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基于埋葬大鼠的骨骼微生物群落演替规律推断死亡时间
1
作者
王雅雅
张君
+4 位作者
余代静
漆小琴
王萌春
王艳
严江伟
《中国法医学杂志》
CSCD
2023年第5期541-545,共5页
目的 基于大鼠模型研究埋葬尸体骨骼微生物的群落演替规律,并以此推断死亡时间(PMI),为埋尸案件的死亡时间推断提供参考。方法 将20只大鼠埋葬于深度20 cm的土壤中,分别于5个时间点(7 d、14 d、30 d、45 d、60 d)采集上肢肱骨及下肢股骨...
目的 基于大鼠模型研究埋葬尸体骨骼微生物的群落演替规律,并以此推断死亡时间(PMI),为埋尸案件的死亡时间推断提供参考。方法 将20只大鼠埋葬于深度20 cm的土壤中,分别于5个时间点(7 d、14 d、30 d、45 d、60 d)采集上肢肱骨及下肢股骨,对细菌16S rRNA基因测序及数据分析,利用机器学习算法构建预测死亡时间的随机森林模型。结果 埋葬大鼠在60 d的分解过程中,上肢肱骨和下肢股骨微生物群落无显著差异,不同时间点微生物群落差异显著。在尸体腐败进程中,骨骼厚壁菌门、拟杆菌门相对丰度总体呈现上升趋势,变形菌门、放线菌门呈现下降趋势。利用随机森林算法筛选出与PMI相关的89个OTU作为标记物并进行预测模型的构建,其R2值可达86.32%,平均绝对误差(MAE)为2.11±1.81 d。结论 本实验基于埋葬大鼠模型所建立的骨骼微生物的死亡时间推断模型具有较好的准确性,可为埋葬案件的死亡时间推断提供参考。
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关键词
法医学
死亡间隔时间
16S
rRNA基因测序
埋葬案件
骨骼微生物
原文传递
题名
基于埋葬大鼠的骨骼微生物群落演替规律推断死亡时间
1
作者
王雅雅
张君
余代静
漆小琴
王萌春
王艳
严江伟
机构
山西医科大学
中国人民解放军总医院医学创新研究部
出处
《中国法医学杂志》
CSCD
2023年第5期541-545,共5页
基金
国家自然科学基金委员会重点项目(82030058)。
文摘
目的 基于大鼠模型研究埋葬尸体骨骼微生物的群落演替规律,并以此推断死亡时间(PMI),为埋尸案件的死亡时间推断提供参考。方法 将20只大鼠埋葬于深度20 cm的土壤中,分别于5个时间点(7 d、14 d、30 d、45 d、60 d)采集上肢肱骨及下肢股骨,对细菌16S rRNA基因测序及数据分析,利用机器学习算法构建预测死亡时间的随机森林模型。结果 埋葬大鼠在60 d的分解过程中,上肢肱骨和下肢股骨微生物群落无显著差异,不同时间点微生物群落差异显著。在尸体腐败进程中,骨骼厚壁菌门、拟杆菌门相对丰度总体呈现上升趋势,变形菌门、放线菌门呈现下降趋势。利用随机森林算法筛选出与PMI相关的89个OTU作为标记物并进行预测模型的构建,其R2值可达86.32%,平均绝对误差(MAE)为2.11±1.81 d。结论 本实验基于埋葬大鼠模型所建立的骨骼微生物的死亡时间推断模型具有较好的准确性,可为埋葬案件的死亡时间推断提供参考。
关键词
法医学
死亡间隔时间
16S
rRNA基因测序
埋葬案件
骨骼微生物
Keywords
Forensic medicine
Postmortem interval(PMI)
16s rRNA gene sequencing
Burial cases
Skeletal microorganisms
分类号
D919.1 [医药卫生—法医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于埋葬大鼠的骨骼微生物群落演替规律推断死亡时间
王雅雅
张君
余代静
漆小琴
王萌春
王艳
严江伟
《中国法医学杂志》
CSCD
2023
0
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