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海南橡胶藻18S rDNA与16S rDNA二级结构构建及分析
被引量:
1
1
作者
常凯军
谭德冠
+2 位作者
李定琴
孙雪飘
张家明
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2009年第27期12965-12967,共3页
[目的]对海南橡胶藻的新属、新种地位进行确认。[方法]对海南橡胶藻这一重要生物资源的18S核编码核糖体RNA序列和16S叶绿体编码核糖体RNA序列进行分析,对18S核编码核糖体RNA进行近缘物种间的序列比对及2个I类内含子二级结构模型的构建。...
[目的]对海南橡胶藻的新属、新种地位进行确认。[方法]对海南橡胶藻这一重要生物资源的18S核编码核糖体RNA序列和16S叶绿体编码核糖体RNA序列进行分析,对18S核编码核糖体RNA进行近缘物种间的序列比对及2个I类内含子二级结构模型的构建。[结果]橡胶藻16S rRNA在639位点(E.coli序列编号)有一个46 bp的插入片段,该片段能形成一个完美的双发夹结构,对16SrRNA的正常折叠不会产生影响。[结论]这一双发夹结构在其他物种的叶绿体rDNA中还未见报道过。
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关键词
18
s
核编码核糖体RNA
16
s
叶绿体
编码核糖体RNA
I类内含子
双发夹结构
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职称材料
太湖光合自养真核超微藻遗传多样性初探
被引量:
5
2
作者
谢薇薇
王志伟
+1 位作者
孔繁翔
史小丽
《湖泊科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期123-128,共6页
采用真核藻类叶绿体16S rRNA的引物PLA491F、OXY1313R,通过PCR、构建基因克隆库的方法初步调查了太湖梅梁湾和东太湖光合自养真核超微藻的遗传多样性.结果表明,太湖自养型真核超微藻主要为隐藻(Cryptophyta),其次为硅藻(Bacillariophyta...
采用真核藻类叶绿体16S rRNA的引物PLA491F、OXY1313R,通过PCR、构建基因克隆库的方法初步调查了太湖梅梁湾和东太湖光合自养真核超微藻的遗传多样性.结果表明,太湖自养型真核超微藻主要为隐藻(Cryptophyta),其次为硅藻(Bacillariophyta)、金藻(Chrysophyta)和定鞭藻(Haptophyta).该结果有助于我们更全面地了解太湖浮游藻类的群落结构及生态功能.
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关键词
光合自养真核超微藻
叶绿体16s
RRNA
遗传多样性
太湖
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职称材料
人参细胞器核糖体小亚单位DNA的PCR扩增与序列测定
被引量:
6
3
作者
邱服斌
刘琳
宋未
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2008年第1期124-127,共4页
采用CTAB法提取了人参(Panax ginseng)根基因组DNA,根据植物叶绿体16S rDNA和线粒体18SrDNA与细菌16S rDNA序列具有高度同源性,用扩增细菌16S rDNA的一对通用引物(8f,1492r)扩增了人参细胞器核糖体小亚单位DNA。对扩增产物进行了克隆与...
采用CTAB法提取了人参(Panax ginseng)根基因组DNA,根据植物叶绿体16S rDNA和线粒体18SrDNA与细菌16S rDNA序列具有高度同源性,用扩增细菌16S rDNA的一对通用引物(8f,1492r)扩增了人参细胞器核糖体小亚单位DNA。对扩增产物进行了克隆与测序,经多序列比对,扩增片段分别与已知植物叶绿体16S rDNA和线粒体18S rDNA具高度同源性,表明该对引物可以用来扩增绝大多数植物细胞器核糖体小亚单位DNA,可以作为鉴定植物叶绿体16S rDNA和线粒体18S rDNA的一种基本实验技术。
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关键词
人参
叶绿体16s
RDNA
线粒体18
s
RDNA
PCR
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职称材料
题名
海南橡胶藻18S rDNA与16S rDNA二级结构构建及分析
被引量:
1
1
作者
常凯军
谭德冠
李定琴
孙雪飘
张家明
机构
中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物技术重点开放实验室
出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2009年第27期12965-12967,共3页
文摘
[目的]对海南橡胶藻的新属、新种地位进行确认。[方法]对海南橡胶藻这一重要生物资源的18S核编码核糖体RNA序列和16S叶绿体编码核糖体RNA序列进行分析,对18S核编码核糖体RNA进行近缘物种间的序列比对及2个I类内含子二级结构模型的构建。[结果]橡胶藻16S rRNA在639位点(E.coli序列编号)有一个46 bp的插入片段,该片段能形成一个完美的双发夹结构,对16SrRNA的正常折叠不会产生影响。[结论]这一双发夹结构在其他物种的叶绿体rDNA中还未见报道过。
关键词
18
s
核编码核糖体RNA
16
s
叶绿体
编码核糖体RNA
I类内含子
双发夹结构
Keywords
18
s
rDNA
16
s
rDNA
Group I intron
Double hairpin
s
tructure
分类号
S335.4 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
太湖光合自养真核超微藻遗传多样性初探
被引量:
5
2
作者
谢薇薇
王志伟
孔繁翔
史小丽
机构
南京农业大学生命科学学院
中国科学院南京地理与湖泊研究所湖泊与环境国家重点实验室
出处
《湖泊科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期123-128,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31070420)
国家重点基础研究发展计划"973"项目(2008CB418005)联合资助
文摘
采用真核藻类叶绿体16S rRNA的引物PLA491F、OXY1313R,通过PCR、构建基因克隆库的方法初步调查了太湖梅梁湾和东太湖光合自养真核超微藻的遗传多样性.结果表明,太湖自养型真核超微藻主要为隐藻(Cryptophyta),其次为硅藻(Bacillariophyta)、金藻(Chrysophyta)和定鞭藻(Haptophyta).该结果有助于我们更全面地了解太湖浮游藻类的群落结构及生态功能.
关键词
光合自养真核超微藻
叶绿体16s
RRNA
遗传多样性
太湖
Keywords
Photo
s
ynthetic picoeukaryote
s
chloropla
s
t
16
s
rRNA gene
genetic diver
s
ity
Lake Taihu
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
人参细胞器核糖体小亚单位DNA的PCR扩增与序列测定
被引量:
6
3
作者
邱服斌
刘琳
宋未
机构
首都师范大学生命科学学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2008年第1期124-127,共4页
基金
国家自然科学基金项目(编号:30370032,30770069)
教育部高等学校博士学科点专项科研基金项目(编号:20060028001)
文摘
采用CTAB法提取了人参(Panax ginseng)根基因组DNA,根据植物叶绿体16S rDNA和线粒体18SrDNA与细菌16S rDNA序列具有高度同源性,用扩增细菌16S rDNA的一对通用引物(8f,1492r)扩增了人参细胞器核糖体小亚单位DNA。对扩增产物进行了克隆与测序,经多序列比对,扩增片段分别与已知植物叶绿体16S rDNA和线粒体18S rDNA具高度同源性,表明该对引物可以用来扩增绝大多数植物细胞器核糖体小亚单位DNA,可以作为鉴定植物叶绿体16S rDNA和线粒体18S rDNA的一种基本实验技术。
关键词
人参
叶绿体16s
RDNA
线粒体18
s
RDNA
PCR
Keywords
Parax gin
s
eng
Chloropla
s
t
16
s
rDNA
Mitochondria 18
s
rDNA
PCR
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
海南橡胶藻18S rDNA与16S rDNA二级结构构建及分析
常凯军
谭德冠
李定琴
孙雪飘
张家明
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2009
1
下载PDF
职称材料
2
太湖光合自养真核超微藻遗传多样性初探
谢薇薇
王志伟
孔繁翔
史小丽
《湖泊科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012
5
下载PDF
职称材料
3
人参细胞器核糖体小亚单位DNA的PCR扩增与序列测定
邱服斌
刘琳
宋未
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2008
6
下载PDF
职称材料
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