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非小细胞肺癌组织EMSY、PIDD表达与同源重组修复基因的相关性及其临床意义
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作者 陈丽萍 项保利 +3 位作者 王布 姬泽萱 郭志青 赵建清 《疑难病杂志》 CAS 2024年第2期186-191,共6页
目的研究非小细胞肺癌(NSCLC)组织中EMSY转录抑制因子(EMSY)、p53诱导的死亡结构域蛋白1(PIDD)表达与同源重组修复基因表达的相关性及临床意义。方法选择2022年1月—2023年4月河北北方学院附属第一医院呼吸与危重症医学科诊治NSCLC患者8... 目的研究非小细胞肺癌(NSCLC)组织中EMSY转录抑制因子(EMSY)、p53诱导的死亡结构域蛋白1(PIDD)表达与同源重组修复基因表达的相关性及临床意义。方法选择2022年1月—2023年4月河北北方学院附属第一医院呼吸与危重症医学科诊治NSCLC患者80例。采用实时荧光定量PCR检测癌组织及癌旁组织中EMSY、PIDD表达与同源重组修复基因人乳腺癌易感基因1(BRCA1)、切除修复交叉互补基因1(ERCC1),核糖核苷酸还原酶亚单位1(RRM1)表达。Pearson相关分析EMSY、PIDD表达与同源重组修复基因表达的相关性;分析EMSY、PIDD表达与NSCLC临床病理相关参数的关系及在NSCLC诊断中的价值。结果NSCLC癌组织中EMSY、PIDD、BRCA1、ERCC1、RRM1 mRNA相对表达量均高于癌旁组织(t/P=30.176/<0.001,27.821/<0.001,25.075/<0.001,16.680/<0.001,25.610/<0.001)。NSCLC癌组织中EMSY、PIDD mRNA与BRCA1、ERCC1、RRM1 mRNA表达均呈正相关(r/P=0.654/<0.001,0.712/<0.001,0.584/<0.001;0.724/<0.001,0.661/<0.001,0.563/<0.001)。低分化程度、有淋巴结转移及TNM分期Ⅲ期NSCLC癌组织EMSY、PIDD mRNA表达分别显著高于高中分化程度、无淋巴结转移及TNM分期Ⅰ~Ⅱ期NSCLC癌组织(t/P=13.693/<0.001,13.380/<0.001,12.197/<0.001;10.289/<0.001,11.130/<0.001,9.405/<0.001)。EMSY、PIDD mRNA及两项联合诊断NSCLC的AUC分别为0.834、0.802、0.906,两项联合诊断的AUC大于单一指标(Z=4.751、5.257,P均<0.001)。结论EMSY、PIDD在NSCLC癌组织中表达升高,与同源重组修复基因表达及不良临床病理特征有关,两者联合有助于NSCLC的诊断。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 EMSY p53诱导的死亡结构域蛋白1 同源重组修复基因 诊断
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非小细胞肺癌同源重组修复通路基因与临床特征的相关性分析
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作者 杨茜 赵洁 +4 位作者 唐海涛 廖鑫 牟康 李小松 沈依帆 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期871-876,共6页
目的:采用基因组不稳定评分(genomic instability score,GIS)描述非小细胞肺癌患者的同源重组修复缺陷(homolo⁃gous recombination deficiency,HRD)状态,探讨HRD状态及同源重组通路基因(homologous recombination repair,HRR)与临床特... 目的:采用基因组不稳定评分(genomic instability score,GIS)描述非小细胞肺癌患者的同源重组修复缺陷(homolo⁃gous recombination deficiency,HRD)状态,探讨HRD状态及同源重组通路基因(homologous recombination repair,HRR)与临床特征的相关性。方法:本研究纳入2020年1月至2022年1月在重庆医科大学附属第一医院接受治疗的335例非小细胞肺癌患者,采用二代测序法检测GIS评分及35个HRR基因,根据杂合性缺失(loss of heterozygosity,LOH)、端粒等位基因失衡(telo⁃meric allelic imbalance,TAI)、大片段迁移(large-scale state transition,LST)综合评估GIS评分。GIS评分及HRR基因与临床特征之间的关系通过Mann-Whitney U检验,Kruskal-Wallis检验和Dunn-Bonferroni检验分析。GIS评分和肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)值的相关性采用Spearman分析。结果:在335例患者中,男性患者、年龄大、分期晚、有吸烟史、鳞癌均会导致GIS评分更高,GIS评分Md(P25,P75)分别是13(4,26.75),12(3,22.5),21.5(12,30),16(4,27)和24(18,38.25)(Z=-5.083,P<0.001;Z=2.973,P=0.003;Z=8.225,P<0.001;Z=4.655,P<0.001;Z=-7.082,P<0.001)。HRR体系基因突变组样本GIS评分高于野生组,2组GIS评分分别为18.5(5.25,28.75)和6(1,16)(Z=5.012,P<0.001)。共检测到33个HRR相关基因突变,主要集中在ATM、RECQL4、ATR、FANCM、BRCA1、FANCA、BRIP1、NBN、WRN等基因,其中BRCA2、FANCI、FANCA基因突变均会导致GIS评分升高,GIS评分Md(P25,P75)分别是34(25.25,51),31.5(14.5,50)和22(12,44)(Z=-2.805,P=0.005;Z=-2.216,P=0.027;Z=-2.478,P=0.013)。GIS评分和TMB值之间呈正相关(rs=0.504,P<0.001)。结论:揭示中国非小细胞肺癌患者GIS评分及HRR基因突变特征,提示基于二代测序的GIS评分及HRR基因检测可能成为非小细胞肺癌患者靶向治疗及免疫治疗新的生物标志物。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 同源重组修复缺陷 基因组不稳定评分 同源重组通路
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基于同源重组的CRISPR精准基因编辑技术及其在农作物育种中的应用 被引量:4
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作者 江桐欣 李晓琳 +5 位作者 朱庆锋 张琪 张爱霞 刘勤坚 于洋 刘文华 《广东农业科学》 CAS 2022年第11期119-127,共9页
随着CRISPR基因编辑技术的出现,几乎在任何动植物细胞基因组的特定目标位点,DNA大片段的“无缝”插入或替换,均可在CRISPR核酸酶产生双链切口后,在供体DNA存在的情况下,诱导同源定向修复来实现。目前,这种基于同源重组的CRISPR精准基因... 随着CRISPR基因编辑技术的出现,几乎在任何动植物细胞基因组的特定目标位点,DNA大片段的“无缝”插入或替换,均可在CRISPR核酸酶产生双链切口后,在供体DNA存在的情况下,诱导同源定向修复来实现。目前,这种基于同源重组的CRISPR精准基因编辑在农作物基因功能分析和新技术育种中正发挥着越来越重要的作用。围绕在植物细胞中高效实现同源重组介导的CRISPR精准编辑这一目标,简述CRISPR精准编辑依赖的两种主要的基于同源重组的细胞修复机制,即合成依赖的链退火修复机制和非同源末端连接辅助的单链退火修复机制;在此基础上,详述产生DNA双链切口并诱导同源重组定向修复的CRISPR核酸酶和供体DNA/RNA,主要包括Cas9/12及其融合蛋白、sgRNA/crRNA及其修饰物、供体DNA/RNA及其修饰物;进而总结在植物遗传转化中为保障DNA双链切口和供体DNA/RNA发生的时空一致性以提高同源重组效率,而通常采用的CRISPR组分及供体DNA/RNA细胞递送方式;最后从功能基因组学研究和农作物新技术育种等方面,展望基于同源重组的CRISPR精准基因编辑技术的应用前景。 展开更多
关键词 CRISPR DNA双链切口 同源重组 同源定向修复 基因编辑
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Red同源重组技术在大肠埃希菌基因敲除中的应用 被引量:8
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作者 吴程华 严玉霖 +2 位作者 高洪 谭锐 董骎 《上海畜牧兽医通讯》 2015年第1期9-11,共3页
近年来,大肠埃希菌一直是分子生物学和基因组学的重要研究对象。20世纪80年代以来,生物学家发展了一种新型分子生物学技术-基因敲除。大肠埃希菌基因敲除技术发展迅速,各种新型技术的出现使得其基因组的改造较以往更为快速、简单,尤其是... 近年来,大肠埃希菌一直是分子生物学和基因组学的重要研究对象。20世纪80年代以来,生物学家发展了一种新型分子生物学技术-基因敲除。大肠埃希菌基因敲除技术发展迅速,各种新型技术的出现使得其基因组的改造较以往更为快速、简单,尤其是Red同源重组技术在大肠埃希菌基因敲除中的应用已经越来越成熟。本文简要综述了利用Red同源重组技术进行大肠埃希菌基因敲除的原理、策略及应用现状。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 基因敲除 Red同源重组技术
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植物DNA双链断裂修复机制及其在重离子诱变和基因编辑中的作用
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作者 隆静 陈婧敏 +3 位作者 刘霄 张一凡 周利斌 杜艳 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期55-67,共13页
在自然界中,植物会遭受各种环境或内源因素导致的DNA损伤,其中DNA双链断裂(double strand breaks,DSBs)的影响最为严重,如果修复不当,将导致基因组不稳定、基因突变甚至细胞死亡。一方面,植物进化出了强大且有序的损伤修复机制,以确保... 在自然界中,植物会遭受各种环境或内源因素导致的DNA损伤,其中DNA双链断裂(double strand breaks,DSBs)的影响最为严重,如果修复不当,将导致基因组不稳定、基因突变甚至细胞死亡。一方面,植物进化出了强大且有序的损伤修复机制,以确保其存活及正常繁衍;另一方面,基于修复过程的容错性及致突变性,T-DNA插入、基因编辑、物理诱变等技术广泛应用于动植物品种改良。相较于哺乳动物,植物DSBs修复通路及其分子机制报道较为有限。本文综述了植物对DSBs损伤的响应、主要修复途径及关键因子,介绍了通路机制尚未完全解析的替代末端连接(alternative end joining,Alt-EJ)的最新研究进展;此外,探讨了重离子束引起的植物DSBs修复特征和多途径选择,以及基于不同DSBs修复途径的基因编辑技术的研究进展,旨在为深入了解植物DSBs损伤响应及修复的分子机制和研发高效生物育种技术提供参考。 展开更多
关键词 植物DSBs损伤修复 同源重组 同源末端连接 重离子束 基因编辑
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同源重组修复缺陷检测的准确性评价
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作者 张咪 孙楠 +5 位作者 张文新 胡泽斌 齐雅宁 黄杰 于婷 曲守方 《分子诊断与治疗杂志》 2024年第12期2236-2239,共4页
目的使用同源重组修复缺陷检测(HRD)国家参考品,评价HRD检测试剂盒的准确性。方法对HRD国家参考品基因组DNA进行片段化、末端修复和分子标签添加,制备文库。文库中目标DNA片段与探针进行杂交捕获和富集后获得捕获文库。捕获文库在MGISEQ... 目的使用同源重组修复缺陷检测(HRD)国家参考品,评价HRD检测试剂盒的准确性。方法对HRD国家参考品基因组DNA进行片段化、末端修复和分子标签添加,制备文库。文库中目标DNA片段与探针进行杂交捕获和富集后获得捕获文库。捕获文库在MGISEQ⁃2000基因测序平台上进行双端测序。分析测序数据,并使用国家参考品的ASCNV和LOH、LST及TAI的参考集评价,计算试剂盒各个指标的准确率。结果试剂盒的拷贝数状态的准确率为83.1%,LOH和TAI指标的准确率分别为94.2%和88.0%,LST指标的准确率为80.6%,符合国家参考品准确率的要求。HRD状态检测结果显示国家参考品的每一组样本(HRD⁃X)的不同浓度比例的样本均为一致的HRD状态,以HRD⁃10样本为例,在DNA含量为30%、40%及50%的情况下,HRD分值均高于42分,为HRD阳性。结论HRD国家参考品具有很好的适用性,能够用于HRD检测试剂盒的性能评价。 展开更多
关键词 同源重组修复缺陷检测 杂合性缺失 端粒等位基因不平衡 大片段迁移 单核苷酸多态性
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叶绿体基因编辑技术:进展与展望
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作者 原明星 尹康权 +2 位作者 李俄仁措 尚海忠 杜芳 《中国草地学报》 CSCD 北大核心 2024年第6期126-134,共9页
叶绿体是植物进行光合作用,参与多个代谢途径和免疫反应的重要场所。叶绿体基因组非常小,只有100多个基因,但对植物生长发育具有重要意义。本文首先总结了叶绿体的起源、结构与功能及叶绿体基因组研究的最新进展。其次,梳理了同源重组... 叶绿体是植物进行光合作用,参与多个代谢途径和免疫反应的重要场所。叶绿体基因组非常小,只有100多个基因,但对植物生长发育具有重要意义。本文首先总结了叶绿体的起源、结构与功能及叶绿体基因组研究的最新进展。其次,梳理了同源重组、碱基编辑两种叶绿体基因编辑技术,重点介绍了碱基编辑技术中的胞嘧啶碱基编辑器和腺嘌呤碱基编辑器,认为相较于传统的同源重组技术,碱基编辑技术可以针对特定靶位点进行定向修饰,单次选择就能获得同质转化植株,且可以不用保留外源DNA片段,实现了非转基因的基因编辑。最后展望了叶绿体基因编辑技术的广阔发展前景,以期促进精准高效的叶绿体基因编辑工具开发,为研究叶绿体基因功能以及加速对叶绿体的合理利用开辟新思路。 展开更多
关键词 叶绿体 叶绿体基因 基因编辑 同源重组 碱基编辑
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同源重组修复通路基因遗传变异与结直肠癌易感性的关联研究 被引量:3
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作者 禚昌龙 陈维艳 +6 位作者 龙琦 夏宜馨 王灵巧 杨桓 曹佳 周紫垣 张爱华 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第18期1769-1775,共7页
目的探讨我国人群同源重组修复(homologous recombination repair,HRR)通路关键基因的单核苷酸多态性与结直肠癌(colorectal cancer,CRC)易感性关联。方法以生物信息学分析结合文献筛选同源重组修复通路关键基因;采用基于通路分析的病例... 目的探讨我国人群同源重组修复(homologous recombination repair,HRR)通路关键基因的单核苷酸多态性与结直肠癌(colorectal cancer,CRC)易感性关联。方法以生物信息学分析结合文献筛选同源重组修复通路关键基因;采用基于通路分析的病例-对照研究设计,共纳入2001年1月至2004年6月于陆军军医大学3所附属医院普通外科经病理诊断的413例新发CRC病例与1 671例非肿瘤患者对照。以ILLUMINA人类基因组芯片对筛选出的基因上下游50 kb区域内的TagSNPs分型,采用logistic回归模型计算SNPs与CRC的关联。结果筛选出17个HRR通路中的关键基因;在17个基因及上下游50 kb区域内的2 207个SNP中有16个位点与结直肠癌风险关联显著,其中RAD52基因3’-UTR的rs11226位点携带A等位基因者的CRC风险相对携带G者增加约1.4倍(OR=1.42,95%CI=1.22~1.66,P=6.67×10-6);CRTC3-AS1基因内含子区rs75893366位点携带G等位基因者的CRC风险仅为携带A者的0.4倍(OR=0.43,95%CI=0.25~0.74,P=1.81×10-3)。但仅rs11226位点经bonferroni校正后在男性和女性中均具有显著性。结论同源重组修复通路中17个关键基因的单核苷酸多态性与结直肠癌患病风险显著关联,提示同源重组修复通路基因的遗传变异可能影响结直肠癌的遗传易感性。 展开更多
关键词 结直肠癌 同源重组修复基因 单核苷酸多态性
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基于基因瘢痕评分(GSS)探索乳腺癌中的同源重组修复缺陷(HRD) 被引量:1
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作者 冯聪 李佳 +7 位作者 张寅斌 吴菲 刘梦洁 陈曦 李超凡 王维玮 谭清华 张淑群 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第5期855-860,共6页
目的:使用基因瘢痕评分(GSS)描述中国乳腺癌人群的HRD状态,并对乳腺癌的HRD状态和临床特征进行统计学分析。方法:使用AmoyDx HRD Panel检测我院诊断的79例乳腺癌患者。根据拷贝数长度(LCN)、拷贝数部位(SCN)和拷贝数类型(TCN)确定基因... 目的:使用基因瘢痕评分(GSS)描述中国乳腺癌人群的HRD状态,并对乳腺癌的HRD状态和临床特征进行统计学分析。方法:使用AmoyDx HRD Panel检测我院诊断的79例乳腺癌患者。根据拷贝数长度(LCN)、拷贝数部位(SCN)和拷贝数类型(TCN)确定基因组疤痕得分(GSS)。HRD阳性是指BRCA突变阳性和/或GSS得分≥50。HRD得分与临床特征之间的关系通过卡方检验和Fisher’s精确检验及Wilcoxon秩和检验进行统计分析。结果:在79例患者中,BRCA突变阳性率10.1%,HRD阳性率35.4%。在TNBC患者中,HRD阳性率为80%,BRCA突变阳性率26.7%。53.4%的TNBC患者BRCA突变阴性但HRD阳性。与HRD阴性的乳腺癌相比,HRD阳性乳腺癌明显更可能是Ki-67高(P<0.05)、ER阴性(P<0.05)和PR阴性(P<0.05)的肿瘤。HRD阳性率在TNBC(80%)中也明显高于Luminal A(7.7%,P<0.001)和Luminal B(27.7%,P<0.05)。结论:GSS是乳腺癌同源重组缺陷的重要检测工具,能帮助挖掘BRCA突变阴性但HRD阳性的乳腺癌人群。HRD状态与乳腺癌的ER、PR和Ki-67状态相关。 展开更多
关键词 乳腺癌 BRCA1/2 同源重组修复缺陷 PARP抑制剂 基因瘢痕评分 临床特征
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重组腺相关病毒载体类体内基因治疗产品临床试验申请药学研究与评价技术指导原则(一)
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《中国医药导刊》 2024年第3期223-223,共1页
一、前言体内基因治疗产品一般选用适当的载体或转染方式将外源基因(或基因编辑工具)导入人体,通过替代、补偿、阻断、修正特定基因以达到治疗疾病的目的。重组腺相关病毒(recombinant adeno-associated virus,rAAV)载体因其理化性质稳... 一、前言体内基因治疗产品一般选用适当的载体或转染方式将外源基因(或基因编辑工具)导入人体,通过替代、补偿、阻断、修正特定基因以达到治疗疾病的目的。重组腺相关病毒(recombinant adeno-associated virus,rAAV)载体因其理化性质稳定、致病性弱、整合风险低、外源基因表达持久等结构和生物学方面的优势,已成为体内基因治疗领域研究、应用最为广泛的载体之一。 展开更多
关键词 技术指导原则 临床试验 重组腺相关病毒载体 基因编辑 基因治疗领域 外源基因表达 RAAV 研究与评价
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携带同源重组修复相关基因突变的消化道肿瘤的临床特点 被引量:1
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作者 郑晓娟 王兴元 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2022年第14期2558-2563,共6页
目的:探讨消化道肿瘤中同源重组修复相关基因(homologous recombination repair related gene,HRR)突变的发生情况及临床意义。方法:共92例消化道肿瘤患者,79例患者进行了血液标本HRR检测,53例患者进行了组织标本HRR检测,40例患者同时... 目的:探讨消化道肿瘤中同源重组修复相关基因(homologous recombination repair related gene,HRR)突变的发生情况及临床意义。方法:共92例消化道肿瘤患者,79例患者进行了血液标本HRR检测,53例患者进行了组织标本HRR检测,40例患者同时行血液和组织的HRR基因检测,收集患者基因检测结果及临床相关资料。结果:在79例患者血液标本检测中发现10例(12.6%)有临床意义HRR突变,在53例患者组织标本检测中发现9例(17.0%)有临床意义HRR突变。40例同时行血液和组织的HRR基因检测患者中常见的有临床意义HRR突变为CDK12突变4例(10.0%)、ATM突变3例(7.5%)、BRCA1突变2例(5.0%)。13例有临床意义HRR突变患者中常见共存突变为TP53突变10例(76.9%)、APC突变5例(38.5%)、PIK3CA突变4例(30.8%)。40例患者中13例患者血液和/或组织中有临床意义HRR突变,27例患者血液和组织中均无任何临床意义HRR突变且两组相比,有临床意义HRR突变组肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)为6.17(2.24~11.52),而未携带HRR突变组TMB为0.4(0~3.75),差异有统计学意义(P<0.05)。40例患者组织检测中7例HRR有临床意义的突变,33例无HRR突变,血液检测中10例HRR有临床意义的突变,30例无HRR突变,一致性检验的Kappa值为0.333(P=0.031)。结论:携带有临床意义HRR突变的消化道肿瘤患者TMB更高,血液和组织检测HRR突变有较好的一致性。 展开更多
关键词 同源重组修复相关基因突变 消化道肿瘤 肿瘤突变负荷 一致性
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Ⅲ型家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增生症易感基因UNC13D参与同源重组修复 被引量:1
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作者 常丽贤 曾慧敏 +6 位作者 周全全 高敏 魏蔚 周剑峰 安文彬 袁卫平 竺晓凡 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期692-695,共4页
本研究从DNA双链断裂同源重组修复角度探讨UNC13D(秀丽新小杆线虫)基因参与Ⅲ型家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增生症(familial hemophagocytic lymphohistiocytosis type 3,FHL3)的发病机制。利用DNA同源重组修复方法,检测正常对照组及U... 本研究从DNA双链断裂同源重组修复角度探讨UNC13D(秀丽新小杆线虫)基因参与Ⅲ型家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增生症(familial hemophagocytic lymphohistiocytosis type 3,FHL3)的发病机制。利用DNA同源重组修复方法,检测正常对照组及UNC13D基因下调后DR-U2OS细胞同源重组修复率的变化情况,并研究此基因的相关功能。结果表明:下调DR-U2OS细胞的UNC13D基因表达后,同源重组修复率较正常对照组明显下降,且差异有统计学意义(P<0.05),提示UNC13D编码蛋白Munc13-4不仅参与到细胞毒颗粒的胞吐过程中,而且在DNA双链断裂修复中也起作用。结论:UNC13D基因突变可能通过抑制细胞毒颗粒的胞吐和降低DNA双链断裂后的同源重组修复率参与FHL3发病过程,这一研究结果为揭示FHL3的发病机制提供新的理论基础。 展开更多
关键词 Ⅲ型家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增生症 UNC13D基因 DNA双链断裂 同源重组修复
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复发性卵巢癌两次手术基因同源重组修复缺陷状态变化与临床价值分析
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作者 张天歌 赵英姿 +3 位作者 李洪琦 李玉荣 刘敏 李长忠 《实用妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期711-713,共3页
目的:分析复发性卵巢癌患者两次手术基因同源重组修复缺陷(HRD)状态的改变,探讨卵巢癌复发时是否需要再次进行HRD检测。方法:收集2017年3月至2021年8月山东省3家三级甲等医院卵巢癌术后复发,再次行卵巢肿瘤减灭术并行HRD检测的9例上皮... 目的:分析复发性卵巢癌患者两次手术基因同源重组修复缺陷(HRD)状态的改变,探讨卵巢癌复发时是否需要再次进行HRD检测。方法:收集2017年3月至2021年8月山东省3家三级甲等医院卵巢癌术后复发,再次行卵巢肿瘤减灭术并行HRD检测的9例上皮性卵巢癌患者的临床资料,比较两次手术样本肿瘤乳腺癌易感基因(BRCA)突变情况、HRD评分以及HRD状态的变化。结果:9例晚期上皮性卵巢癌患者中位年龄为54.8岁,中位无进展生存期为12.4个月。二次手术BRCA突变状态较初次手术均无变化,其中3例患者BRCA突变均为胚系突变,突变位点未发生改变。9例患者中HRD状态阳性6例,阴性3例。所有患者二次手术HRD评分均发生改变,但根据预先设定的HRD状态判定标准,HRD状态无变化。结论:HRD状态在原发和复发样本之间保持不变。初始肿瘤的HRD评分对于接受过含铂治疗的复发性上皮性卵巢癌的治疗方案选择仍有参考价值,提示卵巢癌复发时无需再次进行HRD检测。 展开更多
关键词 复发性卵巢癌 两次手术 基因检测 同源重组修复缺陷
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基于CRISPR/Cas9介导的同源重组技术构建TK、gE和gI基因缺失的伪狂犬病病毒 被引量:2
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作者 张华伟 周明光 +4 位作者 侯真真 朱娴静 郝根喜 金建云 徐高原 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期206-212,共7页
为构建TK、gE和gI基因缺失的伪狂犬病病毒(pseudorabies virus,PRV),采用CRISPR/Cas9介导的同源重组技术,对从湖北某猪场送检的病料中分离到的PRV HB2017株进行基因编辑,并利用蚀斑纯化等方法获取基因缺失株。随后,采用PCR、基因测序、... 为构建TK、gE和gI基因缺失的伪狂犬病病毒(pseudorabies virus,PRV),采用CRISPR/Cas9介导的同源重组技术,对从湖北某猪场送检的病料中分离到的PRV HB2017株进行基因编辑,并利用蚀斑纯化等方法获取基因缺失株。随后,采用PCR、基因测序、间接免疫荧光试验、生长曲线测定及安全性和效力试验对基因缺失株的特性进行初步研究。结果显示:PRV HB2017株的TK、gE和gI基因已缺失,缺失毒株PRV HB2017ΔTKΔgE/gI与亲本毒株PRV HB2017株在PK-15细胞中的生长曲线差异不明显且具有较高的病毒滴度;PRV HB2017ΔTKΔgE/gI株传代至30代,TK和gE/gI基因缺失部分序列稳定,不能恢复;PRV HB2017ΔTKΔgE/gI株对仔猪是安全的;将该基因缺失株以10^(6.0) TCID_(50)和10^(7.0) TCID_(50)的病毒剂量接种仔猪,可保护仔猪免受10^(8.0) TCID_(50)病毒剂量强毒的攻击。 展开更多
关键词 伪狂犬病病毒 CRISPR/Cas9 同源重组 基因缺失 基因工程疫苗 病毒编辑 疫苗研制
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基因编辑技术在视神经再生修复中的应用
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作者 隗雨 马琼 +2 位作者 王常科 梁玉玲 康宏向 《激光生物学报》 CAS 2023年第5期414-422,共9页
视网膜极易因激光意外事故、中枢神经或视网膜退行性疾病发生异常改变,严重威胁视功能。目前,仍没有针对哺乳动物视网膜损伤的完善修复机制。视网膜“干细胞”穆勒胶质(MG)细胞不能自发进入细胞周期,基因编辑手段可使MG细胞转分化,从而... 视网膜极易因激光意外事故、中枢神经或视网膜退行性疾病发生异常改变,严重威胁视功能。目前,仍没有针对哺乳动物视网膜损伤的完善修复机制。视网膜“干细胞”穆勒胶质(MG)细胞不能自发进入细胞周期,基因编辑手段可使MG细胞转分化,从而具有视网膜祖细胞的能力。转分化相关信号通路及调控因子对MG基因组重编程至关重要。基因编辑治疗利用腺病毒、慢病毒等载体将外源基因导入体内,促使哺乳动物受损视网膜中MG细胞激增和去分化,损伤的视网膜神经元再生。与传统药物治疗需要长期服药相比,基因疗法的出现有望实现通过一次治疗达到修复目的。文章就视网膜修复机制、调控视神经再生的信号通路以及基因治疗修复损伤视网膜研究现状和应用过程中存在的问题进行综述,并展望未来相关的发展趋势。未来基因编辑治疗将会给视神经再生修复研究带来深刻变革,为视网膜疾病的治疗带来新的曙光。 展开更多
关键词 视网膜损伤修复 视神经再生 视网膜祖细胞 基因治疗 基因编辑技术
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卵巢癌中同源重组修复基因逆转突变导致多腺苷二磷酸核糖聚合酶抑制剂耐药的研究进展 被引量:1
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作者 袁华 李宁 吴令英 《癌症进展》 2022年第9期875-879,共5页
卵巢癌是最常见的生殖系统肿瘤之一,中国卵巢癌发病率呈明显上升趋势。卵巢癌的发生与同源重组修复基因功能异常密切相关。15%~20%的上皮性卵巢癌患者携带乳腺癌易感基因(BRCA)1/2胚系突变。多腺苷二磷酸核糖聚合酶(PARP)抑制剂利用“... 卵巢癌是最常见的生殖系统肿瘤之一,中国卵巢癌发病率呈明显上升趋势。卵巢癌的发生与同源重组修复基因功能异常密切相关。15%~20%的上皮性卵巢癌患者携带乳腺癌易感基因(BRCA)1/2胚系突变。多腺苷二磷酸核糖聚合酶(PARP)抑制剂利用“合成致死”原理,对BRCA1/2基因突变或同源重组修复缺陷卵巢癌患者具有良好的抗肿瘤作用。随着PARP抑制剂的应用越来越广泛,PARP抑制剂原发或获得性耐药逐渐成为重要的临床问题。目前已经发现同源重组修复基因逆转突变能够恢复DNA损伤修复功能,是导致PARP抑制剂耐药的重要机制。本文就同源重组修复基因逆转突变导致PARP抑制剂耐药及逆转耐药的治疗方法进行综述。 展开更多
关键词 卵巢癌 同源重组修复基因 逆转突变 多腺苷二磷酸核糖聚合酶 耐药 治疗
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102例乳腺癌同源重组修复相关胚系基因突变研究
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作者 史晓青 王珏 +3 位作者 丁颖 陈锐 朱倩男 查小明 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期1600-1606,共7页
目的:探讨乳腺癌患者同源重组修复(homologous recombination repair,HRR)相关胚系基因的突变情况及其与临床病理特征之间的关系。方法:检测本中心102例乳腺癌患者同源重组修复高度相关的21个胚系基因的变异情况,收集患者的年龄、肿瘤... 目的:探讨乳腺癌患者同源重组修复(homologous recombination repair,HRR)相关胚系基因的突变情况及其与临床病理特征之间的关系。方法:检测本中心102例乳腺癌患者同源重组修复高度相关的21个胚系基因的变异情况,收集患者的年龄、肿瘤大小、淋巴结状态、病理类型及家族史等临床资料,统计分析基因突变与各临床病理特征之间的关系。结果:携带HRR相关胚系基因突变(含BRCA及非BRCA基因)的患者与未携带突变的患者在临床特征方面(如年龄、淋巴结状态、肿瘤大小和肿瘤分子分型等)并无统计学差异。携带BRCA突变的患者往往有肿瘤家族史(95%CI:0.997~6.142,P=0.047),尤其是乳腺癌/卵巢癌家族史(95%CI:1.227~9.953,P=0.015)。同时,ATM基因突变在人表皮生长因子受体-2(human epidermal growth factor receptor-2,Her-2)阳性患者中的发生率显著高于Her-2阴性患者(P=0.045)。结论:患者的肿瘤家族史,尤其是乳腺癌/卵巢癌家族史是发生BRCA突变的重要危险因素;Her-2阳性乳腺癌可能与ATM突变存在一定的相关性。 展开更多
关键词 乳腺癌 同源重组修复 基因突变 二代测序
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同源重组法构建多功能农药降解基因工程菌研究 被引量:16
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作者 蒋建东 顾立锋 +3 位作者 孙纪全 代先祝 文阳 李顺鹏 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期884-891,共8页
构建遗传稳定的多功能农药降解基因工程菌可以为农药污染的生物修复提供良好的菌种资源,然而,构建遗传稳定且不带入外源抗性的基因工程菌是一个难点。通过以受体菌的16SrDNA为同源重组指导序列、sacB基因为双交换正筛选标记构建同源重... 构建遗传稳定的多功能农药降解基因工程菌可以为农药污染的生物修复提供良好的菌种资源,然而,构建遗传稳定且不带入外源抗性的基因工程菌是一个难点。通过以受体菌的16SrDNA为同源重组指导序列、sacB基因为双交换正筛选标记构建同源重组载体,二亲结合的方法将甲基对硫磷水解酶基因(mpd)整合到呋喃丹降解菌Sphingomonassp.CDS1染色体的16SrDNA位点,分别成功构建了含1个和2个mpd基因插入到rDNA位点且不带入外源抗性的基因工程菌株CDSmpd和CDS2mpd。同源重组单交换的效率为3.7×10-7~6.8×10-7。通过PCR和Southern杂交的方法验证了同源重组事件。基因工程菌遗传稳定,能同时降解甲基对硫磷和呋喃丹。甲基对硫磷水解酶(MPH)的比活在各生长时期均高于原始出发菌株,比活最高达6.22muμg。 展开更多
关键词 同源重组 RDNA sacB 基因工程菌 农药降解 生物修复
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植物基因组编辑及衍生技术最新研究进展 被引量:70
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作者 单奇伟 高彩霞 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期953-973,共21页
基因组编辑技术已经在多个模式植物、动物以及其他生物中得到成功应用。基因组编辑是利用序列特异核酸酶(Sequence-specific nucleases,SSNs)在基因组特定位点产生DNA双链断裂(Double-strand breaks,DSBs),从而激活细胞自身修复机制—... 基因组编辑技术已经在多个模式植物、动物以及其他生物中得到成功应用。基因组编辑是利用序列特异核酸酶(Sequence-specific nucleases,SSNs)在基因组特定位点产生DNA双链断裂(Double-strand breaks,DSBs),从而激活细胞自身修复机制——非同源末端连接(Non-homologous end joining,NHEJ)或同源重组(Homologous recombination,HR),实现基因敲除、染色体重组以及基因定点插入或替换等。锌指核酸酶(Zinc finger nuclease,ZFN)、TALEN(Transcription activator-like effector nuclease)和CRISPR/Cas9(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated 9)系统是最主要的3类SSNs。ZFN和TALEN是利用蛋白与DNA结合方式靶向特定的基因组位点,而最新的CIRISPR/Cas9系统则是利用更简单的核苷酸互补配对方式结合在基因组靶位点,其构建简单、效率更高效,因而促进了基因组编辑在植物中的广泛应用。利用基因组编辑技术除了实现植物基因定点突变外,还可以将SSNs的DNA结合域与其他功能蛋白融合,实现基因的靶向激活、抑制和表观调控等衍生技术。本文从基因组编辑技术的原理与优势、SSNs组成及构建方法、基因组编辑及衍生技术在植物中应用、优化SSNs突变效率和减少脱靶突变方法等方面进行了系统介绍,并对未来需要迫切解决的一些问题进行了分析和展望。 展开更多
关键词 基因编辑 CRISPR/Cas9 同源重组 脱靶突变
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携带同源重组修复相关基因突变的消化道肿瘤的临床特征研究
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作者 朱博慧 《中文科技期刊数据库(引文版)医药卫生》 2023年第9期20-23,共4页
探讨消化道肿瘤当中的同源重组修复相关基因(Homologous recombination repair related gene,HRR)的突变情况及临床特征。方法 本次研究将2020年11月-2022年10月在本院治疗的92例消化道肿瘤患者作为研究对象,其中有79例的患者接受了同... 探讨消化道肿瘤当中的同源重组修复相关基因(Homologous recombination repair related gene,HRR)的突变情况及临床特征。方法 本次研究将2020年11月-2022年10月在本院治疗的92例消化道肿瘤患者作为研究对象,其中有79例的患者接受了同源重组修复相关基因的血液检测,53例患者接受了HRR的组织样本检测,40例患者同时接受了两种样本检测,对其中的检测结果进行分析。结果 在血液标本的检测过程中,有10例患者出现了基因突变,突变率为12.6%(10/79);在组织样本的检测当中,有9例患者出现了基因突变,突变率为17.0%(9/53);在同时接受组织样本与学哦样本的检测当中, 最常见的突变情况为CDK12突变(10.0%),ATM突变(7.5%)及BRCA1突变(5.0%)。对于出现了基因突变的患者而言,肿瘤突变符合(Tumor mutational burden,TMB)是6.17(2.24-11.52),未出现基因突变的患者为0.4(0-3.75),在数据的对比中具有统计学差异(P<0.05)。在异质性的检验中,Kappa值是0.333(P=0.031)。结论 具有临床意义HRR突变的患者在同源重组修复相关基因更高,且血液样本与组织样本在检测中也具有较好一致性。 展开更多
关键词 消化道肿瘤 临床特征 基因突变 同源重组修复相关基因
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