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卷曲蛋白6在胰腺癌中的表达及其与免疫浸润水平相关性分析
1
作者
武晓龙
冯晓燕
+3 位作者
张旭东
史存真
李鑫
张明智
《肿瘤基础与临床》
2023年第4期286-292,共7页
目的 评估胰腺癌中卷曲蛋白6(FZD6)的表达及其与免疫浸润水平相关性,从而为临床决策和风险管理提供一定的科学依据。方法 利用GEO(GSE28735、GSE15471、GSE16515和GSE71729)、TCGA、GTEx和UALCAN数据库分析FZD6在胰腺癌患者和健康对照...
目的 评估胰腺癌中卷曲蛋白6(FZD6)的表达及其与免疫浸润水平相关性,从而为临床决策和风险管理提供一定的科学依据。方法 利用GEO(GSE28735、GSE15471、GSE16515和GSE71729)、TCGA、GTEx和UALCAN数据库分析FZD6在胰腺癌患者和健康对照者中的基因、蛋白表达水平;运用GEPIA数据库探索FZD6与患者总生存期、无病生存期的关系;利用EMTAB-6134数据中的基因表达谱进行免疫浸润分析、富集通路分析;采用MEXPRESS数据库分析DNA甲基化、拷贝数变异与FZD6表达的相关性。结果 FZD6的mRNA水平(GSE28735:t=3.532,P<0.001、GSE15471:t=6.817,P<0.001、GSE16515:t=4.166,P<0.001,GSE71729:t=2.589,P=0.012,TCGA_GTEx:t=18.118,P<0.001)和蛋白水平(t=2.160,P=0.032)在胰腺癌中的表达均高于正常组织。生存分析显示FZD6高表达的患者的总生存率(HR=1.800,P=0.005)和无病生存率(HR=2.000,P=0.003)均低于FZD6低表达的患者。免疫浸润分析揭示,FZD6与肿瘤纯度评分呈正相关(r=0.280,P<0.001),与基质评分(r=-0.220,P<0.001)、免疫评分(r=-0.280,P<0.001)和ESTIMATE评分(r=-0.280,P<0.001)呈负相关;FZD6高表达组具有更低的免疫评分。富集分析结果显示,FZD6相关的基因主要参与免疫应答的细胞活化、免疫反应的激活、免疫反应-调节细胞表面受体等重要免疫相关通络。DNA甲基化分析发现3个与FZD6表达呈正相关的甲基化位点,9个与FZD6表达呈负相关的甲基化位点。结论 FZD6高表达与胰腺癌患者的不良预后相关,且FZD6与肿瘤纯度正相关,而与基质分数、免疫分数、ESTIMATE分数均呈负相关,有望作为胰腺癌患者预后预测的标志物和治疗靶点。
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关键词
胰腺癌
卷曲蛋白6
预后
免疫浸润
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职称材料
微小RNA-29b靶向卷曲蛋白6参与急性髓系白血病细胞柔红霉素耐药的分子机制
被引量:
1
2
作者
赖思含
何莹
易海
《武警医学》
CAS
2023年第4期295-300,共6页
目的探究微小RNA-29b(miR-29b)靶向卷曲蛋白6(FZD6)参与急性髓系白血病(AML)细胞柔红霉素(DNR)耐药的分子机制。方法CCK-8检测AML细胞系在不同DNR浓度下的生存能力,实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测AML细胞系中miR-29b的表达。选取TH...
目的探究微小RNA-29b(miR-29b)靶向卷曲蛋白6(FZD6)参与急性髓系白血病(AML)细胞柔红霉素(DNR)耐药的分子机制。方法CCK-8检测AML细胞系在不同DNR浓度下的生存能力,实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测AML细胞系中miR-29b的表达。选取THP-1细胞为研究对象,分为Control组(正常培养)、miR-NC mimics组(转染miR-NC mimics)、miR-29b mimics组(转染miR-29b mimics)、miR-29b mimics+pcDNA组(转染miR-29b mimics和pcDNA)、miR-29b mimics+pcDNA-FZD6组(转染miR-29b mimics和pcDNA-FZD6),转染24 h后使用10 mM DNR处理培养24 h。qRT-PCR和免疫印迹(Western blot)检测各组DNR处理的THP-1细胞中miR-29b和FZD6表达水平。生物信息学和双荧光素酶报告基因预测并检测miR-29b和FZD6靶向关系。CCK-8、Edu法和流式细胞术分别检测DNR处理的各组THP-1细胞增殖和凋亡情况。结果AML细胞系对DNR的耐药性是呈浓度依赖性的,qRT-PCR结果显示,miR-29b在AML细胞系THP-1(1.00±0.05)、KG-1(1.87±0.16)、HL-60(2.96±0.21)及Kasumi-1(3.73±0.29)中的表达逐渐增高(P<0.05)。双荧光素酶报告基因检测、qRT-PCR及Western blot证明miR-29b可直接负靶向FZD6(0.32±0.04,0.37±0.05,0.48±0.06,P<0.05)。miR-29b过表达可使AML细胞对DNR的耐药性减弱,抑制细胞增殖,增强细胞凋亡能力(43.59±5.24,21.97±3.13,P<0.05)。上调FZD6可一定程度上逆转上调miR-29b表达对THP-1细胞增殖和凋亡的影响(65.21±6.39,38.26±4.09,P<0.05)。结论miR-29b通过靶向抑制FZD6降低AML细胞对DNR的耐药性。
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关键词
微小RNA-29b
卷曲蛋白6
急性髓系白血病
柔红霉素
耐药
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职称材料
抑制成纤维细胞生长因子受体2-卷曲螺旋结构域蛋白6融合基因表达在人胆管癌异种移植小鼠的作用
3
作者
王绍清
王宇
+2 位作者
李鸿梅
张宁
吴甜
《中华实验外科杂志》
CAS
北大核心
2023年第7期1319-1321,共3页
目的探究抑制成纤维细胞生长因子受体2-卷曲螺旋结构域蛋白6(FGFR2-CCDC6)表达在人胆管癌异种移植小鼠的抗肿瘤作用。方法选择购自美国模式培养物集存库(ATCC)的人正常肝内胆管上皮细胞HIBEC和稳定转染FGFR2-CCDC6表达质粒的人肝内胆管...
目的探究抑制成纤维细胞生长因子受体2-卷曲螺旋结构域蛋白6(FGFR2-CCDC6)表达在人胆管癌异种移植小鼠的抗肿瘤作用。方法选择购自美国模式培养物集存库(ATCC)的人正常肝内胆管上皮细胞HIBEC和稳定转染FGFR2-CCDC6表达质粒的人肝内胆管癌细胞系Hucct1, 分组为沉默FGFR2-CCDC6阴性对照(si-NC)组和沉默FGFR2-CCDC6(si-FGFR2-CCDC6)组。利用实时定量聚合酶链反应(RT-PCR)检测融合基因表达;蛋白质印迹法(Western blot)检测FGFR2、成纤维细胞生长因子2(FGF2)和磷酸化细胞外调节蛋白激酶(p-ERK1/2)蛋白表达。噻唑蓝(MTT)检测抑制FGFR2对细胞增殖的抑制作用。小鼠荷瘤模型探究抑制FGFR2表达对移植瘤体积的抑制作用。应用SPSS 21.0软件进行分析。结果 Hucct1中的FGFR2-CCDC6表达显著高于HIBEC(1.00±0.05比1.92±0.09, t=15.480, P<0.05);FGFR2、FGF2和p-ERK1/2的蛋白表达均明显高于HIBEC(FGFR2:0.54±0.03比1.29±0.05, t=20.360, FGF2:1.32±0.06比1.87±0.09, t=9.207, p-ERK1:0.84±0.05比1.54±0.07, t=14.920, p-ERK2:1.42±0.06比2.11±0.11, t=9.391, 均P<0.05)。si-FGFR2-CCDC6组的FGFR2-CCDC6的mRNA表达水平显著低于si-NC组(1.00±0.06比0.39±0.03, t=19.540, P<0.05);FGFR2、FGF2和p-ERK1/2的蛋白表达均显著低于si-NC组(FGFR2:1.32±0.05比0.77±0.04, t=13.080, FGF2:1.93±0.08比1.23±0.07, t=11.12, p-ERK1:1.48±0.07比0.73±0.06, t=15.260, p-ERK2:2.03±0.12比1.44±0.07, t=7.488, 均P<0.05);转染后24 h和48 h细胞增殖率明显低于si-NC组(24 h:0.74±0.06比0.48±0.04, t=6.245, 48 h:0.97±0.07比0.65±0.06, t=6.012, 均P<0.05)。小鼠荷瘤模型发现, si-FGFR2-CCDC6转染荷瘤组移植瘤体积明显小于si-NC参照组(598.00±50.00比476.00±39.00, F=12.530, P<0.05)。结论抑制FGFR2-CCDC6融合基因表达可抑制FGF2/FGFR2/p-ERK1/2通路的激活, 抑制细胞增殖和肿瘤生长, 进而发挥抑癌作用。
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关键词
胆管癌
成纤维细胞生长因子受体2-
卷曲
螺旋结构域
蛋白
6
融合基因
异种移植
原文传递
题名
卷曲蛋白6在胰腺癌中的表达及其与免疫浸润水平相关性分析
1
作者
武晓龙
冯晓燕
张旭东
史存真
李鑫
张明智
机构
郑州大学第一附属医院肿瘤科
出处
《肿瘤基础与临床》
2023年第4期286-292,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(81970184、82170183)。
文摘
目的 评估胰腺癌中卷曲蛋白6(FZD6)的表达及其与免疫浸润水平相关性,从而为临床决策和风险管理提供一定的科学依据。方法 利用GEO(GSE28735、GSE15471、GSE16515和GSE71729)、TCGA、GTEx和UALCAN数据库分析FZD6在胰腺癌患者和健康对照者中的基因、蛋白表达水平;运用GEPIA数据库探索FZD6与患者总生存期、无病生存期的关系;利用EMTAB-6134数据中的基因表达谱进行免疫浸润分析、富集通路分析;采用MEXPRESS数据库分析DNA甲基化、拷贝数变异与FZD6表达的相关性。结果 FZD6的mRNA水平(GSE28735:t=3.532,P<0.001、GSE15471:t=6.817,P<0.001、GSE16515:t=4.166,P<0.001,GSE71729:t=2.589,P=0.012,TCGA_GTEx:t=18.118,P<0.001)和蛋白水平(t=2.160,P=0.032)在胰腺癌中的表达均高于正常组织。生存分析显示FZD6高表达的患者的总生存率(HR=1.800,P=0.005)和无病生存率(HR=2.000,P=0.003)均低于FZD6低表达的患者。免疫浸润分析揭示,FZD6与肿瘤纯度评分呈正相关(r=0.280,P<0.001),与基质评分(r=-0.220,P<0.001)、免疫评分(r=-0.280,P<0.001)和ESTIMATE评分(r=-0.280,P<0.001)呈负相关;FZD6高表达组具有更低的免疫评分。富集分析结果显示,FZD6相关的基因主要参与免疫应答的细胞活化、免疫反应的激活、免疫反应-调节细胞表面受体等重要免疫相关通络。DNA甲基化分析发现3个与FZD6表达呈正相关的甲基化位点,9个与FZD6表达呈负相关的甲基化位点。结论 FZD6高表达与胰腺癌患者的不良预后相关,且FZD6与肿瘤纯度正相关,而与基质分数、免疫分数、ESTIMATE分数均呈负相关,有望作为胰腺癌患者预后预测的标志物和治疗靶点。
关键词
胰腺癌
卷曲蛋白6
预后
免疫浸润
Keywords
pancreatic cancer
frizzled
6
prognosis
immune infiltration
分类号
R735.9 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
微小RNA-29b靶向卷曲蛋白6参与急性髓系白血病细胞柔红霉素耐药的分子机制
被引量:
1
2
作者
赖思含
何莹
易海
机构
西部战区总医院血液科
出处
《武警医学》
CAS
2023年第4期295-300,共6页
文摘
目的探究微小RNA-29b(miR-29b)靶向卷曲蛋白6(FZD6)参与急性髓系白血病(AML)细胞柔红霉素(DNR)耐药的分子机制。方法CCK-8检测AML细胞系在不同DNR浓度下的生存能力,实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测AML细胞系中miR-29b的表达。选取THP-1细胞为研究对象,分为Control组(正常培养)、miR-NC mimics组(转染miR-NC mimics)、miR-29b mimics组(转染miR-29b mimics)、miR-29b mimics+pcDNA组(转染miR-29b mimics和pcDNA)、miR-29b mimics+pcDNA-FZD6组(转染miR-29b mimics和pcDNA-FZD6),转染24 h后使用10 mM DNR处理培养24 h。qRT-PCR和免疫印迹(Western blot)检测各组DNR处理的THP-1细胞中miR-29b和FZD6表达水平。生物信息学和双荧光素酶报告基因预测并检测miR-29b和FZD6靶向关系。CCK-8、Edu法和流式细胞术分别检测DNR处理的各组THP-1细胞增殖和凋亡情况。结果AML细胞系对DNR的耐药性是呈浓度依赖性的,qRT-PCR结果显示,miR-29b在AML细胞系THP-1(1.00±0.05)、KG-1(1.87±0.16)、HL-60(2.96±0.21)及Kasumi-1(3.73±0.29)中的表达逐渐增高(P<0.05)。双荧光素酶报告基因检测、qRT-PCR及Western blot证明miR-29b可直接负靶向FZD6(0.32±0.04,0.37±0.05,0.48±0.06,P<0.05)。miR-29b过表达可使AML细胞对DNR的耐药性减弱,抑制细胞增殖,增强细胞凋亡能力(43.59±5.24,21.97±3.13,P<0.05)。上调FZD6可一定程度上逆转上调miR-29b表达对THP-1细胞增殖和凋亡的影响(65.21±6.39,38.26±4.09,P<0.05)。结论miR-29b通过靶向抑制FZD6降低AML细胞对DNR的耐药性。
关键词
微小RNA-29b
卷曲蛋白6
急性髓系白血病
柔红霉素
耐药
Keywords
microRNA-29b
frizzled-
6
acute myeloid leukemia
daunorubicin
drug resistance
分类号
R557.3 [医药卫生—血液循环系统疾病]
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职称材料
题名
抑制成纤维细胞生长因子受体2-卷曲螺旋结构域蛋白6融合基因表达在人胆管癌异种移植小鼠的作用
3
作者
王绍清
王宇
李鸿梅
张宁
吴甜
机构
齐齐哈尔医学院病理学院
南方医科大学南方医院肝胆外科
出处
《中华实验外科杂志》
CAS
北大核心
2023年第7期1319-1321,共3页
基金
齐齐哈尔医学科学院项目(QMSI2017B-05)
齐齐哈尔市科技局社会发展攻关项目(SFGG201626)。
文摘
目的探究抑制成纤维细胞生长因子受体2-卷曲螺旋结构域蛋白6(FGFR2-CCDC6)表达在人胆管癌异种移植小鼠的抗肿瘤作用。方法选择购自美国模式培养物集存库(ATCC)的人正常肝内胆管上皮细胞HIBEC和稳定转染FGFR2-CCDC6表达质粒的人肝内胆管癌细胞系Hucct1, 分组为沉默FGFR2-CCDC6阴性对照(si-NC)组和沉默FGFR2-CCDC6(si-FGFR2-CCDC6)组。利用实时定量聚合酶链反应(RT-PCR)检测融合基因表达;蛋白质印迹法(Western blot)检测FGFR2、成纤维细胞生长因子2(FGF2)和磷酸化细胞外调节蛋白激酶(p-ERK1/2)蛋白表达。噻唑蓝(MTT)检测抑制FGFR2对细胞增殖的抑制作用。小鼠荷瘤模型探究抑制FGFR2表达对移植瘤体积的抑制作用。应用SPSS 21.0软件进行分析。结果 Hucct1中的FGFR2-CCDC6表达显著高于HIBEC(1.00±0.05比1.92±0.09, t=15.480, P<0.05);FGFR2、FGF2和p-ERK1/2的蛋白表达均明显高于HIBEC(FGFR2:0.54±0.03比1.29±0.05, t=20.360, FGF2:1.32±0.06比1.87±0.09, t=9.207, p-ERK1:0.84±0.05比1.54±0.07, t=14.920, p-ERK2:1.42±0.06比2.11±0.11, t=9.391, 均P<0.05)。si-FGFR2-CCDC6组的FGFR2-CCDC6的mRNA表达水平显著低于si-NC组(1.00±0.06比0.39±0.03, t=19.540, P<0.05);FGFR2、FGF2和p-ERK1/2的蛋白表达均显著低于si-NC组(FGFR2:1.32±0.05比0.77±0.04, t=13.080, FGF2:1.93±0.08比1.23±0.07, t=11.12, p-ERK1:1.48±0.07比0.73±0.06, t=15.260, p-ERK2:2.03±0.12比1.44±0.07, t=7.488, 均P<0.05);转染后24 h和48 h细胞增殖率明显低于si-NC组(24 h:0.74±0.06比0.48±0.04, t=6.245, 48 h:0.97±0.07比0.65±0.06, t=6.012, 均P<0.05)。小鼠荷瘤模型发现, si-FGFR2-CCDC6转染荷瘤组移植瘤体积明显小于si-NC参照组(598.00±50.00比476.00±39.00, F=12.530, P<0.05)。结论抑制FGFR2-CCDC6融合基因表达可抑制FGF2/FGFR2/p-ERK1/2通路的激活, 抑制细胞增殖和肿瘤生长, 进而发挥抑癌作用。
关键词
胆管癌
成纤维细胞生长因子受体2-
卷曲
螺旋结构域
蛋白
6
融合基因
异种移植
Keywords
Cholangiocarcinoma
Fibroblast growth factor receptor 2-coiled-coil domain containing
6
Fusion gene
Xenotransplantation
分类号
R735.8 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
卷曲蛋白6在胰腺癌中的表达及其与免疫浸润水平相关性分析
武晓龙
冯晓燕
张旭东
史存真
李鑫
张明智
《肿瘤基础与临床》
2023
0
下载PDF
职称材料
2
微小RNA-29b靶向卷曲蛋白6参与急性髓系白血病细胞柔红霉素耐药的分子机制
赖思含
何莹
易海
《武警医学》
CAS
2023
1
下载PDF
职称材料
3
抑制成纤维细胞生长因子受体2-卷曲螺旋结构域蛋白6融合基因表达在人胆管癌异种移植小鼠的作用
王绍清
王宇
李鸿梅
张宁
吴甜
《中华实验外科杂志》
CAS
北大核心
2023
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