一株埃可病毒16型510/YN/CHN/2010的全基因组分析

目的分析一株埃可病毒16型(Echovirus 16,E16)云南分离株510/YN/CHN/2010全基因组序列及其遗传特性。方法设计针对E16的引物,提取病毒RNA,RT-PCR扩增病毒目的基因并测序,利用BioEdit 7.2.3、MEGA 7.0和Simplot 3.5.1软件分析其全基因组。结果E16510/YN/CHN/2010全基因组核苷酸序列全长7432 nt,是编码含2196个氨基酸的多聚蛋白。其全VP1和全基因组与原型株Harrington的核苷酸和氨基酸同源性分别为80.68%、49.33%和81.26%、97.26%。与其他埃可病毒原型株的全基因组核苷酸和氨基酸同源性分别为75.72%~88.44%和83.01%~87.65%。系统进化分析将E16分为3个基因型,分离株510/YN/CHN/2010和其他中国分离株均属于B基因型。重组分析显示,510/YN/CHN/2010株可能在非结构编码区的P2段重组。结论510/YN/CHN/2010分离株为E16 B基因型,可能为重组株。

肠道病毒B家族埃可病毒16(E16)型病毒样颗粒的结构解析

肠道病毒B家族是引发人类病毒性脑炎和脑膜炎的重要病原体之一.然而目前市场上尚缺乏针对此类病毒的特异性疫苗.病毒样颗粒具有保留病毒真实结构特点、不含病毒核酸、不具备病毒复制与感染能力的特征,为开发有效、稳定且安全的新型疫苗提供了理想方案,特别是针对无囊膜的肠道病毒.本研究中,基于昆虫细胞表达系统,经密度梯度离心等方法获得埃可病毒16(E16)型的病毒样颗粒(virus-like particle;VLP).借助冷冻电镜单颗粒技术,成功将该病毒VLP解析到原子分辨率(2.8?),结构分析显示:与同源病毒E30的结构相类似,E16-VLP具备肠道病毒所特有的能够引起机体产生特异性中和免疫反应的重要结构特征,具有较大的疫苗开发价值.本实验室建立的方法在抗肠道病毒B家族通用疫苗的设计与开发上具有巨大潜力.