植物病原真菌嗜水小核菌中dsRNA5和dsRNA8的克隆与序列分析

为探究水稻嗜水小核菌中发现的病毒与真菌的相互作用以及明确其是否可用于病原真菌的生物防治,采用修改的单引物拉增法(M-SPAT)对嗜水小核菌[HZ11]菌丝体和病毒粒子(VPL)中分离的10条双链RNA(dsRNA)片段的RNA5和RNA8进行克隆,并对这些克隆产物进行测序和分析。结果表明,dsRNA5的长度为2038 bp,编码RNA依赖RNA聚合酶(RdRp);dsRNA8的长度为1809 bp,编码外壳蛋白(CP);系统进化分析表明,dsRNA5蛋白和dsRNA8蛋白分别与双分病毒科α病毒属的RdRps和CP高度相近,这两条ds RNA的5'-非翻译区(UTR)包含保守序列5'-GAA(G)T-3'、5'-TTTTCTA(/CG)CCTC(/A)GATAT(A)AAATA(CG)GAA-3'和5'-AAACG(A)AA(G)TC(A)TTACCTCT-3';3'-UTR包含保守序列5'-AAAAAAAA-3',5'-AAAAAG(A)AAAAAAAAAAAAC(A)4A-3'和5'-AAA-3'。表明ds RNA5和dsRNA8属于一种新的α病毒的基因组,推定的新病毒被暂命名为嗜水小核菌病毒3(ShV3);嗜水小核菌分离物dsRNA5和dsRNA8分别对应于ShV3的dsRNA1和dsRNA2。