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含铜胺氧化酶1在脂代谢中的功能研究
1
作者
向思婷
刘莘颖
+2 位作者
李匡政
赵同金
王旭
《生物医学工程学杂志》
EI
CAS
北大核心
2024年第5期1019-1025,1034,共8页
含铜胺氧化酶1(AOC1)是含铜胺氧化酶家族中的关键成员,催化组胺和腐胺的脱氨氧化反应。近年来,AOC1被发现与多种癌症相关,它在某些癌细胞中的表达水平显著升高,提示可能在癌症进展中起到重要作用。然而,AOC1在脂代谢中的功能仍未被充分...
含铜胺氧化酶1(AOC1)是含铜胺氧化酶家族中的关键成员,催化组胺和腐胺的脱氨氧化反应。近年来,AOC1被发现与多种癌症相关,它在某些癌细胞中的表达水平显著升高,提示可能在癌症进展中起到重要作用。然而,AOC1在脂代谢中的功能仍未被充分研究。通过遗传学分析,我们发现AOC1与脂代谢存在潜在关联。接着,我们构建了Aoc1^(-/-)小鼠模型,并在标准饮食和高脂饮食条件下对其代谢表型进行了研究。实验结果显示,在高脂饮食条件下,Aoc1^(-/-)小鼠表现出体脂含量增加和葡萄糖耐受不良,白色脂肪组织和肝脏中的脂质积累显著增加。本研究揭示了AOC1在脂代谢中的潜在作用,以及它在代谢紊乱如肥胖和2型糖尿病中的潜在功能,为代谢性疾病的治疗提供了新的靶点和研究方向。
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关键词
含铜胺氧化酶1
脂代谢
肥胖模型
原文传递
基于癌症基因组图谱数据库挖掘影响前列腺癌预后的关键基因
2
作者
冯超杰
马静
+1 位作者
田沛
马彦
《中华实验外科杂志》
CAS
2024年第5期1082-1085,共4页
目的:采用生物信息学方法对癌症基因组图谱(TCGA)数据库进行挖掘,寻找影响前列腺癌患者预后的关键基因。方法:TCGA中下载前列腺癌患者相关数据,应用RStudio软件筛选差异表达基因,clusterProfiler包对差异基因进行基因本体论(GO)及京都...
目的:采用生物信息学方法对癌症基因组图谱(TCGA)数据库进行挖掘,寻找影响前列腺癌患者预后的关键基因。方法:TCGA中下载前列腺癌患者相关数据,应用RStudio软件筛选差异表达基因,clusterProfiler包对差异基因进行基因本体论(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。用基因表达谱交互分析(GEPIA2)从差异基因中筛选出影响前列腺癌患者预后的基因,将筛选出的基因按表达量绘制接受者操作特性(ROC)曲线,将曲线下面积(AUC)>0.7的3个基因按照最佳截断值分为高低表达组,进行生存分析和多因素回归分析,利用timer2.0进行免疫细胞浸润相关性分析。应用χ^(2)检验、Kaplan-Meier分析及Cox回归进行数据分析。结果:筛选出差异表达基因358个。差异基因的GO及KEGG富集分析发现激素代谢过程、肽酶调节活性、雌激素信号通路等功能和通路有差异。通过GEPIA2初步筛选出12个影响前列腺癌总生存期(OS)的差异基因,3个基因符合AUC>0.7,上调基因为孕激素和脂联素分子受体6(PAQR6)及抗苗勒管激素(AMH),下调基因为含铜胺氧化酶1(AOC1)。生存分析结果显示,Gleason评分、PAQR6、AMH及AOC1影响前列腺癌患者的OS(χ^(2)=7.235、13.513、12.264、13.748,P<0.01),多因素Cox回归结果表明,Gleason评分>7分风险比(HR)5.76,95%置信区间(CI)1.04~32.07,P<0.05、PAQR6高表达(HR:11.75,95%CI:1.42~97.11,P<0.05)和AOC1高表达(HR:0.17,95%CI:0.04~0.85,P<0.05)是影响前列腺癌患者OS的独立影响因素。前列腺癌内PAQR6的表达量与CD4+T细胞、CD8+T细胞及B细胞的表达量呈负相关(r=-0.158、-0.200、-0.142,P<0.01)。结论:PAQR6及AOC1在前列腺癌中差异表达,是影响前列腺癌患者预后的独立影响因子。
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关键词
前列腺癌
脂联素分子受体6
含铜胺氧化酶1
生物信息学
原文传递
题名
含铜胺氧化酶1在脂代谢中的功能研究
1
作者
向思婷
刘莘颖
李匡政
赵同金
王旭
机构
复旦大学代谢与整合生物学研究院
出处
《生物医学工程学杂志》
EI
CAS
北大核心
2024年第5期1019-1025,1034,共8页
基金
国家重点研发计划项目(2020YFA0803601)
国家自然科学基金项目(32101046,32371364)。
文摘
含铜胺氧化酶1(AOC1)是含铜胺氧化酶家族中的关键成员,催化组胺和腐胺的脱氨氧化反应。近年来,AOC1被发现与多种癌症相关,它在某些癌细胞中的表达水平显著升高,提示可能在癌症进展中起到重要作用。然而,AOC1在脂代谢中的功能仍未被充分研究。通过遗传学分析,我们发现AOC1与脂代谢存在潜在关联。接着,我们构建了Aoc1^(-/-)小鼠模型,并在标准饮食和高脂饮食条件下对其代谢表型进行了研究。实验结果显示,在高脂饮食条件下,Aoc1^(-/-)小鼠表现出体脂含量增加和葡萄糖耐受不良,白色脂肪组织和肝脏中的脂质积累显著增加。本研究揭示了AOC1在脂代谢中的潜在作用,以及它在代谢紊乱如肥胖和2型糖尿病中的潜在功能,为代谢性疾病的治疗提供了新的靶点和研究方向。
关键词
含铜胺氧化酶1
脂代谢
肥胖模型
Keywords
Amine oxidase copper-containing
1
Lipid metabolism
Obesity model
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
基于癌症基因组图谱数据库挖掘影响前列腺癌预后的关键基因
2
作者
冯超杰
马静
田沛
马彦
机构
郑州大学附属肿瘤医院
出处
《中华实验外科杂志》
CAS
2024年第5期1082-1085,共4页
基金
河南省重点研发与推广专项项目(222102310327)。
文摘
目的:采用生物信息学方法对癌症基因组图谱(TCGA)数据库进行挖掘,寻找影响前列腺癌患者预后的关键基因。方法:TCGA中下载前列腺癌患者相关数据,应用RStudio软件筛选差异表达基因,clusterProfiler包对差异基因进行基因本体论(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。用基因表达谱交互分析(GEPIA2)从差异基因中筛选出影响前列腺癌患者预后的基因,将筛选出的基因按表达量绘制接受者操作特性(ROC)曲线,将曲线下面积(AUC)>0.7的3个基因按照最佳截断值分为高低表达组,进行生存分析和多因素回归分析,利用timer2.0进行免疫细胞浸润相关性分析。应用χ^(2)检验、Kaplan-Meier分析及Cox回归进行数据分析。结果:筛选出差异表达基因358个。差异基因的GO及KEGG富集分析发现激素代谢过程、肽酶调节活性、雌激素信号通路等功能和通路有差异。通过GEPIA2初步筛选出12个影响前列腺癌总生存期(OS)的差异基因,3个基因符合AUC>0.7,上调基因为孕激素和脂联素分子受体6(PAQR6)及抗苗勒管激素(AMH),下调基因为含铜胺氧化酶1(AOC1)。生存分析结果显示,Gleason评分、PAQR6、AMH及AOC1影响前列腺癌患者的OS(χ^(2)=7.235、13.513、12.264、13.748,P<0.01),多因素Cox回归结果表明,Gleason评分>7分风险比(HR)5.76,95%置信区间(CI)1.04~32.07,P<0.05、PAQR6高表达(HR:11.75,95%CI:1.42~97.11,P<0.05)和AOC1高表达(HR:0.17,95%CI:0.04~0.85,P<0.05)是影响前列腺癌患者OS的独立影响因素。前列腺癌内PAQR6的表达量与CD4+T细胞、CD8+T细胞及B细胞的表达量呈负相关(r=-0.158、-0.200、-0.142,P<0.01)。结论:PAQR6及AOC1在前列腺癌中差异表达,是影响前列腺癌患者预后的独立影响因子。
关键词
前列腺癌
脂联素分子受体6
含铜胺氧化酶1
生物信息学
Keywords
Prostate cancer
PAQR6
AOC
1
Bioinformatics
分类号
R737.25 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
含铜胺氧化酶1在脂代谢中的功能研究
向思婷
刘莘颖
李匡政
赵同金
王旭
《生物医学工程学杂志》
EI
CAS
北大核心
2024
0
原文传递
2
基于癌症基因组图谱数据库挖掘影响前列腺癌预后的关键基因
冯超杰
马静
田沛
马彦
《中华实验外科杂志》
CAS
2024
0
原文传递
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