目的利用反向分子对接技术和网络药理学分析方法,建立臭椿酮抗肿瘤的"化合物-靶标-通路-疾病"网络,并探究其潜在的作用机制。方法借助于Pharm Mapper服务器寻找臭椿酮抗肿瘤的潜在靶蛋白,并通过Kyoto Encyclopedia of Genes a...目的利用反向分子对接技术和网络药理学分析方法,建立臭椿酮抗肿瘤的"化合物-靶标-通路-疾病"网络,并探究其潜在的作用机制。方法借助于Pharm Mapper服务器寻找臭椿酮抗肿瘤的潜在靶蛋白,并通过Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)数据库对获取的靶点进行相关通路分析,进一步利用Cytoscape软件构建臭椿酮的"化合物-靶点-通路-疾病"相互关联网络。结果数据分析结果表明,臭椿酮对人源靶蛋白的102个潜在活性靶点、17条KEGG通路的作用与肿瘤相关。臭椿酮抗肿瘤作用于MAP2K1、PI3KR1、EGFR、GRB2、MDM2、MET等靶蛋白,其中有18、14和11个靶蛋白基因分别富集在肿瘤通路、蛋白多糖肿瘤通路、前列腺癌通路中,有6个靶蛋白基因分别富集在胶质瘤、黑色素瘤、子宫内膜癌、非小细胞肺癌通路中,主要通过细胞因子和细胞因子受体相互作用、磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B信号通路、过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路等起到抗肿瘤的作用。结论臭椿酮有望作为治疗前列腺癌、非小细胞肺癌、胶质瘤、黑色素瘤等多种肿瘤的一个新的潜在药物,该研究为臭椿酮治疗肿瘤的靶标研究、药理活性与临床应用研究提供了理论支撑。展开更多
凹叶木兰和中缅木莲在西南地区作为传统药用植物对于许多疾病有着较好的治疗价值,如行气平喘、化湿导滞、疏肝理气等功效。然而这两种传统药用植物在抗肿瘤活性方面的研究比较缺乏。因此我们利用计算机辅助药物设计(CADD)中的反向分子...凹叶木兰和中缅木莲在西南地区作为传统药用植物对于许多疾病有着较好的治疗价值,如行气平喘、化湿导滞、疏肝理气等功效。然而这两种传统药用植物在抗肿瘤活性方面的研究比较缺乏。因此我们利用计算机辅助药物设计(CADD)中的反向分子对接方法,结合PharmaDB药效团数据库对凹叶木兰、中缅木莲中所提取的18种化合物进行抗肿瘤或抗癌研究,并分析化合物与相关癌症靶标蛋白的相互作用机制。利用Discovery Studio 3.5软件的ADMET模块分析化合物的药代动力学和毒理性质。结果表明:14种化合物与相关癌症靶标蛋白具有一定结合性,其中5种化合物与相关癌症靶标蛋白结合的最好,经过药代动力学和毒理预测筛选出4种化合物在抗肿瘤活性方面具有较大潜力,值得进行下一步的药理实验。该结论为凹叶木兰和中缅木莲在抗肿瘤方面的研究提供了理论依据。展开更多
目的基于网络药理学技术预测苍术酮潜在靶标及可能药理作用。方法利用PharmMapper服务器的反向药效团匹配,将苍术酮与2241个人类蛋白靶标进行匹配,根据Normalized Fit Score的打分由高到低排序,重点分析前10个靶蛋白,再采用Systemsdock ...目的基于网络药理学技术预测苍术酮潜在靶标及可能药理作用。方法利用PharmMapper服务器的反向药效团匹配,将苍术酮与2241个人类蛋白靶标进行匹配,根据Normalized Fit Score的打分由高到低排序,重点分析前10个靶蛋白,再采用Systemsdock Web Site平台对具有疾病治疗价值的主要靶蛋白进行正向分子对接验证。结果发现苍术酮与二肽基肽酶Ⅳ、维甲酸β受体以及细胞维甲酸结合蛋白2结合较好,Dock score打分分别为7.105、6.948、6.842。结论反向药效团匹配和正向分子对接预测到的苍术酮主要潜在靶点有二肽基肽酶Ⅳ、维甲酸β受体、细胞维甲酸结合蛋白2,具有抗糖尿病、抗癌等药理作用。展开更多
文摘目的采用反向分子对接技术和网络药理学分析方法探讨吴茱萸次碱作用于心血管疾病的潜在机制。方法利用TCMSP数据库对吴茱萸次碱进行类药性评价,借助PharmMapper服务器反向对接预测吴茱萸次碱的潜在靶蛋白,并采用Comparative Toxicogenomics Database(CTD)数据库对获取的靶点进行疾病预测分析,进一步利用Cytoscape 3.6.0版软件构建吴茱萸次碱的“化合物-靶点-心血管疾病”网络;同时进行蛋白质-蛋白质相互作用分析和分子对接验证。通过Database for Annotation Visualization and Integrated Discovery(DAVID)数据库对潜在靶点进行通路富集预测分析。结果血红素加氧酶1(HMOX1)、凝血酶原2(F2)、血清白蛋白(ALB)、肾素(REN)和半胱氨酸蛋白酶-3(CASP3)等可能是吴茱萸次碱的关键靶点。吴茱萸次碱可能通过作用于这些靶点参与调控血管内皮生长因子(VEGF)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、缺氧诱导因子(HIF)-1等信号通路。结论吴茱萸次碱是一个潜在治疗心血管疾病的候选药物,其可能通过多靶点、多通路协同作用的机制发挥心血管保护作用。
文摘目的利用反向分子对接技术和网络药理学分析方法,建立臭椿酮抗肿瘤的"化合物-靶标-通路-疾病"网络,并探究其潜在的作用机制。方法借助于Pharm Mapper服务器寻找臭椿酮抗肿瘤的潜在靶蛋白,并通过Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)数据库对获取的靶点进行相关通路分析,进一步利用Cytoscape软件构建臭椿酮的"化合物-靶点-通路-疾病"相互关联网络。结果数据分析结果表明,臭椿酮对人源靶蛋白的102个潜在活性靶点、17条KEGG通路的作用与肿瘤相关。臭椿酮抗肿瘤作用于MAP2K1、PI3KR1、EGFR、GRB2、MDM2、MET等靶蛋白,其中有18、14和11个靶蛋白基因分别富集在肿瘤通路、蛋白多糖肿瘤通路、前列腺癌通路中,有6个靶蛋白基因分别富集在胶质瘤、黑色素瘤、子宫内膜癌、非小细胞肺癌通路中,主要通过细胞因子和细胞因子受体相互作用、磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B信号通路、过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路等起到抗肿瘤的作用。结论臭椿酮有望作为治疗前列腺癌、非小细胞肺癌、胶质瘤、黑色素瘤等多种肿瘤的一个新的潜在药物,该研究为臭椿酮治疗肿瘤的靶标研究、药理活性与临床应用研究提供了理论支撑。
文摘凹叶木兰和中缅木莲在西南地区作为传统药用植物对于许多疾病有着较好的治疗价值,如行气平喘、化湿导滞、疏肝理气等功效。然而这两种传统药用植物在抗肿瘤活性方面的研究比较缺乏。因此我们利用计算机辅助药物设计(CADD)中的反向分子对接方法,结合PharmaDB药效团数据库对凹叶木兰、中缅木莲中所提取的18种化合物进行抗肿瘤或抗癌研究,并分析化合物与相关癌症靶标蛋白的相互作用机制。利用Discovery Studio 3.5软件的ADMET模块分析化合物的药代动力学和毒理性质。结果表明:14种化合物与相关癌症靶标蛋白具有一定结合性,其中5种化合物与相关癌症靶标蛋白结合的最好,经过药代动力学和毒理预测筛选出4种化合物在抗肿瘤活性方面具有较大潜力,值得进行下一步的药理实验。该结论为凹叶木兰和中缅木莲在抗肿瘤方面的研究提供了理论依据。
文摘目的基于网络药理学技术预测苍术酮潜在靶标及可能药理作用。方法利用PharmMapper服务器的反向药效团匹配,将苍术酮与2241个人类蛋白靶标进行匹配,根据Normalized Fit Score的打分由高到低排序,重点分析前10个靶蛋白,再采用Systemsdock Web Site平台对具有疾病治疗价值的主要靶蛋白进行正向分子对接验证。结果发现苍术酮与二肽基肽酶Ⅳ、维甲酸β受体以及细胞维甲酸结合蛋白2结合较好,Dock score打分分别为7.105、6.948、6.842。结论反向药效团匹配和正向分子对接预测到的苍术酮主要潜在靶点有二肽基肽酶Ⅳ、维甲酸β受体、细胞维甲酸结合蛋白2,具有抗糖尿病、抗癌等药理作用。