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基于加权共表达网络分析对下咽癌枢纽基因HOXB9的鉴定
1
作者
唐进渝
刘康
+2 位作者
钟春燕
黄琴
杜经纬
《川北医学院学报》
CAS
2024年第9期1153-1160,共8页
目的:探讨基于加权共表达网络分析,用免疫组织化学法对其结果进行验证,分析枢纽基因HOXB9在下咽癌中的作用。方法:根据TCGA的数据,确定了3496个头颈鳞状细胞癌(HNSCC)和正常样本之间差异表达的基因;选择这些差异基因进行富集分析及加权...
目的:探讨基于加权共表达网络分析,用免疫组织化学法对其结果进行验证,分析枢纽基因HOXB9在下咽癌中的作用。方法:根据TCGA的数据,确定了3496个头颈鳞状细胞癌(HNSCC)和正常样本之间差异表达的基因;选择这些差异基因进行富集分析及加权基因共表达网络分析(WGCNA)确定HNSCC患者临床特征相关的基因模块;随后对其中的枢纽模块进行预后生存分析发现关键基因;对关键基因进行免疫组织验证。结果:数据分析得出肿瘤中的差异表达基因及关键基因模块;关键模块基因的预后生存分析发现11个关键基因;通过免疫组化验证HOXB9,证实HOXB9在下咽癌中表达水平明显上调(P<0.05)。结论:HOXB9在下咽癌肿瘤中明显高表达,且可能与肿瘤分期及淋巴结转移相关,这可能成为下咽癌潜在的预后标志物及治疗靶点。
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关键词
同源盒b9
头颈部鳞状细胞癌
下咽癌
数据库分析
下载PDF
职称材料
结直肠癌中同源盒基因B9的表达及临床意义
被引量:
2
2
作者
刘逸
陈名华
+3 位作者
陈德鑫
朱文奕
王丹
周军
《中国热带医学》
CAS
2014年第4期396-400,共5页
目的通过检测结直肠癌组织中同源盒基因B9(HOXB9)基因的表达模式,探讨HOXB9基因的表达与结直肠癌患者临床病理特征的相关联系。方法应用RT-PCR、Real-time PCR及Western blot方法分别检测HOXB9在不同转移潜能的结直肠癌细胞系、8例结直...
目的通过检测结直肠癌组织中同源盒基因B9(HOXB9)基因的表达模式,探讨HOXB9基因的表达与结直肠癌患者临床病理特征的相关联系。方法应用RT-PCR、Real-time PCR及Western blot方法分别检测HOXB9在不同转移潜能的结直肠癌细胞系、8例结直肠癌及相应癌旁组织中mRNA和蛋白表达水平的表达差异;采用免疫组化方法检测HOXB9在136例结直肠癌石蜡组织标本中的表达特点,分析其与结直肠癌临床病理特征的相关联系及意义。结果 HOXB9基因在具有较高转移潜能的结直肠癌细胞系SW620、Lovo及M5中表达明显上调;在8例结直肠癌组织中HOXB9基因在mRNA及蛋白的表达明显高于相应癌旁正常组织;免疫组化的检测结果则显示在结直肠癌组织中HOXB9蛋白表达的阳性率为83.1%(113/136),强阳性率约为58.8%(80/136),HOXB9蛋白在结直肠癌组织中的表达水平高于相应癌旁组织;统计学分析结果表明,HOXB9蛋白的高表达与结直肠癌临床分期、T分期、淋巴结转移及远处转移密切相关,而与性别、年龄、肿瘤部位、肿瘤大小及分化程度无显著相关性。结论 HOXB9在结直肠癌组织中的表达明显上调,其上调表达与结直肠癌的临床进展关系密切,提示HOXB9在肿瘤发生和转移中可能承担着关键作用。
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关键词
结直肠癌
同源
盒
基因
b
9
转移
原文传递
小干扰RNA沉默同源盒基因B9对前列腺癌细胞侵袭、迁移能力的影响
被引量:
1
3
作者
许浩
沈馨
+1 位作者
吴鼎
孙晓青
《中华实验外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第7期1283-1285,共3页
目的观察小干扰RNA(siRNA)靶向沉默同源盒基因B9(HOXB9)基因对前列腺癌PC3和DU145细胞侵袭、迁移能力的调控。方法将HOXB9siRNA、negative control(NC)siRNA通过Silentfect转染至PC3和DU145细胞株将细胞分为两组(si-HOXB9组和si...
目的观察小干扰RNA(siRNA)靶向沉默同源盒基因B9(HOXB9)基因对前列腺癌PC3和DU145细胞侵袭、迁移能力的调控。方法将HOXB9siRNA、negative control(NC)siRNA通过Silentfect转染至PC3和DU145细胞株将细胞分为两组(si-HOXB9组和si-NC组),通过Western blot方法检测HOXB9基因表达变化;Transwell实验检测细胞侵袭、迁移能力;采用Western blot法检测两细胞株(PC3、DU145)转染后上皮-间充质转化(EMT)相关分子标志物:N-钙黏蛋白(N-cadherin)、E-钙黏蛋白(E-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)的表达变化。结果转染HOXB9siRNA后,PC3和DU145细胞内HOXB9相对表达水平明显下调,差异有统计学意义(PC3:si-HOXB9组(0.440±0.007)对比si-NC组(0.858±0.024,P=0.001);DU145:si-HOXB9组(0.480±0.009)对比si-NC组(0.960±0.014,P=0.001)。两细胞株si-HOXB9组N-cadherin、Vimentin蛋白表达水平较其si-NC组明显降低,E-cadherin则显著升高。Transwell侵袭、迁移实验显示转染后两细胞株的侵袭(P=0.005、0.002)和迁移(P=0.001、0.001)能力明显减弱。结论HOXB9siRNA能特异性下调前列腺癌PC3和DU145细胞中HOXB9的表达,并降低细胞的侵袭和迁移能力,其作用机制可能与EMT相关。
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关键词
同源
盒
基因
b
9
前列腺癌
RNA干扰
上皮-间充质转化
侵袭
迁移
原文传递
题名
基于加权共表达网络分析对下咽癌枢纽基因HOXB9的鉴定
1
作者
唐进渝
刘康
钟春燕
黄琴
杜经纬
机构
川北医学院附属南充市中心医院
川北医学院附属南充市中心医院
出处
《川北医学院学报》
CAS
2024年第9期1153-1160,共8页
基金
四川省南充市市校合作课题(20SXQT0105)。
文摘
目的:探讨基于加权共表达网络分析,用免疫组织化学法对其结果进行验证,分析枢纽基因HOXB9在下咽癌中的作用。方法:根据TCGA的数据,确定了3496个头颈鳞状细胞癌(HNSCC)和正常样本之间差异表达的基因;选择这些差异基因进行富集分析及加权基因共表达网络分析(WGCNA)确定HNSCC患者临床特征相关的基因模块;随后对其中的枢纽模块进行预后生存分析发现关键基因;对关键基因进行免疫组织验证。结果:数据分析得出肿瘤中的差异表达基因及关键基因模块;关键模块基因的预后生存分析发现11个关键基因;通过免疫组化验证HOXB9,证实HOXB9在下咽癌中表达水平明显上调(P<0.05)。结论:HOXB9在下咽癌肿瘤中明显高表达,且可能与肿瘤分期及淋巴结转移相关,这可能成为下咽癌潜在的预后标志物及治疗靶点。
关键词
同源盒b9
头颈部鳞状细胞癌
下咽癌
数据库分析
Keywords
HOX
b
9
Head and neck squamous cell carcinoma
Hypopharyngeal carcinoma
Data
b
ase analysis
分类号
R766.5 [医药卫生—耳鼻咽喉科]
下载PDF
职称材料
题名
结直肠癌中同源盒基因B9的表达及临床意义
被引量:
2
2
作者
刘逸
陈名华
陈德鑫
朱文奕
王丹
周军
机构
南方医科大学基础医学院病理学系
南方医院病理科
出处
《中国热带医学》
CAS
2014年第4期396-400,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.81272763)
文摘
目的通过检测结直肠癌组织中同源盒基因B9(HOXB9)基因的表达模式,探讨HOXB9基因的表达与结直肠癌患者临床病理特征的相关联系。方法应用RT-PCR、Real-time PCR及Western blot方法分别检测HOXB9在不同转移潜能的结直肠癌细胞系、8例结直肠癌及相应癌旁组织中mRNA和蛋白表达水平的表达差异;采用免疫组化方法检测HOXB9在136例结直肠癌石蜡组织标本中的表达特点,分析其与结直肠癌临床病理特征的相关联系及意义。结果 HOXB9基因在具有较高转移潜能的结直肠癌细胞系SW620、Lovo及M5中表达明显上调;在8例结直肠癌组织中HOXB9基因在mRNA及蛋白的表达明显高于相应癌旁正常组织;免疫组化的检测结果则显示在结直肠癌组织中HOXB9蛋白表达的阳性率为83.1%(113/136),强阳性率约为58.8%(80/136),HOXB9蛋白在结直肠癌组织中的表达水平高于相应癌旁组织;统计学分析结果表明,HOXB9蛋白的高表达与结直肠癌临床分期、T分期、淋巴结转移及远处转移密切相关,而与性别、年龄、肿瘤部位、肿瘤大小及分化程度无显著相关性。结论 HOXB9在结直肠癌组织中的表达明显上调,其上调表达与结直肠癌的临床进展关系密切,提示HOXB9在肿瘤发生和转移中可能承担着关键作用。
关键词
结直肠癌
同源
盒
基因
b
9
转移
Keywords
Colorectal cancer
HOX
b
9
Metastasis
分类号
R730.231 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
小干扰RNA沉默同源盒基因B9对前列腺癌细胞侵袭、迁移能力的影响
被引量:
1
3
作者
许浩
沈馨
吴鼎
孙晓青
机构
徐州医科大学附属医院泌尿外科
徐州医科大学附属医院肿瘤内科
出处
《中华实验外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第7期1283-1285,共3页
文摘
目的观察小干扰RNA(siRNA)靶向沉默同源盒基因B9(HOXB9)基因对前列腺癌PC3和DU145细胞侵袭、迁移能力的调控。方法将HOXB9siRNA、negative control(NC)siRNA通过Silentfect转染至PC3和DU145细胞株将细胞分为两组(si-HOXB9组和si-NC组),通过Western blot方法检测HOXB9基因表达变化;Transwell实验检测细胞侵袭、迁移能力;采用Western blot法检测两细胞株(PC3、DU145)转染后上皮-间充质转化(EMT)相关分子标志物:N-钙黏蛋白(N-cadherin)、E-钙黏蛋白(E-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)的表达变化。结果转染HOXB9siRNA后,PC3和DU145细胞内HOXB9相对表达水平明显下调,差异有统计学意义(PC3:si-HOXB9组(0.440±0.007)对比si-NC组(0.858±0.024,P=0.001);DU145:si-HOXB9组(0.480±0.009)对比si-NC组(0.960±0.014,P=0.001)。两细胞株si-HOXB9组N-cadherin、Vimentin蛋白表达水平较其si-NC组明显降低,E-cadherin则显著升高。Transwell侵袭、迁移实验显示转染后两细胞株的侵袭(P=0.005、0.002)和迁移(P=0.001、0.001)能力明显减弱。结论HOXB9siRNA能特异性下调前列腺癌PC3和DU145细胞中HOXB9的表达,并降低细胞的侵袭和迁移能力,其作用机制可能与EMT相关。
关键词
同源
盒
基因
b
9
前列腺癌
RNA干扰
上皮-间充质转化
侵袭
迁移
Keywords
Homeo
b
ox
b
9
Prostate carcinoma
Small interfering RNA
Epithelial - mesenchymal transition
Invasion
Migration
分类号
R737.25 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于加权共表达网络分析对下咽癌枢纽基因HOXB9的鉴定
唐进渝
刘康
钟春燕
黄琴
杜经纬
《川北医学院学报》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
2
结直肠癌中同源盒基因B9的表达及临床意义
刘逸
陈名华
陈德鑫
朱文奕
王丹
周军
《中国热带医学》
CAS
2014
2
原文传递
3
小干扰RNA沉默同源盒基因B9对前列腺癌细胞侵袭、迁移能力的影响
许浩
沈馨
吴鼎
孙晓青
《中华实验外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
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