鸡圆圈病毒3型可视化LAMP检测方法的建立及应用

建立鸡圆圈病毒3型(GyV3)可视化环介导等温扩增(LAMP)检测方法,为临床上快速检测鸡GyV3提供一种诊断方法。参考GyV3的VP3基因序列,设计1套LAMP特异性引物,分别通过温度优化、引物浓度优化和反应时间的优化,确定鸡GyV3可视化LAMP诊断方法的扩增温度、引物浓度和反应时间,通过特异性试验、敏感性试验、重复性试验和临床样品检测,验证鸡GyV3可视化LAMP诊断方法的特异性、敏感性、稳定性和可靠性。结果显示,鸡GyV3 LAMP检测方法的反应体系:总体积为20.0μL,包括DNA模板1.0μL,2×Master Mix 10.0μL,内引物GyV3-FIP和GyV3-BIP混合液(工作浓度16.0μmol/L)2.0μL,外引物GyV3-F3和GyV3-B3混合液(工作浓度2.0μmol/L)2.0μL,环引物GyV3-LF和GyV3-LB混合液(工作浓度8.0μmol/L)2.0μL,ddH_(2)O 3μL;鸡GyV3 LAMP检测方法的扩增程序:66℃反应20 min,80℃灭活5 min。鸡GyV3可视化LAMP检测方法能特异性检测GyV3,最低检测浓度为10^(1)拷贝/μL,组内和组间变异系数小于5%;与常规PCR方法检测临床样品的结果比较,两者结果符合率达100%。建立的鸡GyV3可视化LAMP检测方法能特异性检测GyV3,具有特异性好、敏感性高及污染小等优点,且检测结果可通过肉眼观察进行判断,适用于GyV3的临床快速筛查。

新冠病毒的现场可视化LAMP检测及其冷链食品分析应用

建立了一种基于环介导等温扩增技术(Loop-mediated Isothermal Amplification,LAMP)和核酸分子"光开关"[Ru(phen)_(2)dppz]^(2+)相结合的新型冠状病毒高灵敏可视化检测方法。分别采用保温杯代替实验室恒温装置,采用蓝光手电代替蓝光透射仪,实现了新冠病毒的现场快速可视化LAMP检测。针对新型冠状病毒N基因设计特异性序列引物,采用[Ru(phen)_(2)dppz]^(2+)分子光开关的特性检测LAMP扩增产物,结果可以借助蓝光手电直接通过肉眼观察是否出现红色荧光进行判定。该方法可检测到单个拷贝数的新型冠状病毒基因片段,并具有高度特异性,检验快速,整个过程仅需40min即可目视观察结果。对新冠病毒假病毒人工污染的模拟冷链食品进行检测,结果与目前新型冠状病毒检测金标准实时荧光定量PCR法吻合度为100%。该方法仅需保温杯和蓝光手电,可以作为实时荧光PCR方法的补充,为食品新冠病毒的现场筛查提供快速高效的技术支持。

实时可视化LAMP快速检测高危亚型HPV病毒方法的建立

目的:建立实时可视化LAMP快速检测高危亚型人乳头瘤病毒的方法。方法:基于HPV病毒基因中的L1区保守序列,构建重组标准质粒。应用钙黄绿素作为可视化荧光染料,通过环介导等温扩增技术手段,检测结果可由肉眼观测和荧光检测信号来判读。结果:应用LAMP技术检测HPV病毒,大部分高危亚型的检测限可达到10^3 copies/μL,其中HPV16,HPV33,HPV59,HPV73亚型灵敏度可达10^1 copies/μL;15种高危亚型样品的检测结果显示不存在交叉反应,表明其特异性良好;针对318例临床样本,LAMP的阳性检出率达到79.56%(253/318),与反向杂交试剂盒检测结果基本持平。结论:本研究针对15种高危亚型HPV病毒,建立高效快捷的实时可视化LAMP检测方法,其临床样本符合率高达91.20%,因而具有广泛的市场推广前景和潜在的临床应用意义。

可视环介导恒温扩增技术检测实验猴小肠结肠炎耶尔森菌

本研究在传统环介导恒温扩增反应体系中引入羟基萘酚蓝指示剂,对反应体系进行高温-低温前处理和添加甜菜碱等优化措施提高试验敏感性,液面覆盖矿物油降低气溶胶污染,据此建立的猴小肠结肠炎耶尔森菌可视LAMP检测方法结果判定直观明了,敏感度为6 CFU/反应,无非异性。