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玉米自交系籽粒的遗传距离与其近红外光谱距离和品种鉴别模型性能的关系研究
1
作者
刘旭
贾仕强
+8 位作者
王春英
刘哲
顾建成
翟伟
李绍明
张晓东
朱德海
黄华军
安冬
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015年第9期2510-2515,共6页
从玉米自交系种子的遗传距离、近红外光谱距离、品种鉴别模型性能三方面进行分析,探索三者间的关系。采用三组(共15对)遗传关系远近不同的玉米自交系种子作为实验材料,通过简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)标记计算自交系种...
从玉米自交系种子的遗传距离、近红外光谱距离、品种鉴别模型性能三方面进行分析,探索三者间的关系。采用三组(共15对)遗传关系远近不同的玉米自交系种子作为实验材料,通过简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)标记计算自交系种子间的遗传距离;种子的近红外光谱经预处理后降维到主成分分析(principal component analysis,PCA)空间中,计算各个自交系种子样本中心点之间的欧氏距离,作为对应的近红外光谱距离;使用仿生模式识别方法建立鉴别模型,用模型的鉴别正确率评价模型的性能。分析结果表明,自交系种子间遗传距离与近红外光谱距离相关性为0.986 8,与模型鉴别正确率的相关性为0.911 0,相关性显著。说明近红外光谱可以反映出玉米自交系种子之间的遗传关系,遗传关系的远近影响品种鉴别模型的性能,遗传距离越小,近红外光谱距离越小,模型鉴别能力也越差。实际应用中有望利用近红外光谱技术分析玉米自交系的遗传关系,对遗传育种、品种识别、纯度分选等具有重要意义;且建立品种鉴别模型时,应充分考虑遗传关系较近的玉米自交系对模型性能的影响。
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关键词
玉米自交系
遗传距离
近红外光谱
品种鉴别模型
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职称材料
题名
玉米自交系籽粒的遗传距离与其近红外光谱距离和品种鉴别模型性能的关系研究
1
作者
刘旭
贾仕强
王春英
刘哲
顾建成
翟伟
李绍明
张晓东
朱德海
黄华军
安冬
机构
中国农业大学信息与电气工程学院
北京金色农华种业科技有限公司
出处
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015年第9期2510-2515,共6页
基金
国家公益性行业科研专项项目(201203052)
北京市科技计划项目(D131100000413002)
中国农业大学教育基金会"大北农教育基金"项目(1081-2413001)资助
文摘
从玉米自交系种子的遗传距离、近红外光谱距离、品种鉴别模型性能三方面进行分析,探索三者间的关系。采用三组(共15对)遗传关系远近不同的玉米自交系种子作为实验材料,通过简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)标记计算自交系种子间的遗传距离;种子的近红外光谱经预处理后降维到主成分分析(principal component analysis,PCA)空间中,计算各个自交系种子样本中心点之间的欧氏距离,作为对应的近红外光谱距离;使用仿生模式识别方法建立鉴别模型,用模型的鉴别正确率评价模型的性能。分析结果表明,自交系种子间遗传距离与近红外光谱距离相关性为0.986 8,与模型鉴别正确率的相关性为0.911 0,相关性显著。说明近红外光谱可以反映出玉米自交系种子之间的遗传关系,遗传关系的远近影响品种鉴别模型的性能,遗传距离越小,近红外光谱距离越小,模型鉴别能力也越差。实际应用中有望利用近红外光谱技术分析玉米自交系的遗传关系,对遗传育种、品种识别、纯度分选等具有重要意义;且建立品种鉴别模型时,应充分考虑遗传关系较近的玉米自交系对模型性能的影响。
关键词
玉米自交系
遗传距离
近红外光谱
品种鉴别模型
Keywords
Maize inbred lines
Genetic distance
NIR spectra
Identification model
分类号
O657.3 [理学—分析化学]
S123 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
玉米自交系籽粒的遗传距离与其近红外光谱距离和品种鉴别模型性能的关系研究
刘旭
贾仕强
王春英
刘哲
顾建成
翟伟
李绍明
张晓东
朱德海
黄华军
安冬
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015
0
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职称材料
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参考文献
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