急性髓系白血病患者血浆lncRNA同源盒基因A-反义链2和miR-124-3p表达及其与预后的关系

目的观察急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)患者血浆长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)同源盒基因A-反义链2(homeobox gene A-antisense strand 2,HOXA-AS2)、miR-124-3p的表达情况,探讨其与临床病理特征及预后的关系。方法AML患者116例为AML组,均根据AML分型给予标准化疗方案治疗。同期体检健康者116例为对照组。采用实时荧光定量PCR法检测AML组入院时2组血浆lncRNA HOXA-AS2、miR-124-3p相对表达量;比较不同临床病理特征AML患者血浆lncRNA HOXA-AS2、miR-124-3p相对表达量;采用Pearson相关性分析AML患者血浆lncRNA HOXA-AS2与miR-124-3p相对表达量的相关性。AML患者根据lncRNA HOXA-AS2、miR-124-3p相对表达量均值分为lncRNA HOXA-AS2高表达组(lncRNA HOXA-AS2相对表达量≥3.54)62例和lncRNA HOXA-AS2低表达组(lncRNA HOXA-AS2相对表达量<3.54)54例、miR-124-3p高表达组(miR-124-3p相对表达量≥0.99)55例和miR-124-3p低表达组(miR-124-3p相对表达量<0.99)61例。随访3年,采用Kaplan-Meier生存曲线分析lncRNA HOXA-AS2与miR-124-3p高、低表达组患者3年总生存率;采用多因素Cox回归分析AML患者预后不良的影响因素。结果AML组血浆lncRNA HOXA-AS2相对表达量(3.54±0.98)高于对照组(0.82±0.25)(t=28.942,P<0.001),miR-124-3p相对表达量(0.99±0.37)低于对照组(3.47±1.29)(t=—19.945,P<0.001)。AML患者白细胞计数≥30×10^(9)/L、骨髓原始细胞比率≥70%者lncRNA HOXA-AS2相对表达量(3.76±0.87、3.75±0.89)分别高于白细胞计数<30×10^(9)/L(3.33±1.04)、骨髓原始细胞比率<70%者(3.24±1.03)(t=2.406,P=0.018;t=2.886,P=0.005),miR-124-3p相对表达量(0.88±0.35、0.91±0.36)分别低于白细胞计数<30×10^(9)/L(1.09±0.37)、骨髓原始细胞比率<70%者(1.10±0.37)(t=-3.171,P=0.002;t=-2.776,P=0.006)。预后危险度分层高危者lncRNA HOXA-AS2相对表达量高于中危、低危者(P<0.05),中危者高于低危者(P<0.05);高危者miR-124-3p相对表达量低于中危、低危者(P<0.05),中危者低于低危者(P<0.05)。AML患者血浆lncRNA HOXA-AS2与miR-124-3p相对表达量呈负相关(r=—0.684,P<0.001)。lncRNA HOXA-AS2高表达组3年总生存率(27.42%)低于lncRNA HOXA-AS2低表达组(62.96%)(χ^(2)=9.646,P=0.002),miR-124-3p低表达组3年总生存率(31.15%)低于miR-124-3p高表达组(58.18%)(χ^(2)=10.318,P=0.001)。白细胞计数≥30×10^(9)/L(HR=2.249,95%CI:1.298~3.895,P=0.004)、预后危险度分层高危(HR=1.595,95%CI:1.060~2.856,P=0.031)、lncRNA HOXA-AS2相对表达量≥3.54(HR=1.780,95%CI:1.152~3.168,P=0.038)、miR-124-3p相对表达量<0.99(HR=0.500,95%CI:0.279~0.897,P=0.020)是AML患者预后不良的危险因素。结论白细胞计数≥30×10^(9)/L、骨髓原始细胞比率≥70%、预后危险度分层高危的AML患者lncRNA HOXA-AS2表达增高、miR-124-3p表达降低,lncRNA HOXA-AS2相对表达量≥3.54、miR-124-3p相对表达量<0.99的AML患者可能预后不良。

外周血长链非编码RNA-同源盒基因反义转录RNA与卵巢癌术后转归关系及意义

目的探讨外周血长链非编码RNA(Lnc RNA)-同源盒基因反义转录RNA(HOTAIR)与卵巢癌术后转归的关系及意义。方法选取自2014年5月至2016年5月武汉大学中南医院收治的138例卵巢癌患者为研究对象,根据复发情况将患者分为复发组(n=37)和未复发组(n=101)。比较两组患者术前、后的血清糖类抗原125(CA125)水平及Lnc RNA-HOTAIR表达情况;应用受试者工作特征曲线(ROC)分析CA125和Lnc RNA-HOTAIR对患者术后转归的预测价值。结果复发组的血清CA125水平、外周血Lnc RNA-HOTAIR表达均高于非复发组,组间比较,差异有统计学意义(P <0. 05)。ROC曲线分析结果显示,术前、术后Lnc RNA-HOTAIR和CA125对卵巢癌术后复发均有较高的预测价值,术前Lnc RNA-HOTAIR和CA125的最佳工作点分别为2. 75和356. 7 U/ml,术后Lnc RNA-HOTAIR和CA125的最佳工作点分别为1. 62和46. 3 U/ml。结论外周血Lnc RNA-HOTAIR表达水平与卵巢癌术后转归密切相关,可作为血清CA125的辅助指标对术后复发做出预测。

长链非编码RNA同源盒基因A11反义RNA在急性淋巴细胞白血病患儿骨髓中的表达及意义

目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)同源盒基因A11反义RNA(HOXA11-AS)在急性淋巴细胞白血病(ALL)患儿骨髓中的表达及意义。方法选取108例初治ALL患儿及57例非肿瘤性疾病患儿,比较ALL患儿与非肿瘤性疾病患儿、不同ALL病理类型、治疗后不同疗效ALL患儿HOXA11-AS的相对表达量。实时逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测108例不同临床特征ALL患儿骨髓中HOXA11-AS的相对表达量。结果108例初治ALL患儿骨髓HOXA11-AS的相对表达量明显高于非肿瘤性疾病患儿(P﹤0.01),其中,B-ALL型初治ALL患儿骨髓HOXA11-AS的相对表达量明显低于T-ALL型患儿(P﹤0.01)。108例初治ALL患儿经2个周期的化疗后完全缓解46例,未完全缓解62例,完全缓解患儿HOXA11-AS的相对表达量明显低于未完全缓解和初治ALL患儿(P﹤0.01)。BCR/ABL融合基因阳性表达初治ALL患儿骨髓HOXA11-AS的相对表达量,明显高于BCR/ABL融合基因阴性表达患儿(P﹤0.05)。结论HOXA11-AS在ALL患儿中表达上调,并与ALL分型有关,其可能参与ALL的发生发展过程。

LncRNA ZEB1-AS1和LncRNA SOX2OT在糖尿病肾病患者中的表达及与肾功能的相关性研究

目的探究长链非编码RNA锌指E盒结合同源盒蛋白1反义链1(LncRNA ZEB1-AS1)和长链非编码RNA性别决定相关基因簇2重叠转录本(LncRNA SOX2OT)在糖尿病肾病(DN)患者中的表达及与肾功能的相关性。方法选取于2021年11月—2023年12月在武汉大学人民医院肾内科收治的DN患者106例为DN组,并根据24 h尿蛋白定量(24 h Upro)水平分为正常蛋白尿亚组43例(<30 mg)、微量蛋白尿亚组39例(30~<300 mg)、大量蛋白尿亚组24例(≥300 mg),另选取同期医院单纯糖尿病患者106例作对照组,检测患者血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT水平;Pearson法分析LncRNA ZEB1-AS1和LncRNA SOX2OT与肾功能指标的相关性;Logistic分析影响DN患者肾功能损伤的因素。结果DN组血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT水平低于对照组(t=11.471、10.257,P均<0.001)。血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT比较,正常尿蛋白亚组>微量尿蛋白亚组>大量尿蛋白亚组(F=58.720、117.722,P均<0.001),BUN、SCr、UA水平比较,正常尿蛋白亚组<微量尿蛋白亚组<大量尿蛋白亚组,差异均有统计学意义(F=122.493、595.589、53.178,P均<0.001);LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT分别与BUN、SCr、UA呈负相关(r=-0.487、-0.498、-0.521,-0.527、-0.515、-0.534,P均<0.001);Logistic回归分析显示,糖尿病病程长及高BUN、SCr、UA水平是影响DN患者肾功能损伤的危险因素[OR(95%CI)=1.672(1.128~2.479)、2.839(1.534~5.253)、2.754(1.512~5.017)、2.693(1.464~4.954)],高LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT是保护因素[OR(95%CI)=0.875(0.798~0.959)、0.898(0.832~0.969)]。结论血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT水平与DN患者肾功能有关,可能是评估DN患者肾功能的潜在指标。

LncRNA LBX2-AS1调节miR-873-5p/G6PD轴对胃癌细胞增殖迁移和侵袭的影响

目的:探讨长链非编码RNA(LncRNA)瓢虫同源盒2反义RNA1(LBX2-AS1)调节微小RNA-873-5p(miR-873-5p)/葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)轴对胃癌(GC)细胞增殖、迁移和侵袭的影响。方法:以SGC7901细胞为研究对象,将其随机分为Control组、sh-NC组、sh-LBX2-AS1组、sh-LBX2-AS1+inhibitor-NC组、sh-LBX2-AS1+miR-873-5p inhibitor组;qRT-PCR法检测LncRNA LBX2-AS1、miR-873-5p、G6PD的表达;MTT法和平板克隆实验检测SGC7901细胞增殖;划痕实验检测SGC7901细胞迁移;Transwell实验检测SGC7901细胞的侵袭;Western blot检测SGC7901细胞中MMP-2、PCNA、MMP-9、G6PD蛋白表达;荧光素酶报告基因实验检测LncRNA LBX2-AS1与miR-873-5p,miR-873-5p与G6PD之间的相互作用;小鼠荷瘤实验验证敲除LncRNALBX2-AS1对CC肿瘤生长及G6PD表达的影响。结果:sh-LBX2-AS1组SGC7901细胞中A490值、克隆数、划痕愈合率、侵袭数、LncRNA LBX2-AS1、G6PD mRNA和PCNA、MMP-2、MMP-9蛋白表达低于sh-NC组、Control组,miR-873-5p表达高于sh-NC组、Control组(P<0.05);与sh-LBX2-AS1组、sh-LBX2-AS1+inhibitor-NC组相比,sh-LBX2-AS+miR-873-5p inhibitor组miR-873-5p表达降低,A490值、克隆数、划痕愈合率、侵袭数、G6PD mRNA和PCNA、MMP-2、MMP-9蛋白表达升高(P<0.05)。LncRNA LBX2-AS1靶向负调控miR-873-5p,miR-873-5p靶向负调控G6PD。实验组移植瘤质量、体积、Ki-67阳性率、G6PD阳性率低于对照组(P<0.05)。结论:敲除LncRNA LBX2-AS1可能抑制GC细胞的增殖、迁移和侵袭,其机制可能是调节miR-873-5p/G6PD轴实现的。

HOXA5和miR-196a-5p基因环路在卵巢癌诊断及治疗中的价值

卵巢癌是女性生殖系统常见恶性肿瘤之一,其死亡率占妇科肿瘤首位。因此,找到更准确的卵巢癌诊断及治疗方法对提高卵巢癌患者的生存率有重要意义。随着人们对卵巢癌发病机制的深入研究,同源异形盒基因A5和非编码小分子RNA-196a-5p引起了临床工作者的广泛关注,同源异形盒基因A5是同源盒基因家族中的一员,在胚胎发育及细胞分化中发挥重要的作用;非编码小分子RNA-196a-5p在癌症演变中也发挥着重要作用,这为卵巢癌今后的诊断和治疗提供了新思路。因此,本综述主要阐述同源异形盒基因A5和非编码小分子RNA-196a-5p基因环路与卵巢癌发生发展的关系,并为卵巢癌的早期诊治及判断预后提供依据。

长链非编码RNA HOXA-AS3在结肠癌组织中的表达及与临床预后的关系

目的:观察长链非编码RNA HOXA-AS3(lncRNA HOXA-AS3)在结肠癌组织中的表达并探究其与临床预后的关系。方法:选取2012年01月至2014年02月本院外科行手术治疗的94例结肠癌患者癌变及癌旁结肠组织冻存标本,采用实时定量PCR(RT-qPCR)法检测癌组织和癌旁组织中lncRNA HOXA-AS3的表达水平,采用单因素方差分析其与结肠癌患者临床病理参数的关系;采用Kaplan-Meier生存曲线分析lncRNA HOXA-AS3表达水平与结肠癌患者5年生存率的关系;采用COX多因素回归分析影响结肠癌患者不良预后的危险因素。结果:与癌旁组织比较,结肠癌组织中lncRNA HOXA-AS3表达水平明显升高(P<0.05);lncRNA HOXA-AS3在结肠癌组织中的表达水平与患者年龄、性别、病理类型无关(P>0.05),与TNM分期、肿瘤直径、分化程度、淋巴结转移有关(P<0.05)。lncRNA HOXA-AS3高表达组结肠癌患者5年生存率(60.98%)明显低于低表达组(94.34%)(χ^(2)=16.41,P<0.05)。COX回归分析结果显示,lncRNA HOXA-AS3高表达、TNM分期和淋巴结转移是影响结肠癌患者预后的独立危险因素(P均<0.05)。结论:lncRNA HOXA-AS3在结肠癌组织中高表达,且与患者TNM分期、肿瘤直径、分化程度、淋巴结转移及5年生存率有关,其表达变化可能与结肠癌的发生、发展进程有关,有潜力成为结肠癌预后评估的新型生物指标及潜在治疗靶标。

长链非编码RNA同源盒基因A11反义RNA对肝癌细胞增殖和肝癌相关基因表达的影响

目的探究长链非编码RNA(lncRNA)同源盒基因A11反义RNA(HOXA11-AS)对肝细胞癌(HCC)细胞增殖及HCC相关基因表达的影响。方法15例人HCC组织及癌旁组织由西安交通大学第二附属医院生物诊疗中心样本库于2017年6月至2019年11月收集。采用实时定量聚合酶链反应(qPCR)检测HOXA11-AS的表达并用RNA荧光原位杂交进行亚细胞定位;通过转染lncRNA Smart Silencer敲低Bel-7402和Hep3细胞中HOXA11-AS的表达,并采用细胞计数试剂(CCK-8)、平板克隆形成实验、流式细胞术检测细胞的增殖、周期及凋亡情况;利用qPCR芯片检测敲低HOXA11-AS对HCC相关基因表达的影响,使用R语言clusterProfiler包对差异基因进行功能富集分析,并通过rescue实验验证差异基因介导HOXA11-AS调控HCC细胞增殖的作用。分别采用t检验和Turkey检验分析两组或多组间差异。结果HOXA11-AS在HCC组织中的表达明显高于癌旁组织(9.72±5.99比5.53±4.92,t=2.09,P<0.05),在3种HCC细胞系(Bel-7402、HepG2和Hep3B)中的表达显著高于与正常肝细胞系L-O2(1.81±0.33、1.49±0.17、3.53±0.30比1.00±0.02,t=4.20、4.94、14.34,P均<0.05)。RNA荧光原位杂交显示HOXA11-AS在HCC细胞的胞核和胞质均有分布。HOXA11-AS功能缺失实验提示敲低组细胞增殖活性明显低于对照组(Bel-7402:0.95±0.03比1.27±0.07,t=8.60,P<0.01;Hep3B:0.59±0.04比0.74±0.03,t=6.00,P<0.01);敲低组细胞克隆形成数量显著低于对照组(Bel-7402:228.33±25.18比572.33±26.08,t=19.74,P<0.01;Hep3B:112.33±11.50比214.33±14.64,t=9.49,P<0.01);敲低组S期细胞比例显著高于对照组[Bel-7402:(33.13±2.37)%比(18.92±0.49)%,t=10.15,P<0.01;Hep3B:(27.66±0.85)%比(21.88±0.81)%,t=8.48,P<0.01];敲低组凋亡细胞比例显著高于对照组[Bel-7402:(18.50±0.95)%比(15.43±1.24)%,t=3.41,P<0.05;Hep3B:(8.65±0.88)%比(3.28±0.34)%,t=9.82,P<0.01]。qPCR芯片检测显示敲低HOXA11-AS可显著改变46个HCC相关基因的表达,这些基因显著富集于细胞增殖、周期和凋亡等相关生物学过程以及肿瘤坏死因子(TNF)、酪氨酸激酶(JAK)/信号转导与转录激活因子(STAT)、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)和Ras等肿瘤相关通路。过表达KIT、SPARC、HDAC10可逆转HOXA11-AS敲低对HCC细胞增殖的抑制作用。结论HOXA11-AS在HCC细胞中高表达,可通过影响细胞周期、凋亡以及HCC相关基因的表达促进HCC细胞增殖。

LncRNA ZEB2-AS1调控miR-574-3p/ZEB1轴对卵巢癌细胞迁移及侵袭的影响

目的探讨长链非编码核糖核酸(LncRNA)锌指E盒结合同源盒蛋白2反义RNA(LncRNA ZEB2-AS)1对卵巢癌细胞迁移、侵袭的影响及可能的作用机制。方法体外培养人卵巢癌细胞(SKOV3、SW626、A2780)和正常人卵巢上皮细胞(HOSEpiC),实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测细胞中ZEB2-AS1、miR-574-3p和锌指E盒结合蛋白(ZEB)1的水平。取对数生长期的SW626细胞,分为对照组、pcDNA3.1-NC组、pcDNA3.1-ZEB2-AS1组、si-NC组、si-ZEB2-AS1组、si-ZEB2-AS1+inhibitor-NC组、si-ZEB2-AS1+miR-574-3p inhibitor组。qRT-PCR检测细胞中ZEB2-AS1、miR-574-3p表达,噻唑蓝(MTT)法检测细胞增殖活性;划痕实验检测细胞迁移能力;Transwell实验检测细胞侵袭能力;Western印迹检测细胞ZEB1和迁移、侵袭相关蛋白的表达;双荧光素酶报告基因检测验证ZEB1与miR-574-3p的靶向关系。结果与正常人卵巢上皮细胞HOSEpiC相比,人卵巢癌SKOV3、SW626、A2780细胞中ZEB2-AS1、ZEB1水平明显升高,miR-574-3p水平明显降低(P<0.05),且SW626细胞中ZEB2-AS1表达水平最高。转染后,与对照组相比,pcDNA3.1-ZEB2-AS1组细胞增殖、迁移和侵袭能力及ZEB1、N-钙黏蛋白(cadherin)、波形蛋白(VIM)、基质金属蛋白酶(MMP)-9表达明显升高,E-cadherin表达明显降低(P<0.05);si-ZEB2-AS1组细胞增殖、迁移和侵袭能力及ZEB1、N-cadherin、VIM、MMP-9表达明显降低,E-cadherin表达明显增加(P<0.05)。与si-ZEB2-AS1组相比,si-ZEB2-AS1+miR-574-3p inhibitor组细胞增殖、迁移和侵袭能力及ZEB1、N-cadherin、VIM、MMP-9表达明显升高,E-cadherin表达明显降低(P<0.05)。双荧光素酶结果显示,高表达miR-574-3p可明显抑制ZEB1 WT的荧光素酶活性(P<0.05)。结论在卵巢癌中,LncRNA ZEB2-AS1过表达可能通过下调miR-574-3p,上调ZEB1的表达,进而诱导上皮-间质转化(EMT),促进卵巢癌细胞的迁移与侵袭。

巨噬细胞对内皮细胞系同源盒B2基因和血管内皮生长因子受体mRNA及整合素ανβ3表达的影响

目的 体外观察巨噬细胞(M)对血管内皮细胞同源盒(HOX)B2基因mRNA和血管内皮生长因子(VEGF)受体KDRmRNA及整合素ανβ3表达的影响。 方法 体外培养人脐静脉血管内皮细胞系ECV304,分为(1)ECV304组; (2)ECV304 +伴刀豆球蛋白A(conA,终浓度25mg/L)组; (3)ECV304+人M系U937组:ECV304细胞中加入1×105 /mlU937细胞; (4)ECV304+U937+conA组:ECV304中加入1×105 /mlU937细胞及终浓度25mg/L的conA.反应48h后,用免疫荧光技术检测各组ECV304细胞整合素ανβ3的表达情况,并用逆转录聚合酶链反应(RT PCR)技术检测细胞KDRmRNA和HOXB2基因mRNA的表达水平。 结果 ECV304组细胞的整合素ανβ3、KDRmRNA及HOXB2基因mRNA的表达水平分别为6. 7±1. 5、0. 633±0. 012、0. 674±0. 004。ECV304+U937+conA组细胞上述指标较ECV304组均明显上调(P<0. 01 ),分别为10. 2±1. 7、0. 879±0 003、0. 947±0 003。其余两组细胞上述指标与ECV304组比较,差异均无统计学意义(P>0. 05).结论 被conA活化的M通过影响内皮细胞的KDRmRNA、HOXB2mRNA基因及整合素ανβ3的表达,来促进内皮细胞增殖、迁移及与基质黏附,从而调节血管生成。

预测及分析长链非编码RNA HOTAIR的分子调控通路

目的:预测及分析长链非编码RNA HOTAIR的分子调控通路。方法:运用UCSC Genome Browser、LncBase、miRTar Base、JASPAR等数据库对长链非编码RNA HOTAIR(HOX transcript antisense RNA)的上游转录因子、下游靶miRNA及靶miRNA的靶基因进行生物信息学预测及分析,并进一步推导其分子调控通路。结果:HOTAIR受上游SP1、FOXD1、USF1、SPIB等转录因子的调控,其能调控下游miR-326的表达,SMO、NOTCH1、NOTCH2、CD9与HOTAIR的转录因子存在相互作用,形成一个反馈调控通路。结论:生物信息学预测分析显示xxx-xxx-xxx信号轴(或网络)可能是xxx的重要分子机制,为进一步研究长链非编码RNA功能机制提供新思路。

长链非编码RNA HOXC13-AS在胃癌中的表达及临床意义

目的探究长链非编码同源盒基因C13反义RNA(lnc RNA HOXC13-AS)在胃癌中的表达水平及在胃癌进展中的意义。方法选取胃癌患者112例,术中收集入组患者癌组织及癌旁组织(距病灶≥5 cm)。采用实时荧光定量(qRT-PCR)技术检测胃癌及癌旁组织中lnc RNA HOXC13-AS表达水平,分析其与患者临床病理特征及预后的关系。结果胃癌组织中lnc RNA HOXC13-AS表达水平明显高于癌旁组织(P<0.05)。T1~T2期浸润、Ⅰ~Ⅱ期TNM分期、高中分化、无脉管侵袭、无淋巴结转移、无远处转移患者胃癌组织lncRNA HOXC13-AS表达水平均低于T3~T4期浸润、Ⅲ期TNM分期、低分化、有脉管侵袭、有淋巴结转移、有远处转移患者(均P<0.05)。lnc RNA HOXC13-AS高表达组患者3年总生存明显低于lncRNA HOXC13-AS低表达组患者(P<0.05)。TNM分期Ⅲ期、淋巴结转移、远处转移及lnc RNA HOXC13-AS高表达是影响胃癌患者不良预后独立危险因素(均P<0.05)。结论与癌旁组织相比,胃癌组织中lncRNA HOXC13-AS表达水平明显升高,与T3~T4期浸润、Ⅲ期TNM分期、低分化、有脉管侵袭、有淋巴结转移及有远处转移等临床病理特征及生存率低等不良预后有关,可能作为生物标志物,为胃癌临床诊断及预后评估提供帮助。

长链非编码RNA HOTAIR在肿瘤中的研究进展

长链非编码RNA是多种生物学过程的关键调控因子,可在表观遗传学、转录及转录后等多层面调控基因表达,对个体生长发育及肿瘤发生、发展过程至关重要。新近研究显示,长链非编码RNA同源盒基因转录反义RNA(HOTAIR)在多种实体肿瘤中均高表达,且与肿瘤侵袭转移、预后等密切相关。该文对近年来HOTAIR在多种实体肿瘤中的研究进展予以综述。

矮小同源盒基因亚型2、Runt相关转录因子3基因甲基化在肺癌发生发展中的意义

目的探讨矮小同源盒基因亚型2（SHOX2）、Runt相关转录因子3（Runx3）基因甲基化在非小细胞肺癌（NSCLC）发生发展过程中的意义。 方法应用甲基化特异性聚合酶链反应（MSP）方法检测70例癌组织、60例癌旁组织和30例非肺癌良性切除组织中SHOX2、Runx3基因启动子区的甲基化率，分析NSCLC患者癌组织与癌旁组织甲基化水平的差异，并分析性别、年龄、吸烟史、临床分期及病理分型、分化程度、淋巴结转移对基因启动子区甲基化率的影响。 结果70例肺癌组织、60例癌旁组织、30例非肺癌良性切除组织中SHOX2、Runx3基因启动子区甲基化检出率分别为68.57%（48/70）、62.86%（44/70）；8.33%（5/60）、5.00%（3/60）；6.67%（2/30）、3.33%（1/29），三者基因甲基化检出率比较，差异有统计学意义（χ2＝64.530，P＝0.000；χ2＝63.350，P＝0.000）。SHOX2基因启动子区甲基化与分化程度（χ2＝8.672，P＝0.003）、淋巴结转移（χ2＝6.481，P＝0.011）明显相关；RUNX3基因启动子甲基化与病理分型（χ2＝4.749，P＝0.029）、临床分期（χ2＝7.035，P＝0.008）、分化程度（χ2＝9.341，P＝0.002）、淋巴结转移（χ2＝5.240，P＝0.022）明显相关。 结论SHOX2、Runx3基因启动子区的甲基化与NSCLC有关。

长链非编码RNA HOTAIR与肿瘤发生发展的研究进展

长链非编码RNA(lncRNAs)是一类无蛋白质编码功能的RNA分子,参与多种生物学过程的调控,在生命活动中扮演着重要角色,在表观遗传学水平、转录水平和转录后水平调控基因表达。同源盒基因转录反义RNA(HOTAIR)是第一个被发现的反义转录长链非编码RNA,因其在多种恶性实体肿瘤中高表达,且与肿瘤发生、发展密切相关而引起人们重视。HOTAIR与肿瘤发生、发展关系的研究,对深入了解肿瘤的发病机制具有重要的理论意义,同时为肿瘤的早期诊断和靶向治疗亦提供参考。

长链非编码RNA HOTAIR在肝癌细胞生物学行为中的调节作用及其机制研究进展

反义转录长链非编码RNA-同源盒基因转录反义RNA(HOTAIR)是在肝癌细胞中第一个被发现的长链非编码RNA,其可通过调控表观遗传和染色质状态来调节其基因的表达水平,并影响肝癌细胞的生物学行为。其中,HOTAIR可通过与PRC2转录抑制复合物结合,使其相应靶基因甲基化,从而诱导和促进肝癌细胞的激活与增殖,或者通过竞争同种miRNA,参与靶基因的水平表达调节,来促进肝癌细胞的侵袭与转移。沉默HOTAIR可通过调控miR-217-5p活化磷酸化-磷脂酰肌醇3-激酶/磷酸化-苏氨酸蛋白激酶/基质金属蛋白酶-2/9信号通路及降低磷酸化信号转导和转录激活因子3的表达水平,促进肝癌细胞凋亡现象的发生。

同源盒基因A11反义RNA在脑胶质瘤中的表达及生物学功能

目的探讨长链非编码RNA同源盒基因A11反义RNA(HOXA11-AS)在脑胶质瘤中的表达及生物学功能。方法首先分析HOXA11-AS在癌症基因组图谱(TCGA)计划数据库(689例)的低级别脑胶质瘤、胶质母细胞瘤以及GTEx数据库(255例)的正常脑组织样本中的表达情况。基于TCGA数据库,进一步分析HOXA11-AS在世界卫生组织(WHO)Ⅱ~Ⅳ级的脑胶质瘤样本中的表达情况。根据HOXA11-AS表达量的中位数分为高表达组和低表达组,并绘制Kaplan-Meier生存曲线,采用log-rank检验比较HOXA11-AS低表达组与高表达组脑胶质瘤患者的生存差异。进一步的体外实验以人星形胶质细胞为对照组,通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)实验验证HOXA11-AS在脑胶质瘤U251、U87及LN229细胞株中的表达。U87和LN229细胞株中分别使用携带HOXA11-AS cDNA序列的过表达慢病毒载体构建过表达HOXA11-AS的细胞株,使用空载慢病毒载体构建对照细胞株。U87和LN229细胞株中分别使用siRNA转染敲低HOXA11-AS的表达。进一步通过EdU增殖实验、细胞划痕实验和Transwell实验研究HOXA11-AS对胶质瘤细胞增殖、迁移以及侵袭能力的影响。结果HOXA11-AS在正常脑组织、低级别脑胶质瘤及胶质母细胞瘤中表达量的差异具有统计学意义(P<0.001)。TCGA数据库中,WHOⅢ、Ⅳ级脑胶质瘤的HOXA11-AS表达量均高于Ⅱ级脑胶质瘤(P<0.001)。全级别脑胶质瘤患者中,HOXA11-AS高表达组(n=344)的总生存期短于低表达组(n=345,P<0.001)。进一步的体外实验中,qRT-PCR检测结果显示,与对照组比较,U87组、LN229组及U251组HOXA11-AS的表达均升高(均P<0.001)。U87和LN229过表达组HOXA11-AS的表达均较其对照组上调(均P<0.001)。U87敲低组、LN229敲低组的HOXA11-AS表达均较其对照组下调(均P<0.001)。EdU增殖实验结果显示,U87和LN229过表达组的EdU阳性率分别高于U87和LN229对照组(均P<0.05);相反,U87敲低组较U87无义序列组、LN229敲低组较LN229无义序列组的EdU阳性率均下降(均P<0.001)。细胞划痕实验结果显示,U87和LN229过表达组的细胞迁移率分别高于U87和LN229对照组(均P<0.05);相反,U87敲低组较U87无义序列组、LN229敲低组较LN229无义序列组的细胞迁移率均下降(均P<0.001)。Transwell实验结果显示,U87和LN229过表达组的穿胶细胞数分别多于U87对照组和LN229对照组(均P<0.05);相反,U87敲低组较U87无义序列组、LN229敲低组较LN229无义序列组的穿胶细胞数均低(均P<0.05)。结论HOXA11-AS在脑胶质瘤中呈高表达,并可促进胶质瘤细胞的增殖、迁移和侵袭。

长链非编码RNA HOTAIR与消化系统恶性肿瘤的关系研究进展

长链非编码RNA(long non-encoding RNAs,lncRNAs)是一类转录本长度大于200 nt的不编码蛋白质的RNA分子。因缺乏可编码蛋白的开放阅读区,曾被视为基因转录的副产物。近些年大量研究发现在不同的人类肿瘤组织和细胞中伴有lncRNAs的异常表达,在恶性肿瘤的发生发展过程中扮演着重要的角色。其中,同源盒基因转录反义RNA(HOX transcript antisense RNA,HOTAIR)在多种消化系统恶性肿瘤组织中显著异常表达,并与肿瘤发生、侵袭转移、患者预后等密切相关。本文就近年来lncRNA-HOTAIR与多种消化系统肿瘤的关系研究的最新进展予以综述,为深入探讨HOTAIR在消化系统恶性肿瘤的早期临床分子诊断与肿瘤靶向治疗提供参考。

宫颈癌组织中lncRNA HOXD-AS1、miR-133a-3p的表达变化及其临床意义

目的观察宫颈癌组织中长链非编码RNA同源盒基因D-反义链1(lncRNA HOXD-AS1)、微小RNA-133a-3p(miR-133a-3p)的表达变化,并探讨其临床意义。方法选取手术切除的宫颈癌及其癌旁组织各92例份,采用qRT-PCR法检测上述组织lncRNA HOXD-AS1、miR-133a-3p,分析两指标间及其与宫颈癌临床病理参数的关系,Kaplan-Meier曲线分析不同lncRNA HOXD-AS1、miR-133a-3p表达水平宫颈癌患者术后3年总生存率,Cox回归分析法分析宫颈癌患者预后不良的影响因素。结果宫颈癌组织中lncRNA HOXD-AS1、miR-133a-3p相对表达量分别为2.064±0.644、0.947±0.305,癌旁组织分别为1.044±0.275、1.572±0.563,两者比较,P均<0.05。宫颈癌组织中lncRNA HOXD-AS1与miR-133a-3p表达呈负相关(r=-0.663,P<0.05)。lncRNA HOXD-AS1、miR-133a-3p表达与宫颈癌FIGO分期、淋巴结转移有关(P均<0.05)。lncRNA HOXD-AS1≥2.064患者(40例)和lncRNA HOXD-AS1<2.064患者(52例)术后3年总生存率分别为30.00%(12/40)、67.31%(35/52),两者比较,P<0.05;miR-133a-3p≥0.947患者(45例)和miR-133a-3p<0.947患者(47例)术后3年总生存率分别为68.89%(31/45)、34.04%(16/47),两者比较,P<0.05。多因素分析显示,FIGO分期Ⅲ~Ⅳ期、淋巴结转移、lncRNA HOXD-AS1≥2.064为宫颈癌患者预后不良独立风险因素,miR-133a-3p≥0.947为独立保护因素(P均<0.05)。结论宫颈癌组织中lncRNA HOXD-AS1表达升高,miR-133a-3p表达降低,两指标可能成为宫颈癌患者预后评估指标,lncRNA HOXD-AS1≥2.064及miR-133a-3p≥0.947时是宫颈癌患者预后不良的影响因素。