基于叶绿体全基因组序列的双峰法鉴定粗茎秦艽及其近缘物种

粗茎秦艽Gentiana crassicaulis Duthie ex Burk.为中药“秦艽”的基原植物之一,而同为龙胆属秦艽组的西藏秦艽Gentiana tibetica King ex Hook.f.、粗壮秦艽Gentiana robusta King ex Hook.f.为其近缘的非国家药典品种。因存在较大的种内形态变异,粗茎秦艽与西藏秦艽、粗壮秦艽间表现出较高的形态相似性,且存在一定的同域分布,为粗茎秦艽的鉴定带来了一定的难度。为有效鉴定中药秦艽国家药典品种粗茎秦艽与其近缘的非药典品种,本文基于前期测定的粗茎秦艽、粗壮秦艽叶绿体基因组序列,首次测定西藏秦艽叶绿体基因组序列,筛选分子标记并构建这三个物种的分子鉴定方法。结果如下:①获得西藏秦艽叶绿体基因组序列,长度为148765 bp,大单拷贝区(LSC)、小单拷贝区(SSC)分别为81163 bp和17070 bp,反向重复区(IR)为25266 bp;②粗茎秦艽、西藏秦艽、粗壮秦艽的叶绿体基因组结构一致;粗茎秦艽与西藏秦艽的重复序列、SSR分布情况一致,两个物种间叶绿体基因组变异位点数仅为9;③筛选同时对这三个物种有效鉴定的单核苷酸多态性位点(SNP),并验证稳定性;④建立SNP双峰检测方法,对各物种及混合样品进行有效鉴定。本工作可为粗茎秦艽及其近缘物种的DNA分子鉴定,以及相关藏药品种的整理等工作提供基础资料。