氧化亚铁钩端螺旋菌的固氮供硫蛋白与底物的相互作用

氧化亚铁钩端螺旋菌的nifS基因可能在它的固氮酶成熟中发挥重要的作用.为了考察由这个基因编码的蛋白质,建立了一个关于它的可靠的完整三维分子结构.建立的结构被进一步进行绑定位点搜索,跟辅因子磷酸吡哆醛(PLP)和底物半胱氨酸进行柔性分子对接,并据此识别其关键残基.在跟半胱氨酸对接中,半胱氨酸中的氨基非常靠近His102,Lys204和PLP,半胱氨酸跟它们的相互作用能也很大,这些情况跟那些来自其他生物的固氮供硫蛋白(NifS)类似物的实验事实一致.根据这些结果,这个基因编码NifS;底物半胱氨酸能被有效地募集到激活位点.