纳米孔测序检测嗜麦芽窄食单胞菌重症肺炎1例报告

嗜麦芽窄食单胞菌肺炎是一种因嗜麦芽窄食单胞菌感染所致的肺炎。采用传统病原菌培养法检测,阳性率低,假阴性率高、周期长,病原学证据短期内无法正确获得,影响预后。本文探讨一种较为快速准确的检测方法。纳米孔测序(NTS)是一种第三代测序技术,相比传统方法优点是它的成本和时间效益,吞吐量高。本文检测了1例由嗜麦芽窄食单胞菌引起的重症肺炎。结果表明,该病是由嗜麦芽窄食单胞菌引起的感染。本文提供了NTS可以快速识别病原体的证据,这对临床诊断和治疗具有重要意义。

嗜麦芽窄食单胞菌耐药率变化与抗菌药物使用强度的相关性分析

目的分析嗜麦芽窄食单胞菌的耐药率变化与抗菌药物使用强度之间的相关性。方法统计某三级医院2018~2022年住院患者的嗜麦芽窄食单胞菌的临床分布、耐药率和常用抗菌药物使用强度,采用Spearman进行相关性分析。结果药敏检出438株嗜麦芽窄食单胞菌,其对米诺环素、复方新诺明、左氧氟沙星和氯霉素的耐药率较低,分别为2.19%、7.84%、11.00%和17.59%,对头孢他啶的耐药率相对较高,为36.30%。嗜麦芽窄食单胞菌对头孢他啶的耐药率与碳氢霉希类抗菌药物使用强度呈正相关(r=0.880,P<0.05)。结论抗菌药物使用强度可影响嗜麦芽窄食单胞菌对部分抗菌药物的耐药率,合理控制抗菌药物使用、降低使用强度可减少嗜麦芽窄食单胞菌的诱导耐药。

重组酶聚合酶扩增结合侧向流动试纸条技术快速可视化检测嗜麦芽窄食单胞菌方法的建立与应用

目的:建立一种基于重组酶聚合酶扩增(recombinant polymerase amplification,RPA)和侧向流动试纸条(lateral flow strips,LFS)的嗜麦芽窄食单胞菌快速可视化检测方法。方法:以嗜麦芽窄食单胞菌特异性序列(NC_010943.1)为模板,设计RPA引物。通过基础型RPA反应和琼脂糖凝胶电泳,根据候选引物对的扩增性能及引物二聚体的形成情况筛选最佳引物对。根据最佳引物对,设计探针和修饰引物。在引物和探针中引入碱基错配以消除假阳性信号,建立RPA-LFS反应体系。根据检测线的显色情况,优化RPA-LFS的最佳反应条件。使用临床常见的12种致病菌和12个临床来源的嗜麦芽窄食单胞菌检测该方法的特异性。以10倍梯度稀释的嗜麦芽窄食单胞菌基因组为模板,检测该方法的灵敏度。收集108例临床样本,将该方法与qPCR检测法和生化培养法对比,对RPA-LFS检测法进行kappa一致性检验及临床应用评价。结果:RPA-LFS检测法在37℃恒温条件下8 min即可完成扩增反应,1 min内可在LFS上观察到结果。该方法灵敏度高,最低检出限为1.107 CFU,并且与其他病原菌无交叉反应,特异性强。应用于临床样本检测时,该方法与qPCR相比,检测结果准确性一致。与生化培养方法的符合率为99.07%,kappa指数值为0.972,具有良好的一致性。结论:本研究建立了一种不依赖于精密仪器和专业技术人员的RPA-LFS检测方法,能够短时间内精准鉴定嗜麦芽窄食单胞菌。该方法的建立可为及时制定合理的抗菌治疗方案提供信息,具有较大的临床应用潜力。

嗜麦芽窄食单胞菌的临床分布及耐药性分析

目的分析嗜麦芽窄食单胞菌临床分布情况及对常用抗菌药物耐药性分析。方法收集2019年1月至2021年12月河北医科大学第二医院住院患者分离的嗜麦芽窄食单胞菌,采用WHONET 5.6软件对嗜麦芽窄食单胞菌的临床科室分布、标本来源及药物敏感性试验开展回顾性研究。结果2019年1月至2021年12月共分离得到嗜麦芽窄食单胞菌共966株,在革兰氏阴性杆菌中的检出率为2.54%,检出率最高科室为小儿内科;临床科室分布中呼吸内科构成比最高(30.85%);感染患者以60岁以上老年患者为主,占57.04%;标本来源以痰标本为主,共分离771株,占79.81%。药敏结果分析显示,嗜麦芽窄食单胞菌对米诺环素、复方新诺明和左氧氟沙星的耐药率较低,耐药率分别为2.60%、10.40%、13.50%;对头孢他啶耐药率较高,耐药率为70.9%。不同标本来源嗜麦芽窄食单胞菌药敏结果显示,灌洗液、尿、血标本中嗜麦芽窄食单胞菌对米诺环素、复方新诺明、左氧氟沙星、头孢他啶的耐药率均高于痰标本。结论嗜麦芽窄食单胞菌主要来自呼吸内科,以痰为主。易感人群为老年人,耐药性高,临床医师应根据药敏结果合理选择抗菌药物,减少耐药菌株的产生及流行。

嗜麦芽窄食单胞菌临床感染危险因素的分析

目的分析嗜麦芽窄食单胞菌(stenotrophomonas maltophilia,SMA)临床感染的独立危险因素,为临床减少SMA感染风险提供参考。方法选取2018年某三级综合医院确诊的SMA临床感染患者50例作为病例组,以同期未发生细菌性感染患者50例对照组,收集两组与SMA导致临床感染可能的危险因素资料12项,分别采用单因素和多因素非条件Logistic回归分析SMA临床感染的独立危险因素。结果单因素分析显示,年龄、肺部基础疾病、心血管基础疾病、qSOFA评分、机械通气、低蛋白血症、使用糖皮质激素等7项因素与SMA临床感染显著相关(P<0.05或P<0.01)。多因素Logistic回归分析显示,患者肺部基础疾病(OR=12.009,P=0.005)、心血管基础疾病(OR=5.082,P=0.018)、机械通气(OR=6.373,P=0.033)、低蛋白血症(OR=14.998,P=0.017)是SMA临床感染的独立危险因素。结论临床积极改善患者肺部基础疾病和心血管基础疾病,纠正低蛋白血症,减少机械通气等侵袭性操作,有利于降低患者SMA临床感染的风险。

嗜麦芽窄食单胞菌医院感染危险因素分析

应用 revman5.3 软件系统评价嗜麦芽窄食单胞菌医院感染危险素。方法 检索PubMed 数据库、万方医学网、中国知网和维普数据库中发表的关于嗜麦芽窄食单胞菌医院感染危险因素的研究文献,检索时间从2000年11月截止到2022年11月,采用revman5.3软件对提取的多因素数据进行meta分析,效应指标为OR(odds ratio)值及其95%置信区间(95%confidence interval,95%CI)。结果 纳入13篇嗜麦芽窄食单胞菌医院感染危险因素病例对照研究文献报道,其中病例组共2763例患者,对照组共3371例。Meta分析结果显示与嗜麦芽窄食单胞菌医院感染密切相关的且结果稳定的4个危险因素的OR值及95%CI分别为:ICU入住史OR(2.44),95%CI(1.79,3.33);联合使用抗菌药物OR(12.26),95%CI(10.6,14.18);机械通气OR(6.18),95%CI(2.0,19.1);应用碳青霉烯类抗生素OR(3.5),95%CI(1.77,6.95)。嗜麦芽窄食单胞菌医院感染危险因素不相关且结果存在不稳定性的危险因素OR值及95%CI分别为:APAVHE Ⅱ≥20分OR(3.87),95%CI(0.83,18.00);住院时间OR(1.04),95%CI(0.97,1.12)。结论 嗜麦芽窄食单胞菌医院感染与ICU入住史、联合使用抗菌药物、机械通气、应用碳青霉烯类抗生素密切相关,临床医师应采取相应的措施,降低危险因素医院感染的风险。

嗜麦芽窄食单胞菌CA1定殖及促生长特性相关基因挖掘

【目的】挖掘嗜麦芽窄食单胞菌CA1定殖和促生长特性相关基因,为探究其促生长作用机制提供理论参考。【方法】利用Nanopore测序技术平台对CA1菌株进行全基因组测序,将其基因组序列与GO、NR、KEGG、COG等数据库进行比对,获得基因功能注释信息,挖掘分析其功能特异性基因;使用基质培法收集甘蔗根系分泌物,并分析根系分泌物对菌株CA1的趋化性、生物膜形成和定殖相关基因表达的影响。【结果】嗜麦芽窄食单胞菌CA1基因组大小为4371327 bp,携带6个质粒,GC含量64.58%,其中4696个基因被注释预测,包括4525个蛋白编码基因、87个tRNA、13个rRNA和1个tmRNA。GO、COG、KEGG和NR数据库分别成功注释2795、2078、2494和2584个基因。该菌基因组含有细菌趋化性(cheA、cheV、cheY)、生物膜形成(flhA、flk、flgG)、细菌黏附(pgaA、mrkD)、嗜铁(fes、fepA、fecA)、合成氨(gltP、gltB、gltD)和磷酸盐代谢(phoR、phoB、pstA)等促进植物生长和定殖相关的基因。趋化性试验结果显示,与对照组相比,根系分泌物处理下的菌落数显著增加(P<0.05,下同),且cheA、cheV和cheY基因的相对表达量显著升高,CA1生物膜形成显著增加。【结论】甘蔗根系分泌物有助于菌株CA1的趋化性及生物膜形成,提高与趋化性相关基因的表达量。菌株CA1基因组含有多个与促生长和定殖特性相关的基因,是其促生长特性的分子基础,细菌的趋化性和生物膜的形成是其定殖的关键步骤,根系分泌物有利于菌株的定殖。

2016—2021年河北省血培养嗜麦芽窄食单胞菌分离株的临床分布及耐药性变迁

目的了解河北省血标本分离嗜麦芽窄食单胞菌的临床分布及耐药性变迁,为临床治疗及合理应用抗生素提供依据。方法收集2016年1月—2021年12月河北省血标本分离嗜麦芽窄食单胞菌数据,采用WHONET 5.6和SPSS 24.0软件对细菌分布及耐药性进行分析。结果河北省2016—2021年血标本分离嗜麦芽窄食单胞菌471株,主要来自老年人(34.4%)、中年人(23.6%)和儿童(21.9%),其中男性分离292株,女性分离179株;重症医学科、内科和儿科为最常见的分离科室,分别占27.8%、25.7%和24.2%。2016—2021年该菌对米诺环素、左氧氟沙星、甲氧苄啶-磺胺甲唑、氯霉素、替卡西林-克拉维酸和头孢他啶的耐药率保持稳定,六年平均耐药率分别为2.3%、7.6%、9.8%、15.8%、31.4%和37.5%;在不同科室间该菌对甲氧苄啶-磺胺甲唑和氯霉素的耐药率差异存在统计学意义(均P<0.05),外科分离菌株对甲氧苄啶-磺胺甲唑耐药率高于其他科室;在不同年龄组间该菌对左氧氟沙星、氯霉素、替卡西林-克拉维酸和头孢他啶的耐药率差异存在统计学意义(均P<0.05)。结论2016—2021年河北省血标本分离嗜麦芽窄食单胞菌主要来自重症医学科,以中老年人群为主。六年间,该菌对常用抗菌药物的耐药率保持稳定,对部分抗菌药物的耐药率在不同科室和年龄组间存在差异。临床可根据药敏结果、患者科室和年龄合理选择抗菌药物。

首钢地区某三级综合医院嗜麦芽窄食单胞菌的临床分布及耐药性分析

目的了解首钢地区嗜麦芽窄食单胞菌的临床分布及耐药性的变迁,为临床合理应用抗菌药物提供依据。方法收集北京大学首钢医院2012年1月至2021年12月所分离出的嗜麦芽窄食单胞菌菌株,回顾性分析其临床分布特征及耐药性,采用WHONET 5.6软件进行数据分析。结果十年间本院共分离出革兰氏阴性杆菌18792株,嗜麦芽窄食单胞菌457株,占2.43%。2021年检出率最低(0.27%)。嗜麦芽窄食单胞菌感染者在60岁以上老年患者中占比高(89.50%),临床标本来源前3位分别为痰液(78.99%)、尿液(7.44%)和上呼吸道标本(6.13%);以呼吸内科分布为主(36.11%),其次为重症医学科(12.91%)和血液内科(9.85%)。十年间该菌对左氧氟沙星和复方新诺明保持较低的耐药性,耐药率范围分别为0~14.00%和0~6.45%;对头孢他啶耐药率较高,高达81.82%。结论嗜麦芽窄食单胞菌以呼吸系统感染为主,多集中在呼吸内科,且60岁以上老年患者高发。该菌对左氧氟沙星和复方新诺明耐药率较低,临床应加强嗜麦芽窄食单胞菌的耐药监测,依据药敏结果合理选用抗菌药物,保证感染的有效治疗。

鲢嗜麦芽窄食单胞菌分离及药敏试验

为调查福建某养殖场鲢大面积死亡原因,对发病死亡的鲢肠道内容物、肛门出血分泌物及养殖塘池水中进行病原菌分离、鉴定,并对分离菌进行致病性及药敏试验。结果表明,分离鉴定X1为嗜麦芽窄食单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia),X2为嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila),且这2株菌对鲢具有致病性。在药敏试验中,X1菌株对15种抗生素耐药;X2菌株对新霉素、氯霉素、青霉素G等11种抗生素敏感,对阿莫西林、复方新诺明表现耐药性。

某院重症监护室聚集性多重耐药嗜麦芽窄食单胞菌感染的调查处置

调查某院重症监护室(ICU)聚集性多重耐药嗜麦芽窄食单胞菌(SMA)感染事件,分析原因并及时处置,为预防和控制医院感染提供支持依据。方法 对某中医医院ICU 2021年9月~10月检出多重耐药SMA的患者进行流行病学调查,采集患者标本和环境标本进行培养,对分离菌株进行药敏试验。同时给予控制措施,评价防控效果。结果 该病区在2021年9月~10月出现7例患者检出多重耐药SMA 7株,其中1例患者为医院感染。共采集环境标本76份,分离出多重耐药SMA 7株,菌株分别来自于床栏杆、床把手、设备带、床头桌面、水池、呼吸机面板、勤工手,其他环境标本中未检出该菌。患者标本和环境标本中检测出的多重耐药SMA耐药谱基本一致。采用一系列综合控制措施后,复查未检测出多重耐药SMA。结论 多重耐药相关防控措施可有效去除环境中多重耐药SMA,降低感染风险。

多重耐药嗜麦芽窄食单胞菌医院感染

目的 提高临床对嗜麦芽窄食单胞菌(S.m )感染的诊治水平。方法 调查近两年医院血培养证实的S.m感染病例,分析其发病的危险因素、临床特点及对抗菌药物的耐药情况。结果 发现8 例患者均为医院感染,慢性基础疾病及创伤性操作为其易感因素。感染的临床表现多种多样,且对目前常用抗菌药物多有不同程度耐药。结论 有易感因素时,应密切注意S.m 感染的产生,及早进行微生物学检查。

嗜麦芽窄食单胞菌临床感染诱因及耐药分析

目的为了观察嗜麦芽窄食单胞菌对临床抗生素耐药情况及临床感染诱发因素。方法对临床分离出的３５例嗜麦芽窄食单胞菌进行了感染诱因分析，同时采用肉汤稀释法对抗生素耐药性进行了探讨。结果菌株对头孢一代、头孢二代全部耐药，头孢哌酮耐药率５４．３％，头孢他啶为６０．０％，喹诺酮类体外呈现出较好的抗菌效果。培养阳性的患者当中３４．３％患有恶性肿瘤、２０．０％的患者接受过激素治疗、２２．９％接受过气管插管。结论患者患有其它疾病造成免疫功能低下，增加了嗜麦芽窄食单胞菌感染的机会。各种创伤性检查和治疗手段如气管插管等诱发了细菌感染。嗜麦芽窄食单胞菌对多种抗生素耐药，尤其内酰胺酶类。

2010年中国CHINET嗜麦芽窄食单胞菌耐药性监测

目的了解国内不同地区14所医院2010年临床分离嗜麦芽窄食单胞菌对抗菌药物的耐药性。方法收集14所医院2010年临床分离嗜麦芽窄食单胞菌1 661株,按统一方案、采用统一的材料、K-B法和判断标准(CLSI 2010年版)进行嗜麦芽窄食单胞菌的耐药性监测。结果 1661株嗜麦芽窄食单胞菌住院患者分离株占97.5%;门诊患者分离株仅占2.5%。60岁以上的老年患者分离株占63.8%,<18周岁患者的分离株占4.8%。主要是痰液等呼吸道分泌物分离者占83.0%;分离自血液、胸腹水、关节腔液、脑脊液等无菌体液者占4.7%。该菌对甲氧苄啶-磺胺甲(?)唑、左氧氟沙星和米诺环素的耐药率分别为11.2%、10.7%和3.4%,对头孢哌酮-舒巴坦的耐药率为13.8%。尿液分离株对甲氧苄啶-磺胺甲(?)唑和头孢哌酮-舒巴坦的耐药率为21.6%和33.3%,高于其他标本分离株耐药率,P<0.01。结论嗜麦芽窄食单胞菌主要分离自住院患者及痰液等呼吸道标本中,且多见于≥60岁的老年患者。该菌对多数抗菌药物固有耐药,但对CLSI推荐的甲氧苄啶-磺胺甲(?)唑、左氧氟沙星和米诺环素的耐药率低。头孢哌酮-舒巴坦对该菌亦有良好抗菌活性。应根据药敏试验结果合理选用治疗嗜麦芽窄食单胞菌感染的抗菌药物。

嗜麦芽窄食单胞菌的天然及获得性耐药机制研究进展

嗜麦芽窄食单胞菌,为条件致病菌,近年来感染率在不断增加。其不仅对多种抗生素存在天然耐药性,也可同过耐药基因水平转移获得对临床常见抗菌药物的耐药,本文综述了该菌对临床常见药物尤其是磺胺甲基异噁唑/甲氧苄啶的体外药敏情况,并阐述耐药基因对抗菌药物耐药的作用。

医院获得性嗜麦芽窄食单胞菌下呼吸道感染临床和药敏分析

目的 分析和总结医院获得性嗜麦芽窄食单胞菌下呼吸道感染的临床特点及对抗生素耐药情况。方法 对 6 5例医院获得性嗜麦芽窄食单胞菌下呼吸道感染的临床资料进行统计分析 ,用 VITEK- AMS微生物自动鉴定系统鉴定细菌 ,并用其配套 GNS- KI或 GNS- 2 0 1卡测定该菌的体外药敏。结果 6 5例患者均有基础疾病 ,其中以各种恶性血液病最常见 ,其次为各种恶性肿瘤 ;6 0 %入住 ICU病房 ;不合理使用广谱抗生素 ,化疗、放疗 ,激素使用、意识障碍及各种侵入性治疗为本病高危因素 ;临床表现 :发热 10 0 %,咳嗽、咯痰 87.7%,肺部影像诊断多表现为双下肺斑片状的阴影 ;药敏试验 :该菌对常用抗生素广泛耐药 ,敏感率 >5 0 %的抗生素依次为哌拉西林(91%)、头孢哌酮 /舒巴坦 (84%)、妥布霉素 (77%)、复方新诺明 (6 9%)、替卡西林 /克拉维酸 (6 7%)、环丙沙星(5 3%)。结论 医院获得性嗜麦芽窄食单胞菌下呼吸道感染多发生在有各种基础疾病、免疫功能低下者 ,各种高危因素又促成本病发生 ;临床表现危重复杂 ;该菌耐药现象严重 ,正确。

2012年中国CHINET嗜麦芽窄食单胞菌耐药性监测

目的了解国内不同地区15所医院2012年临床分离嗜麦芽窄食单胞菌对抗菌药物的耐药性。方法对国内主要地区15所医院2012年收集的临床非重复嗜麦芽窄食单胞菌菌株,按统一方案及材料、采用纸片扩散法或自动化仪器法进行细菌药敏试验,按照CLSI 2012年标准判读结果。结果全年共收集2 156株嗜麦芽窄食单胞菌。其中住院患者分离2 103株,占97.5%;门诊患者分离53株,占2.5%。60岁及以上的老年患者分离1 410株,占65.4%,小于18岁的患者分离115株,占5.3%。分离自痰液等呼吸道分泌物标本1 770株,占82.1%;分离自血液、胸腹水、关节腔液、脑脊液等无菌体液标本81株,占3.8%。该菌对甲氧苄啶-磺胺甲口恶唑、左氧氟沙星和米诺环素的耐药率分别为10.0%、10.5%和3.8%,对头孢哌酮-舒巴坦的耐药率为24.4%。结论嗜麦芽窄食单胞菌主要分离于住院患者及其痰液等呼吸道标本,且多见于60岁及以上的老年患者。该菌对大多数常用抗菌药物固有耐药,但对CLSI推荐的甲氧苄啶-磺胺甲口恶唑、左氧氟沙星和米诺环素的耐药率低。头孢哌酮-舒巴坦对该菌亦有较好抗菌活性。临床应以药敏试验结果合理选用治疗嗜麦芽窄食单胞菌的抗菌药物。

2011年中国CHINET嗜麦芽窄食单胞菌耐药性监测

目的了解国内不同地区15所医院2011年临床分离嗜麦芽窄食单胞菌对抗菌药物的敏感性。方法收集15所医院2011年临床分离嗜麦芽窄食单胞菌1 889株,按统一方案及材料、采用纸片扩散法或自动化仪器法进行细菌药敏试验,按照CLSI 2011年标准判读结果。结果监测的1 889株嗜麦芽窄食单胞菌主要分离自住院患者,占93.3%;门诊患者分离株占6.7%。60岁及以上的老年患者分离株占62.9%,小于18周岁患者的分离株占8.2%。痰液等呼吸道分泌物是该菌的主要分离源,占82.6%;分离自血液、胸腹水、关节腔液、脑脊液等无菌体液菌株占4.2%。该菌对甲氧苄啶-磺胺甲口恶唑、左氧氟沙星和米诺环素的耐药率分别为16.6%、10.0%和1.8%,对头孢哌酮-舒巴坦的耐药率为19.0%。血液及无菌体液分离株对甲氧苄啶-磺胺甲口恶唑的耐药率为37.1%,高于其他标本分离株,与伤口及尿液标本比较,P值<0.01。结论嗜麦芽窄食单胞菌主要分离自住院患者及其痰液等呼吸道标本中,且60岁以上的老年患者多见。该菌对多种抗菌药物固有耐药,但对CLSI推荐的甲氧苄啶-磺胺甲口恶唑、左氧氟沙星和米诺环素的耐药率低。头孢哌酮-舒巴坦对该菌亦有抗菌活性。应以药敏试验结果合理选用治疗嗜麦芽窄食单胞菌感染的抗菌药物。

猪源嗜麦芽窄食单胞菌16S rRNA基因的克隆和序列分析

从临床病猪无菌采集抗凝血 ,抽提全血基因组DNA ,用能够扩增大多数真细菌 16SrRNA基因的通用引物 ,扩增出长度为 15 0 2bp的嗜麦芽窄食单胞菌的 16SrRNA基因 ;该基因与国外报道的嗜麦芽窄食单胞菌部分临床和环境分离株核苷酸序列的同源性达 99%以上。证实嗜麦芽窄食单胞菌可感染猪。