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双向孟德尔随机化分析总胆固醇升高风险与胆石症发生风险的关系 被引量:2
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作者 赵伟伟 杜晓旭 戈宏焱 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2024年第3期573-580,共8页
目的 运用双向孟德尔随机化评估总胆固醇升高风险与胆石症发生风险之间的关联。方法 总胆固醇与胆石症相关的单核苷酸多态性数据来自open gwas公共数据库,对基于全基因组相关联研究(GWAS)的所有汇总数据进行二次数据分析,分别选择与总... 目的 运用双向孟德尔随机化评估总胆固醇升高风险与胆石症发生风险之间的关联。方法 总胆固醇与胆石症相关的单核苷酸多态性数据来自open gwas公共数据库,对基于全基因组相关联研究(GWAS)的所有汇总数据进行二次数据分析,分别选择与总胆固醇或者胆石症密切关联的遗传位点作为暴露或者结局变量,用Egger回归法、加权中位数法、IVW随机效应模型、IVW固定效应模型等方法进行双向孟德尔随机化分析,以OR值评价总胆固醇和胆石症之间的因果关系。结果 以总胆固醇为暴露、胆石症为结局,去除异质性前总胆固醇-胆石症的总体OR=0.91,95%CI:0.85~0.97;去除异质性后总胆固醇-胆石症的总体OR=0.93,95%CI:0.89~0.97。以胆石症为暴露、总胆固醇为结局,去除异质性前胆石症-总胆固醇的总体OR=0.20,95%CI:0.06~0.65;去除异质性后胆石症-总胆固醇的总体OR=0.28,95%CI:0.10~0.83。基因预测的总胆固醇和胆石症之间存在双向因果关系。结论 本研究证实了总胆固醇与胆石症之间的双向因果关系,随着遗传上有关能使总胆固醇水平升高的等位基因的增加,发生胆石症的风险降低。反之,随着遗传上有关能使胆石症发病增高的等位基因的增加,总胆固醇水平升高的风险降低。 展开更多
关键词 总胆固醇 胆石症 双向孟德尔随机化分析
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阿尔兹海默症和便秘:两样本双向孟德尔随机化研究
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作者 任招霞 易星宇 +1 位作者 李蓉 郭留学 《临床医学进展》 2024年第3期1582-1593,共12页
目的:采用双向两样本孟德尔随机化(MR)分析探讨阿尔茨海默病(Alzheimer’s Disease, AD)与便秘的因果关系,希望为临床防治提供理论依据。方法:使用公开的全基因组关联研究汇总数据集,运用逆方差加权法(IVW)、加权中位数法、MR-Egger回... 目的:采用双向两样本孟德尔随机化(MR)分析探讨阿尔茨海默病(Alzheimer’s Disease, AD)与便秘的因果关系,希望为临床防治提供理论依据。方法:使用公开的全基因组关联研究汇总数据集,运用逆方差加权法(IVW)、加权中位数法、MR-Egger回归法、简单模式(simple mode法)和加权模式(weighted mode法)进行两样本MR分析,评估AD与便秘的因果关系。结果:MR分析结果表明:AD与便秘增加存在正向因果关系(IVW: OR = 1.174, 95% CI: 1.068~1.290, P = 0.001),便秘与AD风险增加不存在因果关系(IVW: OR = 1.008, 95% CI: 0.977~1.039, P = 0.629)。在便秘对AD及其反向MR分析中,敏感性分析结果表明因果关系稳健,亦未检测到潜在的水平多效性。结论:两样本MR分析结果显示:AD与便秘风险增加存在正向因果关系,但便秘与AD风险增加不存在因果关系。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 便秘 因果关系 双向孟德尔随机化研究
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便秘与肺炎因果关系的双向孟德尔随机化分析
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作者 李舒冉 孙静 +7 位作者 孙绮悦 包蕾 耿子涵 赵荣华 鲍岩岩 崔晓兰 刘莲莲 郭姗姗 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第23期224-229,共6页
目的:通过双向、双样本孟德尔随机化(MR)分析探讨便秘与肺炎之间的双向因果关系,从新的视角理解二者之间的潜在联系。方法:从全基因组关联研究(GWAS)网站选取便秘数据集和肺炎数据集,均为2021年欧洲人群。其中与便秘有关的数据包含41162... 目的:通过双向、双样本孟德尔随机化(MR)分析探讨便秘与肺炎之间的双向因果关系,从新的视角理解二者之间的潜在联系。方法:从全基因组关联研究(GWAS)网站选取便秘数据集和肺炎数据集,均为2021年欧洲人群。其中与便秘有关的数据包含411623例样本,单核苷酸多态性(SNP)数据为24176599个;肺炎数据包含480299例样本,SNP数量为24174646个。该研究采用逆方差加权法(IVW)作为MR的主要分析方法,以加权中位数法、简单模型、加权模型和MR-Egger回归法等分析结果为补充,并进行敏感性分析以评估结果的稳健性。结果:最终纳入17个与便秘高度相关的SNP,12个与肺炎高度相关的SNP。正向MR分析中,IVW分析结果显示,便秘可增加肺炎发生风险[比值比(OR)=1.143,95%置信区间(95%CI)[1.045,1.249],P=0.003];MR-Egger回归法、简单模型、加权模型、加权中位数分析均支持该结果(P<0.05)。反向MR分析的IVW分析结果显示,肺炎不会增加便秘的患病风险(OR=1.138,95%CI[0.974,1.329],P=0.103);MR-Egger回归法、简单模型、加权模型、加权中位数分析亦均支持该结果。结论:利用双向、双样本MR分析方法从遗传变异角度印证便秘与肺炎之间存在因果关系,反之则不存在明显因果关系。该研究将有助于对便秘与肺炎的临床诊疗,为二者之间发病机制研究提供参考。 展开更多
关键词 便秘 肺炎 双向孟德尔随机化 因果关系 肠道菌群 肺-肠轴
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子痫前期与甲状腺功能减退的双向因果关系:来自孟德尔随机化的遗传证据
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作者 张烨潇 王一枭 +2 位作者 吴丹 周秀丽 乌兰 《西南医科大学学报》 2024年第3期206-209,共4页
目的通过孟德尔随机化(mendelian randomization,MR)方法分析子痫前期(pre-eclampsia,PE)与甲状腺功能减退之间是否存在因果关系。方法从Finngen数据库获取PE和甲状腺功能减退数据集,提取工具变量(instrumental variable,IV),应用逆方... 目的通过孟德尔随机化(mendelian randomization,MR)方法分析子痫前期(pre-eclampsia,PE)与甲状腺功能减退之间是否存在因果关系。方法从Finngen数据库获取PE和甲状腺功能减退数据集,提取工具变量(instrumental variable,IV),应用逆方差加权法等5种MR方法探究PE与甲状腺功能减退之间的因果关系。运用Cochran's Q、MR-Egger回归、MR-PRESSO、留一法等敏感性分析方法评价研究结果的稳定性和可靠性。结果逆方差加权法结果表明,PE与甲状腺功能减退之间没有因果关系(OR=1.024,95%CI:0.965~1.087,P=0.435),而甲状腺功能减退和PE风险之间存在潜在的正向因果关系(OR=1.097,95%CI:1.006~1.196,P=0.036)。其余四种MR分析方法表明甲状腺功能减退和PE风险之间的因果关系稳定。Cochrane's Q统计结果表明纳入的各IV之间不存在显著异质性,MR-Egger截距法和MRPRESSO法均未发现纳入的IV存在显著的水平多效性。但是,留一法结果表明多个IV在甲状腺功能减退和PE风险之间的因果关系中发挥决定性作用。结论本研究从遗传学角度切入,应用MR方法揭示了甲状腺功能减退和PE之间的因果关系,为子痫前期高风险人群的个性化管理和精准医疗提供了理论依据。 展开更多
关键词 甲状腺功能减退 子痫前期 双向孟德尔随机化 因果关系
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内在情感对癌症发生风险的影响:基于孟德尔随机化研究 被引量:1
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作者 杜钦 朱雨萱 +2 位作者 郭一泽 许楠馨 刘棣 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期376-382,共7页
目的探究内在情感(幸福感、抑郁情绪、忧虑和内疚感)与癌症(结直肠癌、肝癌、甲状腺癌、肺癌、乳腺癌)的因果关系。方法采用两样本双向孟德尔随机化方法。所有数据基于全基因关联研究(GWAS)汇总数据。逆方差加权法(IVW)得到的结果作为... 目的探究内在情感(幸福感、抑郁情绪、忧虑和内疚感)与癌症(结直肠癌、肝癌、甲状腺癌、肺癌、乳腺癌)的因果关系。方法采用两样本双向孟德尔随机化方法。所有数据基于全基因关联研究(GWAS)汇总数据。逆方差加权法(IVW)得到的结果作为主要结局指标,加权中值法(WM)、MR-Egger法作为补充结果,评价指标为比值比(OR),并进行敏感性分析。结果对于抑郁情绪,提示与肺癌(OR=1.005,95%CI:1.001~1.009,P=0.015)显著相关。对于忧虑,提示与乳腺癌(OR=1.199,95%CI:1.011~1.423,P=0.038)显著相关。对于内疚感,提示与甲状腺癌(OR=2.083,95%CI:1.080~4.017,P=0.029)显著相关。在去除MR-PRESSO检测到的所有潜在多效性SNPs后,忧虑与乳腺癌的关联无统计学差异(P=0.064),忧虑与结直肠癌显著相关(OR=0.739,95%CI:0.571~0.956,P=0.021)。癌症与内在情感之间的关联未发现存在因果关系。结论抑郁情绪与肺癌发生风险增加相关,内疚感与甲状腺癌发生风险增加相关,忧虑可能与结直肠癌发生风险降低相关。 展开更多
关键词 两样本双向孟德尔随机化 内在情感 癌症 全基因组关联研究 因果效应
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阿尔茨海默病和帕金森病的相关性:孟德尔随机化研究
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作者 白一涵 陈军磊 +4 位作者 马扬 任佳慧 宋明容 王飞龙 关慧波 《现代医学》 2024年第7期985-991,共7页
目的:基于双向孟德尔随机化(MR)方法探究阿尔茨海默病(AD)和帕金森病(PD)之间的相关性,为日后进行性神经退行性疾病的研究和治疗提供参考方向。方法:对AD和PD 2个全基因组关联研究(GWAS)的汇总数据进行分析,利用两组数据显著相关的单核... 目的:基于双向孟德尔随机化(MR)方法探究阿尔茨海默病(AD)和帕金森病(PD)之间的相关性,为日后进行性神经退行性疾病的研究和治疗提供参考方向。方法:对AD和PD 2个全基因组关联研究(GWAS)的汇总数据进行分析,利用两组数据显著相关的单核苷酸多态性(SNP)位点作为工具变量,所选用的GWAS数据均来源于欧洲人群。双向MR研究中采用逆方差加权法(IVW)、MR-Egger回归和加权中位数法进行分析评估两疾病的发病关联。经筛选后,最终以与AD相关的4个SNP作为工具变量,PD为研究结局进行正向MR分析;以与PD相关的17个SNP作为工具变量,AD作为研究结局进行反向MR分析。运用留一法、MR-Egger截距、离群值(PRESSO)对评估结果进行敏感性分析以确定多效性和单个SNP对相关性的影响程度。以比值比(OR)评价AD与PD的因果效应。结果:正向MR分析结果显示,差异无统计学意义(IVW:OR=0.0006,95%CI 2.6401×10^(-10)~1476.3674,P=0.324);反向MR分析结果显示,差异无统计学意义(IVW:OR=1.0003,95%CI 0.9999~1.0006,P=0.072)。IVW显示AD和PD之间不存在相关性(P>0.05)。Q检验及MR-Egger回归结果表明,AD和PD不存在异质性及基因的水平多效性(P>0.05)。结论:基于基因组水平上SNP研究分析,目前MR研究不支持AD与PD存在显著的因果关联,仍需要进一步的研究来更全面地评估它们之间的相关性。 展开更多
关键词 双向孟德尔随机化 阿尔茨海默病 帕金森病 相关性
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Dissecting Causal Relationships Between Plasma Metabolites and Osteoporosis:A Bidirectional Mendelian Randomization Study
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作者 Hao Lv Ge Zhang +3 位作者 Zhi-Mu Hu Qing-Song Chu Jiu-Xiang Wang Ting Jiang 《Chinese Medical Sciences Journal》 CAS CSCD 2024年第3期185-192,共8页
Objective To investigate the causal relationships between plasma metabolites and osteoporosis via Mendelian randomization(MR) analysis.Methods Bidirectional MR was used to analyze pooled data from different genome-wid... Objective To investigate the causal relationships between plasma metabolites and osteoporosis via Mendelian randomization(MR) analysis.Methods Bidirectional MR was used to analyze pooled data from different genome-wide association studies(GWAS). The causal effect of plasma metabolites on osteoporosis was estimated using the inverse variance weighted method, intersections of statistically significant metabolites obtained from different sources of osteoporosis-related GWAS aggregated data was determined, and then sensitivity analysis was performed on these metabolites. Heterogeneity between single nucleotide polymorphisms was evaluated by Cochran's Q test. Horizontal pleiotropy was assessed through the application of the MR-Egger intercept method and the MRPRESSO method. The causal effect of osteoporosis on plasma metabolites was also evaluated using the inverse variance weighted method. Additionally, pathway analysis was conducted to identify potential metabolic pathways involved in the regulation of osteoporosis.Results Primary analysis and sensitivity analysis showed that 77 and 61 plasma metabolites had a causal relationship with osteoporosis from the GWAS data in the GCST90038656 and GCST90044600 datasets, respectively. Five common metabolites were identified via intersection. X-13684 levels and the glucose-to-maltose ratio were negatively associated with osteoporosis, whereas glycoursodeoxycholate levels and arachidoylcarnitine(C20) levels were positively associated with osteoporosis(all P < 0.05). The relationship between X-11299 levels and osteoporosis showed contradictory results(all P < 0.05). Pathway analysis indicated that glycine, serine, and threonine metabolism, valine, leucine, and isoleucine biosynthesis, galactose metabolism, arginine biosynthesis, and starch and sucrose metabolism pathways were participated in the development of osteoporosis.Conclusion We found a causal relationship between plasma metabolites and osteoporosis. These results offer novel perspectives with important implications for targeted metabolite-focused interventions in the management of osteoporosis. 展开更多
关键词 OSTEOPOROSIS plasma metabolites mendelian randomization bidirectional analysis
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