基于cpDNA atpB-rbcL非编码序列分析桫椤种群遗传结构和遗传多样性,以贵州赤水桫椤国家级自然保护区为例

以PCR产物克隆后测序的方法测定了贵州赤水桫椤国家级自然保护区3个种群59个个体的叶绿体DNA（cpDNA）atpB—rbcL非编码区序列。序列长度介于727～732bp之间，具长度多态性，A＋T百分比含量较高，介于63．27％～63．89％之间。遗传多样性水平较低，表现出较高的单倍型多样（h=0．639）和低的核苷酸多样性（Dij=0．00028）并存的特征，提示现有种群可能源自一个有效群体规模较小的种群的快速扩张，扩张时间尚短，不足以形成更为复杂的遗传结构。种群间的高基因流Nm、低遗传分化度峙、AMOVA分析以及DNA歧异度结果一致显示各种群间无明显的遗传分化。

龙骨星蕨与膜叶星蕨的关系:来自叶绿体rbcL、rps4和trnL-trnF、rps4-trnS序列的证据

龙骨星蕨(Microsoriummembranaceumvar. carinatum)是新近发表的一个变种,从形态特征看,它与原变种膜叶星蕨(M. membranaceumvar. membranaceum)可以很容易地区分。但将龙骨星蕨与另外 3种国产星蕨属 (Mi crosorium)植物叶绿体基因组中rbcL、rps4基因和trnL trnF、rps4 trnS基因间隔区进行PCR扩增和序列分析,并与已经发表的真蕨类的相应序列进行比较发现,龙骨星蕨与膜叶星蕨在所研究的 4个DNA片段中均未表现出序列差异(除了trnL trnF区的一个 2bp长度差异外 ),而所比较的其他真蕨类变种间的相应DNA片段均存在一定的差异。因此DNA序列证据不支持龙骨星蕨变种的成立。

普通小麦与山羊草叶绿体基因组长度热点突变区的核苷酸序列分析

检测了Ae.speltoides和Ae.ovata叶绿体基因组的一个长度热点突变区的核苷酸序列,并与普通小麦、四倍体Ae.crassa以及Ae.squarrosa的相应序列进行了比较分析。从rbcL基因的终止密码子到cemA基因内的HindIII位点,Ae.speltoides和Ae.ovata的核苷酸序列长度分别为2808和2810bp。与四倍体Ae.crassa的序列相比,在普通小麦和Ae.speltoides中各有一个791bp的大片段缺失,在Ae.ovata中存在一个793bp的大片段缺失。Ae.ovata的缺失片段比普通小麦和Ae.speltoides的长2个碱基,推测Ae.ovata的大片段缺失在进化上是独立发生的。Ae.speltoides的大片段缺失与普通小麦的完全相同,支持Ae.speltoides是普通小麦叶绿体基因组供体的假说。除了大片段缺失外,在这个区域还检测到了7个插入/缺失和15个碱基替换突变。研究结果表明,这个长度热点突变区的核苷酸序列分析是研究小麦与山羊草叶绿体基因组之间遗传变异关系的一个非常有效的途径。

棉毛橐吾和穗序橐吾的自然杂交研究(英文)

在棉毛橐吾(Ligularia vellerea)和穗序橐吾(L.subspicata)同域分布的居群中存在形态特征介于两者之间的个体。经分析,这些个体有3种不同的形态类型,可能是这两个物种之间的杂交后代。为检验这一假设,对所采集的假设亲本和中间个体材料进行了核糖体内转录间隔区ITS4-5和叶绿体atpB-rbcL测序。假设杂交个体的ITS直接测序结果具明显的叠加性,之后的克隆测序也分离出两种与假设亲本种相同的序列类型,因此,这些假设杂交个体得到了证实。据母系遗传的叶绿体atpB-rbcL测序结果,穗序橐吾同是它们的质体贡献者,即虽然这些杂交个体具不同的形态特征,但都是以棉毛橐吾和穗序橐吾为亲本且以穗序橐吾为质体贡献者的杂交后代。