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青稞HD-Zip基因家族鉴定及其在非生物胁迫下的表达特性 被引量:1
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作者 祁存英 李媛 +2 位作者 杨成兰 马银花 段瑞君 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期66-78,共13页
同源异型域-亮氨酸拉链(homedomain-leucine zipper,HD-Zip)转录因子广泛参与植物的生长发育和抗胁迫过程。该研究通过生物信息学方法对青稞HD-Zip基因家族进行全基因组分析鉴定,并采用qRT-PCR技术分析非生物胁迫下该基因的表达特性,为... 同源异型域-亮氨酸拉链(homedomain-leucine zipper,HD-Zip)转录因子广泛参与植物的生长发育和抗胁迫过程。该研究通过生物信息学方法对青稞HD-Zip基因家族进行全基因组分析鉴定,并采用qRT-PCR技术分析非生物胁迫下该基因的表达特性,为深入探讨青稞HD-Zip转录因子的生物学功能及其在高原作物抗逆育种中的应用奠定基础。结果表明:(1)成功从青稞基因组中共鉴定出41个HD-Zip基因家族成员,依次命名为HvvHD-ZipⅠ-1~Ⅳ-13,且这些基因在7条染色体上呈不均匀分布。(2)理化性质分析发现,HvvHD-Zip蛋白包含197~885个不等的氨基酸残基;分子量范围在19914.36~94014.87 Da;亚细胞定位表明HvvHD-Zip蛋白都位于细胞核。(3)根据多序列比对、系统进化、基因结构和保守基序差异将其聚为4个亚家族,各亚家族分类特征与系统聚类结果一致。(4)顺式作用元件预测分析发现,HvvHD-Zip基因启动子中含有11种植物激素和胁迫响应元件。(5)qRT-PCR结果显示,HvvHD-ZipⅠ、Ⅱ、Ⅳ亚家族基因对各胁迫响应明显;与根组织相比,多数HvvHD-Zip基因在叶组织中响应明显(上调或下调);与冷和盐胁迫相比,HvvHD-Zip各基因对旱胁迫响应较强。 展开更多
关键词 青稞 同源异型域-亮氨酸拉链蛋白 基因家族 非生物胁迫 基因表达
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玉米HD-Zip转录因子基因ZmHOX32的克隆及功能探究 被引量:1
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作者 张新 曹丽茹 +5 位作者 张军 魏良明 张前进 魏昕 王振华 鲁晓民 《河南农业科学》 北大核心 2019年第11期34-39,共6页
同源异型域-亮氨酸拉链蛋白(HD-Zip)可通过与其他蛋白质互作参与激素信号传导途径,进而调控植物对逆境胁迫的应答和生长发育等过程。为验证及探究HD-Zip蛋白对干旱胁迫和ABA诱导的响应模式,从玉米抗旱自选系郑D58M中克隆了1个HD-Zip转... 同源异型域-亮氨酸拉链蛋白(HD-Zip)可通过与其他蛋白质互作参与激素信号传导途径,进而调控植物对逆境胁迫的应答和生长发育等过程。为验证及探究HD-Zip蛋白对干旱胁迫和ABA诱导的响应模式,从玉米抗旱自选系郑D58M中克隆了1个HD-Zip转录因子基因,暂时命名为ZmHOX 32。ZmHOX32蛋白包含856个氨基酸,属于亲水性蛋白质,定位于细胞核内。进化树和保守基序分析发现,ZmHOX32蛋白序列与谷子、胡桃木的同源蛋白序列高度相似且保守基序完全一致。ZmHOX 32基因启动子序列含有响应激素、非生物胁迫及光刺激的结合元件。qRT-PCR结果显示,ZmHOX 32基因属于组成型表达基因,在营养分生组织中高表达,且受干旱胁迫和外源ABA的正向诱导,表明ZmHOX 32基因参与干旱胁迫和ABA信号传导途径。 展开更多
关键词 玉米 同源异型域-亮氨酸拉链蛋白 干旱胁迫 外源ABA 正向诱导
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植物HD-Zip转录因子 被引量:7
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作者 沈文飚 《生命的化学》 CAS CSCD 2003年第5期387-389,共3页
同源异型域一亮氨酸拉链(HD-Zip)蛋白是植物特有的一类转录因子,具有调节植物发育进程和应答外界环境胁迫信号的作用。介绍了近年来有关植物HD-Zip蛋白的结构特征与特性、编码基因及其表达规律、相关生理功能的新进展。
关键词 同源异型域-亮氨酸拉链蛋白 转录因子
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过量表达紫花苜蓿MsHB7基因对拟南芥耐旱性的影响 被引量:2
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作者 候怡谣 李霄 +3 位作者 龙瑞才 杨青川 康俊梅 郭长虹 《草业学报》 CSCD 北大核心 2021年第4期170-179,共10页
同源异型域-亮氨酸拉链蛋白(HD-Zip)第I类亚家族在植物非生物胁迫调控过程中起着重要作用,已在多个物种中进行了克隆鉴定,但关于紫花苜蓿该家族基因的研究还鲜有报道。本研究旨在研究紫花苜蓿HD-Zip第I类亚家族基因MsHB7对拟南芥抗旱性... 同源异型域-亮氨酸拉链蛋白(HD-Zip)第I类亚家族在植物非生物胁迫调控过程中起着重要作用,已在多个物种中进行了克隆鉴定,但关于紫花苜蓿该家族基因的研究还鲜有报道。本研究旨在研究紫花苜蓿HD-Zip第I类亚家族基因MsHB7对拟南芥抗旱性的调控功能。通过克隆得到大小为738 bp、编码245个氨基酸的MsHB7基因的开放阅读框。多重序列比对和系统进化树分析结果显示,MsHB7蛋白属于HD-Zip I亚家族,且与拟南芥中ATHB7和ATHB12亲缘关系较近。实时荧光定量分析表明,MsHB7基因受干旱诱导。将MsHB7基因转化拟南芥并获得了阳性植株。干旱处理后,转基因拟南芥比野生型拟南芥萎蔫程度更明显,转基因植株相对含水量显著低于野生型拟南芥,并积累了更多的脯氨酸和丙二醛。qRT-PCR检测发现处理之后逆境胁迫指示基因ATCAT1、ATDREB2A和ATRD29A在转基因拟南芥中的表达量显著升高,而ATLEA3的表达量显著下降。上述结果表明MsHB7基因的过表达可降低转基因拟南芥的耐旱性,为进一步开发利用该基因提供理论依据。 展开更多
关键词 紫花苜蓿 同源异型域-亮氨酸拉链蛋白 干旱胁迫 转基因拟南芥
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CRX基因突变影响视紫红质转录表达和NRL蛋白稳定性的细胞学研究
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作者 赵娜 吕雅素 +4 位作者 陆勤康 王红婷 王惠云 童奇湖 张咸宁 《中华眼视光学与视觉科学杂志》 CAS CSCD 2017年第1期47-52,共6页
目的在细胞水平上,探讨存在和缺乏神经视网膜亮氨酸拉链(NRL)的条件下,视锥.视杆细胞同源异形框基因(CRX)突变型对调控视紫红质基因转录表达的影响.并分析CRX突变型对CRX和NRL蛋白稳定性的影响。方法实验研究。分别构建携带野... 目的在细胞水平上,探讨存在和缺乏神经视网膜亮氨酸拉链(NRL)的条件下,视锥.视杆细胞同源异形框基因(CRX)突变型对调控视紫红质基因转录表达的影响.并分析CRX突变型对CRX和NRL蛋白稳定性的影响。方法实验研究。分别构建携带野生型和c.C766T(p.Gln256X)无义突变型的CRX基因,以及共表达NRL基因和牛视紫红质基因启动子萤光素酶(pBR130-luc)的表达载体,分别转染体外培养的293T细胞和ARPE-19细胞,再行双荧光素酶检测分析和Western blotting实验。以持家蛋白GAPDH作为内参照。结果与野生型CRX蛋白的表达导致牛视紫红质启动子表达5倍的激活率相比,CRX/c.C766T(p.Q256X)突变所造成的相应激活率降至1/4。共表达野生型CRX和NRL基因后,激活率增高至30倍,而共转染CRX/c.C766T和NRL后,牛视紫红质蛋白的活性降至1/13。以持家蛋白GAPDH作为内参,可见存在CRX/c.C766T突变时,CRX蛋白的稳态水平大幅下降。且CRX/c.C766T突变型对NRL蛋白的稳态有一定的影响,出现NRL增高的现象。结论在细胞水平上,CRX基因的c.C766T(p.Q256x)突变可降低所调控的视紫红质蛋白的表达,并对CRX蛋白和NRL蛋白的稳态均造成一定的影响。 展开更多
关键词 视锥-视杆细胞同源异形框基因 神经视网膜拉链 2型视锥-视杆细胞营养不良 遗传性视网膜变性 双荧光素酶实验 蛋白质印迹法
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眼睑基底细胞癌组织中LRIG1、EGFR及GLI1的表达及其相关性研究
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作者 王爱莲 高含笑 +2 位作者 宋文庆 音林康 孙玉娴 《中华解剖与临床杂志》 2024年第8期546-551,共6页
目的:探讨眼睑基底细胞癌组织中亮氨酸重复序列和免疫球蛋白样域蛋白-1(LRIG1)、表皮生长因子受体(EGFR)及神经胶质瘤关联癌基因同源物1(GLI1)的表达情况及其相关性。方法:病例系列报告。纳入蚌埠医科大学第一附属医院2016年1月—2020... 目的:探讨眼睑基底细胞癌组织中亮氨酸重复序列和免疫球蛋白样域蛋白-1(LRIG1)、表皮生长因子受体(EGFR)及神经胶质瘤关联癌基因同源物1(GLI1)的表达情况及其相关性。方法:病例系列报告。纳入蚌埠医科大学第一附属医院2016年1月—2020年11月病理确诊的55例眼睑基底细胞癌患者,其中男26例、女29例,年龄52~89(69.1±9.0)岁。选取55例患者手术切除后保留的癌组织标本,并随机抽取其中22例患者的癌旁正常皮肤组织标本作为对照。观察指标:(1)采用免疫组织化学染色检测并比较LRIG1、EGFR及GLI1在眼睑基底细胞癌组织与癌旁正常皮肤组织中的阳性表达率;(2)比较LRIG1、EGFR及GLI1在不同性别、不同年龄(≥65岁和<65岁)、不同肿块大小(≥2.0 cm和<2.0 cm)患者癌细胞中表达的差异。(3)分析LRIG1、EGFR及GLI1三种蛋白表达水平的相关性。结果:(1)LRIG1在眼睑基底细胞癌组织中阳性表达率为16.4%(9/55),低于在癌旁正常皮肤组织中的阳性表达率72.7%(16/22);而EGFR和GLI1在眼睑基底细胞癌组织中阳性表达率分别为72.7%(40/55)及70.9%(39/55),均高于在癌旁正常皮肤组织中的阳性表达率31.8%(7/22)、27.3%(6/22):差异均有统计学意义(χ^(2)=22.77、11.06、12.32,P值均<0.05)。(2)GLI1、EGFR、LRIG1表达在不同性别、不同年龄及不同肿块大小的患者间差异均无统计学意义(P值均>0.05)。(3)Spearman相关分析表明,55例眼睑基底细胞癌组织中,LRIG1表达分别与EGFR、GLI1表达呈负相关(r=-0.279,P=0.039;r=-0.306,P=0.023);EGFR表达与GLI1表达呈正相关(r=0.499,P<0.001)。结论:EGFR及GLI1在眼睑基底细胞癌组织中均呈高表达,LRIG1呈低表达并分别与两者呈负相关;EGFR及GLI1蛋白可能会导致眼睑基底细胞癌的发生和发展,而LRIG1对癌症的发生发展可能起抑制作用。 展开更多
关键词 眼睑肿瘤 基底细胞癌 重复序列和免疫球蛋白蛋白-1 表皮生长因子受体 神经胶质瘤关联癌基因同源物1
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