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题名新基因Nischarin生物信息学分析及初步验证
被引量:1
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作者
赵太云
王勃
苏瑞斌
吴宁
李锦
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机构
军事医学科学院毒物药物研究所
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出处
《现代生物医学进展》
CAS
2012年第32期6201-6206,共6页
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基金
国家自然基金重点项目(30930040)
国家自然基金青年项目(30701016
+1 种基金
81102426)
北京市自然基金面上项目(7082073)
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文摘
目的:对新基因Nischarin进行生物信息学分析,探索其新功能特征,并通过实验进行初步验证。方法:用生物信息学方法对Nischarin进行初步分析,阐明了它的基因结构、染色体定位、编码蛋白质的理化性质、相互作用基因、相互作用蛋白、亚细胞定位、蛋白质功能域等信息。最后采用细胞免疫荧光对其DNA结合位点进行初步验证。结果:对新基因Nischarin的上述性质进行了有效的预测,分析表明该基因结构复杂,相互作用基因或蛋白多,亚细胞分布预测复杂。验证了Nishcarin存在的DNA结合位点。结论:通过生物信息学分析,表明新基因Nischarin是一个复杂的基因,可能存在的多种蛋白表达形式、这些不同的蛋白可能存在不同的亚细胞分布,且该蛋白可能与多种蛋白存在相互作用,上述基因和蛋白特性可能是Ⅰ型咪唑啉受体(Imidazoline-1 receptor,I1R)复杂药理学作用的分子基础。
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关键词
NISCHARIN
生物信息学
Ⅰ型咪唑啉受体
可变剪接异构体
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Keywords
Nischarin
Bioinformatics analysis
I1R
Isoforms
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分类号
Q-33
[生物学]
Q75
[生物学—分子生物学]
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