含patatin样磷脂酶结构域蛋白7通过过氧化物酶体增殖物激活受体γ促进巨噬细胞M2型极化

溶血磷脂酰胆碱(LPC)在免疫反应、组织炎症和重塑中调控巨噬细胞极化的动态和整体过程。含patatin样磷脂酶结构域蛋白7(PNPLA7)是近年发现的优先水解LPC的溶血磷脂酶。然而,直到现在仍不清楚PNPLA7在巨噬细胞极化中的表达和作用。本研究发现,PNPLA7在白细胞介素4(IL-4)刺激的巨噬细胞向替代激活(M2)表型的极化过程中上调(P<0.05)。本文发现,PNPLA7的敲低和过表达分别降低和增加了M2标记基因,包括精氨酸酶1(Arg1)和类几丁质酶3(Ym1)的表达(P<0.05)。进一步的研究表明,PNPLA7在M2极化过程中调节过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)在mRNA和蛋白质水平上的表达(P<0.05)。然而,信号转导和转录激活因子6(STAT6)的磷酸化不受PNPLA7的影响。这些发现表明,PNPLA7通过PPARγ相关机制促进巨噬细胞抗炎M2型极化。

patatin样磷脂酶结构域蛋白3基因rs738409多态性在代谢相关脂肪性肝病诊疗中的应用研究进展

代谢相关脂肪性肝病(MAFLD)是一种以肝脏脂肪蓄积为特征的疾病,是终末期肝病、原发性肝癌、肝移植的重要原因。MAFLD影响了全球约1/4的人口,给公共卫生带来了巨大的负担。遗传因素与环境因素在MAFLD发生发展中共同发挥作用,其中patatin样磷脂酶结构域蛋白3(PNPLA3)基因rs738409多态性是MAFLD发生发展的决定性遗传因素之一。该文就PNPLA3基因rs738409多态性在MAFLD发生发展中的作用机制,以及其在MAFLD的预测、诊断及治疗中的应用研究进展进行阐述。

不同patatin样磷脂酶结构域蛋白3I148M基因型对肝癌细胞增殖的影响

目的 探讨含patatin样磷脂酶结构域蛋白3（PNPLA3）野生型148I/I及突变型148M/M对人肝癌细胞株HepG2增殖的影响及相关机制.方法 构建PNPLA3148I/I及148M/M慢病毒稳定过表达及阴性对照细胞株即过表达PNPLA3野生型148I/I HepG2细胞、过表达PNPLA3突变型148M/M HepG2细胞和阴性病毒对照（NC）HepG2细胞.细胞增殖/毒性检测试剂盒（CCK8）检测不同细胞株的活力,5-乙炔基-2′脱氧尿苷（EdU）法检测细胞增殖情况,Western印迹检测磷脂酰肌醇-3激酶（PI3K）信号通路的蛋白水平,采用酶联免疫吸附法（ELISA）检测与增殖相关的PNPLA3代谢产物花生四烯酸（AA）、溶血磷脂酸（LPA）,实时荧光定量PCR检测PNPLA3相关增殖指标前列腺素过氧化物合酶2（PTGS2）和过氧化物酶体增殖物激活受体 γ辅助活化因子1α（PGC1α）mRNA表达水平.结果 过表达PNPLA3148M/M组比过表达PNPLA3148I/I组细胞活力高,差异有统计学意义[（98.02±1.29）％比（71.51±2.89）％,P〈0.001],与NC相比差异无统计学意义[（98.02±1.29）％比（100±2.61）％,P=0.181].过表达PNPLA3148M/M组细胞增殖活性较过表达PNPLA3148I/I组高,差异有统计学意义（46.46±1.83比35.96±2.65,P=0.001）,与NC组相比差异无统计学意义（46.46±1.83比46.64±7.33,P=0.965）.过表达PNPLA3148M/M组较过表达PNPLA3148I/I组PGC1αmRNA表达水平,总PI3K、PThr-308蛋白激酶B（PThr-308 AKT）、PSer2448-哺乳动物雷帕霉素靶蛋白（PSer2448-mTOR）、PGC1α蛋白表达水平增高,但AA和LPA水平以及PTGS2 mRNA表达水平两组差异无统计学意义.结论 PNPLA3148M/M细胞增殖作用较PNPLA3148I/I强.

蓝莓联合益生菌对非酒精性脂肪性肝病模型大鼠PNPLA3和SREBP-1c表达的影响

目的观察含patatin样磷脂酶域3(PNPLA3)和胆固醇调节元件结合蛋白(SREBP)1c在蓝莓联合益生菌对非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)模型大鼠干预实验中的表达,并探讨其在NAFLD中的作用机制。方法清洁级SD大鼠36只分为正常组(NG)、模型组(MG)、自然恢复组(SRG)、蓝莓组(BG)、益生菌组(PG)和蓝莓联合益生菌组(BPG)。实验结束后,制作组织切片,观察血清学、组织学形态变化,检测PNPLA3和SREBP-1c基因及蛋白表达情况。多组间比较用单因素方差分析,方差齐时用SNK-q检验,方差不齐时用Tamhane's-T2检验。结果 6组间在肝脏指数、ALT、TC、TG、LDL和HDL上差异均有统计学意义(F值分别为384.908、188.554、75.523、94.667、95.235、132.586,P值均<0.01)。6组间NAFLD活动度积分差异有统计学意义(F=71.896,P<0.01),其中BPG组较MG、SRG、BG、PG组下降最为显著(P值均<0.01)。6组肝组织表达PNPLA3和SREBP-1c阳性率差异均有统计学意义(F值分别为175.527、110.504,P值均<0.01),其中BPG组较MG、SRG、BG、PG组下降最为显著(P值均<0.01)。PNPLA3和SREBP-1c的mRNA和蛋白表达各组间差异有统计学意义(F值分别为375.822、410.379、288.940、116.054,P值均<0.01)。其中BPG组的PNPLA3和SREBP-1C的mRNA和蛋白表达较MG、SRG、BG、PG组明显下降(P值均<0.01)。结论蓝莓联合益生菌能有效改善NAFLD的病理组织结构,减轻肝细胞脂肪变性,其机制可能是蓝莓与益生菌联合可减轻炎症因子诱发的炎症效应,下调SREBP-1c的表达,从而减弱PNPLA3基因转录,增强胆固醇代谢,减少脂质沉积,是NAFLD的一个辅助治疗方案。

非酒精性脂肪性肝病患者PNPLA3基因rs139051 C>T多态性分析

目的观察非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)患者patatin样磷脂酶域3(PNPLA3)基因rs139051 C>T多态性。方法将100例NAFLD患者作为观察组,同时选取100例健康志愿者作为对照组,使用PCR-LDR对两组PNPLA3基因rs139051行单核苷酸多态性分型,采用logsitic回归分析rs139051基因型与ALT、血糖、甘油三酯、胆固醇、肝脏纤维化程度指标(NFS评分、Fibroscan分级)的关系。结果观察组、对照组PNPLA3基因rs139051 CC基因型分别为10、39例,TC基因型分别为48、24例,TT基因型分别为42、37例,两组相比P均<0.01。相对于CC基因型,TC+TT基因型ALT、血糖、甘油三酯、胆固醇、NFS评分、Fibroscan分级的OR(95%CI)分别为1.94(0.50~7.50)、2.33(0.60~9.08)、4.00(1.04~15.32)、1.11(0.27~4.65)、4.29(1.12~16.52)、4.93(1.27~19.13),P分别为0.34、0.22、0.04、0.88、0.03、0.02。结论 NAFLD患者中PNPLA3基因rs139051基因型TC、TT比例高,且更易促进NAFLD进展。

不同研究方法在PNPLA3 I148M SNP诱导非酒精性脂肪性肝病发生、发展中的作用

非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)是引起慢性肝病最常见的原因。近年来研究发现,除外肥胖、胰岛素抵抗(IR)、高脂血症等危险因素,遗传因素在其发病中发挥重要的作用。PNPLA3,又称脂肪营养素,与脂质代谢密切相关。rs738409处基因SNP导致148位异亮氨酸被蛋氨酸取代,自2008年全基因组分析证实了PNPLA3 I148M与NAFLD发生、发展的相关性,此后学者采用了多种研究方法以解释两者之间可能的机制。本文从人群研究、动物实验、细胞实验等几个方面来阐述PNPLA3 I148M SNP与NAFLD的相关性。

PNPLA3基因在非酒精性脂肪性肝病中的作用

非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)在世界范围内发病率成日益上升趋势,其相关基因研究对完善其致病机制,补充其治疗方案及改善预后至关重要.目前,国内外多项实验证实含patatin样磷脂酶域3(PNPLA3)基因突变与NAFLD密切相关,考虑其与肝脏脂代谢有关,但就其致病机制仍无详细阐释.部分文献认为PNPLA3作为patatin样磷脂酶家族,考虑其可能有三酰甘油水解酶活性从而影响肝脏脂肪代谢.也有文献认为PNPLA3突变干扰了脂质转运的过程.本文详细介绍PNPLA3基因及其表达,并就PNPLA3基因突变与NAFLD相关性进行综述.

PNPLA3 I148M (rs738409) SNP与肝硬化及肝细胞癌关系的研究进展

含patatin样磷脂酶域3(patatin-like phospholipase domain containing 3,PNPLA3),又称脂肪营养素.大量位于肝细胞膜上并参与脂质代谢.rs738409处基因突变致148位异亮氨酸被蛋氨酸取代(148 isoleucine to Methionine protein variant,I148M).近年来全基因组分析显示PNPLA3 I148M与肝脏脂肪含量、血清肝酶水平、纤维化程度明显相关,研究显示PNPLA3 I148M与酒精性肝硬化进程及其所致肝细胞癌的临床转归及预后、慢性丙型肝炎的临床转归显著相关.PNPLA3 I148M在肝病进展中扮演重要角色,可作为肝细胞癌的一个独立危险因素.

组蛋白乙酰化修饰调控NF-κB驱动的PNPLA3基因表达的机制初探

目的探讨禁食/再喂食后小鼠肝脏Patatin样磷脂酶域蛋白3(PNPLA3)基因启动子核因子-κB(NF-κB)结合区域组蛋白H3K9乙酰化(H3K9ac)水平以及相关去乙酰化酶(HDAC)和乙酰化转移酶(HAT)的变化特点。方法根据体质量将18只C57BL/6小鼠随机分为3组各6只,分别为自由饮食组、禁食组(夜间饥饿24 h)和再喂食组(饥饿24 h后再自由摄食高蔗糖含量饲料12 h),分别予自由饮食、禁食和禁食后再喂食干预,检测并比较各组肝脏PNPLA3、NF-κB、HDAC(SIRT1、SIRT6)和HAT(GCN5、Elp3)基因表达情况,用染色质免疫共沉淀-定量PCR检测H3K9ac富集水平,并分析H3K9ac与PNPLA3表达的相关性。结果 3组比较,C57BL/6小鼠肝脏PNPLA3、NF-κB基因表达在禁食时下调,再喂食后又上调(P均<0.001)。H3K9ac水平变化与PNPLA3变化趋势一致(P均<0.05),相关分析提示两者具有相关性(rs=0.958, P <0.001);禁食组SIRT1和SIRT6表达水平较自由饮食组高,再喂食组两者水平均下降(P均<0.05),与H3K9ac变化趋势相反;GCN5、Elp3表达变化与SIRT1及SIRT6类似(P均<0.05)。结论 SIRT1和SIRT6相关H3K9去乙酰化涉及饮食调节NF-κB驱动的PNPLA3的表达。

PNPLA3基因I148M多态性对肝癌细胞HepG2细胞周期及Cyclin D1、p53表达的影响

目的探讨含patatin样磷脂酶域蛋白3(PNPLA3)基因I148M多态性对肝癌细胞Hep G2细胞周期及Cyclin D1、p53表达的影响。方法构建PNPLA3基因I148M突变型(突变组)、PNPLA3基因I148M野生型(野生组)的肝癌细胞Hep G2,以空载体细胞作为对照组,采用流式细胞仪检测各组细胞周期,Western blotting、荧光定量PCR技术检测各组细胞Cyclin D1、p53蛋白及mRNA表达。结果突变组G1期细胞所占比例明显低于野生组和对照组,S、G2/M期细胞所占比例明显高于野生组和对照组(P均<0.05);野生组与对照组G1、S、G2/M期细胞所占比例比较差异均无统计学意义(P均>0.05)。三组间Cyclin D1蛋白及mRNA相对表达量比较差异均无统计学意义(P均>0.05),突变组p53蛋白及mRNA相对表达量显著高于野生组和对照组(P均<0.05),而野生组和对照组比较差异均无统计学意义(P均>0.05)。结论 PNPLA3基因I148M多态性能够诱导p53过表达,导致肝细胞周期紊乱,最终发展成肝癌细胞。

中国汉族人群PNPLA3 rs738409(C>G)基因多态性与肝硬化病因学的相关性

目的:探究在中国汉族人群中,含patatin样磷脂酶域3(patain-like phospholipase domaincontaining protein 3,PNPLA3)I148M基因变异与酒精性肝硬化、慢性乙型病毒性肝炎肝硬化及慢性丙型病毒性肝炎肝硬化易感性及肝脏损伤程度、预后是否存在相关性.方法:本研究纳入224例中国汉族酒精性肝硬化、慢性丙型病毒性肝炎肝硬化、慢性乙型病毒性肝炎肝硬化患者,其中,慢性乙型病毒性肝炎肝硬化患者88例,酒精性肝硬化患者83例,慢性丙型病毒性肝炎肝硬化患者53例及200名健康人群作为对照组.采用探针法基因分型检测PNPLA3 rs738409与肝硬化之间的相关性.结果:PNPLA3 I148M rs738409 G等位基因型在酒精性肝硬化(OR=1.902,P<0.001)及慢性乙型肝炎肝硬化(OR=1.452,P=0.047)与健康对照组中的频率分布存在显著差异;丙型肝炎肝硬化与健康对照组中的等位基因频率分布差异无统计学意义(P=0.056).并未得出PNPLA3 I148M rs738409 C>G与肝硬化原发性肝细胞癌相关(P=0.965).结论:PNPLA3 rs738409 C>G在中国汉族人群中与酒精性肝硬化及慢性乙型肝炎肝硬化易感性存在相关性.

外周血PNPLA3 rs738409基因多态性与非酒精性脂肪性肝病遗传易感性研究

目的分析patatin样磷脂酶结构域蛋白3(PNPLA3)rs738409基因多态性与非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)遗传易感性的关系。方法2017年11月~2019年11月我院诊治的162例NAFLD患者和同期体检的100例健康人,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性检测外周血PNPLA3 rs738409位点多态性。结果NAFLD组PNPLA3基因rs738409位点GG基因型频率为37.0%,G等位基因频率为58.3%,显著高于健康人(分别为11.0%和34.0%,P<0.05),而GC和CC基因型频率分别为42.6%和20.4%,C等位基因频率为41.7%,与健康人的46.0%、43.0%和66.0%比,差异无统计学意义(P>0.05);73例GG基因型的NAFLD患者血清ALT和AST水平分别为(118.5±20.3)U/L和(85.2±14.7)U/L,显著高于65例GC基因型患者[分别为(93.3±16.4)U/L和(59.6±10.3)U/L,P<0.05]或24例CC基因型患者[分别为(65.9±11.8)U/L和(31.9±5.5)U/L,P<0.05];GG和GC基因型NAFLD患者血清TG水平分别为(2.0±0.5)mmol/L和(1.6±0.4)mmol/L,均显著高于CC基因型NAFLD患者[(1.1±0.2)mmol/L,P<0.05]。结论本研究结果提示PNPLA3 rs738409基因多态性与NAFLD遗传易感性有关,其影响机制有待进一步研究明确。

酒精性肝硬化患者血CTLA-4和PNPLA3基因多态性及其临床意义分析

目的探讨细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4(CTLA-4)和Patatin样磷脂酶3(PNPLA3)基因多态性与酒精性肝硬化发病的关系。方法2017年1月~2019年1月我院治疗的酒精性肝硬化患者110例和同期健康人100例,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性检测血CTLA-4基因rs4675369位点和PNPLA3基因rs738409位点多态性。结果肝硬化患者CTLA-4基因rs4675369位点为AA型、AG型和GG型比率分别为26.4%、49.1%和24.6%,与健康人的26.0%、50.0%和24.0%比,无显著性差异(P>0.05),等位基因A和G比率分别为50.9%和49.1%,与健康人的51.0%和49.0%比,也无显著性差异(P>0.05);肝硬化患者PNPLA3基因rs738409位点GG基因型和等位基因G比率分别为17.2%和38.2%,显著高于健康人的4.0%和24.0%(P<0.05);血CTLA-4基因rs4675369位点AA型、AG型和GG型和PNPLA3基因rs738409位点CC型、CG型和GG型肝硬化患者血清丙氨酸氨基转移酶、天门冬氨酸氨基转移酶、谷氨酰转肽酶和碱性磷酸酶水平之间比,差异均无统计学意义(P>0.05)。结论本研究结果未提示CTLA-4基因多态性与酒精性肝硬化发病存在相关关系,而PNPLA3基因多态性与酒精性肝硬化发病的关系也需要进一步研究明确。

慢性HBV感染者外周血PNPLA3/PRKAA1基因多态性与肝硬化发生关系研究

目的探讨Patatin样磷脂酶域蛋白3(PNPLA3)和腺苷活化蛋白激酶α1亚基(PRKAA1)基因多态性与感染HBV后肝硬化发生的关系。方法2016年1月~2021年7月我院诊治的乙型肝炎肝硬化患者101例和同期慢性无症状HBV携带者90例,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性检测血浆PNPLA3基因rs738409、rs139047、rs2294919和PRKAA1基因rs3792822、rs10036575、rs154268位点多态性,应用Logistic回归分析疾病风险关联。结果肝硬化组PNPLA3基因rs139047位点AA、GA、GA基因型比率分别为18.8%、51.5%和29.7%,与HBV携带者的16.7%、51.1%和32.2%比,无显著性差异(P>0.05),rs2294919位点CC、TC、TT基因型比率分别为41.6%、45.5%和12.9%,与HBV携带者的38.9%、50.0%和11.1%比,无显著性差异(P>0.05);PRKAA1基因rs3792822位点GG、GA、AA基因型比率分别为54.5%、38.6%和6.9%,与HBV携带者的55.6%、37.8%和6.7%比,无显著性差异(P>0.05),rs154268位点CC、CT、TT基因型比率分别为5.0%、35.6%和59.4%,与HBV携带者的4.4%、34.4%和61.1%比,无显著性差异(P>0.05);肝硬化组PNPLA3基因rs738409位点GG基因型和等位基因G比率分别为19.8%和44.6%,显著高于HBV携带者的8.9%和29.4%(P<0.05);肝硬化组PRKAA1基因rs10036575位点CC基因型和等位基因C比率分别为38.6%和63.9%,显著高于HBV携带者的23.3%和45.5%(P<0.05);经非条件Logistic回归模型分析显示PNPLA3基因rs738409位点GG基因型【OR为1.605(95%CI:1.150~2.239)】和PRKAA1基因rs10036575位点CC基因型【OR值为1.507((95%CI:1.097~2.070)】是影响感染HBV后肝硬化发生的危险基因型。结论感染HBV后发生肝硬化可能与某些特殊基因有关,研究PNPLA3基因和PRKAA1基因可能有助于阐明其中的分子机制。

PNPLA3基因高表达对非酒精性脂肪性肝病模型细胞增殖和甘油三酯的影响

目的探讨patatin样磷脂酶域3(PNPLA3)高表达对非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)细胞模型细胞增殖和甘油三酯(TG)的影响。方法将人肝癌细胞(SMMC-7721细胞)分为对照组、模型组、PNPLA3过表达组、PNPLA3过表达空载组。模型组:经游离脂肪酸诱导建立NAFLD细胞模型,PNPLA3过表达组、PNPLA3过表达空载组:在造模后经慢病毒原液感染、嘌呤霉素筛选获得。用定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)、MTT比色法和TG测试技术检测细胞中PNPLA3表达情况、细胞存活率和胞内TG含量。结果qRT-PCR结果显示,模型组PNPLA3基因的表达量高于对照组(P<0.01),PNPLA3过表达组PNPLA3基因表达量高于模型组(P<0.01)。MTT结果显示,模型组细胞相对存活率高于对照组(P<0.05),PNPLA3过表达组细胞相对存活率高于模型组(P<0.01)。TG检测结果显示:模型组TG含量高于对照组(P<0.01),PNPLA3过表达组中胞内TG含量高于模型组(P<0.05)。结论成功构建PNPLA3过表达NAFLD稳转株,PNPLA3的过量表达有助于细胞脂质堆积并增强细胞相对存活率。

中国东北地区汉族人群PNPLA3 rs738409及TM6SF2 rs58542926基因多态性与原发性肝癌的相关性

目的探讨中国东北地区汉族人群patatin样磷脂酶域3(PNPLA3)rs738409及跨膜蛋白6超家族2(TM6SF2)rs58542926基因多态性与原发性肝癌发病的相关性。方法采用病例-对照研究,纳入521例原发性肝癌患者作为病例组,164名健康人作为对照组。病例组根据病因学分为有及无肝硬化组。采用聚合酶链反应(PCR)方法分别检测PNPLA3 rs738409及TM6SF2 rs58542926两个位点的基因多态性。对计量资料用t检验、方差分析或U检验,对计数资料用χ^(2)检验或Fisher确切概率法。结果病例组与对照组相比,PNPLA3 rs738409 G等位基因频率分布存在明显差异(OR=1.583,P=0.001);进一步分组后显示,除在丙型病毒性肝炎相关性肝癌组中与对照组差异无统计学意义外(P=0.161),在其他分组中均存在明显差异(P值均<0.05)。与对照组相比,病例组TM6SF2 rs58542926 T等位基因频率明显高于对照组(OR=1.759,P=0.048)。分组后仅合并肝硬化肝癌组CT/TT基因型频率及酒精性相关性肝癌组T等位基因频率与对照组的差异有统计学意义(P值分别为0.045,0.032)。将病例组按照是否携带PNPLA3 rs738409 G等位基因分成CG/GG与CC组;按照是否携带TM6SF2 rs58542926 T等位基因分成CT/TT与CC组,结果显示,CG/GG与CC组及CT/TT与CC组肝脏酶学指标、白蛋白(Alb)、总胆红素(TBil)、甲胎蛋白(AFP)及空腹血糖水平的差异均无统计学意义。将病例组伴有肝硬化的患者根据Child-Pugh评分分为≥7分组与<7分组,结果显示,PNPLA3 rs738409 CG/GG型与CC型患者的Child-Pugh评分差异及TM6SF2 rs58542926 CT/TT型与CC型患者的Child-Pugh评分差异均无统计学意义(P值均>0.05)。结论PNPLA3 rs738409及TM6SF2 rs58542926基因多态性在中国东北地区汉族人群中与原发性肝癌的发生存在相关性。PNPLA3 rs738409及TM6SF2 rs58542926基因多态性在原发性肝癌中对肝脏酶学、Alb、TBil、AFP及空腹血糖等指标没有影响。

PNPLA3、TM6SF2基因多态性及其与吸烟、饮酒交互作用对HBV相关肝癌的影响

目的探讨PNPLA3、TM6SF2基因多态性及其与吸烟、饮酒交互作用对HBV相关肝癌(hepatitis B virus—associated hepatocellular carcinoma,HBV-HCC)的影响。方法收集2010年1月至2014年3月HBV-HCC患者、慢性乙型肝炎(乙肝)患者(CHB)、肝硬化患者(LC)以及健康体检者的血液标本,应用飞行质谱技术检测patatin样磷脂酶域3(PNPLA3)基因位点rs738409和6号跨膜超家族成员2(TM6sF2)基因位点rs58542926的单核苷酸多态性(SNP)。利用在线SNP stats寻找基因多态性的最优赋值方法;检验SNP是否符合哈一温(H-W)遗传平衡定律;采用多分类logistic回归分析PNPLA3和TM6SF2多态性及吸烟、饮酒因素对HBV-HCC的影响,采用叉生分析和二分类logistic回归分析探讨基因一基因、基因一吸烟、饮酒交互作用对HBV-HCC的影响。结果H—W遗传平衡检验结果显示,CHB组rs738409位点的基因型频率分布不符合H—W遗传平衡定律(Χ^2=11.980,P<0.005),CHB组rs58542926位点、HBV-HCC组和LC组rs738409和rs58542926位点均符合H-W遗传平衡定律;调整年龄、性别的影响后,与健康体检者相比,HBV-HCC组rs58542926突变的OR=1.659,95%CI:1.026~2.684,P=0.039。与CHB组相比,HBV-HCC组饮酒的OR=1.680,95%CI:1.121~2.519,P=0.012。与LC组相比,HBV-HCC组饮酒与吸烟的OR值(95%CI)分别为1.539(1.071~2.213)和1.453(1.005~2.099)。交互作用分析显示,HBV-HCC组与CHB+LC组相比,rs738409与rs58542926交互作用的叉生分析相加模型OR=1.548(u=1.885,P=0.029),logistic回归相乘模型OR=1.658(P=0.024);饮酒与rs738409的交互作用叉生分析,饮酒且rs738409突变相加模型OR=1.811(U=1.965,P=0.024),相乘模型无统计学意义;logistic回归相乘模型吸烟与饮酒的交互作用OR=1.756(P<0.001)。结论TM6SF2基因突变、吸烟、饮酒是HBV-HCC的危险因素,PNPLA3与TM6SF2基因都突变、饮酒并且吸烟是HBV-HCC的危险因素。PNPLA3的单基因突变可以减弱饮酒对HBV-HCC的危害。

应用“GSEA-WGCNA-验证”整合策略分析类风湿关节炎肝肾亏虚证的生物标志物研究

目的应用基因集富集分析(GSEA)和加权基因共表达网络分析(WGCNA)发现类风湿关节炎(RA)肝肾亏虚证的候选生物标志物,并进行临床验证,探讨RA肝肾亏虚证的生物学基础。方法临床收集RA肝肾亏虚证(3例)、7个非肝肾亏虚证(各3例)及健康志愿者(4名)的全血样本,开展转录组学测序。以健康志愿者为对照,筛选RA肝肾亏虚证的差异表达基因集进行富集分析和功能注释。以RA非肝肾亏虚证患者和健康志愿者为对照,对转录组表达谱开展GSEA和WGCNA联用挖掘,将获取的关键差异表达基因作为RA肝肾亏虚证的候选生物标志物。利用独立临床验证集样本(每组≥12例)对候选生物标志物的表达水平进行qPCR检测,采用受试者操作特征(ROC)曲线等评价其辨证效能。结果RA肝肾亏虚证的差异表达基因富集于“免疫-炎症”相关通路、细胞调控相关通路和代谢相关通路,同时,还参与肝肾发育和代谢等生物过程。转录组表达谱的GSEA富集结果表明,与非肝肾亏虚证组相比,肝肾亏虚证组的差异表达基因更明显地参与肝功能(脂质、血液)代谢调节,肾功能(水盐、激素)代谢调节和神经系统调节相关的作用通路。WGCNA分析使转录组表达谱的17010个基因被分为了19个特征模块,其中3个特征模块与肝肾亏虚证呈明显正相关(r>0.300,P<0.05),其生物功能以“免疫-炎症”调节为主。整合GSEA和WGCNA分析结果后,选取变异系数、作用通路和生物模块代表性均排名前50%的3个关键基因[花生四烯酸5-脂氧合酶(ALOX5)、含Patatin样磷脂酶结构域蛋白8(PNPLA8)及抗沉默功能1(ASF1A)]作为RA肝肾亏虚证的候选生物标志物。验证结果显示:ALOX5、PNPLA8和ASF1A的辨证敏感度分别为88.89%、100.00%和100.00%,特异度分别为84.51%、76.47%和78.69%,准确度分别为85.00%、79.49%和80.00%,精确度分别为88.89%、100.00%和100.00%,ROC曲线下面积值分别为0.860、0.910和0.900。结论应用“GSEA-WGCNA-验证”整合策略,发现了RA肝肾亏虚证的新型生物标志物,有助于提高RA核心证候临床精准化诊断的水平和证候客观化研究的深度。

重视非酒精性脂肪性肝病进展的遗传危险因素

尽管动物模型（鼠）可以复制促进甘油三酯（TG）在肝脏沉积和从脂肪变性到非酒精性脂肪性肝炎（NASH）、肝硬化及肝细胞肝癌这个连续的过程，提供可能的病理机制，但在人类复制这个过程依然没有得到明确的界定。最近，从人类基因识别序列的研究中得到了一些新的见解，可能为非酒精陛脂肪性肝病（NAFLD）发病机制提供新的分子线索。