共有基因数在同胞鉴定中应用的研究

目的 探索利用两个体间共有基因数目资料进行同胞关系鉴定的应用价值。方法 根据 80 7对同胞及无关个体的 13个STR基因座的分型结果 ,进行统计学计算。结果 同胞间及无关个体间共有基因数目均符合正态分布 ,分别得到同胞及无关个体关系的判别函数和后验概率 ,以及该方法的平均错判率。其中同胞组判别函数为 :L同胞 =-2 7 0 870 3 +3 2 0 2 3 2S (S为共有基因个数 ) ;无关个体组判别函数为 :L无关 =-7 495 63 +1 685 0 9S ,用上述判别函数进行同胞 /无关个体关系判别时的平均错判率为 0 0 2 65。结论 当共有基因数目大于 17或小于 8时 ,两个体为同胞或无关个体的后验概率分别大于 0 9980和 0 9994。此方法不失为同胞关系鉴定的可信度较高的方法。

常染色体STR遗传标记在同胞鉴定中的应用

目的 探讨常染色体STR遗传标记用于鉴定两个体同胞关系的可行性。方法 用Power Plex^(TM)16体系15个STR基因座检测150对同胞个体和150对无关个体,ITO法计算同胞关系指数(PI_(FS))与同胞关系概率(W_(FS)),并比较两组W_(FS)值及两个体间等位基因匹配情况的差异,对前者进行组间差异的x^2检验。结果 100对(66.67％)同胞个体的W_(FS)大于0.9995;无关个体W_(FS)均小于0.8,其中100对(66.67％)W_(FS)小于0.27。同胞个体两个体间等位基因全相同的基因座个数为1～10个不等,平均5.49个,无关个体0～5个不等,平均1.33个;等位基因全不同的基因座个数,同胞个体0～6个不等,平均1.66个,无关个体2～11个不等,平均6.57个;等位基因半相同的基因座个数,同胞个体3～13个不等,平均7.85个,而无关个体1～13个不等,平均7.11个。经x^2检验,同胞个体和无关个体间全相同和全不同的基因座数差异均有极显著意义(P<0.001),半相同的基因座数差异无显著意义(P>0.05)。结论 PowerPlex^(TM)16体系可用于鉴定同胞关系。当两个体全不同基因座个数大于或等于6个,或全相同基因座数为0时,提示为无关个体;当两个体全不同基因座个数小于或等于1个,或全相同基因座数大于或等于6个时,提示为同胞。

D3S1358等9个STR基因座在同胞鉴定中的应用

目的探讨D3S1358等9个常染色体STR基因座用于鉴定两个体间同胞亲缘关系的可行性。方法用复合PCR扩增方法检测D3S1358等9个STR基因座的基因型,运用ITO法和IBS法两种分析方法计算两个体间的同胞亲权关系指数(paternity index,PI)和同胞亲权关系概率RCP(relativechance of paternity,RCP),并比较两个体间全相同、半相同和全不同的基因座数。结果同胞个体间RCP值均值显著高于非同胞个体(P>0.05)。同胞对全相同的基因座个数平均值>3,全不同的基因座个数平均值<2;而无关个体间全相同的基因座个数平均值<1,全不同的基因座个数平均值>3。结论检测和分析D3S1358等9个STR基因座的基因型可以应用于同胞鉴定:以RCP≥95%或者以基因型全相同基因座数≥4或全不同基因座数≤1为肯定标准;以RCP≤5%或者以基因型全相同基因座数=0或全不同基因座数≥4为排除标准。

常染色体STR分型在同胞鉴定中的应用

目的研究常染色体STR基因座分型技术在同胞鉴定中的应用价值。方法采用24个STR基因座检测80对同胞个体和80对无关个体,ITO法计算同胞关系指数(PIFS)和同胞关系概率(WFS),分析两组的WFS值分布情况及每对个体等位基因全不同、全相同、半相同的基因座数,用Fisher's Exact Test方法比较后者的分布差异,并预测同胞与无关个体的界值。结果经χ2检验,两组间24个STR位点基因型全相同与全不同的基因座数均存在显著性差异(P<0.001),半相同的基因座数均无显著差异(P>0.05)。结论选择24个STR基因座进行同胞鉴定具有一定的可行性,两个体24个STR基因座中全相同数≥8或全不同数≤3时,提示为同胞关系;全不同数≥9或全相同数≤1时,提示为无关个体。

IBS法和ITO法应用于全同胞鉴定中的探讨

【目的】应用GoldeneyeTM 20A扩增体系,讨论IBS法和ITO法在全同胞鉴定中的应用价值。【方法】选取150对全同胞和500对无关个体,用GoldeneyeTM 20A体系进行19个常染色体STR基因座的扩增,计算状态一致性评分(IBS),用ITO法分别计算全同胞关系指数(FSI)、半同胞关系指数(HSI)及其比值(FSI:HSI)。【结果】在检测GoldeneyeTM 20A体系19个基因座时,(1)当两个体的IBS≥22时,倾向于全同胞;当IBS≤13时,倾向于无关个体;当13<IBS<22时,无法给出倾向性意见。(2)当FSI<0.01时,倾向于无关个体;当FSI>1且FSI:HSI>1时,倾向于全同胞;当0.01≤FSI≤1或FSI>1而FSI:HSI≤1时,无法给出倾向性意见。【结论】IBS法和ITO法都可以用在全同胞亲缘鉴定中,IBS法将作为新标准出台,其具有快速简便,高准确率的优势,而ITO法计算过程较为复杂,但具有较高的检出概率,是IBS法一种很好的补充。在实际检案中,可根据案件具体情况,综合运用。

AGCU 21+1 STR试剂盒在IBS法全同胞鉴定中的可行性验证

应用GoldeneyeTM 20A及AGCU 21+1 STR扩增体系,当GoldeneyeTM 20A无法给出倾向性意见时,讨论AGCU 21+1 STR试剂盒在IBS法全同胞鉴定中的可行性及应用价值。方法:选取131例342人333对全同胞进行检测,并计算状态一致性评分(IBS)。结果:在GoldeneyeTM 20A检测19个基因座时,333对全和同胞的检出率为75.98%, 118例316人303对全同胞(无双胞胎)的检出率为76.24%, 27对异卵双胞胎的检出率为70.37%, 3对同卵双胞胎的检出率为100%;在AGCU 21+1 STR检测补充检验20个STR基因座时,46例117人78对全同胞的检出率为100%;其准确率均为100%。结论:AGCU 21+1 STR试剂盒在IBS法全同胞鉴定中具有较高的检出率和判别准确率,具有较大可行性及应用价值,适宜在日常鉴定中推广应用。

参考全同胞数量在同胞鉴定中的意义

目前全同胞鉴定多建立在可疑同胞与一名参考个体之间,然而两名个体之间的亲缘鉴定信息量有限、识别力低。同胞鉴定时,常常有不止一个参考同胞,如果多名参考个体作为一个整体,基因信息被充分利用,判定的识别力将极大提高。本文通过对一名参考同胞和多名参考同胞在鉴定中识别能力的比较,同时阐述多名参考同胞的父母基因型重构及同胞鉴定似然率计算,证明多名参考个体在亲缘鉴定中具有一名参考个体不能比拟的优势:在检测相同数量基因座的情况下能极大提高鉴定结果的可靠性。同胞鉴定中,充分利用可参考个体信息具有重要意义。

三个体组合半同胞关系鉴定分析

目的建立常见的三个体参与进行半同胞关系鉴定的分析方法。方法针对已知关系的母亲、爷爷或叔叔和两个有争议的半同胞参与的鉴定场景,分别设定两个对立假设,按照孟德尔遗传定律进行家系重建,推导半同胞亲缘关系指数计算公式。通过实际案件进行验证,并与两个体配对半同胞关系鉴定比较。结果在母亲、爷爷和叔叔分别参与的三个体半同胞鉴定场景,分别推算得到54、91及99种基因型组合的亲缘关系指数计算公式。实际案例分析结果显示,与两个体配对半同胞鉴定相比,三个体参与半同胞鉴定的亲缘关系指数均增大。结论增加已知亲属参与半同胞关系鉴定有利于获得更多的遗传信息进行家系重建,提高半同胞关系鉴定的遗传证据强度。

三个体全同胞关系鉴定的检测效能评估

目的研究不同数目常染色体STR分型体系下增加另一已知全同胞个体的三个体组合全同胞关系鉴定的检测效能。方法基于13~55个代表性STR基因座构成的43种检测体系,随机模拟产生10000个真家系(全同胞组)和10000个假家系(无关个体组),基于家系重建法计算全同胞关系指数,以累积全同胞关系指数为0.0001和10000作为评判阈值,计算各检测效能参数,并与两个体组合全同胞关系鉴定比较。结果随着STR基因座数目递增,判断错误率、无法判断率逐渐减小,灵敏度、特异度、判断正确率等参数逐渐增大,系统效能逐渐提升。同一检测体系下,与两个体组合相比,三个体组合的灵敏度、特异度较高且无法判断率较低,系统效能较高。要求系统效能高于0.85且判断错误率低于0.01%时,三个体组合至少需检测20个STR,少于两个体组合(29个STR)。结论同一检测体系下三个体组合全同胞关系鉴定的检测效能优于两个体组合,对检测体系储备不足的实验室或者条件受限的检材是有效的鉴定方案。

常染色体STR鉴定同胞的应用探讨

目的探讨常染色体STR遗传标记鉴定两个体同胞关系的可行性。方法用PowerPlexTM16体系15个常染色体STR基因座检测50对全同胞、25对半同胞和50对无关个体,ITO法计算全同胞关系指数(FSI)、半同胞关系指数(HSI)和FSI∶HSI值,比较3组两个体间等位基因匹配情况,并进行组间差异的χ2检验。结果全同胞的FSI均大于1;19对半同胞的HSI大于1;无关个体FSI均小于1;49对无关个体HSI小于1,1对为1.297。46对全同胞的FSI:HSI值大于1,22对半同胞的FSI:HSI值小于1。全同胞组两个体间1对等位基因全相同、半相同、全不同的基因座数平均值分别为6.06个、7.52个、1.42个;半同胞组分别为2.96个、8.48个、3.56个;无关个体组分别为1.24个、7.22个、6.54个。χ2检验3组两个体间1对等位基因全相同和全不同的基因座数差异有显著意义,半相同的基因座数差异无显著意义。结论PowerPlexTM16体系在全同胞-无关个体的鉴定中效率较高,在鉴定半同胞-无关个体或全同胞-半同胞时效率降低。全同胞-半同胞关系鉴定时,FSI∶HSI值是一个较有效的指标:大于1倾向于为全同胞,小于1倾向于为半同胞。

17个Y-STR位点复合扩增检测在半同胞关系鉴定中的应用

人类Y染色体STR基因座以其独特的优势在法医学实践中发挥着日益重要的作用。各种成熟的Y-STR分型试剂盒也不断被开发出来。本文结合实际案例对Yfiler商品化试剂盒进行了应用和验证。该试剂盒可以检测17个Y-STR位点并在一个管内实现复合扩增。

X染色体STR基因座在同胞亲缘鉴定中的应用

目的:探讨X染色体STR基因座独特的遗传方式在同胞亲缘关系鉴定中的应用。方法:应用聚合酶链式反应(PCR)、聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染显带技术对1名未知女性个体与3名已知同胞兄妹的22个基因座进行分型,并对线粒体D环高变区作序列测定。结果:得到具有排除价值的2个X染色体基因座(DXS7132、DXS6804)和4个常染色体基因座(D1S549、D2S441、D16S539、D5S818),否定了未知个体与3名同父同母兄妹的亲缘关系。结论:X染色体基因座在男性的基因组中呈单倍型形式存在,特别适用于法医学实践中在父母缺如情况下姐妹之间的亲缘鉴定。

短串联重复序列检测法用于同胞血缘关系鉴定

目的探讨人类短串连重复序列(STR)基因位点检测技术应用于同胞亲缘关系鉴定的可靠性。方法采集3名已知同胞与1名未知女性个体血样,提取DNA,常规PCR扩增,非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,银染显色分析。结果得到具有排除价值的5个位点(D12S375,D8S1179,TH01,FGA和D21S11),否定了未知个体与3名同胞同父同母兄妹的亲缘关系。结论STR基因位点多、多态性高、分布广、灵敏度高、易检测,是法医学个体识别和亲子鉴定的主要技术手段,在同胞鉴定中有较强的适用性。

多种遗传标记在一起同母异父半同胞关系鉴定中的综合应用

目的探讨多种遗传标记在一起同母异父半同胞关系鉴定中的综合应用。方法采用常染色体STR遗传标记、Y染色体STR遗传标记、线粒体DNA遗传多态性对甲和乙进行基因分型,根据分型结果,采用IBS法、ITO法和判别函数法进行半同胞关系的判定。结果依据常染色体STR基因分型结果,IBS法评分结果无法判断甲与乙之间存在全同胞关系;通过ITO法和判别函数法分析计算,提示甲与乙存在半同胞亲缘关系;进一步依据Y染色体STR基因分型结果,排除了甲和乙来源于同一生父,同时线粒体DNA高变I区多态性检测结果提示甲与乙来自同一生母,支持甲与乙为同母异父半同胞关系。结论综合应用多种遗传标记和判定方法对同母异父半同胞关系的鉴定有着重要的意义。

利用Identifiler分型系统推断同胞关系

目的探讨自主开发的同胞关系鉴定自动分析软件（ASI）对Identifiler分型系统进行同胞关系鉴定的可行性。方法应用本课题组所开发的软件ASI,对151对同胞及31 224对人工模拟无关个体进行Identifiler系统的15个常染色体STR基因座分型进行分析,计算亲权指数（PI）、同胞关系概率（WFS）和等位基因匹配情况,所获数据进行统计分析,自动计算排序。结果当WFS大于99.999%时,同胞个体占39.07%,无关个体占0%,两组具有显著差异,可以推断两个体同胞关系。当WFS介于1%~99.999%范围内,同胞个体和无关个体有部分重叠,同胞个体占60.93%,无关个体占21.3%,两者具有一定差异,可以通过增加检测STR基因座,再结合案情加作Y-STR、m tDNA检测,以推断两个体是否具有同胞关系。当WFS小于1%时,同胞个体占0%,无关个体占78.7%,可以推断两个体不具有同胞关系。个体间等位基因匹配结果表明：在检测Identifiler体系15个STR基因座时,当两个体常染色体STR基因座的全相同数目≥5时,或全不同数目≤1时,提示为同胞关系;当两个体全不同数目≥6时,或全相同数目≤1时,提示为无关个体,以此作为预测有无同胞关系的界值。结论Identifiler系统及同胞关系鉴定自动分析软件ASI可用于推断同胞关系。

联合应用常染色体STR、X-STR和线粒体SNP鉴别缺失双亲姐妹同胞关系

目的对双亲缺失的姐妹进行同胞鉴定。方法采用chelex-100法提取血液DNA,通过检测常染色体短串联重复序列(short tandem repeat,STR)位点、X染色体STR位点和线粒体单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)进行基因分型,分型结果通过判别函数、ITO法、X染色体STR位点和线粒体SNP分析的方法进行同胞关系判定。结果 39个常染色体等位基因位点的共享基因数为27个,用辨别函数判别归于无关个体;用ITO法计算亲缘关系系数(FSI)为6.95003×10^(-44),判别为无关个体;12个X染色体STR等位基因位点中,有3个X染色体STR位点不匹配,排除姐妹俩来自同一父亲;线粒体SNP的检测显有3个基因座不同,两人来源于不同母系。结论通过联合利用常染色体STR、X染色体STR和线粒体SNP检测技术进行确认两人不是同胞姐妹关系。