急性呼吸道疫情病原学的快速鉴别

[目的]对2007年4月起在陕西高陵县某小学和幼儿园暴发的群体性不明原因发热、咳嗽的急性呼吸道疫情进行病原学快速鉴别研究。[方法]采集流行区新发患儿13例的咽拭子标本,新鲜抽提核酸,对常见12种呼吸道RNA病毒进行反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和巢式PCR,阳性分离标本接种敏感细胞培养,病变细胞进行免疫荧光鉴定。[结果]13例标本中RT-PCR和巢式PCR检出流感病毒B型阳性7例,其他病毒的特异性条带未检出;全部标本接种MDCK狗肾细胞3d后仅7例阳性检出,流感病毒B型者均出现细胞病变效应,其余未见明显细胞病变;病变细胞对B型流感单抗的直接免疫荧光试验均为阳性反应。[结论]本次急性呼吸道疫情的病原体为B型流感病毒。

济南公交主导编制《城市公共交通重大呼吸道传染病疫情防控规范》

近日,由济南公交主导编制的山东省城市公共交通协会团体标准《城市公共交通重大呼吸道传染病疫情防控规范》(T/SUPTA 002-2020)正式发布实施。标准起草依据《突发公共卫生事件应急条例》《中华人民共和国传染病防治法》等法律法规、国务院应对新型冠状病毒肺炎疫情联防联控机制关于印发《公共交通工具消毒操作技术指南》的通知。

玉溪市一起人腺病毒感染导致的儿童呼吸道感染暴发疫情调查

目的了解云南省玉溪市一起儿童呼吸道感染暴发疫情的流行病学及病原学特征。方法对此次暴发进行现场调查,对病例发病过程及流行病学特征进行描述性研究。采集与此次暴发有流行病学相关的住院病例咽拭子样本,采用实时荧光PCR方法对样本进行腺病毒核酸检测,并对腺病毒核酸阳性样本进行病毒分离培养,对分离株进行六邻体基因扩增、测序。结果此次疫情历时11 d,共出现58例住院患儿,临床症状以发热、畏寒和扁桃体发炎为主,在发病前7 d内有某游泳馆暴露史。所采集的20份咽拭子样本腺病毒核酸检测均为阳性,分离培养得到13株腺病毒毒株。六邻体基因测序得出所测13株腺病毒序列相同,基因进化树显示这批分离株均为腺病毒B群,与人腺病毒7型参考株处于同一分支,同源性为100.00%。结论此次疫情有明显的聚集性和儿童易感性,引起疫情的病原为腺病毒7型。

北京市西城区4所小学由人腺病毒3型引起呼吸道传染病聚集性疫情调查

目的分析由人腺病毒3型引起呼吸道传染病聚集性疫情的流行病学和临床特征,为呼吸道传染病疫情的早期判断提供参考。方法对2017年9月26日-11月21日北京市西城区4所小学报告的8起呼吸道聚集性疫情进行现场调查,描述疫情特征,采集患者咽拭子标本,利用荧光定量PCR方法进行病原测定,对部分阳性标本进行病毒分离及基因型别鉴定。结果 8起呼吸道传染病聚集性疫情共涉及68例病例,疫情持续时间平均11.5天,病例病程平均5.4天,患者临床症状以发热(100%)、咽痛(23.58%)和咳嗽(20.69%)为主。基于Hexon,Penton和Fiber 3个基因,构建来源于4所小学的人腺病毒基因亲缘关系树,结果显示,3个基因与人腺病毒3型亲缘关系最近,无重组事件发生且来源于4个学校的腺病毒基因核苷酸同源性为100%。结论 8起疫情均由人腺病毒3型引起,加强聚集性疫情症状及病原学监测,采取有针对性的防控措施,防止疫情进一步扩散和传播。

多重PCR技术在呼吸道暴发疫情中的应用

目的:用有效的方法快速检测呼吸道暴发疫情中的病毒病原学感染现况,探讨病毒活动状况及流行规律。方法:收集宜昌地区2009年全年报告的所有呼吸道疫情标本,先采用RT-PCR方法检测季节性流感病毒和新甲型H1N1流感病毒,排除流感的阴性疫情标本再采用多重RT-PCR法,同时检测腺病毒、间质肺病毒、冠状病毒229E/NL63、副流感病毒1、2、3型;甲、乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒A\B型、鼻病毒、冠状病毒OC43,共12种常见呼吸道病毒。结果:2009年本市报告的29起呼吸道疫情中,流感疫情24起,约占总疫情数的82.8%,非流感疫情中呼吸道合胞病毒和间质肺病毒检出率最高,其次为副流感病毒及冠状病毒。结论:流感病毒、呼吸道合胞病毒、间质肺病毒、冠状病毒和副流感病毒为宜昌地区呼吸道暴发疫情中病毒感染的主要致病原。多重PCR技术在疫情的快速检测方面准确高效,能尽快明确疫情感染的病原体,为防控争取到宝贵时间;从而对指导爆发疫情的处理发挥了重要作用。

多重PCR检测技术在3起小学呼吸道暴发疫情中的应用

目的探索多重PCR检测技术在呼吸道暴发疫情中应用的可行性,为掌握呼吸道病原体的流行规律,早期发现新的病原体提出预警,采取针对性措施降低社会风险。方法2020年6月,针对中山市3所小学呼吸道传染病聚集性疫情,采集34份咽拭子标本,采用1∶2混检的方式,开展22种呼吸道病原体(13种病毒、7种细菌、肺炎支原体和肺炎衣原体)多重PCR检测。结果3起疫情涉及101个病例,罹患率为21.0%~36.0%。病例年龄7~11岁,男性占54.5%。症状主要为咽痛(57.4%)、咳嗽(40.6%)、流涕(32.7%)和发热(23.8%)。17份标本的病原阳性率从高到低依次为鼻病毒100.0%、肺炎链球菌88.2%、流感嗜血杆菌64.7%、A组链球菌5.9%。判断导致3起小学呼吸道聚集性疫情的病原体主要为鼻病毒。结论多重PCR检测技术能快速确认呼吸道暴发疫情的病原体。

2018年北京市西城区呼吸道腺病毒感染疫情流行病学和病原学特征分析

2018年5~9月,北京市西城区五所小学先后共报告了5起呼吸道感染集中发热疫情。为了解报告的5起疫情的流行病学和病原学特征,开展了现场调查,并采集病例咽拭子标本,使用荧光定量PCR方法检测17种常见呼吸道病毒进行病原学筛查,对鉴定为人腺病毒(Human adenovirus,HAdV)阳性的标本进行病毒分离,并分别扩增六邻体蛋白基因Loop2区域以及三个衣壳蛋白(五邻体基座蛋白、六邻体蛋白和纤维蛋白)基因全长,进行HAdV型别的初筛和确认,同时与GenBank数据库中国内外HAdV-3流行株序列进行比对分析。结果显示,5起集中发热疫情的致病原均为HAdV-3。进一步研究发现,全球流行HAdV-3可划分为Clade1和Clade2两个进化分支,2004年至今我国流行的HAdV-3病毒株均属于Clade2进化分支,也是近年全球优势流行株。两个进化分支HAdV-3病毒株在三个基因序列上均高度保守。本研究为我国呼吸道HAdV防控,以及HAdV-3型疫苗研发提供了基础科学数据。