2022—2023年贵州省呼吸道病毒病原谱及流感A(H1N1)pdm亚型病毒基因特征分析

目的了解贵州省2022—2023年流感样病例呼吸道病毒病原谱的构成情况,进一步分析流感A(H1N1)pdm亚型病毒的基因特征及变化规律。方法收集贵州省2022—2023年流感样病例591份,采用多重荧光定量PCR方法对常见呼吸道病原体进行检测,检测项目包括流感病毒(IFV)、副流感病毒(HPIV)、冠状病毒(HCoV)、呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV)、偏肺病毒(HMPV)、鼻病毒(HRV)和博卡病毒(HBoV)8种病毒及其分型,检测结果采用SPSS 22.0统计软件进行数据分析;通过高通量测序技术进行流感A(H1N1)pdm亚型病毒全基因组序列测定,采用Nextclade、MEGA7等进行血凝素(HA)基因序列分析及糖基化位点、抗原决定簇、受体结合位点突变情况分析。结果共检测出呼吸道病毒阳性样本363份,总阳性率为61.42%,检出率前3位的分别是IFV-A(H1N1)pdm亚型病毒(阳性率15.06%,89份)、IFV-A(H3N2)亚型病毒(阳性率13.71%,81份)和新冠病毒(SARS-CoV-2)(阳性率13.37%,79份)。不同性别和不同年龄组呼吸道病原体检出率差异无统计学意义;不同季节呼吸道病原体检出率差异有统计学意义(P<0.001)。混合感染病例检出36份,检出率为6.09%,以鼻病毒的混合感染检出最多(17份,占比47.22%)。共获得16株贵州省流感A(H1N1)pdm09亚型病毒全基因组序列,均为6B.1A.5a.2a进化分支。Sb抗原决定簇发生A186T、Q189E氨基酸替换;受体结合位点发生190位螺旋(184-191):A186T、Q189E及220位环E224A突变;未发现糖基化位点改变。结论呼吸道病毒是流感样病例的重要病原体,以流感病毒最为常见,混合感染占比较高。IFV及HMPV检出率有明显季节性差异。2022—2023年贵州省IFV-A(H1N1)pdm09亚型病毒分子结构与功能尚未发生大的变化,与疫苗株匹配性良好,流感疫苗的抗体保护性较好。

广州地区2018年儿童常见呼吸道感染病原学分析

目的了解广州市儿童呼吸道感染8种呼吸道病原体的流行病学特征,为临床提供诊疗参考。方法选择2018年1月至12月共9179例在本院诊断为呼吸道感染的患儿,采用间接免疫荧光法(IFA)来检测引起人呼吸道感染的8种常见呼吸道病原体的IgM抗体,包括:嗜肺军团菌(LP1)、肺炎支原体(MP)、肺炎衣原体(CP)、腺病毒(ADV)、呼吸道合胞病毒(RSV)、甲型流感病毒(IV-A)、乙型流感病毒(IV-B)、副流感病毒(PIV),并收集患者的临床资料,对所有数据进行统计学分析。结果9179例标本中,检出阳性标本4437例,总阳性率为48.34%,其中IV-B阳性率最高(40.16%),其次是IV-A(30.69%)、MP(27.97%),其他病原体呈散发。在各年龄组中,幼儿组总体阳性率明显高于其他年龄组。春夏季的病毒病原体IgM抗体检出率高于秋冬季。结论2018年广州地区儿童呼吸道感染病原体以IV-A、IV-B为主;夏季呼吸道病毒病原体IgM抗体阳性检出率最高,幼儿为呼吸道感染的高发人群。