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青藏高原东缘溪流型小微湿地沉积物古菌群落的海拔分布格局及驱动因素
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作者 郭云 仲波 +7 位作者 李娜英 李贤祥 张慧 杨早 蒋海波 王晓锋 杨刚 何奕忻 《湖泊科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1506-1515,I0021-I0026,共16页
小微湿地广泛分布于河流源头区域,对维持生态系统稳定性以及提供生态系统服务发挥着重要作用,微生物在其中扮演着重要角色,但当前对小微湿地沉积物中微生物群落尤其是古菌群落的海拔分布格局尚不清楚。因此,基于16S rRNA基因测序技术,... 小微湿地广泛分布于河流源头区域,对维持生态系统稳定性以及提供生态系统服务发挥着重要作用,微生物在其中扮演着重要角色,但当前对小微湿地沉积物中微生物群落尤其是古菌群落的海拔分布格局尚不清楚。因此,基于16S rRNA基因测序技术,本研究调查了岷江上游5个海拔梯度(1000、1600、2000、2700和3200 m)溪流型小微湿地的水文特征、水体理化性质、沉积物古菌群落的组成和多样性等指标。结果表明,岷江上游溪流型小微湿地沉积物中古菌群落组成在海拔梯度上存在显著差异,群落α多样性随海拔升高而显著增加,β多样性在海拔梯度上差异显著。距离衰减分析表明,古菌群落的时空分布与海拔梯度显著相关,进一步的冗余分析证实了溶解性总氮、总氮、溶解性总磷及pH是影响古菌群落结构的主要水体理化因素,浊度和水深是影响古菌群落结构的主要水文因素。综上所述,本研究厘清了岷江上游溪流型小微湿地沉积物古菌群落沿海拔梯度的分布格局,揭示了溪流型小微湿地中水文和水体理化性质共同调控沉积物古菌群落的海拔分布格局,为理解青藏高原自然小微湿地古菌群落海拔分布的生物地理分布提供了科学依据。 展开更多
关键词 群落组成 多样性 水体理化性质 水文
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连栽对木麻黄人工林根际土壤古菌群落变化的影响
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作者 张清旭 李建鹃 +6 位作者 王裕华 彭艳晖 王炎炎 郭玥 胡明玥 林文雄 吴则焰 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2024年第3期106-117,共12页
[目的]探究连栽对木麻黄人工林根际土壤古菌群落变化的影响,为探明木麻黄连栽障碍机制提供基础理论依据。[方法]以3个不同连栽代数(第一代First continuous plantation,FCP;第二代Second continuous plantation,SCP;第三代Third continu... [目的]探究连栽对木麻黄人工林根际土壤古菌群落变化的影响,为探明木麻黄连栽障碍机制提供基础理论依据。[方法]以3个不同连栽代数(第一代First continuous plantation,FCP;第二代Second continuous plantation,SCP;第三代Third continuous plantation,TCP)的木麻黄人工林根际土壤为材料,以未种植木麻黄的天然乔木林根际土壤作为对照(CK),通过Illumina NovaSeq测序平台对古菌群落进行高通量测序。[结果]从3个不同连栽代数木麻黄人工林根际土壤和对照土壤中总共得到1 146 390条有效序列,以100%序列相似度聚类得到998 515个ASV。Alpha多样性分析结果表明,所观察到的物种数和Chao1指数均随着连栽代数的增加呈现下降的趋势,而Shannon指数、Simpson指数和pielou_e均以FCP最高,TCP次之,SCP最低。Beta多样性分析、PCoA分析、UPGMA聚类分析和Anosim分析结果表明,不同连栽代数木麻黄根际土壤古菌群落物种多样性存在差异,但不同组间差异不显著。共检测到5个门,优势菌门为奇古菌门(Thaumarchaeota),且奇古菌门占比随着栽植代数的增加呈现下降的趋势,与对照相比,FCP、SCP、TCP分别下降了17.42%、50.97%、51.51%。古菌群落与土壤理化性质相关性分析结果显示,奇古菌门与pH、全钾(TK)、全氮(TN)、全磷(TP)呈显著正相关,泉古菌门与速效磷(AP)和速效氮(AN)呈显著正相关,不同古菌群落与土壤理化因子之间的相关性存在显著差异。[结论]本研究证实了木麻黄人工林经过多代连续栽植后,根际土壤古菌群落结构发生显著变化,推测古菌群落结构失衡是导致土壤微生态失衡的重要原因之一。研究结果为揭示木麻黄人工林连栽障碍形成的原因提供了理论依据。 展开更多
关键词 连栽障碍 木麻黄 高通量测序 根际 群落
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南方典型母质发育稻田土壤氨氧化细菌和古菌群落结构特征
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作者 俎诗佩 彭德元 +3 位作者 王振华 刘毅 秦红灵 张俊忠 《土壤》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期548-556,共9页
依托中国科学院桃源农业生态试验站水稻土易地置土长期定位试验,以广东英利(YL,发育于玄武岩风化物)、江西鹰潭(YT,发育于第四纪红黏土)和湖南桃源古市(TYG,发育于河流冲积物)3种母质发育稻田土壤为供试土壤,采用常规土壤农化分析方法测... 依托中国科学院桃源农业生态试验站水稻土易地置土长期定位试验,以广东英利(YL,发育于玄武岩风化物)、江西鹰潭(YT,发育于第四纪红黏土)和湖南桃源古市(TYG,发育于河流冲积物)3种母质发育稻田土壤为供试土壤,采用常规土壤农化分析方法测得3种土壤的理化性质、硝化速率,并结合实时荧光定量PCR技术和Illumina MiSeq测序技术,分析了土壤氨氧化古菌(AOA)和氨氧化细菌(AOB)种群丰度及群落结构的异同。结果表明:土壤硝化速率除分蘖期外,均表现为:YT>YL>TYG。YL与YT土壤中AOA数量占主导地位,AOA/AOB比值分别在0.72~3.05、0.98~1.52;TYG土壤中AOB数量占主导地位,AOA/AOB比值在0.21~0.75。群落组成方面,不同母质土壤间AOA、AOB群落结构差异显著,3种土壤AOA优势菌属各不相同,AOB优势菌属均为Nitrosospira。冗余分析表明,pH和可溶性有机碳是造成AOA、AOB群落结构差异的核心因子。综上,在环境背景均统一的前提下,不同母质发育稻田土壤理化性质之间依旧存在差异,这种差异影响着氨氧化微生物AOA、AOB的丰度以及群落结构。 展开更多
关键词 土壤母质 稻田土壤 氨氧化细 氨氧化
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饲料中添加高羊毛氨酸硒对陕北白绒山羊羯羊瘤胃古菌结构与组成的影响
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作者 李托 李陇平 屈雷 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第2期331-341,共11页
为明确不同剂量高羊毛氨酸硒(SeHLan)对陕北白绒山羊羯羊瘤胃古菌结构与组成的影响,本研究选取发育一致的陕北白绒山羊羯羊32只,均分为4组,分别饲喂硒含量为0.016 mg/kg(CK)、0.300 mg/kg、0.600 mg/kg和1.200 mg/kg的饲料,饲养70 d后,... 为明确不同剂量高羊毛氨酸硒(SeHLan)对陕北白绒山羊羯羊瘤胃古菌结构与组成的影响,本研究选取发育一致的陕北白绒山羊羯羊32只,均分为4组,分别饲喂硒含量为0.016 mg/kg(CK)、0.300 mg/kg、0.600 mg/kg和1.200 mg/kg的饲料,饲养70 d后,采集羯羊瘤胃液,提取DNA并利用古菌特异性引物进行PCR扩增,对古菌V4-V5区进行高通量测序和羯羊瘤胃液古菌结构与组成分析。结果表明:随着SeHLan添加量增加,各处理瘤胃液古菌α多样性指数呈现出先降低后增高的变化趋势,但处理间瘤胃液古菌α多样性指数差异均不显著。各处理瘤胃液,在门水平上广古菌门(Euryarchaeota)古菌,在科水平上甲烷短杆菌科(Methanobacteriaceae)古菌,在属水平上甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)古菌的相对丰度均接近80%,且随着饲料中SeHLan添加量增加,相对丰度呈现先降低后升高的变化趋势。0.600 mg/kg硒含量饲料处理的羯羊瘤胃液在门水平上广古菌门(Euryarchaeota)古菌,在科水平上甲烷杆菌科(Methanobacteriaceae)古菌,在属水平上甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)古菌,相对丰度显著低于其他3个处理。综上所述,饲料中添加SeHLan显著影响陕北白绒山羊羯羊瘤胃液古菌组成及结构,0.600 mg/kg硒含量饲料处理的羯羊瘤胃产甲烷菌丰度显著低于其他处理。 展开更多
关键词 高羊毛氨酸硒 陕北白绒山羊羯羊 高通量测序 瘤胃
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断奶仔猪肠道古菌菌群结构功能与腹泻的相关性研究
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作者 潘成麟 宋彤星 +5 位作者 章啸君 楼芳芳 胡旭进 屠平光 肖英平 吕文涛 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期4755-4764,共10页
【目的】研究断奶仔猪肠道古菌菌群结构功能,分析古菌与断奶仔猪腹泻的相关性,为防治断奶仔猪腹泻提供理论依据。【方法】选取同批次24日龄健康断奶仔猪(H组)和腹泻断奶仔猪(D组)各32头,采集粪便后通过16S rRNA基因测序分析两组粪便样... 【目的】研究断奶仔猪肠道古菌菌群结构功能,分析古菌与断奶仔猪腹泻的相关性,为防治断奶仔猪腹泻提供理论依据。【方法】选取同批次24日龄健康断奶仔猪(H组)和腹泻断奶仔猪(D组)各32头,采集粪便后通过16S rRNA基因测序分析两组粪便样本古菌菌群结构,使用PICRUSt2软件预测肠道古菌功能,分析差异古菌与断奶仔猪腹泻的相关性。【结果】健康和腹泻断奶仔猪腹泻评分差异显著(P<0.05)。广古菌门(Euryarchaeota)、泉古菌门(Crenarchaeota)和奇古菌门(Thaumarchaeota)为健康和腹泻仔猪优势古菌菌门;健康仔猪优势菌属为甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)、Euryarchaeota_norank和甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)。腹泻仔猪优势菌属为Euryarchaeota_norank、甲烷八叠球菌属和甲烷短杆菌属。腹泻仔猪菌群多样性和丰富度高于健康仔猪,且健康和腹泻断奶仔猪的古菌菌群结构和功能差异显著(P<0.05),古菌菌群结构差异主要体现在甲烷八叠球菌属、Euryarchaeota_norank、恐硫球菌属(Sulfophobococcus)、Nitrosarchaeum、热网菌属(Pyrodictium)等菌属上;古菌菌群功能差异主要体现在脂多糖的生物合成、氨基酸生物合成、抗原处理和表达等通路上。相关性分析发现,甲烷八叠球菌属、恐硫球菌属、Euryarchaeota_norank、甲烷暖球菌属(Methanocaldococcus)、火球菌属、甲烷卵圆形菌属(Methanocalculus)和Nitrosarchaeum的相对丰度与断奶仔猪腹泻均显著相关(P<0.05)。【结论】健康和腹泻断奶仔猪肠道古菌菌群结构和功能存在显著差异,腹泻断奶仔猪Euryarchaeota_norank相对丰度较高,而甲烷八叠球菌属相对丰度较低,Euryarchaeota_norank、甲烷八叠球菌属和恐硫球菌属与断奶仔猪腹泻存在相关性。 展开更多
关键词 断奶仔猪 腹泻 16S rRNA
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产甲烷古菌甲基转移酶研究进展
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作者 杨清 白丽萍 《中国沼气》 CAS 2024年第2期3-12,共10页
产甲烷古菌是一类能够通过产甲烷代谢生长的严格厌氧微生物。甲基营养型产甲烷古菌主要通过利用甲基类化合物如甲醇、甲胺、甲硫醚、甲氧基芳香族化合物等产CH 4。除了H 2依赖性甲基还原途径外,其余所有产甲烷途径中均含有MtrA-H甲基转... 产甲烷古菌是一类能够通过产甲烷代谢生长的严格厌氧微生物。甲基营养型产甲烷古菌主要通过利用甲基类化合物如甲醇、甲胺、甲硫醚、甲氧基芳香族化合物等产CH 4。除了H 2依赖性甲基还原途径外,其余所有产甲烷途径中均含有MtrA-H甲基转移酶,而甲基营养型产甲烷途径还包含底物特异性的甲基转移酶,负责裂解底物产生甲基并将其转移到一碳载体HS-CoM或H 4MPT。这些甲基转移酶在识别底物的蛋白结构上存在差异,但它们都含有高度保守的类咕啉结合蛋白以及辅因子cobalamin。总结了产甲烷古菌中甲基转移酶的分类、生理功能、结构特征及催化机制的研究进展,并对未来甲基转移酶的研究方向进行了展望。 展开更多
关键词 产甲烷 甲基转移酶 蛋白结构 催化机制
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荒漠孑遗植物沙冬青根部土壤古菌多样性
7
作者 王佳玮 易嘉敏 +3 位作者 刘建利 李晨 康鹏 王丽霞 《中国草地学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期117-125,共9页
孑遗植物沙冬青是西鄂尔多斯荒漠生态系统唯一强旱生常绿阔叶灌木。古菌是组成土壤微生物系统的重要组成部分,在土壤生物地球化学循环中扮演着重要角色,影响植物的生长、生产力、适应性、多样性及健康状况。研究与沙冬青根部共存数千万... 孑遗植物沙冬青是西鄂尔多斯荒漠生态系统唯一强旱生常绿阔叶灌木。古菌是组成土壤微生物系统的重要组成部分,在土壤生物地球化学循环中扮演着重要角色,影响植物的生长、生产力、适应性、多样性及健康状况。研究与沙冬青根部共存数千万年的土壤古菌群落,对科学保护沙冬青,乃至维持脆弱的西鄂尔多斯荒漠生态系统稳定性有特殊意义。本试验采用16S rDNA扩增子高通量测序技术,以裸地土为对照,分析比较沙冬青根际土、非根际土中古菌多样性及群落物种组成,旨在探明沙冬青根部土壤古菌群落在不同土壤区室中的变化规律。结果表明,与裸地土和非根际土相比,沙冬青根际土中营养元素含量增高;非根际土古菌群落多样性和丰富度均高于根际土和裸地土;奇古菌门亚硝化球菌纲亚硝化球菌科是沙冬青根部土壤优势类群,亚硝化球菌科未分类属(unclassified_f__Nitrososphaeraceae)越靠近根际其相对丰度越高,亚硝化球菌科未定属(norank_f__Nitrososphaeraceae)和暂定亚硝化球菌属(Candidatus_Nitrososphaera)却越靠近根际其相对丰度越低。此外,根际土古菌全部来自非根际土,而非根际土中古菌只有48.8%来自裸地土,其余来自非土壤生境。因此,沙冬青根部土壤古菌群落以参与土壤氮循环氨氧化(亚硝化)过程的类群为主,宿主植物显著影响沙冬青根部土壤不同区室古菌群落组装。 展开更多
关键词 沙冬青 群落 多样性 西鄂尔多斯荒漠
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基于荧光定量PCR技术分析草海沉积物中氨氧化古菌和细菌的空间分布特征
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作者 徐霞 李怡 张晓芳 《贵州农业科学》 CAS 2024年第3期121-126,共6页
【目的】探明贵州草海表层沉积物中氮循环微生物的丰度、群落结构及其分布规律,为研究湖泊沉积物氮循环机理和开展湖泊生态修复提供理论参考。【方法】通过实时荧光定量PCR技术测定不同季节草海表层沉积物中氨氧化古菌(AOA)与氨氧化细菌... 【目的】探明贵州草海表层沉积物中氮循环微生物的丰度、群落结构及其分布规律,为研究湖泊沉积物氮循环机理和开展湖泊生态修复提供理论参考。【方法】通过实时荧光定量PCR技术测定不同季节草海表层沉积物中氨氧化古菌(AOA)与氨氧化细菌(AOB)的丰度,同时测定沉积物、间隙水及上覆水体理化因子,分析各环境因子对AOA amoA和AOB amoA的分布影响。【结果】AOA amoA和AOB amoA基因丰度分别为7.81×103~4.11×106 copies/g和3.50×10^(2)~8.11×10^(4) copies/g,amoA拷贝数在各采样区域差异显著,具有空间分布特征,湖岸带AOA amoA与AOB amoA基因丰度较低。草海沉积物中AOA/AOB为2.3~181.4。草海沉积物整体有机质含量为65.57~436.30 g/kg,总磷为3.870~5.640 g/kg,全氮为0.585~1.252 g/kg;间隙水氨氮和硝酸盐氮浓度分别为0.283~2.082 mg/L和0.007~0.060 mg/L。【结论】AOA在草海氨氧化过程发挥主要作用。AOA amoA基因丰度受有机质和总氮影响,AOB amoA基因丰度受溶解氧和总磷影响。 展开更多
关键词 草海 沉积物 氨氧化细 氨氧化 实时荧光定量 丰度
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淡水和海洋沉积物中N-DAMO古菌对聚氯乙烯微塑料的响应研究
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作者 有海荣 刘帅 《山东化工》 CAS 2024年第18期44-48,共5页
硝酸盐型厌氧甲烷氧化(Nitrate-dependent anaerobic methane oxidation,N-DAMO)对自然环境中的甲烷减排起着重要作用。近年来,由于人类活动的影响,自然环境中的微塑料含量逐渐增加。然而,微塑料对N-DAMO古菌的生态分布及功能的影响尚... 硝酸盐型厌氧甲烷氧化(Nitrate-dependent anaerobic methane oxidation,N-DAMO)对自然环境中的甲烷减排起着重要作用。近年来,由于人类活动的影响,自然环境中的微塑料含量逐渐增加。然而,微塑料对N-DAMO古菌的生态分布及功能的影响尚不清楚,微塑料在甲烷减排中的作用有待探究。本研究以淡水和海洋沉积物为对象,利用同位素示踪技术和分子生物学手段研究了不同聚氯乙烯微塑料浓度处理下沉积物中N-DAMO古菌的活性,丰度及多样性。结果表明:聚氯乙烯微塑料在短期内显著提高淡水和海洋沉积物N-DAMO古菌活性。聚氯乙烯微塑料对海洋沉积物中的N-DAMO古菌活性刺激更强。加入微塑料后,淡水和海洋沉积物的N-DAMO古菌多样性均发生改变,海洋沉积物中的N-DAMO古菌群落结构更容易受到微塑料影响。 展开更多
关键词 厌氧甲烷氧化 N-DAMO 海洋生态系统 淡水生态系统 微塑料污染
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绰墩山遗址古水稻土细菌与古菌群落的PCR-DGGE分析 被引量:10
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作者 申卫收 尹睿 +3 位作者 林先贵 褚海燕 胡正义 曹志洪 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期2916-2924,共9页
江苏苏州绰墩山遗址考古发掘中,发现了在剖面不同深度埋藏的距今约6280a的新石器时期灌溉古水稻田土层和距今约3320 a的商周时期的古水稻田土层。为了解古代水稻种植活动对土壤中细菌、古菌及产甲烷古菌群落多样性的影响,以土壤剖面P... 江苏苏州绰墩山遗址考古发掘中,发现了在剖面不同深度埋藏的距今约6280a的新石器时期灌溉古水稻田土层和距今约3320 a的商周时期的古水稻田土层。为了解古代水稻种植活动对土壤中细菌、古菌及产甲烷古菌群落多样性的影响,以土壤剖面P-01(包含100-116cm新石器时期水稻土,42-57cm商周时期水稻土,0-15cm现代水稻土和174-200cm土壤母质)为对象,利用细菌、古菌及产甲烷古菌群落16S rDNA的高可变区V3区的PCR-DGGE分析技术,研究了不同土层细菌、古菌及产甲烷古菌群落多样性。结果表明:利用PCR-DGGE技术成功获得了古水稻土细菌、古菌及产甲烷古菌群落的分子指纹图谱。现代水稻土、商周时期古水稻土和新石器时期古水稻土中细菌、古菌及产甲烷古菌群落的DGGE条带类型各不相同,并且DGGE条带类型都较母质层丰富多样。UPGAMA聚类分析可以将不同时期水稻土及母质层的细菌、古菌及产甲烷古菌群落区分开来。埋藏古水稻土中仍有较多的细菌、古菌与产甲烷古菌存活。与母质层相比,不同时期水稻种植活动均增加了细菌、古菌与产甲烷古菌群落多样性。不同时期水稻种植活动可以引起特异性的细菌、古菌与产甲烷古菌群落发育,而且不同的栽培措施可能导致不同的优势种群。 展开更多
关键词 水稻土 新石器时代 DGGE 产甲烷
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内蒙古锡林浩特地区嗜盐古菌多样性的研究 被引量:23
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作者 潘海莲 周成 +2 位作者 王红蕾 薛燕芬 马延和 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期1-6,共6页
从内蒙古锡林浩特地区3个不同的盐湖中共分离到165株古菌,通过ARDRA分析后得到不同的类群,从各个类群中随机选取1—2个代表菌株进行16S rDNA序列测定和系统发育的分析。结果表明分离的菌株分布在Halorubrum,Natronococcus,Natronoru... 从内蒙古锡林浩特地区3个不同的盐湖中共分离到165株古菌,通过ARDRA分析后得到不同的类群,从各个类群中随机选取1—2个代表菌株进行16S rDNA序列测定和系统发育的分析。结果表明分离的菌株分布在Halorubrum,Natronococcus,Natronorubrum,Haloterrigena,Halorhabdus,Halobiforma,Haloarcula,Haloferax8个属和另外两个分支中,表现了锡林浩特地区嗜盐古菌的多样性。部分菌株的16S rDNA序列同源性低于97%,可能是潜在的新属或新种,代表了该地区嗜盐古菌的独特类型。 展开更多
关键词 盐湖 嗜盐 ARDRA 16S RDNA
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用DGGE和Real-Time PCR对低温沼气池中产甲烷古菌群落的研究 被引量:23
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作者 王彦伟 徐凤花 +3 位作者 阮志勇 宋金龙 王庆 赵斌 《中国沼气》 北大核心 2012年第1期8-12,共5页
利用DGGE及Real-Time PCR技术对不同地区低温沼气池中沼泥行进发酵前期、后期产甲烷古菌群落变化进行了研究。DGGE技术用于分析发酵前后产甲烷古菌优势群落的变化;Real-Time PCR技术用于分析发酵前期、后期样品产甲烷古菌的数量变化。... 利用DGGE及Real-Time PCR技术对不同地区低温沼气池中沼泥行进发酵前期、后期产甲烷古菌群落变化进行了研究。DGGE技术用于分析发酵前后产甲烷古菌优势群落的变化;Real-Time PCR技术用于分析发酵前期、后期样品产甲烷古菌的数量变化。结果表明,沼气低温发酵的过程中,不同沼泥样品发酵前期、后期产甲烷古菌的优势群落差异明显且数量上也存在较大差异;主要变化的产甲烷古菌的优势群落为甲烷粒菌属(Methanocor-pusculum),甲烷八叠球菌属(Methanosarcina),甲烷鬃毛菌属(Methanosaeta)。甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)在黑龙江沼泥样品(A1)发酵后期成为优势群落,甲烷鬃毛菌属(Methanosaeta)在山东发酵前期(B1),后期样品(B2)及安徽发酵前期样品(C1)中占有绝对优势。产甲烷古菌的数量介于104~105个.mL-1之间,其中黑龙江样品中产甲烷菌数量最多,而安徽样品中产甲烷菌数量最少。 展开更多
关键词 沼泥 产甲烷 DGGE REAL-TIME PCR
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扬州古运河沿岸生态林主要绿化树种抑菌功能的初步研究 被引量:21
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作者 李晓储 蒋继宏 +3 位作者 陈凤美 刘群 黄利斌 何小弟 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第6期129-133,共5页
The paper reported antimicrobial function of different trees species in woodland along the Grand Canal, Yangzhou, China, at 16:30-17:00, Sep 5, 2004. The tested result showed that in different communities of Platyclad... The paper reported antimicrobial function of different trees species in woodland along the Grand Canal, Yangzhou, China, at 16:30-17:00, Sep 5, 2004. The tested result showed that in different communities of Platycladus orientalis,Osmanthus fragrans, Cedrus deodara, Albizzia julibrissin, Cinnamomum camphora had antibacterial action. The content of pollutant bacteria in the forest atmosphere (1.5~1.8 m above the land) decreased obviously,which amounted to 23.59%~99.78% compared with the control in open area and 10.08%~99.71% compared with the near communities away from {15 m} distance. There was nat antifungal (against mold) effect in general; only two tree communities for Osmanthus fragrans (decreased 40.66% compared with the near 15 m distance) and P.orientalis (decreased 24.73% than in open area) had less antifungal effect. At the same time, the antimicrobial activities were tested by the extractive volatile of foliage for more tree species in lab. The results showed that antibacterial activities to against Staphalococus aureus and Escherichia coli were the highest in P.orientalis , Manglietia yuyuanensis and C.camphora , and higher in Koelreuteria bipinnata, Viburnum macrocephalum, Metasequoia glyptostroboides, Eriobotrya japonica, Ginkgo biloba, C.deodara, Magnolia grandiflora, Sabina chinensis. Most of the tree species tested had less antifungal activities against Fusarium graminerum and Glomerella cingulata. While Ginkgo biloba, Cinnamomum camphora, S.chinensis, Elaeocarpus sylvestris and C.deodara had higher antifungal activities against G.cingulata than others. The P.orientalis, C.camphora, S.chinensis Magnolia grandiflor, G.biloba, Acer mono, Acer palmatum had higher antifungal activities against F.graminerum than others.The research results recognized that the suitable cultivated tree species in cities were P.orientalis, C.deodara, C.camphora and M.glyptostroboides. 展开更多
关键词 扬州运河 绿化植物 叶挥发物 功能
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新疆两盐湖可培养嗜盐古菌多样性研究 被引量:32
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作者 崔恒林 杨勇 +2 位作者 迪丽拜尔.托乎提 周培瑾 刘双江 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期171-176,共6页
从新疆地区艾比盐湖和艾丁盐湖卤水及泥土样品中分离到86株嗜盐古菌。16S rRNA基因序列分析结果表明,分离自艾比湖的嗜盐古菌分别属于Haloarcula、Halobacterium、Halorubrum、Haloterrigena、Natrinema和Natronorubrum6个属的11个分类... 从新疆地区艾比盐湖和艾丁盐湖卤水及泥土样品中分离到86株嗜盐古菌。16S rRNA基因序列分析结果表明,分离自艾比湖的嗜盐古菌分别属于Haloarcula、Halobacterium、Halorubrum、Haloterrigena、Natrinema和Natronorubrum6个属的11个分类单元,而分离自艾丁湖的嗜盐古菌分别属于Haloarcula、Halobiforma、Halorubrum、Haloterrigena、Natrialba、Natrinema6个属的8个分类单元,这一结果表明艾比湖可培养嗜盐古菌生物多样性稍高于艾丁湖。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明代表菌株ABH15应为Natronorubrum属的中性嗜盐古菌新种,代表菌株ABH07、ABH12、ABH17、ABH19、ABH51和AD30可能是Halobacterium、Halorubrum、Haloterrigena、Haloarcula的新成员。 展开更多
关键词 嗜盐 生物多样性 艾比盐湖 艾丁盐湖
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土壤中温泉古菌研究进展 被引量:16
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作者 贺纪正 沈菊培 张丽梅 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第9期5047-5055,共9页
古菌一直被冠以嗜极端环境的特征,直到最近十几年,由于分子生物学技术的发展,越来越多的证据表明,在许多非极端环境,包括海洋、湖泊和土壤中,分布着一类特殊的古菌—非嗜热泉古菌(non-thermophilic Crenarchaeota)。该类古菌不仅分布广... 古菌一直被冠以嗜极端环境的特征,直到最近十几年,由于分子生物学技术的发展,越来越多的证据表明,在许多非极端环境,包括海洋、湖泊和土壤中,分布着一类特殊的古菌—非嗜热泉古菌(non-thermophilic Crenarchaeota)。该类古菌不仅分布广泛,而且数量巨大。通过16S rRNA基因序列分析发现,中温泉古菌可能参与到全球碳、氮等生物地球化学循环,预示着其在整个生态系统中起着重要的作用。从古菌分类着手,阐述了中温泉古菌在土壤中的分布和数量特征、影响因素,进而对其在氮和碳循环过程中的潜在作用进行了简要介绍,并提出了今后的研究重点。 展开更多
关键词 中温泉 多样性 丰度 土壤环境
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稻田土壤古菌群落组成对秸秆还田的响应 被引量:11
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作者 王宁 赵亚慧 +3 位作者 艾玉春 张永春 汪吉东 于建光 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期374-382,共9页
为探讨秸秆还田下稻田土壤古菌群落的演替规律及其驱动因子,本研究开展室内稻田土壤淹水培养试验,利用高通量测序技术,研究了淹水培养第0、15、30 d和60 d时不同量小麦秸秆(0、1%、2%和5%)施用下两种类型的稻田土壤(高砂土和黄泥土)古... 为探讨秸秆还田下稻田土壤古菌群落的演替规律及其驱动因子,本研究开展室内稻田土壤淹水培养试验,利用高通量测序技术,研究了淹水培养第0、15、30 d和60 d时不同量小麦秸秆(0、1%、2%和5%)施用下两种类型的稻田土壤(高砂土和黄泥土)古菌群落组成的动态变化及其影响因子。结果表明:秸秆还田导致土壤pH显著降低,而土壤电导率(EC)、总碳(TC)、总氮(TN)、碳氮比(C/N)以及土壤孔隙水中溶解性有机碳(DOC)、还原性亚铁[Fe(Ⅱ)]和总铁(Fe)含量显著增加,并且当秸秆还田量为5%时,上述土壤指标改变量最大。基于高通量测序技术发现,两种类型稻田土壤的优势古菌均为奇古菌门(Thanumarchaeota)。在淹水培养的0~30 d,秸秆还田对奇古菌门的相对丰度没有显著影响,维持在97%~98%;然而,在培养的第60 d,与未施用秸秆相比,秸秆施用下两种类型稻田土壤中奇古菌门的相对丰度显著降低(P<0.05),并且随着秸秆施用量的增加,奇古菌门丰度的降低程度越大。主成分分析(PCA)结果显示两种不同类型土壤的古菌群落存在着显著差异(P<0.05),表明土壤类型是土壤古菌群落结构的重要影响因子。与未施用秸秆的土壤相比,5%秸秆施用显著改变了高砂土古菌群落结构,而1%秸秆施用显著改变了黄泥土壤古菌群落结构。进一步对不同量秸秆施用下土壤古菌群落结构的分析发现,秸秆施用量为5%时高砂土壤古菌群落显著不同于秸秆施用量为1%和2%的土壤,而1%和2%秸秆施用量之间并无显著差异;而对黄泥土,仅秸秆施用量为1%和2%时古菌群落存在着显著差异。为了进一步探究土壤古菌群落迁移的驱动因子,冗余分析(RDA)发现,pH和C/N比是秸秆还田下两种类型土壤古菌群落迁移的重要影响因子。综合分析认为,秸秆还田主要通过改变土壤性质来调控古菌群落结构,而不同类型土壤的古菌群落结构对秸秆还田的响应亦不同。 展开更多
关键词 群落 秸秆还田 演替规律 驱动因子
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非培养手段分析珠江口淇澳岛海岸带沉积物中的古菌多样性 被引量:11
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作者 姜丽晶 彭晓彤 +1 位作者 周怀阳 王风平 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期114-122,共9页
利用古菌16SrDNA特异引物对珠江口淇澳岛海岸带沉积物中古菌的多样性及垂直分布特征进行研究。结果表明珠江口淇澳岛海岸带沉积物中古菌多样性丰富,大部分为新的不可培养古菌;泉古菌在整个沉积物柱中是优势菌群,约占81%;古菌多样性随沉... 利用古菌16SrDNA特异引物对珠江口淇澳岛海岸带沉积物中古菌的多样性及垂直分布特征进行研究。结果表明珠江口淇澳岛海岸带沉积物中古菌多样性丰富,大部分为新的不可培养古菌;泉古菌在整个沉积物柱中是优势菌群,约占81%;古菌多样性随沉积物深度增加而增加,区系结构也随深度变化而呈现出明显的不同,在表层沉积物中,88%的序列属于Ⅰ型海洋泉古菌(MGⅠ),而在中层和底层检测到的古菌序列大部分与不可培养的富含甲烷的环境序列有最高的同源性,并且有15%的克隆子序列属于甲烷八叠球菌目(Methanosarcinales)和甲烷微菌目(Methanomicrobiales)。QC-PCR结果表明珠江口淇澳岛海岸带沉积物中古菌含量丰富[(1.93±0.60)×106^(6.45±0.25)×10716S rDNA拷贝/g],呈现随深度增加含量增加的趋势。 展开更多
关键词 珠江口 沉积物 16S RDNA QC-PCR
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浓香型白酒窖池细菌与古菌随窖龄变化的特征 被引量:17
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作者 何翠容 吴冬梅 +2 位作者 郑佳 吴重德 周荣清 《酿酒科技》 北大核心 2013年第1期27-30,38,共5页
窖龄是影响浓香型白酒品质和风格的关键因素,在优化FISH(Fluorescence in situ hybridization)技术预处理条件的基础上,结合荧光显微镜的可视化信息,探究了不同窖龄浓香型白酒窖池中窖泥的细菌、古菌数量随窖龄变化的特征。结果表明,不... 窖龄是影响浓香型白酒品质和风格的关键因素,在优化FISH(Fluorescence in situ hybridization)技术预处理条件的基础上,结合荧光显微镜的可视化信息,探究了不同窖龄浓香型白酒窖池中窖泥的细菌、古菌数量随窖龄变化的特征。结果表明,不同窖龄窖泥中细菌与古菌的数量存在显著差异(p<0.05),随着窖龄的增长有不同程度的增加。试验窖池窖泥中细菌和古菌数量最低,分别为0.82×109cells/g和0.78×109cells/g,300年窖池窖泥中细菌数量最高,为11.19×109cells/g,100年窖池窖泥中古菌数量最高,为12.61×109cells/g。FISH技术能较真实地反映出窖池中细菌与古菌的生长信息,为浓香型白酒窖池微生物群落结构的研究提供了一种快速、有效的检测手段。同时,窖池中微生物群落结构组成的研究,对新窖老熟工艺及名优白酒的生产均有着积极的指导意义。 展开更多
关键词 FISH 窖龄
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浓香型白酒不同窖龄窖池窖泥中古菌群落结构分析 被引量:31
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作者 邓杰 卫春会 +1 位作者 边名鸿 黄治国 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第8期37-42,共6页
用高通量测序技术对浓香型白酒不同窖龄窖池窖泥中古菌群落结构进行研究,找出其差异性,并利用古菌群落结构信息对不同窖龄窖泥进行聚类分析,同时分析环境因子对各个窖龄段窖泥古菌的影响。结果表明,窖泥中的古菌群落主要分布于Euryarcha... 用高通量测序技术对浓香型白酒不同窖龄窖池窖泥中古菌群落结构进行研究,找出其差异性,并利用古菌群落结构信息对不同窖龄窖泥进行聚类分析,同时分析环境因子对各个窖龄段窖泥古菌的影响。结果表明,窖泥中的古菌群落主要分布于Euryarchaeota(占99%OTU数目),分布于7个属;窖泥中古菌的多样性与窖龄呈负相关,Methanobacterium和Methanocorpusculum的优势度与窖龄呈正相关,Thermoplasmatales的优势度与窖龄呈负相关;5 a窖龄的不同窖池窖泥和100 a窖龄不同窖池窖泥微生物群落相似性较高,30 a窖龄的不同窖池窖泥微生物群落差异性较大,对各窖龄段窖泥中古菌群落影响最大的环境因子各不相同。浓香型白酒不同窖龄窖池窖泥古菌群落结构差异性明显,这可能是不同窖龄窖池发酵产酒存在差异性的重要原因之一。 展开更多
关键词 群落 高通量测序 聚类分析 浓香型白酒 窖泥
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古菌研究及其展望 被引量:26
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作者 李曙光 皮昀丹 Zhang Chuan-lun 《中国科学技术大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期830-838,共9页
古菌是目前生物地球化学研究的热点之一,不仅能在高温、强酸/碱性条件、高盐度、缺氧等极端条件下存在,而且能在普通海洋环境中存活.其含量巨大,在全球的生物地球化学作用中正扮演重要角色.该领域研究对阐明生命运动的基本规律,揭示生... 古菌是目前生物地球化学研究的热点之一,不仅能在高温、强酸/碱性条件、高盐度、缺氧等极端条件下存在,而且能在普通海洋环境中存活.其含量巨大,在全球的生物地球化学作用中正扮演重要角色.该领域研究对阐明生命运动的基本规律,揭示生命起源和物种进化,生物圈与地圈环境的相互作用具有重要意义,并可为外太空生命问题的探讨和推测提供依据.本文评述了近30年来古菌基本研究成果和研究现状,展望有待解决的前沿研究内容及解决思路,旨在建立一个较为清晰的古菌基本概念及研究思路,以利于地质学、生物学界了解这一交叉领域. 展开更多
关键词 脂类 GDGT DNA
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