鸡贫血病毒哈尔滨分离株全基因克隆和序列分析

通过PCR方法克隆了从哈尔滨分离的一株鸡贫血病毒 (CAV)的全基因 ,并对其进行了测序 ,该病毒基因组为环状 ,全长 2 2 98bp ,含有三个互相重叠的开放读码框和一个调控区。将克隆的基因与GenBank收录的CAV基因比较 ,同源性至少为 97% ,未发现与本次克隆的CAV基因完全一致的分离株。与德国分离株Cux la、2 6p4和马来西亚分离株分别有 42、42和72个核苷酸不同 ,同源性分别为 98 2 %、98 2 %和 96 9%。与德国分离株Cux 1b相比 ,除在调控区内少一个类似增强子的重复序列外 ,尚有 3 9处核苷酸不同。它与分离于欧洲的几株CAV的亲源性要比来自亚洲的马来西亚株近。对CAV哈尔滨分离株、2 6p4、Cux 1b、Cux 1a和马来西亚株的VP1、VP2和VP3蛋白比较 。

鸡贫血病毒哈尔滨分离株VP2基因克隆 测序和比较

通过 PCR方法克隆了从我国哈尔滨分离的一株鸡贫血病毒 (CAV)的 VP2基因 ,并对之进行了测序 ,该基因的开放读码框由 6 5 1bp组成 ,编码 2 16个氨基酸。通过将本次克隆的基因与 Gen Bank收录的 CAV的 VP2基因比较 ,同源性至少为99% ,未发现与本次克隆的 VP2蛋白完全一致的 CAV分离株 ,与之同源性最好的是 CIA - 1的 VP2蛋白 ,相差 1个氨基酸 ,与Cux- 1也仅相差 2个氨基酸 ,因此从该蛋白看 CAV哈尔滨分离株的变异程度不很高。比较这 2 7株病毒的 VP2及其基因序列 ,发现共有 31处核苷酸发生变异 ,这些变异将导致 VP2的 12个氨基酸变化 ,尽管他们散布于整个 VP2 ,但在 186到 191号氨基酸区域存在一个没有报道过的变异程度相对较高的区域 ,CAV的