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四色荧光标记二硫键可逆终端的合成及在DNA合成测序中的应用
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作者 汤道年 江敏 +6 位作者 李小卫 康亚妮 伍新燕 龚兵 邵志峰 赵小东 沈玉梅 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2014年第11期2346-2352,共7页
分别以5-碘-2'-脱氧尿苷、5-碘-2'-脱氧胞苷、7-去氮-7-碘-2'-脱氧腺苷及7-去氮-7-碘-2'-脱氧鸟苷为原料,以二硫键为可裂解连接单元,通过多步反应合成了四色荧光标记不同碱基的脱氧核糖核苷酸;研究了该类荧光标记核苷... 分别以5-碘-2'-脱氧尿苷、5-碘-2'-脱氧胞苷、7-去氮-7-碘-2'-脱氧腺苷及7-去氮-7-碘-2'-脱氧鸟苷为原料,以二硫键为可裂解连接单元,通过多步反应合成了四色荧光标记不同碱基的脱氧核糖核苷酸;研究了该类荧光标记核苷酸作为可逆终端在DNA合成测序中的应用.所得产物结构经1H NMR,31P NMR及HRMS表征,并对其进行了DNA高通量测序的测试.结果表明,该类荧光标记核苷酸作为DNA合成测序的可逆终端能够满足高通量测序的生化反应要求,具有较好的应用前景. 展开更多
关键词 DNA合成测序 可逆终端 可裂解连接单元 四色荧光标记
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高通量DNA合成测序化学研究进展 被引量:1
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作者 陈婧 肖鹏峰 《生物过程》 2012年第1期1-6,共6页
高通量DNA测序是近年来发展起来的革命性技术,大大推动了快速、廉价获取基因组信息的能力,进而对生命科学产生深刻的影响。测序化学是高通量DNA测序的重要内容,且发展十分迅速;一些构思巧妙的新颖测序化学方法被相继报道,本文综述了高通... 高通量DNA测序是近年来发展起来的革命性技术,大大推动了快速、廉价获取基因组信息的能力,进而对生命科学产生深刻的影响。测序化学是高通量DNA测序的重要内容,且发展十分迅速;一些构思巧妙的新颖测序化学方法被相继报道,本文综述了高通量DNA测序化学的最新研究进展。 展开更多
关键词 生物化学 高通量DNA 合成测序 化学
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用于DNA合成测序的可断裂连接单元研究现状
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作者 姜玉 谭连江 +3 位作者 殷燕 沈玉梅 龚兵 邵志峰 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2016年第1期58-66,共9页
DNA测序技术是遗传基因组相关疾病研究的基础。合成测序是DNA二代测序技术中非常重要的一种。合成测序技术能够有效地实现大规模平行测序,大大提高测序通量的同时也降低成本,目前已得到广泛的应用。在合成测序中,首先需要合成荧光素标... DNA测序技术是遗传基因组相关疾病研究的基础。合成测序是DNA二代测序技术中非常重要的一种。合成测序技术能够有效地实现大规模平行测序,大大提高测序通量的同时也降低成本,目前已得到广泛的应用。在合成测序中,首先需要合成荧光素标记的核苷酸,作为能够参与DNA链延伸的循环可逆终端。已有文献报道的可逆终端结构主要包括单位点修饰(MRT)和双位点修饰(DRT)两种类型。DRT类型可逆终端的最大优势是DNA聚合酶容易识别且合成路线简单,能够较好地应用于DNA合成测序。在此过程中可断裂连接单元将核苷酸和荧光素连接起来,它的性质直接决定了测序的效率、读长等关键指标。本文主要对目前用于DNA合成测序的可断裂连接单元研究现状进行介绍,并对其发展前景进行了展望。 展开更多
关键词 DNA合成测序 循环可逆终端 可断裂连接单元
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新一代测序技术的发展和应用 被引量:33
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作者 田李 张颖 赵云峰 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1-8,共8页
DNA测序技术是人类探索生命秘密的重要研究手段。自第一代的Sanger测序技术诞生以来,DNA测序技术经历了三代变革,产生了第二代到第四代测序技术,统称为新一代测序技术。目前,新一代测序技术的数据产出能力呈指数增长,而且这一技术本身... DNA测序技术是人类探索生命秘密的重要研究手段。自第一代的Sanger测序技术诞生以来,DNA测序技术经历了三代变革,产生了第二代到第四代测序技术,统称为新一代测序技术。目前,新一代测序技术的数据产出能力呈指数增长,而且这一技术本身也从依赖DNA聚合酶的生化反应转变为面向物理学中纳米技术的新领域。新一代测序对生命科学领域具有里程碑意义,引领了科学研究模式革新和研究思维的转变。科研人员可利用新一代测序技术对基因组、转录组和表观组等诸多领域展深入的研究。分析了新一代测序技术的特点,并对其未来的发展方向以及应用进行了展望。 展开更多
关键词 新一代DNA 合成 单分子 纳米孔 应用
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第二代基因测序仪的硬件设计 被引量:1
5
作者 韩九强 吴思佳 +2 位作者 刘瑞玲 吕红强 钟德星 《生命科学仪器》 2017年第1期43-45,42,共4页
随着基因序列分析研究的深入,中短基因片段的快速准确测序已经成为生物信息研究的瓶颈。本文针对第二代基因测序仪的硬件设计问题,在深入研究第二代基因测序原理和流程的基础上完成了硬件总体方案设计。此方案采用自上而下逐步分解的方... 随着基因序列分析研究的深入,中短基因片段的快速准确测序已经成为生物信息研究的瓶颈。本文针对第二代基因测序仪的硬件设计问题,在深入研究第二代基因测序原理和流程的基础上完成了硬件总体方案设计。此方案采用自上而下逐步分解的方法,设计了流动槽、PCR、边合成边测序、控制与数据传输等硬件模块,继续分解设计了温度控制、试剂控制、激光触发、光学采集、扫描控制等硬件子模块,并根据各个子模块的功能和厂商的产品说明书完成了部分关键器件的选型。为后续基因测序仪的机械结构设计和硬件组装奠定了基础。 展开更多
关键词 生物信息学 基因 合成 硬件设计
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反相高效液相色谱与质谱联用分析合成七肽的消旋产物 被引量:9
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作者 齐崴 贾辰熙 +2 位作者 何志敏 乔斌 张延莹 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2006年第9期1244-1248,共5页
采用反相高效液相色谱(RP-HPLC)与质谱(MS)联用技术对固相法化学合成七肽(H2N-PFNSLAI-COOH,M r 760.9)时出现的消旋产物进行了分析。根据弱疏水性合成七肽粗品特性,提出了充分利用吸附和分配双重保留机制的“早期吸附”概念,以此优化... 采用反相高效液相色谱(RP-HPLC)与质谱(MS)联用技术对固相法化学合成七肽(H2N-PFNSLAI-COOH,M r 760.9)时出现的消旋产物进行了分析。根据弱疏水性合成七肽粗品特性,提出了充分利用吸附和分配双重保留机制的“早期吸附”概念,以此优化色谱条件得到4个峰形良好的色谱峰;质谱分析表明:4谱峰具有相同的m/z761.5[M+H]+值,对每一消旋产物进行在线多肽测序,并利用串联质谱(MSn)谱图叠加的方法,得到b轴和y轴两套片段信息,成功确定了合成七肽的4个消旋产物。 展开更多
关键词 高效液相色谱-质谱 固相多肽合成 消旋 多肽
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Conceptual study of lunar-based SAR for global change monitoring 被引量:9
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作者 GUO HuaDong DING YiXing +3 位作者 LIU Guang ZHANG DaoWei FU WenXue ZHANG Lu 《Science China Earth Sciences》 SCIE EI CAS 2014年第8期1771-1779,共9页
As an active microwave remote sensing imaging sensor, Synthetic Aperture Radar(SAR) plays an important role in earth observation. Here we establish a SAR system based on the platform of the moon. This will aid large-s... As an active microwave remote sensing imaging sensor, Synthetic Aperture Radar(SAR) plays an important role in earth observation. Here we establish a SAR system based on the platform of the moon. This will aid large-scale, constant, and long-term dynamic Earth observations to better meet the needs of global change research and to complement the space borne and airborne earth observations. Lunar-based SAR systems have the characteristics of high resolution and wide swath width. The swath width could be thousands of kilometers in the stripe mode and it could cover 40% of earth's surface with 10 meters or even higher spatial resolution in the scanning mode. Using the simplified observation model, here we quantitatively analyze the spatial resolution and coverage area of lunar-based SAR and simulate the observation on the Qinghai-Tibet plateau and the Amazon plain. The results show that this system could provide near 100% daily coverage of the Qinghai-Tibet plateau, whereas 40% to 70% daily coverage of the Amazon plain. Lunar-based SAR could provide large-scale, long-term and stable time series data in order to support future research of global change. 展开更多
关键词 Earth observation global change Lunar-based SAR
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