基于加权共表达网络分析对下咽癌枢纽基因HOXB9的鉴定

目的:探讨基于加权共表达网络分析,用免疫组织化学法对其结果进行验证,分析枢纽基因HOXB9在下咽癌中的作用。方法:根据TCGA的数据,确定了3496个头颈鳞状细胞癌(HNSCC)和正常样本之间差异表达的基因;选择这些差异基因进行富集分析及加权基因共表达网络分析(WGCNA)确定HNSCC患者临床特征相关的基因模块;随后对其中的枢纽模块进行预后生存分析发现关键基因;对关键基因进行免疫组织验证。结果:数据分析得出肿瘤中的差异表达基因及关键基因模块;关键模块基因的预后生存分析发现11个关键基因;通过免疫组化验证HOXB9,证实HOXB9在下咽癌中表达水平明显上调(P<0.05)。结论:HOXB9在下咽癌肿瘤中明显高表达,且可能与肿瘤分期及淋巴结转移相关,这可能成为下咽癌潜在的预后标志物及治疗靶点。

结直肠癌中同源盒基因B9的表达及临床意义

目的通过检测结直肠癌组织中同源盒基因B9(HOXB9)基因的表达模式,探讨HOXB9基因的表达与结直肠癌患者临床病理特征的相关联系。方法应用RT-PCR、Real-time PCR及Western blot方法分别检测HOXB9在不同转移潜能的结直肠癌细胞系、8例结直肠癌及相应癌旁组织中mRNA和蛋白表达水平的表达差异;采用免疫组化方法检测HOXB9在136例结直肠癌石蜡组织标本中的表达特点,分析其与结直肠癌临床病理特征的相关联系及意义。结果 HOXB9基因在具有较高转移潜能的结直肠癌细胞系SW620、Lovo及M5中表达明显上调;在8例结直肠癌组织中HOXB9基因在mRNA及蛋白的表达明显高于相应癌旁正常组织;免疫组化的检测结果则显示在结直肠癌组织中HOXB9蛋白表达的阳性率为83.1%(113/136),强阳性率约为58.8%(80/136),HOXB9蛋白在结直肠癌组织中的表达水平高于相应癌旁组织;统计学分析结果表明,HOXB9蛋白的高表达与结直肠癌临床分期、T分期、淋巴结转移及远处转移密切相关,而与性别、年龄、肿瘤部位、肿瘤大小及分化程度无显著相关性。结论 HOXB9在结直肠癌组织中的表达明显上调,其上调表达与结直肠癌的临床进展关系密切,提示HOXB9在肿瘤发生和转移中可能承担着关键作用。

小干扰RNA沉默同源盒基因B9对前列腺癌细胞侵袭、迁移能力的影响

目的观察小干扰RNA（siRNA）靶向沉默同源盒基因B9（HOXB9）基因对前列腺癌PC3和DU145细胞侵袭、迁移能力的调控。方法将HOXB9siRNA、negative control（NC）siRNA通过Silentfect转染至PC3和DU145细胞株将细胞分为两组（si-HOXB9组和si-NC组），通过Western blot方法检测HOXB9基因表达变化；Transwell实验检测细胞侵袭、迁移能力；采用Western blot法检测两细胞株（PC3、DU145）转染后上皮-间充质转化（EMT）相关分子标志物：N-钙黏蛋白（N-cadherin）、E-钙黏蛋白（E-cadherin）、波形蛋白（Vimentin）的表达变化。结果转染HOXB9siRNA后，PC3和DU145细胞内HOXB9相对表达水平明显下调，差异有统计学意义（PC3：si-HOXB9组（0．440±0．007）对比si-NC组（0．858±0．024，P=0．001）；DU145：si-HOXB9组（0．480±0．009）对比si-NC组（0．960±0．014，P=0．001）。两细胞株si-HOXB9组N-cadherin、Vimentin蛋白表达水平较其si-NC组明显降低，E-cadherin则显著升高。Transwell侵袭、迁移实验显示转染后两细胞株的侵袭（P=0．005、0．002）和迁移（P=0．001、0．001）能力明显减弱。结论HOXB9siRNA能特异性下调前列腺癌PC3和DU145细胞中HOXB9的表达，并降低细胞的侵袭和迁移能力，其作用机制可能与EMT相关。