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埃可病毒11型分离株的分子流行病学研究 被引量:3
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作者 姚学君 管书慧 +3 位作者 陈国清 李峰 刘秀兰 沈进进 《江苏预防医学》 CAS 2020年第2期125-129,共5页
目的分析埃可病毒11型(Echovirus 11,Echo11)分离株全长VP1区序列的遗传进化规律和流行趋势。方法从GenBank下载全球Echo11型病毒分离株全长VP1区序列,采用生物信息学技术手段构建进化树、测算序列同源性、预测正向选择位点、计算氨基... 目的分析埃可病毒11型(Echovirus 11,Echo11)分离株全长VP1区序列的遗传进化规律和流行趋势。方法从GenBank下载全球Echo11型病毒分离株全长VP1区序列,采用生物信息学技术手段构建进化树、测算序列同源性、预测正向选择位点、计算氨基酸置换熵值。结果合计纳入433株Echo11型病毒分离株,毒株来源于34个国家,时间跨度为1953—2018年;上传地区前3位是中国(143株,占33.0%)、俄罗斯(91株,占21.0%)和日本(36株,占8.3%);基因型A和D为流行优势株。433株分离株VP1区核苷酸和氨基酸序列平均同源性分别为81.9%和92.0%。不同基因型间平均同源性分别为75.6%~81.1%和86.8%~93.0%。核苷酸碱基总突变数10 844bp,总突变率2.9%;276位氨基酸为正向选择位点,存在34个氨基酸易突变位点,易突变率11.6%。结论全球Echo11型病毒存在不同基因型分离株循环流行,分子亲缘性较远。 展开更多
关键词 埃可病毒11 分子流行病学 VP1区 生物信息学
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6例新生儿埃可病毒11型感染的临床特点 被引量:3
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作者 王萍 潘翩翩 +3 位作者 黄龙光 尧杰 黄大彬 周伟 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第20期2806-2809,共4页
目的总结同源新生儿埃可病毒11型(Echovirus type 11,ECHO11)感染新生儿资料,为救治重症病例提供依据。方法选取2019年6月同一医院同间病房转入广州市妇女儿童医疗中心NICU的ECHO11患儿资料进行研究。结果 6例患儿与病毒感染相关的起病... 目的总结同源新生儿埃可病毒11型(Echovirus type 11,ECHO11)感染新生儿资料,为救治重症病例提供依据。方法选取2019年6月同一医院同间病房转入广州市妇女儿童医疗中心NICU的ECHO11患儿资料进行研究。结果 6例患儿与病毒感染相关的起病日龄为1~16 d,首发症状是呕吐(50%)和发热(50%),病程早期出现血小板减少(100%),合并自身免疫性溶血病患儿(100%)。重症3例,谷丙转氨酶(ALT)、总胆红素(TBIL)升高,凝血功能异常。血浆置换后ALT(H=20.0,P<0.05)、TBIL(t=17.5,P<0.01)显著下降,凝血酶时间(PT)缩短(H=20.5,P<0.05)。结论新生儿感染ECHO11可引发免疫性血小板降低和自身免疫性溶血压;早期、多次使用血液净化治疗可能改善预后。自身免疫反应可能是造成重症病例的原因。 展开更多
关键词 埃可病毒11 新生儿 临床特点 自身免疫性溶血 血浆置换
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云南省2022年手足口病病例中2株埃可病毒11型VP1区基因特征分析
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作者 罗春蕊 徐敏 +7 位作者 姜黎黎 寸建萍 杨溪 周晓芳 曹亿会 伏晓庆 田炳均 罗定富 《中国病毒病杂志》 CAS 2024年第1期59-65,共7页
目的对云南省2022年从手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例中分离到的2株埃可病毒11型(echovirus 11,E11)进行分子生物学鉴定并对它们的VP1区基因特征进行分析。方法对2022年云南省手足口病实验室监测网络收集到的手足口病... 目的对云南省2022年从手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例中分离到的2株埃可病毒11型(echovirus 11,E11)进行分子生物学鉴定并对它们的VP1区基因特征进行分析。方法对2022年云南省手足口病实验室监测网络收集到的手足口病病例粪便标本进行病毒分离,对阳性标本先进行VP4/VP2结合区逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)和基因测序定型,再对VP4/VP2结合区初步定型的标本进行VP1区RT-PCR和测序,用MEGA 7.0软件构建病毒VP1区基因进化树,进行基因特征分析。结果2022年从云南省手足口病病例粪便标本中检测到2株E11病毒,VP1区基因序列同源性分析结果表明,2株病毒最接近3株在欧洲葡萄膜炎(uveitis)病例中分离的病毒。本研究分离的2株病毒与欧洲3株病毒之间核苷酸相似性(nucleotide,nt)和氨基酸(amino acid,aa)同源性分别为84.37%(差异率15.63%)和95.21%(差异率4.79%)。云南2株和E11原始株(Silva)之间的核苷酸相似性为80.03%(差异率为19.97%),氨基酸同源性为93.50%(差异率6.50%),与原型株(Gregory)的核苷酸相似性为76.95%(差异率23.05%),氨基酸同源性为88.02%(差异率11.98%)。本次云南分离的2株E11为D5亚型。结论2022年云南省手足口病实验室检测到的2株E11为D5亚型,是目前云南和整个中国最为流行的基因亚型。应进一步加强对非脊灰肠道病毒(non-polio enteroviruses,NPEVs)和非EV-A71、非CVA16等手足口病中“其他肠道病毒”(other enteroviruses)尤其是E11病毒的分子生物学检测。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒 埃可病毒11 基因特征分析
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2021年广东省广州市一株埃可病毒11型菌株的分离与鉴定
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作者 李贝杰 陈澜 +4 位作者 范前进 刘文宽 孙晖 郑雅匀 罗雪莲 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期655-660,共6页
目的探索疑似埃可病毒病原体感染标本的分离鉴定,了解埃可病毒11型(ECHO 11)生长特性及进化特征。方法将2021年广东省广州市发热、急性扁桃体炎患儿的咽拭子标本接种人横纹肌肉瘤细胞(RD)进行病毒分离培养通过巢式反转录聚合酶链反应及... 目的探索疑似埃可病毒病原体感染标本的分离鉴定,了解埃可病毒11型(ECHO 11)生长特性及进化特征。方法将2021年广东省广州市发热、急性扁桃体炎患儿的咽拭子标本接种人横纹肌肉瘤细胞(RD)进行病毒分离培养通过巢式反转录聚合酶链反应及一步法聚合酶链反应等方法对疑似埃可病毒病原体进行鉴定;扩增分离株VP1基因全长序列,选择全球有代表性流行株,绘制进化树,确定分离株的基因型并研究分离株在细胞中的生长动力学。结果从患者咽拭子标本中分离出ECHO 11毒株,命名为Qi-2023。分离株在RD细胞中能有效增殖,病毒滴度随着复制时间的增加而上升,3~12 h之间病毒增殖最快。进化树结果表明该分离株与D型代表株聚类在一起,VP1基因核苷酸相似性为84.42%~99.08%。且与D5亚型同源性最高,VP1基因核苷酸相似性99.08%。结论从疑似肠道病毒感染患者的咽拭子中成功分离出一株ECHO 11,为D5亚型。这些研究将为ECHO 11感染防控提供实验室数据参考。 展开更多
关键词 肠道病毒 埃可病毒11 分离鉴定 VP1基因
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2020年西藏自治区0~5岁健康儿童携带埃可病毒11型的基因特征分析
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作者 红梅 刘莹 +13 位作者 顿珠多吉 李冀琛 索朗德吉 罗央措 杨婷婷 丛如意 肖金波 王琴 代国龙 旦增曲扎 孙强 许文波 张勇 彭措次仁 《国际病毒学杂志》 2023年第3期187-191,共5页
目的本研究旨在通过对2020年西藏自治区5岁以下健康儿童中携带埃可病毒11型(echovirus11,E11)的基因特征进行研究,掌握肠道病毒的流行情况,填补西藏自治区关于E11基因特征研究的空白。方法收集2020年在中国西藏自治区内采集的0~5岁健康... 目的本研究旨在通过对2020年西藏自治区5岁以下健康儿童中携带埃可病毒11型(echovirus11,E11)的基因特征进行研究,掌握肠道病毒的流行情况,填补西藏自治区关于E11基因特征研究的空白。方法收集2020年在中国西藏自治区内采集的0~5岁健康儿童的粪便标本,通过病毒分离和肠道病毒分子定型方法,对阳性病毒分离物进行肠道病毒血清型鉴定,并对鉴定结果为E11的病毒分离物进行全长VP1区扩增及核苷酸序列测定和分析。使用MEGA软件构建基因进化树(最大似然法),与中国其他省份E11和全球E11进行遗传进化分析。结果574份粪便标本中分离到89株肠道病毒分离株,其中E11有44株,是主要的血清型,VP1区核苷酸序列之间的相似性为96.4%~100%,在系统发育树上呈现为多个传播链,但均属于D5基因亚型,且与我国2017年后其它省份E11流行株聚为一簇。结论本研究获得了我国西藏自治区流行的E11的基因特征的基本信息,并了解了全球E11的基因型分布。 展开更多
关键词 西藏自治区 埃可病毒11 基因特征
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病毒性脑炎病例中埃可病毒11型病毒的基因特征分析 被引量:12
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作者 陈前进 曹春远 +5 位作者 张彦锋 何春荣 罗招福 何云 廖亦红 吴水新 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期36-41,共6页
分析埃可病毒11型(Echovirus 11,ECHO11)福建龙岩分离株的分子生物学特征。收集龙岩市第一医院2011年1~12月临床诊断为病毒性脑炎或中枢神经系统感染的住院病例脑脊液标本进行病毒分离鉴定,从7株经血清中和鉴定的ECHO11分离株中,... 分析埃可病毒11型(Echovirus 11,ECHO11)福建龙岩分离株的分子生物学特征。收集龙岩市第一医院2011年1~12月临床诊断为病毒性脑炎或中枢神经系统感染的住院病例脑脊液标本进行病毒分离鉴定,从7株经血清中和鉴定的ECHO11分离株中,选取4株测定VP1完整编码区序列,与GenBank上已发表的ECHO11型病毒VP1区进行同源性比较及遗传进化分析。4株ECHO11分离株VP1区序列长度为600个核苷酸,编码200个氨基酸;4株之间的核苷酸同源性为100%,氨基酸同源性为99%~100%;与1953年Gregory原型株之间的核苷酸同源性为75%~76%,氨基酸同源性为90%;与2007年荷兰株(GU393773)之间核苷酸的同源性为94%~95%,氨基酸同源性为98%~99%,同源性最高;与国内2010年山东株之间核苷酸的同源性为74%,氨基酸同源性为88%~89%。系统进化树分析显示,4株龙岩分离株同属D5型,其与D5型病毒株(GU393713)之间核苷酸的同源性为93%,氨基酸同源性为99%。国内分离株之间相对较低的相似性提示国内ECHO11病毒可能存在不同的传播链。 展开更多
关键词 病毒性脑炎 埃可病毒11 基因特征
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云南省4株埃可病毒11型VP1基因特征分析 被引量:2
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作者 周晓芳 寸建萍 +3 位作者 姜黎黎 徐闻 伏晓庆 向以斌 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期140-145,共6页
埃可病毒11型(Echovirus 11,ECHO11)属于肠道病毒B组,是最常见的人类肠道病毒(Human enterovirus,HEV)之一,常引起儿童无菌性脑膜炎、脑炎和急性迟缓性麻痹等疾病。为了对云南省手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)监测中分离到... 埃可病毒11型(Echovirus 11,ECHO11)属于肠道病毒B组,是最常见的人类肠道病毒(Human enterovirus,HEV)之一,常引起儿童无菌性脑膜炎、脑炎和急性迟缓性麻痹等疾病。为了对云南省手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)监测中分离到的4株ECHO11毒株的VP1基因进行序列分析,并为云南地区ECHO11的进化及流行趋势等研究提供基础数据,本研究对收集到的HFMD病例标本进行病毒分离培养和鉴定,对鉴定为ECHO11的毒株VP1基因测定其完整序列,与GenBank上其他参考株的VP1区序列构建遗传进化树进行基因分析。结果显示,4株ECHO11型毒株分属A1和D5两个基因亚型,分别与各自基因亚型参考株的同源性为最高。D5基因亚型ECHO11分离株在进化树上聚集为3簇,提示存在多个传播链,其D5-1簇的VP1区氨基酸在多个位点上与同基因亚型的其他簇参考株存在特异突变。本研究揭示,云南地区存在两种不同基因亚型的ECHO11流行情况,特别是D5亚型的出现,提示我国周边流行的ECHO11基因型已进入中国大陆,应密切关注其流行变异情况,为今后制定由ECHO11引起的HFMD的公共卫生策略提供依据。 展开更多
关键词 手足口病(HFMD) 埃可病毒11(echo11) VP1基因
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埃可病毒11型山东株分子流行病学研究 被引量:8
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作者 樊庆莹 王海岩 +10 位作者 杨赫 冯艺 张岩 李岩 陶泽新 纪峰 宋立志 刘桂芳 刘尧 冯蕾 徐爱强 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期155-158,共4页
目的 分析埃可病毒11型(Echo11)山东分离株的分子流行病学特征.方法 对1994-2009年山东省急性弛缓性麻痹监测系统中采集到的粪便标本,采用RD、Hep-2和L20B 3种细胞进行病毒分离;对阳性分离物采用中和试验确定其血清型别;选取27株Echo1... 目的 分析埃可病毒11型(Echo11)山东分离株的分子流行病学特征.方法 对1994-2009年山东省急性弛缓性麻痹监测系统中采集到的粪便标本,采用RD、Hep-2和L20B 3种细胞进行病毒分离;对阳性分离物采用中和试验确定其血清型别;选取27株Echo11山东株病毒,测定VP1完整编码区序列,与国外其他病毒株进行同源性分析并构建VP1区全基因亲缘进化树,分析其进化来源及不同基因型的流行范围.结果 1994-2009年山东省急性弛缓性麻痹病例标本共分离出 915株已确定血清型的非脊髓灰质炎肠道病毒(NPEV),其中Echo11 79株,占8.6%.Echo11山东株VP1区全长共876个核苷酸,编码292个氨基酸;27株Echo11 VP1区山东株之间核苷酸同源性为76.4%~100.0%,氨基酸同源性为91.4%~100.0%;与原型Gregory株之间核苷酸同源性为77.7%~80.7%,氨基酸同源性为90.7%~94.8%.结论 山东省存在Echo11 A基因型和C基因型流行,并构成A1、A2和C1三个新基因亚型,且不同亚型内存在着多条传播链,A1亚型为近年山东省流行的基因亚型. 展开更多
关键词 埃可病毒11 基因特征 分子流行病学
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基于环境污水监测的埃可病毒11型的循环动态变化及其基因特征分析 被引量:5
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作者 李文凤 陶泽新 +7 位作者 杨静 林小娟 刘尧 纪峰 王海岩 王素婷 宋立志 徐爱强 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期561-566,共6页
为探讨山东省环境污水监测中埃可病毒11型(Echovirus 11,Echo11)的动态变化及分子流行病学特征,本研究对山东省2011~2012年环境污水监测分离到的Echo11毒株进行了VP1区核酸扩增和序列测定,并与1994~2010年山东省急性弛缓性麻痹(Acute... 为探讨山东省环境污水监测中埃可病毒11型(Echovirus 11,Echo11)的动态变化及分子流行病学特征,本研究对山东省2011~2012年环境污水监测分离到的Echo11毒株进行了VP1区核酸扩增和序列测定,并与1994~2010年山东省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)监测系统中Echo11分离株以及国外同型毒株进行同源性分析和系统发生学分析。结果显示:2011~2012年山东省济南市和临沂市共分离到Echo11 94株,其时间分布具有季节性特征,夏秋季高峰明显。分离毒株之间核苷酸和氨基酸同源性分别为89.5%~100.0%和95.4%~100.0%;与原型株(Gregory)之间核苷酸和氨基酸同源性分别为76.6%~79.7%和90.4%~92.5%。山东环境分离株全部属于A基因型,毒株之间核苷酸变异较大,提示山东地区存在多个传播链共循环。本研究描述了山东省环境污水中Echo11分离株的动态变化和遗传特征,结果证明环境污水监测是探索人类肠道病毒动态流行和遗传变异的重要手段。 展开更多
关键词 埃可病毒11 基因特征 分子流行病学 环境监测
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上海市环境污水监测埃可病毒11型基因特征和循环动态 被引量:3
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作者 李云逸 陆菁 +5 位作者 杨玉颖 费洁 张莉萍 李智 胡家瑜 李崇山 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2020年第3期270-275,共6页
目的探讨基于上海市环境污水监测中埃可病毒11型(echovirus 11,Echo11)的基因特征和循环动态变化。方法本研究对上海市2012—2019年环境污水监测获得的Echo11分离株进行了VP1区核酸扩增和序列测定,结合上海市急性弛缓性麻痹(acute flacc... 目的探讨基于上海市环境污水监测中埃可病毒11型(echovirus 11,Echo11)的基因特征和循环动态变化。方法本研究对上海市2012—2019年环境污水监测获得的Echo11分离株进行了VP1区核酸扩增和序列测定,结合上海市急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)监测系统和健康儿童肠道病毒监测中Echo11分离株以及Echo11参考株进行序列同源性分析和系统发生学分析。结果上海市3个监测系统来源Echo11分离株共有156株,其中2012—2019年环境污水共分离到136株,其流行高峰主要集中在夏秋季。上海市不同来源Echo11分离株进化速度较快,有40.3%存在第54位氨基酸位点突变。上海市不同来源Echo11共有5个基因亚型传播链,即A1、A2、C1、C3和D5基因亚型。2012年,环境污水、AFP病例和健康儿童之间存在A1基因亚型Echo11共循环现象。2012—2015年的优势传播链为A1基因亚型,从2016年开始,优势传播链逐渐变为D5基因亚型。结论环境污水监测真实反映人类肠道病毒(human enterovirus,HEV)的循环状况,对于HEV相关疾病预测预警具有实际意义。 展开更多
关键词 埃可病毒11 监测 基因特征 循环
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2019年广东省新生儿埃可病毒11型感染事件病原检测结果分析 被引量:3
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作者 陈晓丽 曾汉日 +6 位作者 郑焕英 林穗彬 李彩霞 刘冷 杨芬 李晖 邓小玲 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期281-286,共6页
目的:分析2019年广东省两起医疗机构新生儿肠道病毒感染暴发事件实验室检测结果及埃可病毒11型(Echovirus 11, Echo11)基因特性,为新生儿肠道病毒感染防控提供依据。方法:收集疑似肠道病毒感染新生儿病例病原学标本,采用荧光定量PCR和... 目的:分析2019年广东省两起医疗机构新生儿肠道病毒感染暴发事件实验室检测结果及埃可病毒11型(Echovirus 11, Echo11)基因特性,为新生儿肠道病毒感染防控提供依据。方法:收集疑似肠道病毒感染新生儿病例病原学标本,采用荧光定量PCR和基因测序两种方法进行肠道病毒分型鉴定,对阳性标本开展病毒分离,对Echo11的VP1基因进行全长序列测定并运用Danstar6、Bioedit7.09和MEGA6.06等生物信息学软件开展遗传进化分析。结果:收集到36例新生儿病例的93份标本,经鉴定,24例55份标本肠道病毒阳性,其中23例为Echo11阳性,1例为柯萨奇病毒B组4型(CVB4)阳性。从19例病例标本中分离到肠道病毒29株,其中18例28株为Echo11,1例1株为CVB4。VP1全长序列分析发现,本研究18株Echo11核苷酸同源性为98.2%~100.0%,两起新生儿感染事件Echo11的核苷酸同源性分别为99.7%~100.0%和99.8%~100.0%,均高度同源;Echo11可分为A、B、C、D、E和F共6个基因型,其中A基因型包含5个亚型(A1~A5),C基因型包含4个亚型(C1~C4),D基因型可分为等5个亚型(D1~D5),本研究18株Echo11均为D5亚型。结论:2019年广东省两起医疗机构新生儿感染暴发事件均由肠道病毒Echo11引起,均属于D5基因亚型。 展开更多
关键词 肠道病毒 埃可病毒11 新生儿 医疗机构
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广州市生活污水中埃可病毒11型循环动态变化及基因特征分析 被引量:2
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作者 黄淑芬 张薇 +8 位作者 陈美钟 郭雪 祝双利 李彩霞 曾汉日 方苓 张勇 郑焕英 邓小玲 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期1108-1116,共9页
埃可病毒11型(Echovirus 11,E11)属于B组肠道病毒,是最常见的人类肠道病毒(Enterovirus,EV)之一,是引起无菌性脑膜炎,新生儿感染的重要病原体之一。为探讨广州市生活污水监测中E11分离株循环动态变化及其基因组特征,本研究对2009-2021... 埃可病毒11型(Echovirus 11,E11)属于B组肠道病毒,是最常见的人类肠道病毒(Enterovirus,EV)之一,是引起无菌性脑膜炎,新生儿感染的重要病原体之一。为探讨广州市生活污水监测中E11分离株循环动态变化及其基因组特征,本研究对2009-2021年广州市生活污水EV监测获得的E11分离株进行VP1区基因扩增及测序,结合2019年广东省发生的两起E11新生儿感染事件及部分散发病例中获得的E11分离株,与全球E11参考株进行序列相似性分析和系统发生学分析。结果显示,2009-2021年生活污水EV监测中E11分离株的核苷酸及氨基酸相似性分别为72.8%~99.3%和84.5%~99.6%。监测发现,广州市2018-2019年在污水中检出大量E11,与两起新生儿感染事件及散发病例的分离株核苷酸相似性高达96.2%~99.2%,但序列间仍存在差异,两起新生儿感染及散发病例感染的毒株为不同来源。通过系统进化树分析发现,2018-2019年污水E11分离株及两起新生儿感染与散发病例E11亲缘关系较近,分子分型结果均为E11 D5基因型。2017年及以前的污水分离株以A1基因型为主,但也有C3和D5基因型,2018年开始则以D5基因型为主,与同时期EV感染病例基因型结果一致。而在2021年污水中则发现了E11 E基因型,但广州暂未有该基因型的感染病例报道,仍需持续进行病例和环境监测。结果表明,生活污水监测能够及时反映EV在环境和人群中的循环动态变化,对EV引起的相关疾病起到预测预警作用。 展开更多
关键词 埃可病毒11 污水监测 基因特征 循环动态变化
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湖北襄阳2016-2017年埃可病毒11型流行株基因特征分析 被引量:3
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作者 魏真妮 钱莎莎 +10 位作者 童叶青 徐长征 卢佳 郭靖 王文辉 周艳萍 王泽鋆 孟胜利 陈晓琦 官旭华 申硕 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期133-142,共10页
目的对2016—2017年中国湖北襄阳地区分离的埃可病毒11型(Echovirus 11,Echo11)基于VP1基因进行分子进化特征分析。方法采集2016—2017年中国湖北襄阳地区手足口病患儿肛拭子或咽拭子标本,应用real-time RT-PCR技术对肠道病毒阳性样本... 目的对2016—2017年中国湖北襄阳地区分离的埃可病毒11型(Echovirus 11,Echo11)基于VP1基因进行分子进化特征分析。方法采集2016—2017年中国湖北襄阳地区手足口病患儿肛拭子或咽拭子标本,应用real-time RT-PCR技术对肠道病毒阳性样本进行筛选,对肛拭子或咽拭子样本进行病毒分离。采用常规RT-PCR方法对在人横纹肌瘤细胞上分离的Echo11病毒襄阳流行株VP1区和3株代表株全长基因扩增并进行序列分析,使用DNAStar7.0软件包中的MegAlign、MEGA6.0中的Data和Phylogeny软件对核苷酸和氨基酸序列同源性、突变位点进行分析和构建系统进化树等。使用SimPlot软件进行重组分析,对3株代表株全长序列和GenBank中下载的核苷酸序列进行BootScan扫描,生成相似性图。结果本研究从3494份手足口病患儿样本中共分离出Echo11病毒11株,占比0.31%。11株Echo11流行株的VP1基因同源性比较高。核酸序列和氨基酸序列同源性分别为98.4%~100.0%和98.3%~100.0%。11株Echo11襄阳流行株与Echo11原型株(Echo11/Gregory,X80059)核酸序列和氨基酸序列同源性分别为73.9%~74.8%和87.7%~88.7%。襄阳地区流行的Echo11毒株均属于D进化分支,与中国大陆部分地区2013年以来的流行株亲缘关系相近。襄阳流行株和2010年Echo1河南流行株和2015年的Echo6湖北流行株在多个区域有较高的相似度,说明襄阳流行株基因组的多个区域可能发生了重组。结论襄阳地区流行的Echo11毒株均属于D进化分支,2016—2017年襄阳地区流行的Echo11是重组株。 展开更多
关键词 埃可病毒11 VP1 进化分析 肠道病毒 重组
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埃可病毒11型利用双受体CD55和FcRn侵染细胞的分子结构基础
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作者 牛胜 刘闯 +7 位作者 刘聪聪 刘升 宋洋 张勇 田文霞 赵欣 王培毅 高福 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第1期67-79,共13页
埃可病毒11型属于小RNA病毒科,肠道病毒属,是B族肠道病毒中的一个重要血清型.埃可病毒11型可导致儿童和青少年脑炎和脑膜炎等疾病,在婴儿和新生儿中导致重症感染甚至致命的病例也时有报道.此外,埃可病毒11型还多次在新生儿和婴幼儿群体... 埃可病毒11型属于小RNA病毒科,肠道病毒属,是B族肠道病毒中的一个重要血清型.埃可病毒11型可导致儿童和青少年脑炎和脑膜炎等疾病,在婴儿和新生儿中导致重症感染甚至致命的病例也时有报道.此外,埃可病毒11型还多次在新生儿和婴幼儿群体中引起暴发性感染,如2019年中国广东省发生的院内感染暴发事件,造成了19例新生儿的感染和5例死亡,严重威胁人类健康和公共卫生安全.CD55是20世纪90年代初发现的部分埃可病毒的吸附受体,该受体可以帮助病毒吸附在细胞表面,但并不能介导病毒完成完整的入侵过程.我们在2019年的研究中,发现了人新生儿Fc受体(neonatal Fc receptor,FcRn)是B族肠道病毒的通用脱衣壳受体,并以埃可病毒6型为例解析了病毒入侵机制.本研究利用冷冻电子显微镜技术,解析了埃可病毒11型在入侵过程中不同pH条件下各阶段的病毒颗粒结构,以及病毒与两受体的复合物,共10个原子或近原子水平高分辨率冷冻电子显微镜结构,并结合表面等离子共振(surface plasmon resonance,SPR)和脂质体模拟试验等分子水平试验,系统地阐述了埃可病毒11型利用CD55和FcRn"双受体系统"入侵细胞的分子机制.埃可病毒11型利用其VP2、VP3结构域与吸附受体CD55的3、4两个短同源重复(short consensus repeat,SCR)结构域结合,结合后病毒颗粒不发生变构.病毒与脱衣壳受体Fc Rn结合之后,开始发生变构,并可在脂质体膜的辅助作用下释放遗传物质完成脱衣壳.与埃可病毒6型不同的是,埃可病毒11型结合FcRn之后在中性条件下即可起始变构.本项研究解析了重要病原埃可病毒11型侵染细胞的分子结构基础,并进一步完善了非囊膜病毒的"双受体"入侵模型. 展开更多
关键词 埃可病毒11 肠道病毒 冷冻电子显微镜 入侵 双受体系统 CD55 FCRN
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埃可病毒11型感染RD细胞的转录组学分析及PLK1对其感染影响的初步探究
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作者 张国艳 李冀琛 +3 位作者 张珂艺 孙强 张勇 武桂珍 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2021年第6期605-611,共7页
目的探究埃可病毒11型(echovirus 11,E11)感染人横纹肌肉瘤细胞(human rhabdomyosarcoma cells,RD)后细胞内宿主因子在转录水平上的变化,初步了解Polo样激酶1(polo-like kinase 1,PLK1)对E11复制的影响及可能的分子机制。方法利用转录... 目的探究埃可病毒11型(echovirus 11,E11)感染人横纹肌肉瘤细胞(human rhabdomyosarcoma cells,RD)后细胞内宿主因子在转录水平上的变化,初步了解Polo样激酶1(polo-like kinase 1,PLK1)对E11复制的影响及可能的分子机制。方法利用转录组测序(RNA-Seq技术)对E11感染RD细胞组和RD细胞对照组进行差异表达基因分析。使用基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析显著差异表达基因,利用实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time PCR,qPCR)对代表性差异基因的表达水平进行验证,并初步探究抑制PLK1对E11复制的影响。结果E11感染RD细胞后,共鉴定出3726个差异表达基因,感染组(感染后12 h、24 h和48 h)共同显著差异表达基因484个,这些显著差异表达基因主要富集在免疫反应、细胞内信号转导、转录因子活性、序列特异性DNA结合、蛋白激酶活性、核、膜的组成成分、PI3K-Akt信号通路等。使用qPCR对6个靶基因(CXCL14、IFITM1、OAS1、SAMD9、MX1和PLK1)的表达情况进行验证,均与RNA-Seq结果一致,其中CXCL14、IFITM1、OAS1、SAMD9、MX1表达上调倍数在1.2~104.97倍之间,PLK1表达下调倍数在0.99~5.79倍之间。抑制PLK1后,E11复制能力增加。结论炎症反应、PI3K-Akt、MAPK等通路可能在E11感染抗病毒免疫过程中发挥重要作用,此外,宿主因子PLK1可能通过调节细胞周期在E11感染中起到关键作用。 展开更多
关键词 埃可病毒11 转录组分析 POLO样激酶1 差异表达基因 宿主因子
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埃可病毒11型抗体的制备及其ELISA定量检测方法的建立、应用
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作者 张仲锴 魏真妮 +3 位作者 罗娜 吴杰 申硕 陈晓琦 《微生物学免疫学进展》 CAS 2022年第3期1-7,共7页
目的制备埃可病毒11型(Echovirus 11,Echo11)鼠单抗及兔多抗,建立Echo11抗原定量检测方法。方法以制备的Echo11病毒颗粒抗原作为免疫原,分别免疫BALB/c小鼠和家兔,制备Echo11鼠单抗和兔多抗。建立Echo11病毒抗原定量检测方法,对其进行... 目的制备埃可病毒11型(Echovirus 11,Echo11)鼠单抗及兔多抗,建立Echo11抗原定量检测方法。方法以制备的Echo11病毒颗粒抗原作为免疫原,分别免疫BALB/c小鼠和家兔,制备Echo11鼠单抗和兔多抗。建立Echo11病毒抗原定量检测方法,对其进行方法学验证和初步应用。结果分别制备了效价为1∶1×10^(6)和1∶1×10^(8)的Echo11兔多克隆抗体(多抗)及鼠单克隆抗体(单抗),建立了双抗夹心ELISA抗原定量检测方法,该方法在4.0~16.0μg/mL范围内线性关系良好,R^(2)>0.99;高、中、低3个浓度样品准确度验证回收率在96.9%~107.5%之间;板内精密度验证CV分别为7.4%、3.6%、4.2%;板间精密度验证CV分别为11.6%、6.8%、4.6%;特异性验证结果显示,制备的抗体与Echo11之外的抗原均无交叉反应;稳定性验证结果显示,样品CV均<3%。结论制备了Echo11鼠单抗及兔多抗,建立了Echo11抗原定量ELISA检测方法,该法可应用于Echo11病毒抗原制备过程中样品的检测,为Echo11疫苗的研发提供了质控方法。 展开更多
关键词 埃可病毒11 单克隆抗体 多克隆抗体 抗原定量检测
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2006—2020年四川省急性弛缓性麻痹病例埃可病毒的基因特征分析 被引量:1
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作者 陈娜 马小珍 +2 位作者 文海燕 王成 郝玉通 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2021年第6期419-422,共4页
目的了解四川省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例感染的不同型别埃可病毒的时间及地区分布,以及优势型别的基因特征。方法使用细胞培养法对2006—2020年四川省5089份AFP病例粪便标本进行病毒分离,并对分离的埃可病毒毒... 目的了解四川省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例感染的不同型别埃可病毒的时间及地区分布,以及优势型别的基因特征。方法使用细胞培养法对2006—2020年四川省5089份AFP病例粪便标本进行病毒分离,并对分离的埃可病毒毒株进行VP1基因核苷酸序列测定及分析。结果分离到75株埃可病毒,经测序鉴定出18个型别,包括E1、E3、E6、E7、E11、E12、E13、E14、E16、E17、E18、E19、E20、E21、E24、E25、E30、E33,其中数量最多的是E11,占分离株数量的22.7%,其次是E6(20.0%)、E14(14.7%)、E3(9.3%)、E13(6.7%)等。四川省E11的优势流行株在2006—2010年为A1-2基因亚型,2015—2019年为D5基因亚型。结论2006—2020年四川省共分离鉴定出18个型别的埃可病毒,E11的优势流行株从A基因型转变为D基因型。 展开更多
关键词 埃可病毒 急性弛缓性麻痹 埃可病毒11 基因特征
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一种三氯生复方消毒剂对三种肠道病毒灭活效果的研究 被引量:2
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作者 张磊 纪洵敏 +6 位作者 周莹 彭拓华 郑小凌 李自强 张贤昌 张吉凯 钟昱文 《中国消毒学杂志》 CAS 2020年第5期323-325,共3页
目的观察一种三氯生复方消毒剂对3种肠道病毒的灭活效果。方法采用悬液定量灭活试验方法,对该复方消毒剂灭活3种肠道病毒的效果进行观察。结果该复方消毒剂含三氯生4000~5000 mg/L与体积分数75%~85%乙醇。以该复方消毒剂原液作用0.5 min... 目的观察一种三氯生复方消毒剂对3种肠道病毒的灭活效果。方法采用悬液定量灭活试验方法,对该复方消毒剂灭活3种肠道病毒的效果进行观察。结果该复方消毒剂含三氯生4000~5000 mg/L与体积分数75%~85%乙醇。以该复方消毒剂原液作用0.5 min,对悬液内脊髓灰质炎病毒I型、肠道病毒71型和埃可病毒11型平均灭活对数均>4.00。结论该复方消毒剂原液对3种肠道病毒具有快速灭活效果。 展开更多
关键词 三氯生 复方消毒剂 脊髓灰质炎病毒 肠道病毒71 埃可病毒11 灭活效果
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2023年6月全球传染病疫情概要 被引量:2
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作者 韩辉 伍波 +2 位作者 邵忠阁 贾娇娇 宋悦谦 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期762-764,共3页
2023年6月,全球共监测到传染病70种,涉及236个国家和地区。除流感外,涉及国家和地区数量位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染(236个)、猴痘(112个)、登革热(29个)、麻疹(27个)和霍乱(19个)。病死率位于前5位的传染病分别为马尔堡... 2023年6月,全球共监测到传染病70种,涉及236个国家和地区。除流感外,涉及国家和地区数量位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染(236个)、猴痘(112个)、登革热(29个)、麻疹(27个)和霍乱(19个)。病死率位于前5位的传染病分别为马尔堡病毒病(83.7%)、拉沙热(17.1%)、鼠疫(13.8%)、克里米亚–刚果出血热(7.9%)和脑膜炎(6.4%)。死亡病例数位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染、霍乱、麻疹、登革热和脑膜炎。亚洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、猴痘、克里米亚–刚果出血热和登革热;非洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、拉沙热、猴痘和脑膜炎;美洲主要流行新型冠状病毒感染、猴痘、登革热和基孔肯雅热;欧洲主要流行新型冠状病毒感染和侵袭性A群链球菌感染。 展开更多
关键词 冠状病毒感染 猴痘 登革热 克里米亚–刚果出血热 埃可病毒11感染
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