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人Mcl-1基因启动子区结合蛋白的生物信息学分析
被引量:
3
1
作者
杜冠魁
骆凯丽
+6 位作者
庞驰
郭杨
恽枫林
柳红琴
文茂羽
张雪子
肖曼
《吉林医学》
CAS
2016年第12期2865-2867,共3页
目的:对人Mcl-1基因启动子区结合蛋白进行生物信息学分析。方法:从Gene Bank数据库中获取人Mcl-1基因5'调控区,使用在线软件JASPAR对该序列可能存在的转录因子结合位点进行预测。结果:Relative profile score threshold在85%、90%、...
目的:对人Mcl-1基因启动子区结合蛋白进行生物信息学分析。方法:从Gene Bank数据库中获取人Mcl-1基因5'调控区,使用在线软件JASPAR对该序列可能存在的转录因子结合位点进行预测。结果:Relative profile score threshold在85%、90%、95%和100%时,该序列存在1700、1147、368和32个可能的转录因子结合位点,包含Arid3a,Atoh1,ETV6,Gata1,GATA3,KLF5,LMX1A,LMX1B,MZF1,Prrx2,SPI1,TBX4,USF1,YY1,ZEB1等。结论:人Mcl-1基因5'调控区存在多种转录因子的结合位点,这些转录因子大多与肿瘤发生,红细胞生成及神经发育等有关。
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关键词
人Mcl-1基因
启动子5'调控区
转录因子结合位点
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职称材料
题名
人Mcl-1基因启动子区结合蛋白的生物信息学分析
被引量:
3
1
作者
杜冠魁
骆凯丽
庞驰
郭杨
恽枫林
柳红琴
文茂羽
张雪子
肖曼
机构
海南医学院理学院生化与分子生物学教研室
出处
《吉林医学》
CAS
2016年第12期2865-2867,共3页
基金
2013年国家自然科学基金[项目编号:81360359]
文摘
目的:对人Mcl-1基因启动子区结合蛋白进行生物信息学分析。方法:从Gene Bank数据库中获取人Mcl-1基因5'调控区,使用在线软件JASPAR对该序列可能存在的转录因子结合位点进行预测。结果:Relative profile score threshold在85%、90%、95%和100%时,该序列存在1700、1147、368和32个可能的转录因子结合位点,包含Arid3a,Atoh1,ETV6,Gata1,GATA3,KLF5,LMX1A,LMX1B,MZF1,Prrx2,SPI1,TBX4,USF1,YY1,ZEB1等。结论:人Mcl-1基因5'调控区存在多种转录因子的结合位点,这些转录因子大多与肿瘤发生,红细胞生成及神经发育等有关。
关键词
人Mcl-1基因
启动子5'调控区
转录因子结合位点
Keywords
Human Mcl - 1 gene
Promoter
5
' regulatory region
Transcription factors
分类号
R346 [医药卫生—基础医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人Mcl-1基因启动子区结合蛋白的生物信息学分析
杜冠魁
骆凯丽
庞驰
郭杨
恽枫林
柳红琴
文茂羽
张雪子
肖曼
《吉林医学》
CAS
2016
3
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引证文献
统计分析
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