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Goniurosaurus indet.的有效性及中国睑虎属(Squamata:Sauria:Eublepharidae)种间的亲缘关系
被引量:
5
1
作者
张洁
庆宁
+4 位作者
易祖盛
王英勇
江晓汕
卢文华
James Lazell
《华南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2014年第2期92-98,共7页
了解我国睑虎属Goniurosaurus(Squamata:Sauria:Eublepharidae)种间的亲缘关系以及广东新纪录的睑虎属未定种Goniurosaurus indet.的有效性,对睑虎属10个种的线粒体DNA基因片段比较和遗传变异分析.获得12S rRNA(385 bp)和16S rRNA(477 ...
了解我国睑虎属Goniurosaurus(Squamata:Sauria:Eublepharidae)种间的亲缘关系以及广东新纪录的睑虎属未定种Goniurosaurus indet.的有效性,对睑虎属10个种的线粒体DNA基因片段比较和遗传变异分析.获得12S rRNA(385 bp)和16S rRNA(477 bp)总长度为862 bp的联合序列,共有核苷酸变异位点388个,简约信息位点269个.选取大壁虎Gekko gecko为外类群,采用贝叶斯演绎法(BI)、最大似然法(ML)、最大简约法(MP)、邻接法(NJ)对两个基因联合序列的分析均显示相同结果,即广东睑虎属未定种Goniurosaurus indet.与英德睑虎G.yingdeensis以及凭祥睑虎G.luii与蛛纹睑虎G.araneus两两种间的亲缘关系较近;且分布区相邻的Goniurosaurus indet.与G.yingdeensis之间的遗传分化(遗传距离=0.044-0.046)相似于分类地位已经明确的G.luii与G.araneus种间的遗传差异(遗传距离=0.051).结合形态学研究结果,认为Goniurosaurus indet.和G.yingdeensis之间已发生显著的遗传差异,前者可能为睑虎属新种.同时,系统发育分析表明海南睑虎G.hainanensis与睑虎属其它物种之间的遗传分化较大,系统发育地位最为特殊.系统发育分析进一步表明具4条背部横纹是祖征,具5条背部横纹为衍征.该文首次提出宽阔的河流可能是造成睑虎种群分化和新种形成的重要地理屏障.这一"河流隔离"观点对全球睑虎属物种的亲缘地理分布格局的解释具有重要的理论意义.
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关键词
睑虎属
线粒体DNA
地理亲缘关系
河流隔离
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职称材料
中国、日本和澳大利亚珍珠贝的ITS2序列特征分析
被引量:
18
2
作者
喻达辉
李有宁
吴开畅
《南方水产》
2005年第2期1-6,共6页
对中国、日本和澳大利亚的珍珠贝核糖体DNA第二内部转录间隔子(ITS2)的序列特征进行了分析。PCR扩增产物包括5.8S基因部分序列、ITS2基因和28S基因部分序列。去除引物序列后5.8S基因片段长64bp,ITS2长230~237bp,28S基因片段长249bp。...
对中国、日本和澳大利亚的珍珠贝核糖体DNA第二内部转录间隔子(ITS2)的序列特征进行了分析。PCR扩增产物包括5.8S基因部分序列、ITS2基因和28S基因部分序列。去除引物序列后5.8S基因片段长64bp,ITS2长230~237bp,28S基因片段长249bp。共分析了16个基因型的序列特征,结果表明,5.8S和28S基因片段高度保守,仅28S有1个碱基位点突变;而ITS2变异大,237个比对位点中有20个位点发生突变,其中12个位点为缺失/插入突变,4个简约信息位点。在碱基组成中,5.8S和28S的GC含量(58.1%~59.4%)高于AT含量,也高于ITS2的GC含量(51.3%~52.0%),ITS2的GC含量与AT含量相差不大。碱基组成中5.8S的A碱基含量较低,28S的T碱基含量较低,存在较大的碱基偏倚性。3个地理群体内和群体间的遗传距离都很小(0.010~0.013),且相互重叠。从基因型数据看,3个群体既有各自独立的基因型,也有共享基因型。但从序列的碱基变异数据看,3个群体没有各自独有的突变位点。上述结果表明,3个地理群体既具有丰富的遗传多样性,又具有高度的遗传一致性,即亲缘关系近,可能存在基因交流,或者分化时间不长。丰富的遗传多样性有利于合浦珠母贝的遗传选育。
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关键词
合浦珠母贝
内部转录间隔子
DNA序列分析
地理亲缘关系
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职称材料
陕西太白山自然保护区蕨类植物区系研究
被引量:
4
3
作者
刘均阳
刘建军
韩其晟
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期77-83,共7页
对太白山自然保护区蕨类植物区系进行了初步的研究。结果表明:太白山共有蕨类植物21科、39属、110种,并且优势科属明显,蹄盖蕨科、鳞毛蕨科、水龙骨科为优势科,卷柏属、铁线蕨属、耳蕨属、瓦韦属、鳞毛蕨属、铁角蕨属为优势属;科的地理...
对太白山自然保护区蕨类植物区系进行了初步的研究。结果表明:太白山共有蕨类植物21科、39属、110种,并且优势科属明显,蹄盖蕨科、鳞毛蕨科、水龙骨科为优势科,卷柏属、铁线蕨属、耳蕨属、瓦韦属、鳞毛蕨属、铁角蕨属为优势属;科的地理分布主要以世界分布为主,占该区总科数的47.6%,属的分布以温带成分为主,占总属数的58.3%,种的地理分布也以温带分布为主,占总种数的48.2%;该区在地理亲缘关系上与河南伏牛山和陕西化龙山最为密切,与四川唐家河、山西五鹿山、北京松山、河北茅荆坝、湖北神农架为其次,与湖南壶瓶山、甘肃祁连山较为疏远,与宁夏南华山的的联系最为疏远。
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关键词
太白山自然保护区
蕨类植物
区系分析
地理亲缘关系
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职称材料
题名
Goniurosaurus indet.的有效性及中国睑虎属(Squamata:Sauria:Eublepharidae)种间的亲缘关系
被引量:
5
1
作者
张洁
庆宁
易祖盛
王英勇
江晓汕
卢文华
James Lazell
机构
华南师范大学生命科学学院
广州大学生命科学学院
中山大学生命科学学院生物博物馆
华南农业大学生命科学学院
美国罗德岛州生物保护所
出处
《华南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2014年第2期92-98,共7页
基金
广东省自然科学基金项目(06025054)
美国the Falconwood Foundation项目
文摘
了解我国睑虎属Goniurosaurus(Squamata:Sauria:Eublepharidae)种间的亲缘关系以及广东新纪录的睑虎属未定种Goniurosaurus indet.的有效性,对睑虎属10个种的线粒体DNA基因片段比较和遗传变异分析.获得12S rRNA(385 bp)和16S rRNA(477 bp)总长度为862 bp的联合序列,共有核苷酸变异位点388个,简约信息位点269个.选取大壁虎Gekko gecko为外类群,采用贝叶斯演绎法(BI)、最大似然法(ML)、最大简约法(MP)、邻接法(NJ)对两个基因联合序列的分析均显示相同结果,即广东睑虎属未定种Goniurosaurus indet.与英德睑虎G.yingdeensis以及凭祥睑虎G.luii与蛛纹睑虎G.araneus两两种间的亲缘关系较近;且分布区相邻的Goniurosaurus indet.与G.yingdeensis之间的遗传分化(遗传距离=0.044-0.046)相似于分类地位已经明确的G.luii与G.araneus种间的遗传差异(遗传距离=0.051).结合形态学研究结果,认为Goniurosaurus indet.和G.yingdeensis之间已发生显著的遗传差异,前者可能为睑虎属新种.同时,系统发育分析表明海南睑虎G.hainanensis与睑虎属其它物种之间的遗传分化较大,系统发育地位最为特殊.系统发育分析进一步表明具4条背部横纹是祖征,具5条背部横纹为衍征.该文首次提出宽阔的河流可能是造成睑虎种群分化和新种形成的重要地理屏障.这一"河流隔离"观点对全球睑虎属物种的亲缘地理分布格局的解释具有重要的理论意义.
关键词
睑虎属
线粒体DNA
地理亲缘关系
河流隔离
Keywords
leopard gecko
mtDNA
phylogeography
separation by river
分类号
Q958.2 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
中国、日本和澳大利亚珍珠贝的ITS2序列特征分析
被引量:
18
2
作者
喻达辉
李有宁
吴开畅
机构
中国水产科学研究院南海水产研究所
出处
《南方水产》
2005年第2期1-6,共6页
基金
国家"863"重大项目(2002AA603022)
广东省科技计划项目(2002B2150101)
广东省自然科学基金项目(037148)
文摘
对中国、日本和澳大利亚的珍珠贝核糖体DNA第二内部转录间隔子(ITS2)的序列特征进行了分析。PCR扩增产物包括5.8S基因部分序列、ITS2基因和28S基因部分序列。去除引物序列后5.8S基因片段长64bp,ITS2长230~237bp,28S基因片段长249bp。共分析了16个基因型的序列特征,结果表明,5.8S和28S基因片段高度保守,仅28S有1个碱基位点突变;而ITS2变异大,237个比对位点中有20个位点发生突变,其中12个位点为缺失/插入突变,4个简约信息位点。在碱基组成中,5.8S和28S的GC含量(58.1%~59.4%)高于AT含量,也高于ITS2的GC含量(51.3%~52.0%),ITS2的GC含量与AT含量相差不大。碱基组成中5.8S的A碱基含量较低,28S的T碱基含量较低,存在较大的碱基偏倚性。3个地理群体内和群体间的遗传距离都很小(0.010~0.013),且相互重叠。从基因型数据看,3个群体既有各自独立的基因型,也有共享基因型。但从序列的碱基变异数据看,3个群体没有各自独有的突变位点。上述结果表明,3个地理群体既具有丰富的遗传多样性,又具有高度的遗传一致性,即亲缘关系近,可能存在基因交流,或者分化时间不长。丰富的遗传多样性有利于合浦珠母贝的遗传选育。
关键词
合浦珠母贝
内部转录间隔子
DNA序列分析
地理亲缘关系
Keywords
Pinctada fucata
ITS 2
DNA sequence analysis
phylogeography
分类号
Q523.8 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
陕西太白山自然保护区蕨类植物区系研究
被引量:
4
3
作者
刘均阳
刘建军
韩其晟
机构
西北农林科技大学林学院
出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期77-83,共7页
基金
国家林业局公益性项目(200904004)
文摘
对太白山自然保护区蕨类植物区系进行了初步的研究。结果表明:太白山共有蕨类植物21科、39属、110种,并且优势科属明显,蹄盖蕨科、鳞毛蕨科、水龙骨科为优势科,卷柏属、铁线蕨属、耳蕨属、瓦韦属、鳞毛蕨属、铁角蕨属为优势属;科的地理分布主要以世界分布为主,占该区总科数的47.6%,属的分布以温带成分为主,占总属数的58.3%,种的地理分布也以温带分布为主,占总种数的48.2%;该区在地理亲缘关系上与河南伏牛山和陕西化龙山最为密切,与四川唐家河、山西五鹿山、北京松山、河北茅荆坝、湖北神农架为其次,与湖南壶瓶山、甘肃祁连山较为疏远,与宁夏南华山的的联系最为疏远。
关键词
太白山自然保护区
蕨类植物
区系分析
地理亲缘关系
Keywords
Taibaishan Nature Reserve
Pteridophyte
floristic analysis
geographical kinship
分类号
Q948 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
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被引量
操作
1
Goniurosaurus indet.的有效性及中国睑虎属(Squamata:Sauria:Eublepharidae)种间的亲缘关系
张洁
庆宁
易祖盛
王英勇
江晓汕
卢文华
James Lazell
《华南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2014
5
下载PDF
职称材料
2
中国、日本和澳大利亚珍珠贝的ITS2序列特征分析
喻达辉
李有宁
吴开畅
《南方水产》
2005
18
下载PDF
职称材料
3
陕西太白山自然保护区蕨类植物区系研究
刘均阳
刘建军
韩其晟
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2014
4
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职称材料
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