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草菇基因组中的tRNA分析
被引量:
2
1
作者
陈炳智
谢宝贵
+4 位作者
胡良韬
邓优锦
江玉姬
刘新锐
贵甫
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期594-599,共6页
草菇(Volvariella volvacea),又名中国蘑菇,是一种生长于中国和东南亚的重要经济食用菌。本文基于本实验室的草菇基因组测序结果,分析了草菇基因组中的tRNA情况。草菇基因组的302个框架中,共发现了177个tRNA基因,其中有7个可能的假基因,...
草菇(Volvariella volvacea),又名中国蘑菇,是一种生长于中国和东南亚的重要经济食用菌。本文基于本实验室的草菇基因组测序结果,分析了草菇基因组中的tRNA情况。草菇基因组的302个框架中,共发现了177个tRNA基因,其中有7个可能的假基因,有2个携带硒代半胱氨酸,一个抑制性tRNA基因和一个未知的异型结构tRNA。除了上述11个特殊的tRNA基因外,166个tRNA可按反密码子类型分成47类。与其它5种担子菌的基因组tRNA比较,草菇的tRNA数量处于第4位,少于鬼伞、裂褶菌、灵芝,多于双孢蘑菇和平菇。通过比较分析草菇及这5种大型真菌的基因组tRNA编码情况,首次报道了几种食用菌tRNA遵守修正的摆动假说的情况。另外,草菇的同功受体tRNA非编码子序列也具有差异性,对tRNA的分析将有助于进一步研究草菇的进化。
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关键词
草菇基因组
trna
基因
修正的摆动假设
同功受体trna
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职称材料
题名
草菇基因组中的tRNA分析
被引量:
2
1
作者
陈炳智
谢宝贵
胡良韬
邓优锦
江玉姬
刘新锐
贵甫
机构
福建农林大学菌物研究中心
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期594-599,共6页
基金
国家现代农业产业技术体系建设专项资金资助(CARS 24)资助
文摘
草菇(Volvariella volvacea),又名中国蘑菇,是一种生长于中国和东南亚的重要经济食用菌。本文基于本实验室的草菇基因组测序结果,分析了草菇基因组中的tRNA情况。草菇基因组的302个框架中,共发现了177个tRNA基因,其中有7个可能的假基因,有2个携带硒代半胱氨酸,一个抑制性tRNA基因和一个未知的异型结构tRNA。除了上述11个特殊的tRNA基因外,166个tRNA可按反密码子类型分成47类。与其它5种担子菌的基因组tRNA比较,草菇的tRNA数量处于第4位,少于鬼伞、裂褶菌、灵芝,多于双孢蘑菇和平菇。通过比较分析草菇及这5种大型真菌的基因组tRNA编码情况,首次报道了几种食用菌tRNA遵守修正的摆动假说的情况。另外,草菇的同功受体tRNA非编码子序列也具有差异性,对tRNA的分析将有助于进一步研究草菇的进化。
关键词
草菇基因组
trna
基因
修正的摆动假设
同功受体trna
Keywords
Volvariella volvaeea genome,
trna
, Modified wobble hypothesis, Isoacceptor
trna
分类号
S646.13 [农业科学—蔬菜学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
草菇基因组中的tRNA分析
陈炳智
谢宝贵
胡良韬
邓优锦
江玉姬
刘新锐
贵甫
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2013
2
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职称材料
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