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PLS变量筛选法用于有机物透聚乙烯膜性能QSAR研究
被引量:
3
1
作者
张永红
刘树深
+2 位作者
肖乾芬
覃礼堂
夏之宁
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2011年第10期1232-1238,共7页
随着大量分子描述符应用于QSAR/QSPR,如何筛选出具有良好稳定性和预测能力的描述符集,成为亟待解决的一个瓶颈问题.将63个有机化合物的1664个描述符经过初步预选后,利用偏最小二乘(PLS)方法进行变量筛选,获得42个重要描述符;随机选择43...
随着大量分子描述符应用于QSAR/QSPR,如何筛选出具有良好稳定性和预测能力的描述符集,成为亟待解决的一个瓶颈问题.将63个有机化合物的1664个描述符经过初步预选后,利用偏最小二乘(PLS)方法进行变量筛选,获得42个重要描述符;随机选择43个有机物,针对透聚乙烯膜性能进行训练研究,得优良估计能力和良好稳定性模型(A=6,r2=0.9647,RMSE=0.213,q2=0.8364,RMSV=0.467);对模型外部20个有机物进行预测,表明模型具有良好预测能力(rp 2=0.9306,RMSP=0.326).PLS变量筛选法可以快速有效地筛选与活性密切相关的重要描述符,进而构建具有良好稳定性和预测能力的QSAR模型.
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关键词
变量
筛选
偏最小二乘(PLS)
变量
投影
性
指标
(
vip
)
定量构效关系(QSAR)
透聚乙烯膜
性
能
原文传递
题名
PLS变量筛选法用于有机物透聚乙烯膜性能QSAR研究
被引量:
3
1
作者
张永红
刘树深
肖乾芬
覃礼堂
夏之宁
机构
重庆医科大学药学院
同济大学环境科学与工程学院长江水环境教育部重点实验室
重庆大学生物工程学院
出处
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2011年第10期1232-1238,共7页
基金
国家水体污染控制与治理科技重大专项(No.2008ZX07421-001)资助项目
文摘
随着大量分子描述符应用于QSAR/QSPR,如何筛选出具有良好稳定性和预测能力的描述符集,成为亟待解决的一个瓶颈问题.将63个有机化合物的1664个描述符经过初步预选后,利用偏最小二乘(PLS)方法进行变量筛选,获得42个重要描述符;随机选择43个有机物,针对透聚乙烯膜性能进行训练研究,得优良估计能力和良好稳定性模型(A=6,r2=0.9647,RMSE=0.213,q2=0.8364,RMSV=0.467);对模型外部20个有机物进行预测,表明模型具有良好预测能力(rp 2=0.9306,RMSP=0.326).PLS变量筛选法可以快速有效地筛选与活性密切相关的重要描述符,进而构建具有良好稳定性和预测能力的QSAR模型.
关键词
变量
筛选
偏最小二乘(PLS)
变量
投影
性
指标
(
vip
)
定量构效关系(QSAR)
透聚乙烯膜
性
能
Keywords
variable selection
partial least squares(PLS)
variable importance in projection(
vip
)
QSAR
permeability coefficient
分类号
O631.3 [理学—高分子化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PLS变量筛选法用于有机物透聚乙烯膜性能QSAR研究
张永红
刘树深
肖乾芬
覃礼堂
夏之宁
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2011
3
原文传递
已选择
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参考文献
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