarian cancer,OV)中的表达情况、临床意义及功能机制,为OV的早期诊断和治疗提供新思路,本研究通过多个数据库的联合运用探讨TEKT2在OV中的作用。首先,应用GEPIA2数据库分析TEKT2在OV中的表达情况,同时使用GEPIA2数据库、TIMER数据库和Ka-plan-Meier绘图平台探究TEKT2在OV中的预后价值;其次,采用Pearson分析探究TEKT2与肿瘤蛋白53(tumor protein 53,TP53)在OV中的相关性,并且基于Kaplan-Meier绘图平台探究TEKT2预后价值与TP53突变类型的关系;再次,通过TIMER数据库分析TEKT2与免疫细胞的相关性;最后,实时聚合酶链反应(re-al-time PCR)被用来验证TEKT2在OV细胞中的表达,细胞增殖毒性检测(CCK-8)被用来评估TEKT2与OV细胞增殖的关系。结果显示:TEKT2在OV中高表达,与OV患者的预后较好相关,且是一个独立预后因素;在OV患者中,TEKT2与TP53的表达呈正相关,并且在野生型TP53患者中,TEKT2具有预后价值;TEKT2的高表达与巨噬细胞和中性粒细胞密切相关,其中TEKT2的臂水平缺失与中性粒细胞的浸润显著相关。进一步的CCK-8实验结果表明,TEKT2可抑制OV细胞的增殖。上述研究提示,TEKT2可能通过调节免疫细胞的浸润和抑制OV细胞的增殖影响OV患者预后。

卵巢癌相关差异表达基因的生物信息学分析

卵巢癌(ovarian cancer,OV)是一种常见的具有高死亡率的妇科恶性肿瘤。本研究旨在为OV的发生发展机制研究提供更多数据支持,从而对OV的临床治疗提供一定的理论基础。从GEO数据库下载卵巢患者芯片数据GSE26712。用limma包分析OV肿瘤组织中与正常卵巢表面上皮组织样本中差异表达基因。随后进行GO和KEGG富集分析。Cytoscape的MCODE插件用于鉴定差异基因之间的蛋白质互作关系(protein-protein interaction network,PPI)。并筛选出Hub基因并应用GEPIA验证其在卵巢癌患者和正常人群中的表达。筛选得到287个DEGs(72个上调基因和215个下调基因),主要富集在间充质发育和细胞外基质组织过程,以及癌症中的蛋白多糖通路中。从PPI网络中鉴定出2个关键子网络和12个Hub基因。本研究可望为OV发生发展的机制研究提供新的研究方向。