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四川山鹧鸪(Arborophila rufipectus)研究进展 被引量:2
1
作者 付义强 戴波 文陇英 《乐山师范学院学报》 2018年第8期37-41,共5页
四川山鹧鸪是我国特产的国家I级重点保护鸟类,主要分布在四川省中南部和云南省东北部的少数山地森林中。因种群数量稀少和分布区狭窄,四川山鹧鸪被世界自然保护联盟(IUCN)列为全球性濒危物种。文章综述了四川山鹧鸪种群状况、栖息地、... 四川山鹧鸪是我国特产的国家I级重点保护鸟类,主要分布在四川省中南部和云南省东北部的少数山地森林中。因种群数量稀少和分布区狭窄,四川山鹧鸪被世界自然保护联盟(IUCN)列为全球性濒危物种。文章综述了四川山鹧鸪种群状况、栖息地、繁殖生态、分子生物学、鸣声及越冬生态等方面的研究进展,并对未来研究方向提出了建议。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 特有种 研究进展 研究展望
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基于454 GS FLX高通量测序的四川山鹧鸪基因组微卫星特征分析 被引量:16
2
作者 黄杰 周瑜 +5 位作者 刘与之 朱丹 宋旭颢 陈本平 张修月 岳碧松 《四川动物》 北大核心 2015年第1期8-14,共7页
为了有效地保护四川山鹧鸪Arborophila rufipectus这一中国特有珍稀濒危鸟类,本研究采用454 GS FLX对该物种基因组测序,首次利用微卫星搜索软件搜索并初步统计和分析基因组微卫星序列,共搜索到l^6个碱基重复类型的完美型微卫星335 263... 为了有效地保护四川山鹧鸪Arborophila rufipectus这一中国特有珍稀濒危鸟类,本研究采用454 GS FLX对该物种基因组测序,首次利用微卫星搜索软件搜索并初步统计和分析基因组微卫星序列,共搜索到l^6个碱基重复类型的完美型微卫星335 263个。不同类型微卫星中,单碱基重复类型数目最多,为197 913个,约占总数的59.03%,其次是四碱基、三碱基、六碱基、二碱基和五碱基,分别约占微卫星总数的13.59%、8.39%、7.55%、6.49%和4.95%。单碱基微卫星中A重复类型数量最多,两碱基中AC最多,三碱基中AAC,四碱基中AAAC最多,五碱基中AAACA最多,六碱基中AGGGTT最多。A、AGGGTT、AAAC、AC、AAAT、AAC、C、AG、AAAG、AAACA、AAT、AGG、AT、AGC、AAGG、CCG是在所搜索到的四川山鹧鸪微卫星中数量最多的16种重复拷贝类型。本研究深化了对四川山鹧鸪基因组的认识和了解,并为以后开发和筛选大量高质量微卫星标记提供数据支持,也为利用微卫星标记研究更加有效地保护和管理四川山鹧鸪这一珍稀濒危动物奠定了基础。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 基因组序列 微卫星 分布
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四川山鹧鸪的分布及生境选择 被引量:15
3
作者 李操 胡杰 余志伟 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期46-51,共6页
研究了四川山鹧鸪 (Arborophilarufipectus)的分布区域和栖息地的生境 ,认为四川山鹧鸪的分布范围比已知的要大 ,但其实际分布区呈明显的岛屿状 ,显示出生境的破碎化 ;指出四川山鹧鸪的适宜生境是原始的常绿阔叶林、针阔混交林和具有较... 研究了四川山鹧鸪 (Arborophilarufipectus)的分布区域和栖息地的生境 ,认为四川山鹧鸪的分布范围比已知的要大 ,但其实际分布区呈明显的岛屿状 ,显示出生境的破碎化 ;指出四川山鹧鸪的适宜生境是原始的常绿阔叶林、针阔混交林和具有较大常绿落叶阔叶乔木树种盖度的多年生次生林 ,亦可选择部分人工林 ,而对地表灌丛密度大的次生幼林以及人工幼林生境不喜好。由于天然林的禁伐和生态林的管护 ,四川山鹧鸪的栖息地趋于稳定并有所扩大。但四川山鹧鸪仍然处于濒危状态。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 分布 生境选择
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老君山自然保护区四川山鹧鸪非繁殖期对栖息地的利用(英文) 被引量:10
4
作者 廖文波 李操 +1 位作者 胡锦矗 卢欣 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期172-178,共7页
四川山鹧鸪(Arborophila rufipectus)是中国西南山地特产珍稀鸟类,由于亚热带阔叶林破碎化,其种群数量显著下降。2005年11—12月在老君山自然保护区,共记录四川山鹧鸪非繁殖期栖息地20个。以其新鲜粪便为中心设一个10m×10m大样方和... 四川山鹧鸪(Arborophila rufipectus)是中国西南山地特产珍稀鸟类,由于亚热带阔叶林破碎化,其种群数量显著下降。2005年11—12月在老君山自然保护区,共记录四川山鹧鸪非繁殖期栖息地20个。以其新鲜粪便为中心设一个10m×10m大样方和4个1m×1m的小样方,测量每个样方中与栖息地利用有关的12个生境因子(海拔、坡向、坡度、乔木层盖度、灌木高、灌木密度、灌木层盖度、竹盖度、竹密度、雪盖度、林缘距离和道路距离);并在距栖息地100m处任意设对照样方1—2个,共获取30个对照样方,测量相同的生境因子。结果表明,四川山鹧鸪非繁殖期以靠近林间小道和森林边缘的次生落叶阔叶林为栖息地,主要利用海拔高度为1000—1600m,坡度为2—15°的南坡;其偏爱的栖息地竹盖度、竹密度和雪盖度明显小于对照样方,而灌木盖度明显大于对照样方。对栖息地变量进一步分析表明,影响四川山鹧鸪栖息地利用的主要因子依次为地面层食物因子、地型因子、隐蔽因子、温度因子等,其中食物条件的贡献率为29.407%。四川山鹧鸪在利用栖息地时可能面对食物资源与天敌风险的权衡。因此,为了更好地保护四川山鹧鸪栖息地,应重视阔叶林的保护和恢复。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 非繁殖期 生态因子 栖息地利用
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再谈四川山鹧鸪的模式产地 被引量:4
5
作者 何芬奇 宋道军 +5 位作者 金鑫 彭永安 郭汉城 李从浩 沈尤 张铭 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2009年第4期946-948,共3页
四川山鹧鸪Arborophila rufipectus系由R.Boulton于1932年依据F.T.Smith在原西康省某地"TaChoFu"采获的单独一号雄性标本而定名。中国鸟类学家以往多认为该种的模式标本产地为今四川甘洛县的大桥乡。通过对大桥乡所在地理坐... 四川山鹧鸪Arborophila rufipectus系由R.Boulton于1932年依据F.T.Smith在原西康省某地"TaChoFu"采获的单独一号雄性标本而定名。中国鸟类学家以往多认为该种的模式标本产地为今四川甘洛县的大桥乡。通过对大桥乡所在地理坐标的实测,并使用GoogleEarth对该地区进行查检,作者曾提出"TaChoFu"当在今四川汉源县境内,并指出对该地点具体位置的订正和重新定位,使四川山鹧鸪的总分布区域北推了至少100km范围。尽管Traylor(1967)曾对"TaChoFu"这一地点给出过一个差异颇大的地理坐标,作者通过进一步研究和对相关史料的分析,认为F.T.Smith当年采得四川山鹧鸪的地点仍应当是在四川汉源县境内。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 模式标本产地 四川汉源
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四川山鹧鸪繁殖期的鸣声行为特征 被引量:7
6
作者 廖文波 李操 +1 位作者 胡锦矗 卢欣 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期56-62,共7页
2005年4—12月在四川老君山自然保护区,通过计算机声谱分析技术,对四川山鹧鸪(Arborophilarufipectus)雄性的鸣声行为特征进行了研究,其结果表明,雄性单音节鸣声出现在啼叫、保护领域和求偶中,这些鸣声持续时间差异明显,主峰值差异不明... 2005年4—12月在四川老君山自然保护区,通过计算机声谱分析技术,对四川山鹧鸪(Arborophilarufipectus)雄性的鸣声行为特征进行了研究,其结果表明,雄性单音节鸣声出现在啼叫、保护领域和求偶中,这些鸣声持续时间差异明显,主峰值差异不明显;雄性双音节鸣声出现在啼叫、保护领域、竞争雌体和求偶中,这些鸣声第一音节时间、第二音节时间、音节间隔时间和主峰值差异极显著,全句时间差异不明显;雄性多音节鸣声出现在保护领域、警戒和惊吓中。雄性亚成体多音节鸣声出现在惊吓和警戒中;雄性成体和亚成体警戒鸣叫的音节持续时间、音节间隔时间和主峰值差异均不明显,全句持续时间差异明显;雄性亚成体和雄性成体的惊吓鸣叫音节持续时间、音节间隔时间、全句持续时间和主峰值差异均不明显。四川山鹧鸪表现出的各种鸣声行为是为了保护配偶和防止天敌,使该种群更好地繁衍。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 老君自然保护区 声谱分析 鸣声
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四川山鹧鸪栖息地分析与预测 被引量:8
7
作者 戴波 陈本平 +1 位作者 岳碧松 曾涛 《四川动物》 CSCD 北大核心 2014年第3期329-336,共8页
四川山鹧鸪Arborophila rufipectus属鸡形目雉科山鹧鸪属,是我国特产珍稀鸟类,国家一级重点保护野生动物,IUCN濒危物种。本文应用卫星遥感影像解译技术对该物种的现实栖息地和潜在栖息地进行了分析和预测。结果表明,现存四川山鹧鸪分布... 四川山鹧鸪Arborophila rufipectus属鸡形目雉科山鹧鸪属,是我国特产珍稀鸟类,国家一级重点保护野生动物,IUCN濒危物种。本文应用卫星遥感影像解译技术对该物种的现实栖息地和潜在栖息地进行了分析和预测。结果表明,现存四川山鹧鸪分布格局自四川中南部向云南东北延伸,跨越金沙江,呈现西北-东南走向,分布区涉及大相岭山系南缘、小相岭山系东缘、凉山山系东北部、乌蒙山山系西部,行政区域涉及2省5市(州)19县(区)。栖息地由10片现实栖息地和36片潜在栖息地组成,总面积约5869 km2。"甘洛-金口河-峨边-马边-美姑"片和"雷波-马边-屏山"片是四川省境内呈南北布局的两大核心分布区,"绥江-永善-水富-盐津-大关"片为云南省境内的核心分布区。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 栖息地 分布格局 地貌特征
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四川山鹧鸪栖息地破碎化及保护管理状况分析 被引量:4
8
作者 戴波 陈本平 +1 位作者 岳碧松 曾涛 《四川动物》 北大核心 2015年第2期174-180,共7页
四川山鹧鸪Arborophila rufipectus是我国特有珍稀鸟类,国家Ⅰ级重点保护野生动物,世界自然保护联盟濒危物种。应用3S技术制作其栖息地分布和保护区位置图层,并对栖息地破碎化情况和受保护状况进行分析。结果表明,无论现实栖息地还是潜... 四川山鹧鸪Arborophila rufipectus是我国特有珍稀鸟类,国家Ⅰ级重点保护野生动物,世界自然保护联盟濒危物种。应用3S技术制作其栖息地分布和保护区位置图层,并对栖息地破碎化情况和受保护状况进行分析。结果表明,无论现实栖息地还是潜在栖息地,破碎化程度都高;部分栖息地斑块相互邻接,具备连通的可能性;分布区内初步形成的保护区网络还需完善。文末提出了景观保护的建议。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 栖息地 破碎化 保护
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老君山自然保护区四川山鹧鸪繁殖巢址记述 被引量:2
9
作者 季婷 何巧巧 +3 位作者 蒋迎昕 李金林 冯盛林 凌征文 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期88-88,共1页
Sichuan Partridge(Arborophila rufipectus)is an endangered bird species only found inhabiting in the subtropical broadleaf forest in S Sichuan and NE Yunnan,China.On 8 May 2007,a nest of the Sichuan Partridge was found... Sichuan Partridge(Arborophila rufipectus)is an endangered bird species only found inhabiting in the subtropical broadleaf forest in S Sichuan and NE Yunnan,China.On 8 May 2007,a nest of the Sichuan Partridge was found in Laojunshan Natural Reserve,Sichuan,China.The nest was built on the ground,in the secondary bamboo forest.The clutch size was five,nest size and egg sizes were measured.The male bird was preyed near the nest,and the nest was abandoned.Embryo development showed the eggs had been well incubated. 展开更多
关键词 四川鹧鸪 老君自然保护区 巢址 繁殖 珍稀鸟类 保护动物 濒危物种
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四川麻咪泽自然保护区四川山鹧鸪繁殖期对栖息地的利用 被引量:3
10
作者 赵成 耿秋扎西 +3 位作者 冉江洪 李波 胡晓玲 孙彬彬 《四川动物》 北大核心 2015年第4期626-630,共5页
四川山鹧鸪Arborophila rufipectus属鸡形目雉科山鹧鸪属,是我国特产珍稀鸟类,国家Ⅰ级重点保护动物,世界自然保护联盟濒危物种。2014年4—5月,在四川麻咪泽自然保护区对四川山鹧鸪及其栖息地进行了野外调查。结果表明,四川山鹧鸪分布... 四川山鹧鸪Arborophila rufipectus属鸡形目雉科山鹧鸪属,是我国特产珍稀鸟类,国家Ⅰ级重点保护动物,世界自然保护联盟濒危物种。2014年4—5月,在四川麻咪泽自然保护区对四川山鹧鸪及其栖息地进行了野外调查。结果表明,四川山鹧鸪分布在海拔1700-2550 m,主要分布在2100-2300 m;其栖息生境主要为天然阔叶林,尤喜原始林;利用的坡度集中在20°-40°;偏好乔木数量多、高大和郁闭度大的森林生境;其中乔木均高是影响四川山鹧鸪栖息地利用的主要因子。保护四川山鹧鸪偏好的天然阔叶林,减少栖息地的人类干扰,是保护四川山鹧鸪这一濒危物种的首要措施。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 麻咪泽自然保护区 栖息地 繁殖 保护
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四川山鹧鸪的冬季生态研究 被引量:8
11
作者 徐照辉 梅文正 +2 位作者 张刚 陈新华 曾兆群 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1994年第2期21-23,共3页
四川山鹧鸪调查在四川省马边县黄连山林区。冬季单只、成对活动。其数量在原始林为每平方公里2.75只,人工杉木林和自然更新林为每平方公里0.75只。主食草子、根等物,夜栖树上。冬季的主要天敌为猛离。野外考察还发现沐川县为... 四川山鹧鸪调查在四川省马边县黄连山林区。冬季单只、成对活动。其数量在原始林为每平方公里2.75只,人工杉木林和自然更新林为每平方公里0.75只。主食草子、根等物,夜栖树上。冬季的主要天敌为猛离。野外考察还发现沐川县为新的分布。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 冬季生态 种群密度
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对四川山鹧鸪模式产地的再认识 被引量:4
12
作者 何芬奇 沈尤 张铭 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2008年第3期642-643,共2页
四川山鹧鸪Arborophila rufipectus系由R.Boulton于1932年依据F.T.Smith在原西康省某地"Ta Cho Fu"采获的单独一号雄性标本而定名,中国鸟类学家以往多认为该种的模式标本产地为今四川甘洛县的大桥乡。通过对大桥乡所在地理坐... 四川山鹧鸪Arborophila rufipectus系由R.Boulton于1932年依据F.T.Smith在原西康省某地"Ta Cho Fu"采获的单独一号雄性标本而定名,中国鸟类学家以往多认为该种的模式标本产地为今四川甘洛县的大桥乡。通过对大桥乡所在地理坐标的实测,并使用GoogleEarth对该地区进行查检,作者提出"Ta Cho Fu"当在今四川汉源县境内,对该地点具体位置的订正和重新定位,使四川山鹧鸪的总分布区域北推了至少100km范围。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 模式标本产地 四川汉源
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四川山鹧鸪生态习性研究进展 被引量:5
13
作者 廖文波 胡锦矗 《绵阳师范学院学报》 2010年第2期67-71,75,共6页
四川山鹧鸪(Arborophila rufipectus)是中国西南山地特产珍稀鸟类。由于亚热带阔叶林的破碎化,其种群数量显著下降,故对其生态习性概括既具有理论意义,又具有保护价值。该文基于近10年的大量相关资料,综述了四川山鹧鸪生态习性研究的最... 四川山鹧鸪(Arborophila rufipectus)是中国西南山地特产珍稀鸟类。由于亚热带阔叶林的破碎化,其种群数量显著下降,故对其生态习性概括既具有理论意义,又具有保护价值。该文基于近10年的大量相关资料,综述了四川山鹧鸪生态习性研究的最新情况,全面介绍了物种的地理分布情况、种群数量、对栖息地的利用、繁殖特征、鸣声特征和保护地位,并对该领域今后应进行的研究提出了建议。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 种群密度 栖息地 繁殖 鸣声 保护地位
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四川山鹧鸪于攀枝花市发现的意义 被引量:1
14
作者 何芬奇 刘成友 +1 位作者 唐平 吴家琮 《动物分类学报》 CSCD 2000年第3期348-348,共1页
关键词 四川鹧鸪 攀枝花市 分布 保护
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四川省屏山县老君山发现一例部分白化的四川山鹧鸪成年雌鸟 被引量:2
15
作者 付义强 陈本平 凌征文 《四川动物》 北大核心 2020年第1期89-89,共1页
四川山鹧鸪Arborophila rufipectus是我国西南山地特有的雉科Phasianidae鸟类,国家Ⅰ级重点保护野生动物,仅分布于四川省中南部和云南省东北部的少数山区森林中(郑光美,2015)。2019年5月,在四川省屏山县老君山国家级自然保护区,通过红... 四川山鹧鸪Arborophila rufipectus是我国西南山地特有的雉科Phasianidae鸟类,国家Ⅰ级重点保护野生动物,仅分布于四川省中南部和云南省东北部的少数山区森林中(郑光美,2015)。2019年5月,在四川省屏山县老君山国家级自然保护区,通过红外相机监测到1只体羽部分白化的四川山鹧鸪成年雌鸟(图1:左)。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 雌鸟 郑光美 红外相机监测 雉科 老君 区森林 云南省东北部
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四川山鹧鸪育雏期幼体鸣声行为 被引量:2
16
作者 廖文波 《西华师范大学学报(自然科学版)》 2011年第2期127-131,150,共6页
作者于2005年4-6月在四川老君山自然保护区,通过计算机声谱分析技术和回放技术,对四川山鹧鸪育雏期(Arborophila rufipectus)幼体的鸣声行为特征进行了研究,其结果表明,幼体有取食、警戒、惊恐和呼唤等4种不同行为的鸣声.取食鸣声和警... 作者于2005年4-6月在四川老君山自然保护区,通过计算机声谱分析技术和回放技术,对四川山鹧鸪育雏期(Arborophila rufipectus)幼体的鸣声行为特征进行了研究,其结果表明,幼体有取食、警戒、惊恐和呼唤等4种不同行为的鸣声.取食鸣声和警戒鸣声均为单音节,它们的音节持续时间和主峰值差异显著.两种惊恐鸣声和四种呼唤鸣声的MPF和音节间隔时间差异性不明显,而音节持续时间差异极显著. 展开更多
关键词 四川鹧鸪 幼体 声谱分析 育雏期
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四川山鹧鸪脑源性神经营养因子(BDNF)基因的扩增与序列分析 被引量:6
17
作者 杨光垚 陈红卫 +3 位作者 杨玉华 刘绍龙 张志和 张义正 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2000年第S1期195-198,共4页
:参照人BDNF基因序列设计出一对引物 ,利用聚合酶链式反应 (PCR)方法 ,从四川山鹧鸪 (Arborophilarufipectus)基因组DNA中扩增到BDNF基因 .序列分析表明 ,该基因序列长 736bp ,与人和鸡BDNF基因的核苷酸同源性分别为 84 % ,95% ,推导的... :参照人BDNF基因序列设计出一对引物 ,利用聚合酶链式反应 (PCR)方法 ,从四川山鹧鸪 (Arborophilarufipectus)基因组DNA中扩增到BDNF基因 .序列分析表明 ,该基因序列长 736bp ,与人和鸡BDNF基因的核苷酸同源性分别为 84 % ,95% ,推导的蛋白质序列与人和鸡相应序列的同源性分别为 92 %和 98% .实验扩增并分析了四川山鹧鸪的BDNF基因 ,为四川山鹧鸪的保护和繁育提供了重要资料 . 展开更多
关键词 四川鹧鸪(a.rufipectus) 脑源性神经营养因子(BDNF)基因 PCR 序列分析
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四川山鹧鸪基因组中内源性逆转录病毒的分析 被引量:1
18
作者 郑帅 周闯 +3 位作者 范振鑫 李静 岳碧松 孟杨 《四川动物》 北大核心 2019年第5期521-525,共5页
内源性逆转录病毒(ERV)是插入到宿主基因组中的、可以稳定遗传的病毒基因组,能够在宿主体内表达和复制,调节插入位点附近的基因表达,以及抑制同源病毒的感染。从四川山鹧鸪Arborophila rufipectus基因组中确定了3 962个全长ERV拷贝,其中... 内源性逆转录病毒(ERV)是插入到宿主基因组中的、可以稳定遗传的病毒基因组,能够在宿主体内表达和复制,调节插入位点附近的基因表达,以及抑制同源病毒的感染。从四川山鹧鸪Arborophila rufipectus基因组中确定了3 962个全长ERV拷贝,其中4个具有完整的结构,72个具有自我复制的能力,554个含有gag、pol或env基因所编码的蛋白质结构域。根据逆转录酶序列的相似性,确定了7个ERV家族,并依据与其他物种的相似性对家族进行了命名。其中,AruERV-L包含122个ERV拷贝,为拷贝数最多的家族。7个ERV家族的年龄分布在0~12百万年,其中AruERV-K1是最年轻的家族,其约86%的拷贝年龄在1百万年以内。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 基因组 内源性逆转录病毒 内源性逆转录病毒家族 内源性逆转录病毒年龄
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四川老君山国家级自然保护区四川山鹧鸪繁殖期的生境利用及其变化研究 被引量:3
19
作者 西丽媛子 罗概 +3 位作者 冉江洪 冯盛林 陈建武 陈本平 《四川动物》 北大核心 2020年第3期258-265,共8页
基于2006年4月—2018年6月四川老君山国家级自然保护区四川山鹧鸪Arborophila rufipectus固定样点监测数据,对四川山鹧鸪栖息地利用及变化进行了分析,结果显示:(1)不同年间四川山鹧鸪对样点的利用率存在差异,2006—2012年对样点的利用... 基于2006年4月—2018年6月四川老君山国家级自然保护区四川山鹧鸪Arborophila rufipectus固定样点监测数据,对四川山鹧鸪栖息地利用及变化进行了分析,结果显示:(1)不同年间四川山鹧鸪对样点的利用率存在差异,2006—2012年对样点的利用频次呈现下降趋势,2012年后呈现上升趋势;(2)利用样点的平均海拔为1580 m±183 m,年间差异不大,总体保持稳定;(3)对人工林的利用频次最低,2006—2012年对原始林和次生林的利用偏好不明显,2012年之后对原始林的利用率大于次生林;(4)高频利用的生境具有海拔较高、坡度较小、灌丛盖度和竹丛盖度较大、且为原始林的特点。高海拔区域的原始林是保护区需要重点加强保护的区域;加强对低海拔区域人类活动的管控,促进次生林恢复,同时加强对人工林的改造,促进人工林林下灌丛和竹丛生长,将有利于保护区内四川山鹧鸪的栖息与繁衍。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 生境利用 鸣声计数法 原始林 保护管理
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四川山鹧鸪的转录组组装和注释
20
作者 刘乙 何乐为 +4 位作者 兰月 周闯 陈本平 岳碧松 孟杨 《四川动物》 北大核心 2022年第1期24-29,共6页
四川山鹧鸪Arborophila rufipectus是中国特有的珍稀濒危鸟类。本研究对1只成年雄性四川山鹧鸪个体的心脏、肝脏和肾脏进行了转录组测序、组装和注释。其原始序列过滤后分别产生了5.70 G、4.60 G和5.16 G数据。286661条转录本经过Trinit... 四川山鹧鸪Arborophila rufipectus是中国特有的珍稀濒危鸟类。本研究对1只成年雄性四川山鹧鸪个体的心脏、肝脏和肾脏进行了转录组测序、组装和注释。其原始序列过滤后分别产生了5.70 G、4.60 G和5.16 G数据。286661条转录本经过Trinity组装并去掉冗余后共得到234488个基因。BUSCO评估组装完整性为97.6%。81.29%的unigenes不包含开放阅读框(ORF),16.43%的包含1个ORF,而2.28%的包含2个及以上ORF。70737个基因在NR、GO、KEGG、Swiss和COG数据库获得注释结果,占比30.17%,其中NR数据库的注释结果占比最高(29.27%),而COG数据库的注释结果最低(4.37%)。5个数据库共同注释到的基因6998个,NR数据库中单独注释到的基因最多(23773个)。本研究为四川山鹧鸪功能基因的挖掘提供了基础数据,并为保护该物种提供了遗传数据。 展开更多
关键词 四川鹧鸪 转录组 组装 注释
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