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计算受体和配体结合自由能的新方法 被引量:1
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作者 于玲 杨忠志 《分子科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期303-306,共4页
利用ABEEMσπ浮动电荷力场与连续介质模型相结合的方法,计算了受体和配体的结合自由能.将结合自由能分解为真空中的力场作用项、溶剂化能量以及熵效应.由于ABEEMσπ/MM方法充分考虑了外界环境发生变化引起的体系中各个位点之间的电荷... 利用ABEEMσπ浮动电荷力场与连续介质模型相结合的方法,计算了受体和配体的结合自由能.将结合自由能分解为真空中的力场作用项、溶剂化能量以及熵效应.由于ABEEMσπ/MM方法充分考虑了外界环境发生变化引起的体系中各个位点之间的电荷极化,因而极大地提高了结合自由能的计算精度.利用该方法计算的2个复合物的结合自由能与实验值的偏差均小于0.5kJ/mol. 展开更多
关键词 浮动电荷力场方法 连续介质模型 结合自由能 受体和配体
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Analysis of receptor-ligand binding by photoaffinity cross-linking
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作者 XU Bin WU Ling 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 2014年第2期232-242,共11页
Photoaffinity cross-linking is a fast developing technology for biomolecular interactions,including receptor-ligand binding.The chemical mechanisms of the most commonly used photoactivatable probes and their respectiv... Photoaffinity cross-linking is a fast developing technology for biomolecular interactions,including receptor-ligand binding.The chemical mechanisms of the most commonly used photoactivatable probes and their respective photochemistry are summarized.This review focuses on the expanding utilities of this technology as a result of recent advances in the(i)identification of receptor contact sites,(ii)monitoring ligand-induced receptor conformational changes,(iii)identification of global binding surfaces,(iv)binding mode analysis using bifunctional photo-probes,(v)application of biosynthetic photo-probes,and(vi)examples of novel target discovery using this technology.Limitations and future potential of this approach are also discussed. 展开更多
关键词 photoaffinity cross-linking receptor-ligand interaction photoscanning bifunctional photo-probe biosynthetic photo-probe novel receptor discovery
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