吸烟对健康人群唾液微生物组的影响

【背景】吸烟是重要的公共健康问题,可能通过改变唾液微生物组影响口腔健康甚至全身健康。【目的】探究吸烟对中国健康人群唾液微生物组的影响,为研究吸烟在疾病发展中的作用提供线索。【方法】收集167位健康个体的唾液样本,利用HiSeq高通量测序技术对样品中16S rRNA基因V3-V4区进行测序,分析比较吸烟者和非吸烟者的唾液微生物组的多样性、群落结构和物种丰度,并预测功能组成,探究吸烟对唾液微生物组的影响。【结果】吸烟对唾液微生物组的α多样性影响较小,但是在微生物组组成上,吸烟组中奈瑟菌属、艾肯菌属、二氧化碳嗜纤维属等细菌明显减少,而普雷沃氏菌属、韦荣氏球菌属、放线菌属、奇异菌属和巨球型菌属等细菌明显增加。在功能上,PICRUSt的预测结果显示吸烟组富集不依赖氧气的代谢功能,非吸烟组富集需要氧气参与的代谢功能。【结论】吸烟可能会通过改变唾液微生物组,造成微生物组功能途径的变化,进而引发与吸烟相关的疾病。

孤独症谱系障碍儿童的唾液微生物群落研究

目的:通过宏基因组学方法结合Pacbio SMRT高通量测序技术探究孤独症谱系障碍(ASD)儿童中口腔健康和罹患龋齿者的唾液微生物菌群的组成及其差异。方法:收集42名ASD儿童唾液样本,其中无龋组22名,高龋组20名,提取DNA进行聚合酶链式反应扩增,利用PacBio SMRT高通量测序技术对16S rRNA全长进行测序,进行口腔菌群结构和组成的分析比较。结果:两组间唾液菌群结构差异有统计学意义(P<0.05),且高龋组的菌落结构更为相似和保守(P<0.05)。在种水平上,无龋组高表达有伯杰氏杆菌、南锡普氏菌、金黄色葡萄球菌三个健康相关微生物(P<0.05),高龋组高表达有变形链球菌、口普氏菌、浑浊戴阿利斯特杆菌、具核梭杆菌四个龋病相关微生物(P<0.05)。结论:ASD儿童的龋齿唾液菌群有整体菌群结构和特定物种组成的改变,为ASD儿童的龋齿预防和诊断提供新策略。

肺结节患者唾液微生物菌群特征分析:一项前瞻性、非随机、同期对照试验

目的 发现并鉴定肺结节患者与健康人群唾液微生物菌群特征差异及其潜在作用,以期为肺结节早期预警提供新的候选生物标志物。方法 对肺结节(pulmonary nodule, PN)组(n=173)和健康对照(healthy control, HC)组(n=40)的唾液样本进行16S rRNA测序,比较两组人群唾液微生物群的多样性、组成和差异物种等特征,及其功能改变情况。使用随机森林算法识别唾液微生物标志物,并用曲线下面积(area under the curve, AUC)评估其对PN的预测效能。最后,基于PICRUSt2菌群功能预测分析,对唾液样本中差异基因的生物学功能及潜在作用机制进行初步探索。结果 与HC相比,PN组唾液样本的微生物α、β多样性较高(P<0.05),且PN组唾液微生物的群落组成和丰度与HC组相比差异有统计学意义(P<0.05)。随机森林算法对差异微生物种进行筛选,Porphyromonas、Haemophilus和Fusobacterium构成了最优标志物集(AUC=0.79,95%置信区间:0.71~0.86),可有效区分PN。差异菌群的生物信息学功能显示,PN患者唾液微生物在免疫缺陷和氧化还原稳态相关的蛋白/分子功能表现出显著富集。群的生物信息学功能显示,PN患者唾液微生物在免疫缺陷和氧化还原稳态相关的蛋白/分子功能表现出显著富集。结论 唾液微生物群的变化与PN密切相关,其可能驱动了肺结节或肺“结癌转化”的发生,提示唾液微生物具有作为PN早期诊断新型无创体液标志物的潜力。