脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)回交家系遗传变异的微卫星分析

为解析脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)回交家系的遗传变异规律,本研究利用自行开发的25个微卫星标记对本实验室构建的A、B、C 3个回交家系的遗传结构特征进行了分析。结果显示,回交家系A、B、C的平均等位基因数(Na)分别为2.21、2.18、2.09,观测杂合度(Ho)分别为0.3805、0.3703、0.2489,期望杂合度(He)分别为0.3629、0.3998、0.2503,多态信息含量(PIC)分别为0.3257、0.3391、0.2585,相较于野生群体与杂交家系已有了大幅度的降低,属中度或低度多态。回交家系A、B、C在25个位点共得到62个等位基因,其中,A家系56个,B家系54个,C家系51个,3个回交家系共同存在的等位基因为39个,6个位点在回交家系中已经纯合(其中,ECL10在A、B、C中都已纯合),计算得出3个回交家系的纯合率分别达到了53.86%、56.53%、63.33%。由此可见,回交家系的基因纯化速率较快,适用于脊尾白虾重要经济性状的遗传解析和优良种质的选育。

植物数量性状遗传体系检测中回交或自交家系重复试验数据的分析方法

为提高主基因 +多基因混合遗传分析的精度 ,降低试验误差 ,采用重复内分组随机区组设计 ,对低遗传力性状的B1∶2 和B2∶2 或F2∶3 家系平均数资料进行遗传分析。通过AIC准则和适合性检验比较无主基因 (A - 0 )、1对主基因 (A)、2对主基因 (B)、多基因 (C)、1对主基因 +多基因 (D)和 2对主基因 +多基因 (E)模型以鉴定其遗传模式。采用IECM算法估计混合模型参数。通过油菜HSTC14×宁油 7号初花期F2∶3 家系平均数资料阐明该方法。

回交自交系(BIL)群体4对主基因加多基因混合遗传模型分离分析方法的建立

主基因加多基因混合遗传模型是用于分析数量性状表型数据的统计分析方法,该方法便于育种工作者利用杂种分离世代的数据对育种性状的遗传组成初步判断,制定相应的育种策略,也可用于校验QTL定位所揭示的数量性状的性状遗传组成。回交自交系(BIL)群体是永久性群体,可以进行有重复的比较试验,适用于受环境影响较大的复杂性状的遗传研究。本研究以BIL群体为对象构建了4对主基因、主基因加多基因分离分析方法的遗传模型,包括2类11个遗传模型。利用基于IECM(iterative expectation conditional maximization)算法的极大似然分析方法估算各个混合遗传模型中的分布参数,用AIC值和一组适合性测验结果选取最优模型,并从入选模型的分布参数通过最小二乘法估计遗传参数。由1个模拟的随机区组试验对模型进行验证,模拟群体中遗传参数的估计值与设定值之间具有很好的一致性。利用本文建立的模型重新分析大豆回交自交系群体(Essex×ZDD2315)及其亲本对胞囊线虫(Hetero-dera glycines Ichinohe)1号生理小种的抗性数据后发现4对主基因模型优于原报道的3对主基因模型,说明本方法的有效性和正确性。

利用目标区段剩余杂合系进行大豆开花期QTL的验证和精细定位

以成熟期V组的Essex为母本，Ⅱ组的ZDD2315为父本和轮回亲本，创建114个单株的BC1Fl群体；采用250个SSR标记，通过MAPMAKER3．0构建遗传图谱，覆盖大豆基因组2963．5cM．采用WinQTLCart2．5，IciMapping2．0，MapQTL5．0以及QTLnetwork2．0共4种软件的6种遗传统计模型对BC1F3家系的开花期表型数据，共检测到9个控制开花期的QTL．6个能被至少两种模型检测到；3个只被一种模型检测到，其中Flwdt7定位在C2连锁群的SaR643和Sat213之间，置信距33．8cM，贡献率11．0％．为验证此结果，从BC1F5家系中选择该区间附近标记杂合单株，经自交建立5个剩余杂合系（RHL），分别在7个位点上有分离．在检测遗传背景相对一致后将分离位点相同的合并，采用JoinMap3．0构建该区段子图谱．用QTLnetwork2．0NWIM将Flwdt7定位在邻区间Satt277～Satt489，离两侧标记的距离分别为1．40和0．45cM，置信距缩短为2．7cM，贡献率上升为36．8％．再用RHL标记等位变异分组差异显著性分析和目标区间近等基因系分析等方法验证了该结果．多种模型全基因组QTL初扫描基础上的目标区段剩余杂合系定位是一种有效的精细定位策略．