一种仿生的面向可重构多细胞阵列的分布式定序方法

提出一种仿生的面向多细胞阵列的分布式定序方法.该方法是基于生物学上的图式形成理论,通过催化剂-抑制剂模型在多细胞阵列中建立浓度梯度,并在此基础上进行定序.该方法具有如下的特点:跟现有的多细胞阵列维序方法相比,它采用主动的维序方式;跟传统的分布式定序方法相比,它不需要初始特征值就能实现定序和维序.故障注入实验表明,该定序方法较现有的方法具有更强的鲁棒性,在细胞出错的情况下能够重新建立浓度梯度和重新定序.此外,我们在Xilinx公司的型号为Virtex-6 XC6VLX760的FPGA芯片上实现了5x5多细胞阵列,对浓度梯度建立和重建时间及硬件资源开销进行了评估.