拟南芥同源转换盒基因A21反义RNA基因重组体的构建及转化

A2 1是拟南芥的一同源转换盒基因 ,在发育旺盛的组织中高度表达 .采用反义RNA技术 ,将该基因cDNA 5′端片段 410bp反向克隆到pTA70 0 2后 ,构建成了可在植物中调控表达A2 1反义RNA基因片段的重组体 .以根癌农杆菌浸渍法将重组体转入拟南芥Landsbergerecta生态型植株中 ,筛选到转A2 1反义RNA基因的拟南芥植株 .反义基因可在甾类激素诱导下表达出A2 1的反义RNA .经初步诱导表达 。

外周血长链非编码RNA-同源盒基因反义转录RNA与卵巢癌术后转归关系及意义

目的探讨外周血长链非编码RNA(Lnc RNA)-同源盒基因反义转录RNA(HOTAIR)与卵巢癌术后转归的关系及意义。方法选取自2014年5月至2016年5月武汉大学中南医院收治的138例卵巢癌患者为研究对象,根据复发情况将患者分为复发组(n=37)和未复发组(n=101)。比较两组患者术前、后的血清糖类抗原125(CA125)水平及Lnc RNA-HOTAIR表达情况;应用受试者工作特征曲线(ROC)分析CA125和Lnc RNA-HOTAIR对患者术后转归的预测价值。结果复发组的血清CA125水平、外周血Lnc RNA-HOTAIR表达均高于非复发组,组间比较,差异有统计学意义(P <0. 05)。ROC曲线分析结果显示,术前、术后Lnc RNA-HOTAIR和CA125对卵巢癌术后复发均有较高的预测价值,术前Lnc RNA-HOTAIR和CA125的最佳工作点分别为2. 75和356. 7 U/ml,术后Lnc RNA-HOTAIR和CA125的最佳工作点分别为1. 62和46. 3 U/ml。结论外周血Lnc RNA-HOTAIR表达水平与卵巢癌术后转归密切相关,可作为血清CA125的辅助指标对术后复发做出预测。

LncRNA ZEB1-AS1和LncRNA SOX2OT在糖尿病肾病患者中的表达及与肾功能的相关性研究

目的探究长链非编码RNA锌指E盒结合同源盒蛋白1反义链1(LncRNA ZEB1-AS1)和长链非编码RNA性别决定相关基因簇2重叠转录本(LncRNA SOX2OT)在糖尿病肾病(DN)患者中的表达及与肾功能的相关性。方法选取于2021年11月—2023年12月在武汉大学人民医院肾内科收治的DN患者106例为DN组,并根据24 h尿蛋白定量(24 h Upro)水平分为正常蛋白尿亚组43例(<30 mg)、微量蛋白尿亚组39例(30~<300 mg)、大量蛋白尿亚组24例(≥300 mg),另选取同期医院单纯糖尿病患者106例作对照组,检测患者血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT水平;Pearson法分析LncRNA ZEB1-AS1和LncRNA SOX2OT与肾功能指标的相关性;Logistic分析影响DN患者肾功能损伤的因素。结果DN组血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT水平低于对照组(t=11.471、10.257,P均<0.001)。血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT比较,正常尿蛋白亚组>微量尿蛋白亚组>大量尿蛋白亚组(F=58.720、117.722,P均<0.001),BUN、SCr、UA水平比较,正常尿蛋白亚组<微量尿蛋白亚组<大量尿蛋白亚组,差异均有统计学意义(F=122.493、595.589、53.178,P均<0.001);LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT分别与BUN、SCr、UA呈负相关(r=-0.487、-0.498、-0.521,-0.527、-0.515、-0.534,P均<0.001);Logistic回归分析显示,糖尿病病程长及高BUN、SCr、UA水平是影响DN患者肾功能损伤的危险因素[OR(95%CI)=1.672(1.128~2.479)、2.839(1.534~5.253)、2.754(1.512~5.017)、2.693(1.464~4.954)],高LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT是保护因素[OR(95%CI)=0.875(0.798~0.959)、0.898(0.832~0.969)]。结论血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT水平与DN患者肾功能有关,可能是评估DN患者肾功能的潜在指标。

lncRNA HAGLR促卵巢癌细胞生长和上皮-间充质转化的机制研究

目的研究长链非编码RNA同源盒D基因簇反义生长相关长链非编码RNA(lncRNA HAGLR)通过调控核苷酸结合寡聚化结构域样受体家族pyrin结构域蛋白3(NLRP3)炎症小体对卵巢癌细胞生长和上皮-间充质转化(EMT)的调控作用。方法培养卵巢正常细胞IOSE-80(IOSE-80组)以及卵巢癌细胞A2780(A2780组)。然后将A2780随机分为lncRNA HAGLR沉默组(siHAGLR组)、沉默阴性对照组(siNC组)、siHAGLR联合NLRP3抑制剂MCC950处理组(siHAGLR+MCC950组)。qRT-PCR法检测lncRNA HAGLR的表达。Western blot检测NLRP3炎症小体相关蛋白NLRP3、caspase-1、ASC和EMT相关蛋白Vimentin、Snail1、α-SMA、Twist1的表达。CCK-8法检测A2780细胞的增殖活性。Transwell法检测A2780细胞的迁移和侵袭能力。细胞克隆形成实验检测A2780细胞的生长能力。TUNEL染色检测A2780细胞的凋亡。结果与IOSE-80组相比,A2780组lncRNA HAGLR、Vimentin、Snail1、α-SMA、Twist1表达均上调(P<0.05),但NLRP3、caspase-1、ASC的表达均下调(P<0.05)。与siNC组相比,siHAGLR组的lncRNA HAGLR、Vimentin、Snail1、α-SMA、Twist1表达均下调(P<0.05),但NLRP3、caspase-1、ASC的表达均上调(P<0.05),细胞增殖率、细胞克隆数以及迁移和侵袭数均明显减少(P<0.05),细胞凋亡数则增加(P<0.05)。与siHAGLR组相比,siHAGLR+MCC950组的lncRNA HAGLR表达无明显变化(P>0.05),而Vimentin、Snail1、α-SMA、Twist1表达均上调(P<0.05),但NLRP3、caspase-1、ASC的表达均下调(P<0.05),细胞增殖率、细胞克隆数以及迁移和侵袭数均显著增加(P<0.05),细胞凋亡数则减少(P<0.05)。结论lncRNA HAGLR通过抑制NLRP3炎症小体促进卵巢癌细胞的生长和EMT。

长链非编码RNA同源盒基因A11反义RNA在急性淋巴细胞白血病患儿骨髓中的表达及意义

目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)同源盒基因A11反义RNA(HOXA11-AS)在急性淋巴细胞白血病(ALL)患儿骨髓中的表达及意义。方法选取108例初治ALL患儿及57例非肿瘤性疾病患儿,比较ALL患儿与非肿瘤性疾病患儿、不同ALL病理类型、治疗后不同疗效ALL患儿HOXA11-AS的相对表达量。实时逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测108例不同临床特征ALL患儿骨髓中HOXA11-AS的相对表达量。结果108例初治ALL患儿骨髓HOXA11-AS的相对表达量明显高于非肿瘤性疾病患儿(P﹤0.01),其中,B-ALL型初治ALL患儿骨髓HOXA11-AS的相对表达量明显低于T-ALL型患儿(P﹤0.01)。108例初治ALL患儿经2个周期的化疗后完全缓解46例,未完全缓解62例,完全缓解患儿HOXA11-AS的相对表达量明显低于未完全缓解和初治ALL患儿(P﹤0.01)。BCR/ABL融合基因阳性表达初治ALL患儿骨髓HOXA11-AS的相对表达量,明显高于BCR/ABL融合基因阴性表达患儿(P﹤0.05)。结论HOXA11-AS在ALL患儿中表达上调,并与ALL分型有关,其可能参与ALL的发生发展过程。

LncRNAHOTAIR靶向miR-17-5p/TXNIP对狼疮性肾炎进展的机制研究

目的探讨长链非编码RNA同源盒基因转录反义RNA(LncRNAHOTAIR)靶向miR-17-5p/硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)对狼疮性肾炎(LN)进展的机制。方法取60只MRL/lpr雌性小鼠,随机分为模型组、LncRNAHOTAIR敲低组、miR-17-5p agomir组、阴性对照组和LncRNAHOTAIR敲低+miR-17-5p antagomir组,每组12只,另取12只C57BL/6J雌性小鼠作为对照组,检测各组小鼠肾功能、免疫器官指数;以HE染色实验检测各组小鼠肾组织病理形态;以酶联免疫吸附测定(ELASA)法测定各组小鼠血清抗双链DNA(dsDNA)、免疫细胞因子免疫球蛋白G(IgG)、白细胞介素-6(IL-6)、单核细胞趋化蛋白1(MCP-1)及肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平;以实时荧光定量多聚核苷酸链式反应(qPCR)和免疫印迹法检测各组小鼠肾组织LncRNAHOTAIR、miR-17-5p及TXNIP表达。以双荧光素酶报告基因实验检测小鼠肾小球系膜细胞中LncRNAHOTAIR对miR-17-5p、miR-17-5p对TXNIP的靶向调节。结果与对照组比较,模型组小鼠肾组织发生严重病理损伤,胸腺指数、脾脏指数、miR-17-5p表达降低(P<0.05),尿蛋白浓度、血尿素氮(BUN)、血清抗dsDNA及IgG、IL-6、MCP-1、TNF-α、肾组织LncRNAHOTAIR及TXNIP表达升高(P<0.05)。与模型组比较,Ln⁃cRNAHOTAIR敲低组、miR-17-5p agomir组小鼠肾组织病理损伤减轻,胸腺指数、脾脏指数、miR-17-5p表达升高(P<0.05),尿蛋白浓度、BUN、血清抗dsDNA及IgG、IL-6、MCP-1、TNF-α、肾组织LncRNAHOTAIR及TXNIP表达降低(P<0.05)。下调miR-17-5p可减弱敲低LncRNAHOTAIR组对模型组小鼠各指标的作用。结论敲低LncRNAHOTAIR可通过上调miR-17-5p而降低TXNIP表达,进而减少LN小鼠免疫炎性因子产生,增强其免疫功能,抑制体内炎症发生发展,最终减轻小鼠肾组织损伤并改善其肾功能。

过表达lncRNA HAGLR促胫骨骨折大鼠骨髓间充质干细胞成骨分化的机制研究

目的研究骨质疏松(OP)-胫骨骨折(TF)大鼠长链非编码RNA同源盒D基因簇反义生长相关长链非编码RNA(lncRNA HAGLR)与其下游靶基因的表达情况,并探讨lncRNA HAGLR对大鼠骨髓间充质干细胞(MSC)成骨分化的作用与机制。方法30只SD雌性大鼠随机分为sham组、OP组、OP-TF组,每组10只。ELISA法检测大鼠血清碱性磷酸酶(ALP)和抗酒石酸酸性磷酸酶(TRAP)的水平。对大鼠MSC细胞系R7500使用成骨分化诱导培养基进行诱导,并分为MSC组和成骨诱导组(Osteogenic-MSC组)。分别转染pcDNA-HAGLR、pcDNA-NC、miR-19a-3p的模拟物(miR-19a-3p mimic)、mimic的阴性对照(NC mimic)、miR-19a-3p的抑制剂(miR-19a-3p inhibitor)、miR-19a-3p inhibitor的阴性对照(NC inhibitor)至R7500后进行相应分组。双荧光素酶报告基因实验验证lncRNA HAGLR和miR-19a-3p以及骨形态发生蛋白2(BMP2)和miR-19a-3p的靶向关系。qRT-PCR检测各组lncRNA HAGLR和miR-19a-3p的表达。Western blot检测BMP2、ALP、胶原蛋白I(COL-I)、骨钙素(OCN)、骨桥蛋白(OPN)的表达。ALP染色和AR染色检测MSC的成骨分化能力。结果OP组和OP-TF组的血清ALP和TRAP水平均高于sham组,差异有统计学意义(P<0.05)。而OP组与sham组胫骨组织中lncRNA HAGLR、miR-19a-3p、BMP2的表达水平比较差异均无统计学意义(P>0.05),而OP-TF组胫骨组织中lncRNA HAGLR、BMP2的表达水平均明显低于sham组和OP组(P<0.05),OP-TF组胫骨组织中miR-19a-3p的表达水平高于sham组和OP组(P<0.05)。与MSC组相比,Osteogenic-MSC组的lncRNA HAGLR表达水平明显升高(P<0.05),而miR-19a-3p的表达降低(P<0.05)。双荧光素酶报告基因实验表明lncRNA HAGLR与miR-19a-3p具有靶向关系,miR-19a-3p与BMP2具有靶向关系。pcDNA-HAGLR组的miR-19a-3p的表达水平低于pcDNA-NC组(P<0.05)。miR-19a-3p mimic组与NC mimic组的lncRNA HAGLR的表达水平比较,差异无统计学意义(P>0.05)。与NC mimic组相比,miR-19a-3p mimic组BMP2的表达水平降低(P<0.05),miR-19a-3p表达水平升高(P<0.05)。pcDNA-HAGLR组细胞较pcDNA-NC组具有更强的成骨分化能力和更高的ALP活性(P<0.05)。miR-19a-3p inhibitor组细胞较NC inhibitor组具有更强的成骨分化能力和更高的ALP活性(P<0.05)。结论胫骨骨折大鼠lncRNA HAGLR和BMP2表达降低,miR-19a-3p表达增高。过表达lncRNA HAGLR通过靶向调控miR-19a-3p/BMP2轴促进大鼠MSC的成骨分化。

长链非编码RNA HOXC13-AS在胃癌中的表达及临床意义

目的探究长链非编码同源盒基因C13反义RNA(lnc RNA HOXC13-AS)在胃癌中的表达水平及在胃癌进展中的意义。方法选取胃癌患者112例,术中收集入组患者癌组织及癌旁组织(距病灶≥5 cm)。采用实时荧光定量(qRT-PCR)技术检测胃癌及癌旁组织中lnc RNA HOXC13-AS表达水平,分析其与患者临床病理特征及预后的关系。结果胃癌组织中lnc RNA HOXC13-AS表达水平明显高于癌旁组织(P<0.05)。T1~T2期浸润、Ⅰ~Ⅱ期TNM分期、高中分化、无脉管侵袭、无淋巴结转移、无远处转移患者胃癌组织lncRNA HOXC13-AS表达水平均低于T3~T4期浸润、Ⅲ期TNM分期、低分化、有脉管侵袭、有淋巴结转移、有远处转移患者(均P<0.05)。lnc RNA HOXC13-AS高表达组患者3年总生存明显低于lncRNA HOXC13-AS低表达组患者(P<0.05)。TNM分期Ⅲ期、淋巴结转移、远处转移及lnc RNA HOXC13-AS高表达是影响胃癌患者不良预后独立危险因素(均P<0.05)。结论与癌旁组织相比,胃癌组织中lncRNA HOXC13-AS表达水平明显升高,与T3~T4期浸润、Ⅲ期TNM分期、低分化、有脉管侵袭、有淋巴结转移及有远处转移等临床病理特征及生存率低等不良预后有关,可能作为生物标志物,为胃癌临床诊断及预后评估提供帮助。

LncRNA FAM83H-AS1调控miR-136-5p/HOXC10轴对胶质瘤细胞增殖和凋亡的影响

目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)序列相似性家族83成员H反义RNA 1(lncRNA FAM83H-AS1)调控微小RNA-136-5p(miR-136-5p)/同源异型盒基因10(HOX10)轴对胶质瘤细胞增殖和凋亡的影响。方法体外培养人胶质瘤细胞U87,对U87细胞转染质粒,并将细胞分为对照组、si-NC组、si-FAM83H-AS1组、miR-NC组、miR-136-5p mimics组、si-FAM83H-AS+NC inhibitor组、si-FAM83H-AS+miR-136-5p inhibitor组、miR-136-5p mimics+HOXC10 NC组、miR-136-5p mimics+HOXC10组。检测胶质瘤组织与细胞U87中FAM83H-AS1、miR-136-5p、HOXC10的表达。细胞计数盒8(CCK-8)法检测U87细胞增殖;流式细胞仪检测U87细胞凋亡;蛋白免疫印迹(WB)法检测U87细胞中HOXC10、Cyclin D1、Bcl-2、Bax蛋白的表达;双荧光素酶报告系统分析miR-136-5p与FAM83H-AS1、HOXC10的靶向关系。结果胶质瘤组织中FAM83H-AS1表达水平显著升高,miR-136-5p表达水平降低(P<0.05);沉默FAM83H-AS1表达或过表达miR-136-5p,U87细胞凋亡率、Bax蛋白表达显著升高,细胞存活率、HOXC10 mRNA、Cyclin D1、Bcl-2蛋白表达显著降低(P<0.05);双荧光素酶报告基因显示,miR-136-5p与FAM83H-AS1、HOXC10均有靶向关系;抑制miR-136-5p表达可逆转沉默FAM83H-AS1表达对U87细胞增殖的抑制作用,HOXC10过表达可逆转过表达miR-136-5p对U87细胞增殖的抑制作用。结论FAM83H-AS1通过调控miR-136-5p/HOXC10轴促进胶质瘤细胞增殖,抑制细胞凋亡。

宫颈癌组织中lncRNA HOXD-AS1、miR-133a-3p的表达变化及其临床意义

目的观察宫颈癌组织中长链非编码RNA同源盒基因D-反义链1(lncRNA HOXD-AS1)、微小RNA-133a-3p(miR-133a-3p)的表达变化,并探讨其临床意义。方法选取手术切除的宫颈癌及其癌旁组织各92例份,采用qRT-PCR法检测上述组织lncRNA HOXD-AS1、miR-133a-3p,分析两指标间及其与宫颈癌临床病理参数的关系,Kaplan-Meier曲线分析不同lncRNA HOXD-AS1、miR-133a-3p表达水平宫颈癌患者术后3年总生存率,Cox回归分析法分析宫颈癌患者预后不良的影响因素。结果宫颈癌组织中lncRNA HOXD-AS1、miR-133a-3p相对表达量分别为2.064±0.644、0.947±0.305,癌旁组织分别为1.044±0.275、1.572±0.563,两者比较,P均<0.05。宫颈癌组织中lncRNA HOXD-AS1与miR-133a-3p表达呈负相关(r=-0.663,P<0.05)。lncRNA HOXD-AS1、miR-133a-3p表达与宫颈癌FIGO分期、淋巴结转移有关(P均<0.05)。lncRNA HOXD-AS1≥2.064患者(40例)和lncRNA HOXD-AS1<2.064患者(52例)术后3年总生存率分别为30.00%(12/40)、67.31%(35/52),两者比较,P<0.05;miR-133a-3p≥0.947患者(45例)和miR-133a-3p<0.947患者(47例)术后3年总生存率分别为68.89%(31/45)、34.04%(16/47),两者比较,P<0.05。多因素分析显示,FIGO分期Ⅲ~Ⅳ期、淋巴结转移、lncRNA HOXD-AS1≥2.064为宫颈癌患者预后不良独立风险因素,miR-133a-3p≥0.947为独立保护因素(P均<0.05)。结论宫颈癌组织中lncRNA HOXD-AS1表达升高,miR-133a-3p表达降低,两指标可能成为宫颈癌患者预后评估指标,lncRNA HOXD-AS1≥2.064及miR-133a-3p≥0.947时是宫颈癌患者预后不良的影响因素。

长链非编码RNA同源盒基因A11反义RNA对肝癌细胞增殖和肝癌相关基因表达的影响

目的探究长链非编码RNA(lncRNA)同源盒基因A11反义RNA(HOXA11-AS)对肝细胞癌(HCC)细胞增殖及HCC相关基因表达的影响。方法15例人HCC组织及癌旁组织由西安交通大学第二附属医院生物诊疗中心样本库于2017年6月至2019年11月收集。采用实时定量聚合酶链反应(qPCR)检测HOXA11-AS的表达并用RNA荧光原位杂交进行亚细胞定位;通过转染lncRNA Smart Silencer敲低Bel-7402和Hep3细胞中HOXA11-AS的表达,并采用细胞计数试剂(CCK-8)、平板克隆形成实验、流式细胞术检测细胞的增殖、周期及凋亡情况;利用qPCR芯片检测敲低HOXA11-AS对HCC相关基因表达的影响,使用R语言clusterProfiler包对差异基因进行功能富集分析,并通过rescue实验验证差异基因介导HOXA11-AS调控HCC细胞增殖的作用。分别采用t检验和Turkey检验分析两组或多组间差异。结果HOXA11-AS在HCC组织中的表达明显高于癌旁组织(9.72±5.99比5.53±4.92,t=2.09,P<0.05),在3种HCC细胞系(Bel-7402、HepG2和Hep3B)中的表达显著高于与正常肝细胞系L-O2(1.81±0.33、1.49±0.17、3.53±0.30比1.00±0.02,t=4.20、4.94、14.34,P均<0.05)。RNA荧光原位杂交显示HOXA11-AS在HCC细胞的胞核和胞质均有分布。HOXA11-AS功能缺失实验提示敲低组细胞增殖活性明显低于对照组(Bel-7402:0.95±0.03比1.27±0.07,t=8.60,P<0.01;Hep3B:0.59±0.04比0.74±0.03,t=6.00,P<0.01);敲低组细胞克隆形成数量显著低于对照组(Bel-7402:228.33±25.18比572.33±26.08,t=19.74,P<0.01;Hep3B:112.33±11.50比214.33±14.64,t=9.49,P<0.01);敲低组S期细胞比例显著高于对照组[Bel-7402:(33.13±2.37)%比(18.92±0.49)%,t=10.15,P<0.01;Hep3B:(27.66±0.85)%比(21.88±0.81)%,t=8.48,P<0.01];敲低组凋亡细胞比例显著高于对照组[Bel-7402:(18.50±0.95)%比(15.43±1.24)%,t=3.41,P<0.05;Hep3B:(8.65±0.88)%比(3.28±0.34)%,t=9.82,P<0.01]。qPCR芯片检测显示敲低HOXA11-AS可显著改变46个HCC相关基因的表达,这些基因显著富集于细胞增殖、周期和凋亡等相关生物学过程以及肿瘤坏死因子(TNF)、酪氨酸激酶(JAK)/信号转导与转录激活因子(STAT)、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)和Ras等肿瘤相关通路。过表达KIT、SPARC、HDAC10可逆转HOXA11-AS敲低对HCC细胞增殖的抑制作用。结论HOXA11-AS在HCC细胞中高表达,可通过影响细胞周期、凋亡以及HCC相关基因的表达促进HCC细胞增殖。

LncRNA HOTAIR在肿瘤中转录调控及作用机制的研究进展

长链非编码RNA(lncRNAs)在表观遗传学、转录水平及转录后水平等多方面广泛参与基因组的调控过程。其中,同源异型盒基因转录反义基因间RNA(HOTAIR)是目前探究的热点lncRNAs之一。HOTAIR在多种肿瘤中高表达,并可促进肿瘤恶性生物学行为的进展。但HOTAIR的转录调控机制异常复杂,受雌激素、雌激素内分泌干扰物、原癌基因c-Myc等许多因素的调控,还可通过与多梳蛋白抑制复合体2和赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶1复合物结合、作为竞争性内源RNA、激活信号通路等方式发挥作用。HOTAIR在肿瘤中的具体转录调控及作用机制的深入研究可为靶向阻断HOTAIR表达及作用途径提供理论基础,从而实现肿瘤的精准治疗。

lncRNA HOTAIR在卵巢癌发生发展中的作用机制及其临床应用研究进展

长链非编码RNA同源异型盒基因转录反义基因间RNA(HOTAIR)在卵巢癌组织和循环中表达上调,能够增加卵巢癌的易感性,促进肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭,抑制细胞凋亡,干扰细胞周期进展,促进细胞自噬以及诱导上皮-间充质转化,从而介导卵巢癌的发生发展过程。循环HOTAIR检测可应用于卵巢癌的诊断。多项研究表明,HOTAIR高表达常预示卵巢癌患者预后不良,靶向HOTAIR可逆转卵巢癌化疗耐药性及抑制卵巢癌进展。HOTAIR有望作为卵巢癌生物诊断、预后评估的标志物以及潜在的治疗靶点。

急性髓系白血病患者血浆lncRNA同源盒基因A-反义链2和miR-124-3p表达及其与预后的关系

目的观察急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)患者血浆长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)同源盒基因A-反义链2(homeobox gene A-antisense strand 2,HOXA-AS2)、miR-124-3p的表达情况,探讨其与临床病理特征及预后的关系。方法AML患者116例为AML组,均根据AML分型给予标准化疗方案治疗。同期体检健康者116例为对照组。采用实时荧光定量PCR法检测AML组入院时2组血浆lncRNA HOXA-AS2、miR-124-3p相对表达量;比较不同临床病理特征AML患者血浆lncRNA HOXA-AS2、miR-124-3p相对表达量;采用Pearson相关性分析AML患者血浆lncRNA HOXA-AS2与miR-124-3p相对表达量的相关性。AML患者根据lncRNA HOXA-AS2、miR-124-3p相对表达量均值分为lncRNA HOXA-AS2高表达组(lncRNA HOXA-AS2相对表达量≥3.54)62例和lncRNA HOXA-AS2低表达组(lncRNA HOXA-AS2相对表达量<3.54)54例、miR-124-3p高表达组(miR-124-3p相对表达量≥0.99)55例和miR-124-3p低表达组(miR-124-3p相对表达量<0.99)61例。随访3年,采用Kaplan-Meier生存曲线分析lncRNA HOXA-AS2与miR-124-3p高、低表达组患者3年总生存率;采用多因素Cox回归分析AML患者预后不良的影响因素。结果AML组血浆lncRNA HOXA-AS2相对表达量(3.54±0.98)高于对照组(0.82±0.25)(t=28.942,P<0.001),miR-124-3p相对表达量(0.99±0.37)低于对照组(3.47±1.29)(t=—19.945,P<0.001)。AML患者白细胞计数≥30×10^(9)/L、骨髓原始细胞比率≥70%者lncRNA HOXA-AS2相对表达量(3.76±0.87、3.75±0.89)分别高于白细胞计数<30×10^(9)/L(3.33±1.04)、骨髓原始细胞比率<70%者(3.24±1.03)(t=2.406,P=0.018;t=2.886,P=0.005),miR-124-3p相对表达量(0.88±0.35、0.91±0.36)分别低于白细胞计数<30×10^(9)/L(1.09±0.37)、骨髓原始细胞比率<70%者(1.10±0.37)(t=-3.171,P=0.002;t=-2.776,P=0.006)。预后危险度分层高危者lncRNA HOXA-AS2相对表达量高于中危、低危者(P<0.05),中危者高于低危者(P<0.05);高危者miR-124-3p相对表达量低于中危、低危者(P<0.05),中危者低于低危者(P<0.05)。AML患者血浆lncRNA HOXA-AS2与miR-124-3p相对表达量呈负相关(r=—0.684,P<0.001)。lncRNA HOXA-AS2高表达组3年总生存率(27.42%)低于lncRNA HOXA-AS2低表达组(62.96%)(χ^(2)=9.646,P=0.002),miR-124-3p低表达组3年总生存率(31.15%)低于miR-124-3p高表达组(58.18%)(χ^(2)=10.318,P=0.001)。白细胞计数≥30×10^(9)/L(HR=2.249,95%CI:1.298~3.895,P=0.004)、预后危险度分层高危(HR=1.595,95%CI:1.060~2.856,P=0.031)、lncRNA HOXA-AS2相对表达量≥3.54(HR=1.780,95%CI:1.152~3.168,P=0.038)、miR-124-3p相对表达量<0.99(HR=0.500,95%CI:0.279~0.897,P=0.020)是AML患者预后不良的危险因素。结论白细胞计数≥30×10^(9)/L、骨髓原始细胞比率≥70%、预后危险度分层高危的AML患者lncRNA HOXA-AS2表达增高、miR-124-3p表达降低,lncRNA HOXA-AS2相对表达量≥3.54、miR-124-3p相对表达量<0.99的AML患者可能预后不良。

长链非编码RNA HOTAIR在肝癌细胞生物学行为中的调节作用及其机制研究进展

反义转录长链非编码RNA-同源盒基因转录反义RNA(HOTAIR)是在肝癌细胞中第一个被发现的长链非编码RNA,其可通过调控表观遗传和染色质状态来调节其基因的表达水平,并影响肝癌细胞的生物学行为。其中,HOTAIR可通过与PRC2转录抑制复合物结合,使其相应靶基因甲基化,从而诱导和促进肝癌细胞的激活与增殖,或者通过竞争同种miRNA,参与靶基因的水平表达调节,来促进肝癌细胞的侵袭与转移。沉默HOTAIR可通过调控miR-217-5p活化磷酸化-磷脂酰肌醇3-激酶/磷酸化-苏氨酸蛋白激酶/基质金属蛋白酶-2/9信号通路及降低磷酸化信号转导和转录激活因子3的表达水平,促进肝癌细胞凋亡现象的发生。

LncRNA HOTAIR、VEGF在肾上腺恶性肿瘤组织中的表达及其预后相关性

目的研究肾上腺恶性肿瘤患者长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)人类同源盒基因转录反义间RNA(HOX transcript antisense intergenic RNA,HOXTAIR)、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)表达水平,并分析其与患者预后的关系。方法选取2014年1月至2017年1月于沧州市人民医院手术治疗切除的肾上腺标本167例患者。采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)法检测所有研究对象组织HOTAIR、VEGF mRNA表达水平。Pearson法分析肾上腺恶性肿瘤组织HOTAIR与VEGF的相关性。Kaplan-Meier法评估HOTAIR、VEGF mRNA表达水平与肾上腺恶性肿瘤患者生存情况关系。采用COX法分析影响肾上腺恶性肿瘤患者预后的因素。结果与良性肾上腺组织相比,肾上腺恶性肿瘤组织HOTAIR、VEGF mRNA相对表达水平较高(P<0.05)。HOTAIR与VEGF呈正相关(r=0.739,P<0.05)。HOTAIR、VEGF mRNA与肾上腺肿瘤临床病理特征的关系显示HOTAIR、VEGF mRNA与有无远处转移相关(P<0.05),与年龄、性别、肿瘤直径、肿瘤单发或多发无关(P>0.05)。HOTAIR低表达肾上腺肿瘤患者平均生存时间为(32.09±0.92)个月,显著长于HOTAIR高表达肾上腺肿瘤患者(21.64±1.49)个月(P<0.05);VEGF mRNA低表达肾上腺肿瘤患者平均生存时间为(31.81±0.97)个月,显著长于VEGF mRNA高表达肾上腺肿瘤患者(22.37±1.47)个月(P<0.05)。多因素分析表明,远处转移、HOTAIR高表达、VEGF高表达是影响肾上腺肿瘤患者不良预后的独立危险因素。结论LncRNA HOTAIR、VEGF在肾上腺恶性肿瘤组织表达上调,可能是肾上腺肿瘤患者不良预后的生物标志物。

同源盒基因转录反义RNA(HOTAIR)在乳腺癌临床诊疗中的研究进展

同源盒基因转录反义RNA(HOTAIR)是第一个被发现具有反式转录调控作用的长链非编码RNA。作为反义RNA,HOTAIR本身并不编码蛋白质,而是以反式转录调控因子作用于不同染色体上的HOX基因簇,从而在基因组调控和肿瘤的发生、发展中起着重要作用。研究表明,HOTAIR与人类多种肿瘤(如乳腺癌、结直肠癌、肝癌、胰腺癌、喉癌等)的发生、发展及转移预后密切相关,高表达HOTAIR能抑制抑癌基因的表达,促进肿瘤复发转移,而下调HOTAIR表达则降低肿瘤细胞的转移侵袭能力。近年来研究逐渐证实,HOTAIR在乳腺癌组织、细胞系及其外周血中存在异常表达,并且这种表达失调有助于阐明乳腺癌的发生机制及耐药机制。临床研究则进一步表明,检测HOTAIR的表达水平不仅有助于提高乳腺癌的诊断敏感性和特异性,而且有助于促进临床上对乳腺癌的病情评估、预后判断、疗效评价和肿瘤复发转移的动态监测。此外,HOTAIR表达可能与乳腺癌不同激素受体类型的生物学行为相关。在乳腺癌治疗方面的探索研究则显示,通过设计HOTAIR促癌通路上的相应抗肿瘤药物或将能够为某些难治性乳腺癌的治疗带来曙光,比如他莫昔芬耐药乳腺癌。本文将对近几年上述研究进展进行综述。

同源异型盒基因C13在食管鳞癌中表达与其病理特征和预后的关系

目的探讨检测同源异型盒基因C13(HOXC13)在食管鳞癌的表达及其临床意义。方法采用实时PCR检测120例食管鳞癌组织和癌旁正常食管组织中HOXC13基因表达水平,分析其与临床病理特征的关系和食管鳞癌生存时间的影响因素。结果与癌旁正常食管组织相比,食管鳞癌组织中HOXC13基因表达水平上调(P<0.05);HOXC13水平升高与食管鳞癌T分期、淋巴结转移和TNM分期密切相关(P<0.05);HOXC13基因高表达的食管鳞癌患者5年总生存率降低(P<0.05)。Cox回归分析显示,HOXC13基因高表达为食管鳞癌预后的危险因素(P<0.05)。结论HOXC13在食管鳞癌组织中表达升高,与患者T分期、淋巴结转移、TNM分期和预后密切相关。

同源盒基因A11反义RNA在脑胶质瘤中的表达及生物学功能

目的探讨长链非编码RNA同源盒基因A11反义RNA(HOXA11-AS)在脑胶质瘤中的表达及生物学功能。方法首先分析HOXA11-AS在癌症基因组图谱(TCGA)计划数据库(689例)的低级别脑胶质瘤、胶质母细胞瘤以及GTEx数据库(255例)的正常脑组织样本中的表达情况。基于TCGA数据库,进一步分析HOXA11-AS在世界卫生组织(WHO)Ⅱ~Ⅳ级的脑胶质瘤样本中的表达情况。根据HOXA11-AS表达量的中位数分为高表达组和低表达组,并绘制Kaplan-Meier生存曲线,采用log-rank检验比较HOXA11-AS低表达组与高表达组脑胶质瘤患者的生存差异。进一步的体外实验以人星形胶质细胞为对照组,通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)实验验证HOXA11-AS在脑胶质瘤U251、U87及LN229细胞株中的表达。U87和LN229细胞株中分别使用携带HOXA11-AS cDNA序列的过表达慢病毒载体构建过表达HOXA11-AS的细胞株,使用空载慢病毒载体构建对照细胞株。U87和LN229细胞株中分别使用siRNA转染敲低HOXA11-AS的表达。进一步通过EdU增殖实验、细胞划痕实验和Transwell实验研究HOXA11-AS对胶质瘤细胞增殖、迁移以及侵袭能力的影响。结果HOXA11-AS在正常脑组织、低级别脑胶质瘤及胶质母细胞瘤中表达量的差异具有统计学意义(P<0.001)。TCGA数据库中,WHOⅢ、Ⅳ级脑胶质瘤的HOXA11-AS表达量均高于Ⅱ级脑胶质瘤(P<0.001)。全级别脑胶质瘤患者中,HOXA11-AS高表达组(n=344)的总生存期短于低表达组(n=345,P<0.001)。进一步的体外实验中,qRT-PCR检测结果显示,与对照组比较,U87组、LN229组及U251组HOXA11-AS的表达均升高(均P<0.001)。U87和LN229过表达组HOXA11-AS的表达均较其对照组上调(均P<0.001)。U87敲低组、LN229敲低组的HOXA11-AS表达均较其对照组下调(均P<0.001)。EdU增殖实验结果显示,U87和LN229过表达组的EdU阳性率分别高于U87和LN229对照组(均P<0.05);相反,U87敲低组较U87无义序列组、LN229敲低组较LN229无义序列组的EdU阳性率均下降(均P<0.001)。细胞划痕实验结果显示,U87和LN229过表达组的细胞迁移率分别高于U87和LN229对照组(均P<0.05);相反,U87敲低组较U87无义序列组、LN229敲低组较LN229无义序列组的细胞迁移率均下降(均P<0.001)。Transwell实验结果显示,U87和LN229过表达组的穿胶细胞数分别多于U87对照组和LN229对照组(均P<0.05);相反,U87敲低组较U87无义序列组、LN229敲低组较LN229无义序列组的穿胶细胞数均低(均P<0.05)。结论HOXA11-AS在脑胶质瘤中呈高表达,并可促进胶质瘤细胞的增殖、迁移和侵袭。

肝细胞癌患者血清PTPN3、VEGF、IRX5、HOTAIR的表达水平及其与病理特征和预后的相关性

目的检测血清蛋白质酪氨酸磷酸酶3(PTPN3)、血管内皮生长因子(VEGF)、易洛魁族同源盒基因5(IRX5)、长链非编码RNA HOX转录反义RNA(HOTAIR)在肝细胞癌(HCC)中的表达水平,并分析其与患者的病理特征和预后的相关性,为临床工作提供血清学参考。方法选取2020年6月至2022年10月南阳市中心医院收治的117例HCC患者作为观察组,另选取同期117例良性肝内结节患者作为对照组,比较两组患者的血清PTPN3、VEGF、IRX5、HOTAIR水平,分析HCC患者血清PTPN3、VEGF、IRX5、HOTAIR水平与病理特征的关系。随访6个月,依据患者预后情况分为预后良好组72例和预后不良组45例,比较不同预后患者的血清PTPN3、VEGF、IRX5、HOTAIR水平,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清PTPN3、VEGF、IRX5、HOTAIR单独及联合预测HCC预后的效能,采用相对危险度(RR)分析血清PTPN3、VEGF、IRX5、HOTAIR水平与HCC预后的关系。结果观察组患者的血清PTPN3、VEGF、IRX5、HOTAIR水平分别为(181.42±10.19)ng/mL、(154.66±11.82)μmol/L、(82.42±8.23)ng/mL、1.20±0.28,明显高于对照组的(86.64±13.28)ng/m L、(83.64±9.50)μmol/L、(34.80±6.63)ng/m L、1.07±0.25,差异均有统计学意义(P<0.05);不同TNM分期、分化程度、肿瘤直径、伴肝硬化、区域淋巴结转移、Ki-67指数、脉管内瘤栓、包膜侵犯HCC患者血清PTPN3、VEGF、IRX5、HOTAIR水平比较,差异均有统计学意义(P<0.05);肿瘤多发患者的血清VEGF水平为(154.10±10.26)μmol/L,明显高于肿瘤单发患者的(191.62±9.45)μmol/L,差异有统计学意义(P<0.05);治疗后2个月,预后良好患者的血清PTPN3、VEGF、IRX5、HOTAIR水平分别为(153.69±22.24)ng/m L、(113.27±25.64)μmol/L、(70.53±10.24)ng/m L、1.15±0.23,明显低于预后不良患者的(217.58±27.06)ng/m L、(215.33±38.19)μmol/L、(96.35±14.88)ng/m L、1.36±0.28,差异均有统计学意义(P<0.05);绘制血清PTPN3、VEGF、IRX5、HOTAIR单独及联合预测HCC预后的ROC,结果显示各血清联合预测的AUC最大,为0.924(95%CI:0.860~0.965);HCC预后不良的危险度分析结果显示,血清PTPN3、VEGF、IRX5、HOTAIR所致RR值分别为4.604(95%CI:2.602~8.145)、7.139(95%CI:3.660~13.924)、4.733(95%CI:2.749~8.149)、4.690(95%CI:2.575~8.544)(P<0.05)。结论血清PTPN3、VEGF、IRX5、HOTAIR在HCC中的表达异常升高,且与病理特征联系密切,对患者预后有一定评估作用。