福建漳江口红树林沉积物中的古菌类群

利用环境16S rRNA基因序列分析技术,对福建漳江口红树林沉积物中存在的古菌类群进行检测。首先提取红树林沉积物的总DNA,并进一步构建环境16SrRNA基因克隆文库。随机挑选文库克隆,根据Amplified rDNAre-striction analysis(ARDRA)分析分型后进行测序。对所测序列进行系统进化分析。结果显示,文库中的大部分古菌克隆(95%)分别属于广古菌门(Euryarchaeota)中的Marine benthic group D和泉古菌门(Crenarchaeota)的Miscellaneous crenarchaeotic group和Marine group I等3个已描述的古菌类群,另有小部分克隆(5%)可能代表广古菌门中新的古菌类群。Miscellaneous crenarchaeotic group类群古菌是红树林沉积物中古菌的优势类群。上述古菌类群的检测加深了人们对于红树林古菌群落结构复杂性及其生态学意义的认识。

浓香型白酒窖泥古菌群落结构研究及其系统发育学分析

本试验分别提取30、100和200年窖龄窖泥样品总DNA，采用PCR-DGGE和16SrDNA测序技术探索浓香型白酒不同窖龄窖泥古菌群落演替规律，结果表明：不同窖龄窖泥的古菌DGGE图谱均出现1和17条较清晰的条带，其中第4、7、11号条带在所有样品中均有检出，且优势度较高，均在4％以上；不同窖龄窖泥的古菌群落多样性指数都在1．91-2．29之间，且随窖龄的增加而呈现上升趋势；不同窖龄窖泥的古菌相似性指数在0．43-0．61之间，30年与100年窖泥古菌群落相似性指数达到了0．6l且聚为一类，与200年古菌群落相似性指数相比较却分为两类。PCR-DGGE图谱优势条带割胶测序结果显示：他们分属于产甲烷古菌（Methanogenic archaeon）、甲烷袋状菌属（Methanoculleussp）、甲烷八叠球菌属（Methanosarcinalesarchaeon）、瘤胃古菌属（Rumenarchaeon）四个类群。本研究结果对浓香型白酒窖泥古菌群落有了一定的认识。

不同窖龄窖泥古菌的系统发育多样性分析

为探索不同窖龄窖泥古菌类群与演替规律，分别提取20、50和150年窖龄窖泥样品总DNA，应用PCR—ARDRA和16SrDNA克隆测序技术对不同窖龄窖泥古菌群落结构进行研究．结果表明：191个克隆子分成22个可操作分类单元（OTUs），系统发育分析归为6个类群，分别属于甲烷八叠球菌属（Methanosarcina）、甲烷杆菌属（Methanobacterium）、甲烷袋状菌属（Methanoculleus）、甲烷粒菌属（Methanocorpuseulum）、甲烷鬃菌属（Methanosaeta）和甲烷螺菌属（Methanospirillum）．不同窖龄窖泥的优势古菌类群有明显差异，20年窖泥优势古茵类群以乙酸利用型Methanosarcina、Methanosaeta为主，50年、150年龄窖泥优势古菌类群以氢气营养型Methanocorpusculum、Methanobacterium为主；随着窖龄的增加，窖泥古菌Shannon．Wiener多样性指数（日）和Berger-Parker优势度指数（D）呈增加的趋势，Pielou均匀度指数（，）呈降低趋势；不同窖龄窖池古菌的相似性系数为0．429～0．677，50年和150年窖泥的菌群结构最为相似．本研究揭示了不同窖龄窖泥古菌系统发育多样性的差异与窖泥老熟的关系．

高浓度酒精废水厌氧处理工程系统中古菌多样性及其代谢特征

颗粒污泥形成快、抗冲击能力强、悬浮性好是新型高浓度有机废水厌氧处理系统的重要特征。为了研究颗粒污泥中古菌组成多样性及其功能特征,采集活性污泥样品,提取总基因组DNA,应用PCR-DGGE和16S rDNA克隆测序技术对系统内古菌群落进行研究。结果表明:古菌克隆文库中克隆子的近缘种归属于Methanosaeta、Methanosarcina、Methanobacterium和Methanomethylovorans 4个类群,所占文库容量比例依次为58.2%、23.6%、12.7%和3.6%,1个克隆子未能找到相似菌株,占1.8%。系统发育分析找到了未知克隆子C10、C11、C13和C19的相似菌株FJ618821、AB479397、AJ244290和AB447878,并明确相应的分类地位。古菌类群以乙酸利用型Methanosaeta、Methanosarcina为主,说明甲烷形成过程以乙酸途径为主。中间代谢产物VFAs组成与不同产甲烷菌代谢功能分析的结果证明了古菌群落组成多样性与其代谢功能的对应关系。