腺病毒载体左侧反向末端重复区对下游基因表达特异性的影响

目的:研究腺病毒载体左侧反向末端重复区(ITR)对下游基因表达特异性的影响。方法:采用分子生物学方法及Gateway技术构建正反2个方向含有人端粒酶逆转录酶(hTERT)启动子及GFP报告基因的重组腺病毒载体。以含CMV启动子及GFP报告基因的重组腺病毒载体和不含任何启动子只含GFP报告基因的重组腺病毒载体作对照。重组腺病毒质粒经PacⅠ线性化后用脂质体转染法转染293A细胞,包装并扩增出重组腺病毒颗粒,TCID50测得滴度后分别以相同的感染复数感染4种肿瘤细胞,观察荧光表达情况。结果:携带正向和反向hTERT启动子的重组腺病毒载体在各细胞中荧光表达量无差异,无启动子的重组载体在腺病毒增殖比较强的细胞中有微弱荧光表达。结论:重组腺病毒左侧ITR能够影响上下游特异启动子及其调控基因表达,但对上下游基因的影响程度无明显差异,并且左侧ITR具有类启动子功能。

rps12基因在裸子植物中的分子进化式样

叶绿体rps12基因是所有叶绿体基因中最特殊的,由在基因组上相距甚远的两部分组成,含有3个外显子,经反式剪接作用编码核糖体小亚基S12蛋白.探究该基因的分子进化式样有助于理解该基因的进化过程及基因组特征.应用二代测序技术对南洋杉和柏木的叶绿体基因组进行测序;共选取78种裸子植物和2种蕨类植物,在系统发育背景下结合最大似然法,对rps12基因的进化速率、选择压力和适应性进化进行分析.结果显示,外显子3发生独立的碱基插入事件,发生插入的序列受到了更强的负选择作用;外显子2~3位于反向重复区,它们的替换率显著低于外显子1, rps12编码序列受到更强的负选择作用;适应性进化分析没有检测到正选择位点.结果表明,在裸子植物的进化过程中rps12基因结构稳定,并保持着相对较低的进化速率且表现出高度的保守特性;这为反向重复区具有降低的替换率提供了更多的证据,同时也揭示了裸子植物中存在的进化速率异质性现象.

荷花玉兰叶绿体全基因组高通量测序及结构解析

荷花玉兰是重要的药用、观赏及园林绿化植物.应用454高通量测序技术对荷花玉兰叶绿体全基因组进行测序,解析了其基因组结构,并与近缘物种基因组进行了比较分析.荷花玉兰叶绿体基因组全长为159623bp,两个反向互补重复区(IRs)长26563bp,被分隔的大单拷贝区(LSC)和小单拷贝区(SSC)长度分别为87757和18740bp.成功注释129个叶绿体基因,其中18个基因含有内含子.基因的种类、数目以及GC含量等与其他木兰科物种相类似.生物信息学分析获得218个SSR位点,大多位点富含A-T,具有碱基偏好性.木兰科物种的重复基序类型和丰度相对保守,有利于开发叶绿体基因组载体.木兰亚纲植物叶绿体基因组的大小及IR区边界的变化与ycf1的长度密切相关.采用30个物种叶绿体基因组的66个共有蛋白编码基因构建系统发育树,对木兰属在被子植物中的进化位置进行了探讨.荷花玉兰叶绿体全基因组序列的获得和结构解析对优良品种培育、叶绿体基因组工程、木兰科物种分子标记开发及系统发育关系的研究具有重要价值.