细胞周期依赖激酶抑制基因2A/B纯合缺失在组织病理2或3级脑胶质瘤中的临床意义

目的细胞周期蛋白依赖激酶抑制基因2A/B(CDKN2A/B)纯合缺失在较低级别胶质瘤(2或3级)中罕见,新版WHO分类将其定为恶性度最高4级。该研究旨在系统报道CDKN2A/B纯合缺失在较低级别胶质瘤中的临床特点、预后及相关功能通路。方法收集473例有CDKN2A/B纯合缺失、临床和预后信息的较低级别胶质瘤患者,对发生率、临床特点及预后统计分析;收集27例新鲜肿瘤标本(13例CDKN2A/B纯合缺失),通过Ki-67和CD31免疫组织化学分析细胞增殖和血管增生;在1116例胶质瘤RNA测序数据中对CDKN2A/B纯合缺失的相关功能和通路进行分析。结果CDKN2A/B纯合缺失在较低级别胶质瘤中发生率为7.2%(34/473),该缺失在年龄偏大、星形细胞瘤、3级、近全切及IDH野生型患者中发生率更高(均P<0.05)。在IDH突变型或野生型较低级别胶质瘤中,CDKN2A/B纯合缺失均与患者更短的总生存期和无进展生存期相关。缺失型标本Ki-67(P=0.045)和CD31(P=0.058)蛋白表达高于野生型。生物信息学显示CDKN2A/B纯合缺失激活DNA复制、修复和细胞周期等功能和通路。结论CDKN2A/B纯合缺失与较低级别胶质瘤患者差的预后和恶性表型有关,该类患者临床应积极治疗。

细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2A/2B基因和妊娠糖尿病的关系

目的探讨细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2A/2B基因(CDKN2A/2B)和妊娠糖尿病(GDM)的相关性,为GDM的早期诊断和治疗提供依据。方法选取本院2014年12月-2015年12月收治的GDM患者56例(GDM组)进行研究,同时选取正常糖耐量孕妇108例(正常组)以及2型糖尿病患者98例(T2DM组)进行对比,所有受试者均进行清晨空腹采血后进行DNA的提取,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法,观察三组受试者CDKN2A/2B基因分布频率情况,并对CDKN2A/2B基因多态性与GDM的相关性进行分析。结果三组受试者中CDKN2A/2B基因rsl0811661位点均存在于TT、TC、CC三种基因型。TT基因分布频率,GDM和T2DM组显著高于正常孕妇组,差异有统计学意义;而GDM组和T2DM组相比,差异无统计学意义。正常组CC分布频率显著高于GDM组和T2DM组,差异有统计学意义;GDM组和T2DM组CC分布频率差异无统计学意义。三组TC分布频率相似,组间差异无统计学意义。正常组等位基因T的分布频率(34.3%)显著低于GDM组(58.9%)和T2DM组(60.2%),差异有统计学意义;但GDM组与T2DM组间的基因型和等位基因频率分布相近,组间差异无统计学意义。相关性分析发现,rs10811661危险等位基因T与GDM具有显著的相关性(r=4.227,P<0.05)。结论 CDKN2A/2B基因rs10811661位点存在基因多态性,其等位基因T可能为GDM的风险最高的等位基因,CDKN2A/2B基因可能是GDM的易感基因之一,可能为GDM和T2DM共同的易感基因。

高血压患者周期蛋白依赖性激酶抑制因子2B基因启动子甲基化与缺血性脑卒中发病风险相关性研究

目的探讨周期蛋白依赖性激酶抑制因子2A/2B(CDKN2A/2B)基因启动子甲基化状态是否能够预测原发性高血压患者缺血性脑卒中(CIS)的发生风险。方法选取自2019年1月至2020年10月在澄迈县中医院高血压管理信息系统中登记的302例原发性高血压患者(高血压组)与158例原发性高血压合并CIS患者(合并CIS组)为研究对象,采用亚硫酸盐扩增子高通量测序法(BSAS)对血液样本进行定量甲基化分析,检测CDKN2B基因甲基化水平。结果合并CIS组患者饮酒史比例、同型半胱氨酸(Hcy)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白(LDL)、CDKN2B甲基化水平均高于高血压组,差异均有统计学意义(P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,饮酒史、血清Hcy和LDL水平升高以及CDKN2B基因启动子甲基化是高血压患者发生CIS的独立危险因素(P<0.05)。另外,根据性别对患者进行分层,在调整饮酒史、Hcy、TC、LDL等变量后,无论是男性还是女性患者,CDKN2B基因启动子甲基化均是CIS发生的独立危险因素(P<0.05)。Spearman相关性分析结果显示,对于原发性高血压患者,CDKN2B基因甲基化水平与患者年龄呈正相关性(rs=0.178,P<0.05)。CDKN2B基因甲基化水平预测高血压患者继发CIS的受试者工作特征(ROC)曲线下面积为0.677(95%可信区间0.589~0.779)。另外,对男性和女性患者CIS发生风险的预测曲线下面积分别为0.603(95%可信区间0.527~0.678)和0.754(95%可信区间0.693~0.815),差异有统计学意义(Z=-3.579,P<0.05)。结论高血压合并CIS患者普遍存在CDKN2B基因高甲基化水平,其可作为一个有效预测CIS发病风险的分子标志物。

急性冠脉综合征患者血清lncRNA CDKN2B-AS1、miR-184水平与介入治疗后冠状动脉再狭窄发生的相关性研究

目的分析急性冠脉综合征(ACS)患者血清长链非编码RNA细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2B基因反义RNA1(lncRNA CDKN2B-AS1)、微小RNA-184(miR-184)水平与经皮冠状动脉介入(PCI)治疗后冠状动脉再狭窄(RS)发生的相关性。方法选取2020年2月至2023年3月在该院行PCI治疗的288例ACS患者,根据术后6个月复查造影结果分为RS发生组96例和RS未发生组192例。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测血清lncRNA CDKN2B-AS1、miR-184相对表达水平;采用Pearson相关性分析血清lncRNA CDKN2B-AS1与miR-184相关性;影响ACS患者PCI后RS发生的因素采用多因素Logistic回归分析;以受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA CDKN2B-AS1、miR-184对ACS患者PCI后RS发生的评估价值。结果与RS未发生组相比,RS发生组血清lncRNA CDKN2B-AS1水平显著升高,miR-184水平显著降低,差异有统计学意义(P<0.05);两组超敏C反应蛋白(hs-CRP)、白细胞介素18(IL-18)、总胆红素(TBIL)及心肌肌钙蛋白I(cTnI)比较,差异有统计学意义(P<0.05);Pearson相关性分析显示,ACS患者血清lncRNA CDKN2B-AS1与miR-184水平呈显著负相关(r=-0.427,P<0.05);多因素Logistic回归分析结果显示,lncRNA CDKN2B-AS1、hs-CRP、IL-18、cTnI是影响ACS患者PCI后RS发生的危险因素,miR-184、TBIL是影响ACS患者PCI后RS发生的保护因素(P<0.05);ROC曲线结果显示,血清lncRNA CDKN2B-AS1、miR-184及二者联合对ACS患者PCI后RS发生评估的曲线下面积(AUC)分别为0.787、0.844、0.929,二者联合对ACS患者PCI后RS发生评估的AUC显著高于血清lncRNA CDKN2B-AS1、miR-184单独评估(Z二者联合-lncRNA CDKN2B-AS1=4.490、Z二者联合-miR-184=3.429,均P<0.05)。结论ACS患者血清lncRNA CDKN2B-AS1水平显著升高,miR-184水平显著降低,与ACS患者PCI后RS发生具有相关性,均是影响ACS患者PCI后RS发生的因素,且二者联合对ACS患者PCI后RS发生的评估效能更佳。

细胞周期调控基因及Bcl-2、c-Jun基因在人肝细胞脂肪变性过程中的表达变化

目的观察细胞周期调控基因及Bcl-2、c-Jun基因在人肝细胞L02脂肪变性过程中的表达变化。方法以油酸和软脂酸(2∶1)混合液处理L02细胞0、5、10、20 h,建立人肝细胞脂肪变性模型。用油红O染色检测L02细胞内脂质含量;用荧光定量PCR技术检测L02细胞脂肪变性过程中CDK2、CDK4、Cyclin D1、Bcl-2、c-Jun mRNA表达。结果随造模时间延长,L02细胞内橘红色脂滴聚集越来越多,至造模20 h,肝细胞染成橘红色。L02细胞内CDK2 mRNA相对表达量逐渐升高,造模5 h达最高(P均<0.05),随后逐渐下降;CDK4 mRNA相对表达量逐渐升高,造模10 h达最高(P均>0.05),随后逐渐下降,造模20 h最低(P均>0.05);不同时间点Cyclin D1 mRNA相对表达量比较差异无统计学意义(P均>0.05);Bcl-2 mRNA相对表达量随造模时间延长而升高,造模10 h达最高(P<0.05),随后降低;造模5、10、20 h的c-Jun mRNA相对表达量均较造模0 h高(P均<0.05),但无变化规律。结论人肝细胞L02脂肪变性过程中癌症相关基因CDK2、CDK4、Bcl-2、c-Jun表达先升高后降低,Cyclin D1表达变化不明显。

CDKN2A/2B基因单核苷酸多态性与妊娠期糖尿病的相关性

目的探讨细胞周期素依赖性蛋白激酶抑制因子2A/2B(CDKN2A/2B)基因单核苷酸多态性(SNP)与妊娠期糖尿病(GDM)发生风险的关系。方法选择459例GDM患者为病例组,571例正常妊娠者为对照组。通过相关数据库及文献筛选CDKN2A/2B基因的7个候选SNP位点,并对其进行基因分型。采用多因素Logistic回归模型评估候选SNP位点与GDM的相关性,采用多因子降维法评估候选SNP位点的单独或联合作用对妊娠期女性发生GDM的影响。结果多因素回归分析结果显示,与携带CDKN2A/2B基因rs10811661位点CC基因型的孕妇比较,携带TC或TT基因型的孕妇GDM患病风险升高(均P<0.05);在显性遗传模型下,与CC基因型携带者比较,携带TC/TT基因型的孕妇发生GDM的风险升高(P<0.05)。多因子降维分析结果显示,最优单位点模型为rs10811661位点(P<0.05);SNP-SNP联合作用与GDM发病存在关联,rs10811661-rs7036656-rs1063192-rs3217986位点的交互作用可增加GDM发病风险(P<0.05)。结论 CDKN2A/2B基因rs10811661位点多态性与GDM发生有关,SNP单独和联合作用均可影响妊娠期女性对GDM的易感性。

TNFα诱导激活NF-κB上调抑癌基因CDKN2B表达

NF-κB通过转录调控其靶基因,在肿瘤发生发展和精准治疗中起关键作用。过表达抑癌基因细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B(CDKN2B)可抑制肿瘤细胞增殖并诱导凋亡,但是否受NF-κB调节尚无报道。本文发现,NF-κB直接结合并上调CDKN2B基因:在TNFα处理的He La细胞内,CDKN2B的基因区覆盖大量NF-κB结合峰,其中富集倍数大于20的结合峰有14个。TRANSFAC软件分析发现,NF-κB结合峰内包含大量经典的κB位点。Ch IP-q PCR证明,TNFα诱导NF-κB结合CDKN2B基因。将NF-κB结合峰中心区DNA片段插入荧光素酶报告基因载体中,发现该DNA片段的插入使荧光素酶相对活性上调至7.88倍,TNFα处理又使其相对活性提高到2.37倍,且NF-κB/p65 siRNA显著干扰其相对活性的升高。免疫荧光检测显示,TNFα诱导激活NF-κB进入细胞核,而NF-κB/p65 siRNA阻止它入核。此结果提示,我们成功构建了具有NF-κB转录活性差异的细胞模型,q PCR检测两个已知的NF-κB靶基因NFKB2和STAT5A的表达,进一步验证该细胞模型构建成功。利用此细胞模型,发现受TNFα诱导激活的NF-κB,能够上调CDKN2B基因。总之,本文发现抑癌基因CDKN2B是NF-κB新的靶基因,NF-κB直接结合并上调CDKN2B基因在转录水平的表达。本研究为抑癌基因CDKN2B的抗肿瘤应用奠定了基础。

小儿急性髓性白血病的CDKN2A和CDKN2B的拷贝数变异情况分析

目的探讨小儿急性髓性白血病(p-AML)的细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂(CDKN)2A和CDKN2B基因的拷贝数变异(CNV)情况。方法下载癌症基因组图谱TCGA数据库中1978例p-AML的标本全基因组或全外显子组测序的综合分析结果和相应临床病理特征,采用GISTIC2.0整合队列分析764例体细胞CNV表现,采用cBioPortal在线分析CDKN2A和CDKN2B参与的信号通路情况。结果764例体细胞CNV数据显示29553个基因存在CNV,发生率为0.1%~59.6%,主要类型为纯合删除(HOMDEL)和扩增(AMP),排名前10的癌症基因CDKN2A、CDKN2B、MTAP、PRSS1、IKZF1、PAX5、ETV6、MLLT3、LRP6和CDKN1B的发生率依次为36.1%(276/764)、33.6%(257/764)、26.6%(203/764)、25.3%(193/764)、12.8%(98/764)、11.5%(88/764)、10.5%(80/764)、9.9%(76/764)、8.4%(64/764)和7.5%(57/764);其中CDKN2A的CNV表现:缺失352例(Deep Deletion 276例+Shallow Deletion 76例)、正常(Diploid)392例和扩增19例(Gain 15例+Amplification 4例),而CDKN2B为缺失342例(Deep Deletion 257例+Shallow Deletion 85例)、正常(Diploid)399例和扩增22例(Gain 17例+Amplification 5例)。CDKN2A和CDKN2B CNV均与ETV6-RUNX1融合状态有关,且两者共同在细胞凋亡和细胞周期通路中发挥作用。结论p-AML的基因CNV情况较为普遍,其中发生率最高的癌基因CDKN2A和CDKN2B与常见t(12;21)(p13;q22)易位形成的ETV6/RUNX1融合基因有关,基因CNV情况在p-AML的诊治中有一定潜在价值,值得在临床上推广。

斑蝥酸钠维生素B6诱导人肝癌HepG2细胞凋亡及周期阻滞

目的:研究斑蝥酸钠维生素B6(艾易舒)注射液对人肝癌HepG2细胞增殖、细胞周期与凋亡的影响,探讨其分子机制。方法:将不同浓度的斑蝥酸钠维生素B6注射液(0,1,5,10 mg·L-1)作用于人肝癌HepG2细胞12,24,48 h,MTT法检测细胞增殖抑制率,流式细胞学技术检测细胞凋亡率及细胞周期的变化,Western blot检测蛋白激酶B(Akt),磷酸化蛋白激酶B(pAkt),B细胞淋巴瘤-2基因相关X蛋白(Bax),B细胞淋巴瘤-2基因(Bcl-2)及细胞周期依赖性激酶抑制因子p21蛋白表达变化,RT-PCR检测Bax,Bcl-2及p21 mRNA表达变化。结果:斑蝥酸钠维生素B6可显著抑制HepG2细胞的增殖,诱导细胞凋亡,具有显著的时间和浓度效应(P<0.05);同时G0/G1期细胞比例显著升高,S期细胞比例显著降低(P<0.05)。Western blot结果显示斑蝥酸钠维生素B6可下调HepG2细胞中pAkt和Bcl-2蛋白的表达,上调Bax和p21蛋白的表达(P<0.05)。RT-PCR结果显示Bax,p21 mRNA的表达水平明显升高,而Bcl-2 mRNA的表达水平下降(P<0.05)。结论:斑蝥酸钠维生素B6可抑制人肝癌HepG2细胞的增殖,诱导其凋亡并引发G0/G1期阻滞,其机制可能与斑蝥酸钠维生素B6参与调控磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)通路有关。