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基于NMR的代谢组学方法对硝酸钕急性生物效应的研究 被引量:6
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作者 廖沛球 张晓宇 +5 位作者 魏来 李伟生 吴亦洁 李晓晶 倪嘉缵 裴奉奎 《分析化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第4期426-432,共7页
采用现代核磁共振和模式识别技术,分析了腹腔注射给药2、10和50mg/kg体重剂量硝酸钕48h内Wistar大鼠尿液和血清的核磁共振氢谱。由尿液及血清中内源性代谢物如柠檬酸、肌酸酐、N-氧三甲胺、氨基酸、乳酸、琥珀酸、牛磺酸及葡萄糖等物种... 采用现代核磁共振和模式识别技术,分析了腹腔注射给药2、10和50mg/kg体重剂量硝酸钕48h内Wistar大鼠尿液和血清的核磁共振氢谱。由尿液及血清中内源性代谢物如柠檬酸、肌酸酐、N-氧三甲胺、氨基酸、乳酸、琥珀酸、牛磺酸及葡萄糖等物种的浓度变化,结合大鼠血清指标和肝、肾组织切片图研究了轻稀土化合物Nd(NO3)3在大鼠体内的急性生物效应。结果表明,3个剂量的Nd(NO3)3主要对大鼠肝脏造成了不同程度的损伤,而且随着剂量的升高渐趋严重。同时,Nd(NO3)3也对肾脏的特定部位(肾乳头、肾小管)造成了损害。 展开更多
关键词 硝酸钕 体液 核磁共振 生物效应 模式识别 代谢
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基于NMR的代谢组学研究中样品的预处理方法 被引量:6
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作者 王小娟 黄荣清 +4 位作者 肖炳坤 杨建云 刘妍如 杨雁 段卫华 《现代仪器》 2010年第2期16-19,共4页
在代谢组学研究中,核肱共振作为分析平台之一,其样品预处理方法简单,且可处理多种样品,如动物和人的各种组织体液等。样品收集和预处理是整个代谢组学研究的基础阶段,本文就核磁共振样品预处理做一小结以供参考。
关键词 代谢 nmr 样品前处理
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基于NMR的代谢组学技术在疾病诊断研究中的应用 被引量:1
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作者 郭玲玲 吴巧凤 +4 位作者 李亮 卢圣锋 袁成凯 彭静 唐勇 《现代诊断与治疗》 CAS 2007年第4期227-231,共5页
代谢组学作为一种比较新颖的组学技术,在医学界也逐渐开始运用,尤其是在疾病诊断中已经取得了一定的成果。本文主要对代谢组学在医学疾病诊断中的研究现状进行综述,以供医学工作者参阅。
关键词 代谢 疾病诊断
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基于NMR的代谢组学在中医证候研究中的应用 被引量:5
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作者 徐彬 李泽庚 +5 位作者 彭波 王浩 鹿林 季乔雪 童佳兵 杨程 《中医药临床杂志》 2012年第7期607-609,共3页
生物体是一个完整的系统,生物分子组织和调控水平是相互关联、相互依赖的,并受环境等因素的影响;代谢组学这一新近研究方法更近于中医学"司外揣内"的思维方式,更准确和全面地反映患者生理状态的整体性和动态性变化。基于核磁... 生物体是一个完整的系统,生物分子组织和调控水平是相互关联、相互依赖的,并受环境等因素的影响;代谢组学这一新近研究方法更近于中医学"司外揣内"的思维方式,更准确和全面地反映患者生理状态的整体性和动态性变化。基于核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR)技术的代谢组学研究,是近几年发展起来的一种新的"组学"技术。它主要是利用生物体液的核磁共振谱图所提供的生物体内全部小分子代谢物的丰富信息,通过对这些信息的多元统计分析和模式识别处理,了解相关生物体在病理生理学方面的状况及动态变化,以及它们所揭示的生物学意义,并从分子水平来认识生命运动的规律。该文综述了基于核磁共振技术的代谢组学在中医证候方面的研究进展。 展开更多
关键词 核磁共振 代谢 证候 中医
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MPFGE:一种有效的抑制水峰的方法及其基于NMR的代谢组学中的应用(英文)
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作者 郭春华 李晶晶 +5 位作者 刘妍如 杨建云 肖炳坤 姜娜 张春生 黄荣清 《科学技术与工程》 北大核心 2014年第28期1-4,共4页
建立适用于代谢组学研究生物体液样品的核磁共振测定实验方法。鉴于代谢组学研究的核磁共振测定中传统方法预饱和压抑水峰的实验结果不甚理想,通过在脉冲序列的适当位置引入新的脉冲元素,对相关脉冲序列进行结构改造,以延迟信号检测时间... 建立适用于代谢组学研究生物体液样品的核磁共振测定实验方法。鉴于代谢组学研究的核磁共振测定中传统方法预饱和压抑水峰的实验结果不甚理想,通过在脉冲序列的适当位置引入新的脉冲元素,对相关脉冲序列进行结构改造,以延迟信号检测时间,消除梯度脉冲涡流电流效应的影响。由结果可知,建立了代谢组学研究的尿样、血样核磁共振检测方法 1D MPFGE 1H NMR、2D MPFGE1H1H COSY和2D MPFGE NOESY等新的脉冲序列实验方法。因此,新的核磁共振方法压制水峰效果好,实验谱图偏共振效应弱、基线平稳,明显优于传统的预饱和实验方法。在黄药子代谢组学研究中取得满意结果,实验方法亦适用于其它的相关代谢组学研究。 展开更多
关键词 核磁共振 多脉冲梯度场回波 水峰 黄药子 代谢
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基于NMR的代谢组学体液样品制谱技术综述
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作者 肖娴 《中国中医药咨讯》 2011年第23期64-64,共1页
核磁共振以其固有的定量性质和丰富的化学信息为代谢组学提供了一种重要的分析平台。典型的1H一维核磁共振实验得到的谱图可以有数以千计的谱峰。核磁共振分析的灵敏性也给代谢组学的分析带来了一定的挑战。本章综述了现今代谢组学中涉... 核磁共振以其固有的定量性质和丰富的化学信息为代谢组学提供了一种重要的分析平台。典型的1H一维核磁共振实验得到的谱图可以有数以千计的谱峰。核磁共振分析的灵敏性也给代谢组学的分析带来了一定的挑战。本章综述了现今代谢组学中涉及体液核磁共振的主要分析技术。 展开更多
关键词 核磁共振(nmr) 代谢 制谱技术
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基于非靶代谢组学探究食管鳞状细胞癌津血亏虚证患者的代谢特征
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作者 张玉双 吴忠冰 +4 位作者 黄鸣 贾蕾 高爽 赵伟鹏 李晶 《中国全科医学》 北大核心 2025年第12期1513-1519,共7页
背景津血亏虚是中晚期食管癌患者的主要临床表现,但目前关于食管鳞状细胞癌津血亏虚证代谢组学特征的研究报道较少见。目的探究食管鳞状细胞癌津血亏虚证患者的代谢组学特征。方法选择2022年4—12月就诊于河北医科大学第四医院中医科、... 背景津血亏虚是中晚期食管癌患者的主要临床表现,但目前关于食管鳞状细胞癌津血亏虚证代谢组学特征的研究报道较少见。目的探究食管鳞状细胞癌津血亏虚证患者的代谢组学特征。方法选择2022年4—12月就诊于河北医科大学第四医院中医科、胸外科的食管鳞状细胞癌津血亏虚证患者35例作为病例组,招募同时期健康志愿者35例作为对照组。收集两组受试者血清标本,通过超高效液相色谱质谱技术分析其代谢组学特征,筛选差异代谢物及差异代谢通路。结果筛选出具有物质二级匹配名称的差异代谢物88种,具有显著性差异的关键代谢通路5条(β-丙氨酸代谢通路,鞘脂代谢通路,亚油酸代谢通路,甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸代谢通路,花生四烯酸代谢通路)及其代谢物11种(表达下调代谢物:β-丙氨酸,磷脂酰胆碱,L-高丝氨酸,L-别苏氨酸;表达升高代谢物:肌肽,亚油酸,9,10-二羟基八氢-1-氧杂-4-氮杂苯并环庚烯,羟基丙酮酸,花生四烯酸,肝素B3,血栓素B2)。结论食管鳞状细胞癌津血亏虚证患者存在具有显著性差异的代谢通路及其代谢物,主要涉及氨基酸、脂肪酸等能量代谢异常。 展开更多
关键词 食管肿瘤 食道鳞癌 代谢 津血亏虚 色谱法 液相
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菟丝子黄酮减轻雷公藤多苷生殖毒性的代谢组学分析
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作者 韩姗姗 魏金辉 +3 位作者 代彦林 徐闪闪 孙利辉 丁樱 《天然产物研究与开发》 北大核心 2025年第1期131-142,共12页
探究菟丝子黄酮干预雷公藤多苷生殖毒性的作用机制。随机将21只4周龄雄性大鼠分为正常组、雷公藤多苷组、菟丝子黄酮组,每组7只,连续灌胃12周。HE染色观察大鼠睾丸、附睾组织病理改变;采用超高效液相色谱-串联四级杆飞行时间质谱联用技... 探究菟丝子黄酮干预雷公藤多苷生殖毒性的作用机制。随机将21只4周龄雄性大鼠分为正常组、雷公藤多苷组、菟丝子黄酮组,每组7只,连续灌胃12周。HE染色观察大鼠睾丸、附睾组织病理改变;采用超高效液相色谱-串联四级杆飞行时间质谱联用技术建立大鼠睾丸组织代谢指纹图谱,通过主成分分析、正交偏最小二乘判别分析筛选菟丝子黄酮干预生殖损伤模型大鼠的睾丸组织潜在生物标志物,并应用Metabo Analyst平台进行代谢通路分析。结果表明与雷公藤多苷组相比,菟丝子黄酮组各级精原细胞显著增加,生精小管排列更为规则。通过代谢组学技术共获得1-亚麻酰甘油磷酸胆碱、溶血磷脂、磷脂酰乙醇胺等47个差异代谢物,主要涉及苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成及代谢、鞘脂代谢、甘油磷脂代谢途径。本研究为菟丝子黄酮减轻雷公藤多苷所致生殖损伤提供科学依据。 展开更多
关键词 菟丝子黄酮 雷公藤多苷 代谢 生殖毒性
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慢性肌筋膜触发点模型大鼠的尿液代谢组学分析
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作者 刘琳 刘世轩 +1 位作者 陆馨悦 王侃 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第8期1585-1592,共8页
背景:慢性肌筋膜触发点通过非靶向代谢组学技术可识别差异性代谢物变化,有助于从内源性小分子代谢物层面理解并进一步探究慢性肌筋膜触发点的病理生理过程和发病机制。目的:以慢性肌筋膜触发点模型大鼠为研究对象,基于尿液代谢组学寻找... 背景:慢性肌筋膜触发点通过非靶向代谢组学技术可识别差异性代谢物变化,有助于从内源性小分子代谢物层面理解并进一步探究慢性肌筋膜触发点的病理生理过程和发病机制。目的:以慢性肌筋膜触发点模型大鼠为研究对象,基于尿液代谢组学寻找潜在生物标志物及相关代谢通路。方法:将16只SD大鼠随机分为造模组和正常组,造模组大鼠采用钝性打击结合离心运动(跑台坡度为-16°,跑速为16 m/min,训练时间为90 min/次)方式建立慢性肌筋膜触发点动物模型,每周1次,连续干预8周,休息4周;正常组大鼠不做干预。12周造模结束后,采用代谢笼法收集大鼠造模后24 h尿液,利用液相色谱-质谱联用非靶向代谢组学技术对尿样进行代谢图谱检测,筛选出共同差异代谢物,并进行生物信息学分析。结果与结论:①与正常组相比,造模组有32个差异代谢标志物,其中上调21个、下调11个;依据变量权重值>3,共14个差异代谢物被认定为潜在生物标志物;②京都基因与基因组百科全书富集分析表明,慢性肌筋膜触发点的形成与初级胆汁酸生物合成、花生四烯酸代谢通路密切相关。 展开更多
关键词 肌筋膜触发点 大鼠 尿液 代谢 生物信息 生物标志物 差异代谢 代谢笼法 运动损伤
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基于代谢组学和蛋白组学研究砷暴露对肥胖孕鼠肝脏代谢分子网络的影响 被引量:1
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作者 蔡丽静 王妍 +4 位作者 谭峻峰 周海霞 梁诗佳 吴衍 张洁 《色谱》 CAS 北大核心 2025年第1期50-59,共10页
砷是普遍存在的环境毒物,可能影响生物体的正常生理过程。尽管已有研究探讨了砷对健康的影响,但砷暴露对肥胖孕妇肝脏代谢的影响及其作用机制尚不明确。本研究旨在通过高脂饮食诱导肥胖孕鼠模型,并采用灌胃方式模拟孕期砷暴露,以探究其... 砷是普遍存在的环境毒物,可能影响生物体的正常生理过程。尽管已有研究探讨了砷对健康的影响,但砷暴露对肥胖孕妇肝脏代谢的影响及其作用机制尚不明确。本研究旨在通过高脂饮食诱导肥胖孕鼠模型,并采用灌胃方式模拟孕期砷暴露,以探究其对肝脏代谢的影响。孕鼠砷暴露后,我们利用代谢组学和蛋白组学技术,结合病理生化分析,对肝脏组织进行了深入研究。结果显示,砷暴露显著增加了肥胖孕鼠肝脏中的脂质累积,并伴随着炎症因子和氧化应激标志物的升高。代谢组学分析揭示了砷暴露对脂质代谢通路,特别是花生四烯酸代谢的显著影响。此外,蛋白组学分析确认了与脂质合成、氧化应激和炎症反应相关的蛋白质表达水平发生了变化。这些结果表明,砷暴露可能通过多种代谢途径和蛋白质调节通路,对肥胖孕鼠肝脏的脂质代谢产生显著影响。本研究不仅为理解砷暴露与肥胖及相关代谢性疾病之间的关系提供了新的科学视角,也为环境健康风险评估和公共卫生政策的制定提供了重要参考。 展开更多
关键词 肥胖 孕鼠 肝脏 代谢 蛋白
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基于代谢组学的崇觉罗汉茶主要化学成分分析
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作者 钱园凤 杨高中 +5 位作者 徐伟林 徐国栋 邓慧芳 兰炳英 林智 吕海鹏 《食品科学》 EI CAS 北大核心 2025年第3期138-145,共8页
为阐明崇觉罗汉茶风味品质的化学物质基础,采用感官审评和基于超高效液相色谱-四极杆高分辨质谱的代谢组学方法等对4款代表性茶样(滋福、安康、平安、聚福)进行分析。结果表明,崇觉罗汉茶具有较高的茶多酚质量分数(13.7%~18.1%),高于对... 为阐明崇觉罗汉茶风味品质的化学物质基础,采用感官审评和基于超高效液相色谱-四极杆高分辨质谱的代谢组学方法等对4款代表性茶样(滋福、安康、平安、聚福)进行分析。结果表明,崇觉罗汉茶具有较高的茶多酚质量分数(13.7%~18.1%),高于对照茶样(9.6%);此外,从茶样中共鉴定出206种次级代谢物,包括类黄酮71种、氨基酸及其衍生物类31种、有机酸类24种、核苷酸及其衍生物类19种、酚酸类16种、生物碱类12种、糖类及其衍生物7种等。结合多元统计分析进一步筛选出46个差异代谢物,滋福款茶产品和安康款茶产品中儿茶素类、原花青素及黄酮糖苷等苦涩味成分的含量较高,而平安款茶产品和聚福款茶产品中富含L-天冬酰胺和L-茶氨酸等鲜甜味成分。研究结果揭示了崇觉罗汉茶独特品质的重要化学物质基础,可为这类茶叶新产品的工艺研发提供参考依据。 展开更多
关键词 崇觉罗汉茶 品质化 代谢 差异代谢
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饲粮中添加刺梨渣对鲤鱼肠道组织形态、抗氧化能力、免疫力及代谢组学的影响
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作者 冯轶 杨芸芸 +6 位作者 罗永荣 吴鹏 王艳 杨颖 陈江凤 姜海波 文明 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第1期80-93,共14页
[目的]探究饲粮中添加刺梨渣(Rosa roxburghii Tratt. residue)对鲤鱼肠道组织形态、抗氧化能力、免疫力及代谢组学的影响,以期为刺梨渣饲料在贵州山区农村稻田养鱼中的推广应用提供科学依据。[方法]选取180尾健康无病、初始体重为25 g&... [目的]探究饲粮中添加刺梨渣(Rosa roxburghii Tratt. residue)对鲤鱼肠道组织形态、抗氧化能力、免疫力及代谢组学的影响,以期为刺梨渣饲料在贵州山区农村稻田养鱼中的推广应用提供科学依据。[方法]选取180尾健康无病、初始体重为25 g±1 g的鲤鱼,随机分为正常组(基础饲料中不添加刺梨渣)和刺梨渣饲喂组(基础饲料中添加0.4%刺梨渣),每组设3个重复,每个重复30尾,试验期60 d。试验结束后,采集鲤鱼中段肠道,通过显微镜观察、ELISA检测和基于液相色谱的代谢组学技术分析鲤鱼肠道组织形态、抗氧化能力、免疫力及代谢组学。[结果]与正常组相比,饲喂刺梨渣对鲤鱼肠道的正常结构无不良影响,且肠道绒毛长度和肌层厚度均极显著增加(P<0.01);刺梨渣饲喂组鲤鱼肠道中谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性显著升高(P<0.05),肿瘤坏死因子-α(TNF-α)含量显著降低(P<0.05);刺梨渣饲喂组共显著富集到2-酮丁酸、L-(+)-乳酸、丙酸、琥珀酸、D-天冬氨酸、D-谷氨酰胺、黄嘌呤核苷、次黄嘌呤、胸腺嘧啶、尿嘧啶和D-焦谷氨酸等85种差异代谢物,这些代谢物主要富集到丙酸盐代谢,丙氨酸、天门冬氨酸和谷氨酸代谢,嘌呤代谢,嘧啶代谢等代谢通路。[结论]饲粮中添加刺梨渣可提高鲤鱼肠道组织抗氧化性能和免疫指标,可通过影响嘌呤和嘧啶代谢以及相关代谢物D-谷氨酰胺、黄嘌呤核苷、次黄嘌呤、胸腺嘧啶、2′-脱氧尿苷-5′-单磷酸盐和尿嘧啶等来改善鲤鱼肠道健康,进而提高机体免疫力。 展开更多
关键词 刺梨渣 鲤鱼 肠道织形态 抗氧化能力 免疫力 代谢
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基于非靶向代谢组学分析不同品种新疆大果沙棘代谢物的差异
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作者 韩蓉 马燕 +4 位作者 李圣杰 孟新涛 许铭强 张婷 潘俨 《食品工业科技》 北大核心 2025年第4期19-29,共11页
为探究不同品种新疆大果沙棘代谢产物的差异性,采用超高效液相色谱-质谱联用技术(UPLC-QTOFMS)结合多元统计分析法和通路富集分析对6种新疆大果沙棘样品(‘混果’、‘巨人’、‘深秋红’、‘无刺丰’、‘向阳’和‘状元黄’)进行非靶向... 为探究不同品种新疆大果沙棘代谢产物的差异性,采用超高效液相色谱-质谱联用技术(UPLC-QTOFMS)结合多元统计分析法和通路富集分析对6种新疆大果沙棘样品(‘混果’、‘巨人’、‘深秋红’、‘无刺丰’、‘向阳’和‘状元黄’)进行非靶向代谢组学研究。结果表明,代谢组学分析共得到334种代谢产物。依据log_(2)FC绝对值≥1和错误发现率(FDR)<0.05分析,‘混果’与‘巨人’共筛选出112种差异代谢物;‘混果’与‘深秋红’间筛选出118种差异代谢物;‘混果’和‘无刺丰’共筛选出67种差异代谢物;‘混果’和‘向阳’共筛选出160种差异代谢物;‘混果’和‘状元黄’共筛选出126种差异代谢物。代谢通路富集分析表明,不同大果沙棘的差异代谢物主要富集在不饱和脂肪酸生物合成、脂肪酸生物合成、色氨酸代谢、黄酮和黄酮醇生物合成等通路上。基于VIP值>1、log_(2)FC绝对值≥1和FDR<0.05筛选标准,发现共有差异代谢物5种,且大果沙棘中脂质和类脂质分子、苯丙烷及聚酮类化合物的总体丰度较高,占比分别在38%~81%和15%~49%之间,其中芥酸酰胺、亚油酸、棕榈酸、水仙苷、异鼠李素-3-O-葡萄糖苷、芦丁等可能是鉴别不同新疆大果沙棘的关键代谢物。非靶向代谢组学可从整体水平上阐明不同品种新疆大果沙棘的代谢差异,为新疆大果沙棘品种选育和加工利用提供了科学依据。 展开更多
关键词 新疆大果沙棘 非靶向代谢 差异代谢 超高效液相色谱-质谱联用技术
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基于肠道菌群和广泛靶向代谢组学的山柰酚抗骨质疏松的作用机制
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作者 梁周 张驰 +7 位作者 潘成镇 杨博 蒲张林 刘桦 彭金辉 文立春 凌观汉 陈锋 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第20期4190-4204,共15页
背景:山柰酚具有抗骨质疏松的作用,但山柰酚通过调控肠道菌群、代谢物防治骨质疏松的作用机制尚不明确。目的:基于肠道菌群和广泛靶向代谢组学探究山柰酚抗骨质疏松的可能作用机制。方法:将雌性Sprague-Dawley大鼠18只随机分为假手术组... 背景:山柰酚具有抗骨质疏松的作用,但山柰酚通过调控肠道菌群、代谢物防治骨质疏松的作用机制尚不明确。目的:基于肠道菌群和广泛靶向代谢组学探究山柰酚抗骨质疏松的可能作用机制。方法:将雌性Sprague-Dawley大鼠18只随机分为假手术组、模型组和山柰酚组,每组6只,后2组切除双侧卵巢制备骨质疏松大鼠模型。造模后8周,假手术组和模型组采用蒸馏水灌胃,山柰酚组采用40 mg/kg山柰酚灌胃,各组均连续给药12周。取大鼠粪便进行16SrDNA扩增子测序,观察肠道菌群结构的变化;采用超高效液相色谱-串联质谱技术、自主开发的数据库和多元统计分析的方法进行血清样本广泛靶向代谢组学检测。结果与结论:①连续干预12周后,16SrDNA扩增子测序结果显示,与假手术组相比,模型组肠道菌群丰度增加;与模型组相比,山柰酚组上调Latilactobacillus菌属(P=0.021)丰度,下调泛菌属(Pantoea)(P=0.034)、肠杆菌属(Enterorhabdus)(P=0.000)、Monoglobus菌属(P=0.024)、丁酸单胞菌属(Butyricimonas)(P=0.034)、Rothi属(P=0.043)、梭杆菌属(Clostridia)(P=0.004)等菌属丰度。②连续干预12周后,血清样本广泛靶向代谢组学检测结果显示,假手术组与模型组、模型组与山柰酚组之间分别鉴定出120和79种代谢物,3组间共有17种交集差异代谢物,包括乌头酸、巴比妥酸、L-高瓜氨酸、3,4,5-三甲氧基肉桂酸、L-3-苯基乳酸、环(脯氨酸-脯氨酸)、L-苯丙氨酸-L-丝氨酸、脯氨酸-异亮氨酸、L-冬胺基乙酸-L-苯丙胺基乙酸、苯丙氨酸-天冬氨酸等。大部分属于氨基酸及其代谢物、甘油磷脂类和脂肪酰类。差异代谢物涉及的KEGG通路主要富集在D-氨基酸代谢、组氨酸代谢、丙酸代谢、赖氨酸降解、脂肪酸代谢、鞘脂代谢等。③连续干预12周后,联合分析发现,肠杆菌属(Enterorhabdus)、Latilactobacillus属、Rothia属和瘤胃球菌属(Ruminococcus)等与血清差异代谢物密切相关。④山柰酚可能通过调节肠道菌群的丰度、多样性及结构,调控氨基酸及其代谢物的代谢、脂肪酸代谢等发挥抗骨质疏松的作用。 展开更多
关键词 山柰酚 骨质疏松 肠道菌群 16SrDNA扩增子测序 广泛靶向代谢 超高效液相色谱-串联质谱 作用机制 大鼠
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基于非靶向代谢组学分析甲基化对副干酪乳酪杆菌发酵剂贮藏特性的影响
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作者 游明坤 张文羿 《食品科学》 EI CAS 北大核心 2025年第1期49-55,共7页
副干酪乳酪杆菌(Lacticaseibacillus paracasei)Zhang是一株具有调节免疫反应、抗氧化等益生特性的优良菌株。DNA甲基化是一种重要的表观遗传机制,在细菌的很多生理过程中发挥关键作用。为更好利用该菌株,本研究重点关注甲基化对L.parac... 副干酪乳酪杆菌(Lacticaseibacillus paracasei)Zhang是一株具有调节免疫反应、抗氧化等益生特性的优良菌株。DNA甲基化是一种重要的表观遗传机制,在细菌的很多生理过程中发挥关键作用。为更好利用该菌株,本研究重点关注甲基化对L.paracasei Zhang发酵剂贮藏特性的影响。利用L.paracasei Zhang及其DNA甲基化突变株ΔpglX制备发酵剂并在30℃条件下贮藏90 d。结果表明:与野生型相比,甲基化突变株在贮藏90 d后活菌数极显著提高(P<0.01);利用非靶向代谢组学方法分析贮藏90 d后野生型及其甲基化突变体的代谢物差异发现,与野生型相比,突变体的差异代谢物质有269种,在负离子模式下主要富集到核苷酸代谢、嘌呤代谢、嘧啶代谢、柠檬酸循环、乙醛酸盐和二羧酸盐代谢等多条代谢通路,在正离子模式下主要富集到生物素代谢等多条代谢通路。研究结果证实DNA甲基化可以通过生成和利用碳水化合物类、脂肪酸类物质等提高L.paracasei Zhang的贮藏特性。 展开更多
关键词 副干酪乳酪杆菌 DNA甲基化 贮藏特性 发酵剂 pglX 非靶向代谢
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基于液相色谱-质谱代谢组学技术的硒化黑木耳代谢产物及通路分析
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作者 岳诗博 崔航 +1 位作者 沈琴 曹冬梅 《食品科学》 EI CAS 北大核心 2025年第3期162-168,共7页
本研究通过在黑木耳菌包中添加外源硒,结合液相色谱-质谱联用代谢组学技术,运用主成分分析、偏最小二乘判别分析、层次聚类分析等多元统计学分析,探究硒化对黑木耳代谢通路及代谢物的动态变化影响。结果表明,从黑木耳(HME)、亚硒酸钠无... 本研究通过在黑木耳菌包中添加外源硒,结合液相色谱-质谱联用代谢组学技术,运用主成分分析、偏最小二乘判别分析、层次聚类分析等多元统计学分析,探究硒化对黑木耳代谢通路及代谢物的动态变化影响。结果表明,从黑木耳(HME)、亚硒酸钠无机硒化黑木耳(HMEa)和富硒玉米秸秆有机硒化黑木耳(HMEb)组共定性出669个代谢物,通过对差异代谢物进行筛选,无机硒化组(HME vs HMEa)共得到228个差异代谢物;有机硒化组(HME vs HMEb)共得到267个差异代谢物,硒化对黑木耳中有机酸及其衍生物、脂类及类脂质分子含量影响较大,且有机硒化富硒效果更显著。综合两组的京都基因与基因组百科全书代谢通路分析,发现硒化对脂类代谢、氨基酸类代谢影响显著。综上所述,黑木耳受到硒化后,脂类代谢、氨基酸代谢以及其他次生代谢产物的生物合成过程发生显著变化,对黑木耳中脂类和氨基酸等代谢产物产生显著影响,说明硒化会对黑木耳的营养成分和风味品质产生一定影响。 展开更多
关键词 硒化 黑木耳 液相色谱-质谱法 非靶向代谢
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代谢组学在肝细胞癌诊疗中的研究进展
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作者 马晓萱 王荣琦 《中国全科医学》 北大核心 2025年第8期1017-1022,共6页
肝细胞癌(HCC)是较常见的恶性肿瘤之一,具有高发病率、高死亡率的特点,因此早发现、早诊断、早治疗非常重要。灵敏、便捷的血清学生物标志物可在HCC诊疗中起关键性作用,而甲胎蛋白(AFP)等传统生物标志物已远不能满足临床需求。肝脏是机... 肝细胞癌(HCC)是较常见的恶性肿瘤之一,具有高发病率、高死亡率的特点,因此早发现、早诊断、早治疗非常重要。灵敏、便捷的血清学生物标志物可在HCC诊疗中起关键性作用,而甲胎蛋白(AFP)等传统生物标志物已远不能满足临床需求。肝脏是机体重要的代谢器官,HCC的发生和发展与代谢密不可分。代谢组学是新近发展起来的一门学科,在HCC的筛查诊断、机制探索、精准治疗、预后判断、疗效评估中具有一定优势。作为系统生物学的重要组成部分,代谢组学技术可在HCC患者的组织、血液和尿液中筛查出差异表达的代谢产物。这些代谢产物不仅能作为生物标志物用于HCC的早期诊断和预后评估,还可阐明HCC发生和进展过程中的代谢机制,用于研发治疗HCC的新药物及新靶点。本文将对代谢组学在HCC诊疗中的研究进展进行综述,以期为HCC生物学诊断标志物及潜在治疗靶点的筛选提供理论依据。 展开更多
关键词 肝细胞癌 代谢 生物标志物 诊断 治疗
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比较代谢组学解析3种中国东北苹果代谢物特征
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作者 田永涛 刘焰 +3 位作者 滕宇 王歆然 洪利亚 王文蜀 《食品科学》 北大核心 2025年第5期194-207,共14页
本研究以红富士苹果为对照,基于超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱技术的非靶向代谢组学结合多元统计分析方法解析3种东北产苹果(塞外红、K9、龙丰)果皮、果肉的代谢物组成及差异,以探究3种东北产苹果果实代谢组轮廓及特征性成分。结... 本研究以红富士苹果为对照,基于超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱技术的非靶向代谢组学结合多元统计分析方法解析3种东北产苹果(塞外红、K9、龙丰)果皮、果肉的代谢物组成及差异,以探究3种东北产苹果果实代谢组轮廓及特征性成分。结果表明,4种苹果果皮、果肉中共检测到239种代谢物,分属酚类(种类数量占比为48.95%,后同)、糖类(15.06%)、萜类(13.81%)、维生素及脂肪酸(11.72%)、氨基酸类(7.11%)和核苷酸类(3.35%)。3种东北产苹果与红富士苹果果皮或果肉相同部位的代谢物数量、种类及代谢通路途径相近,表明4种苹果具有类似品质特征。4种苹果的代谢物相对含量具有差异,主成分分析和层次聚类分析结果显示果皮、果肉各为一类,果皮或果肉相同部位在各组间明显分离,表明4种苹果果皮、果肉代谢物组成存在差异。塞外红vs红富士苹果果皮、果肉的特征差异代谢物分别为19、10个,K9 vs红富士苹果果皮、果肉的特征差异代谢物分别为22、16个,龙丰vs红富士特征差异代谢物分别为31、20个,龙丰与红富士苹果的果皮、果肉代谢物差异相较更大;塞外红vs K9的果皮、果肉间特征差异代谢物均为22个,塞外红vs龙丰果皮、果肉间特征差异代谢物均为21个,K9 vs龙丰的果皮、果肉间特征差异代谢物分别为31、15个。酚类是4种苹果果皮、果肉特征差异代谢物的主要组分,其中表儿茶素及其低聚体等黄烷醇在塞外红苹果中丰度最高,槲皮素糖苷等黄酮醇在K9苹果中丰度最高,绿原酸、新绿原酸等酚酸在龙丰苹果中丰度最高,可能分别是其特征代谢物和品种差异关键代谢物。研究结果揭示了3种东北产苹果代谢组特征,可为其现代精准开发及我国苹果种质资源培育改良提供科学参考。 展开更多
关键词 塞外红苹果 K9苹果 龙丰苹果 比较代谢 超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱
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非靶向代谢组学分析影响轻中度脑卒中后认知功能障碍的生物标记物
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作者 王之枫 杨娇 +8 位作者 郗域江 徐双凤 施婷 蓝浚峯 郝志慧 和鹏芬 杨爱明 潘攀 王健 《中国组织工程研究》 北大核心 2025年第24期5116-5126,共11页
背景:认知功能障碍是脑卒中后的常见并发症,其严重程度与患者的预后密切相关。如果能尽早识别患者的认知功能障碍严重程度并进行针对性治疗,那么患者的预后可以得到显著改善。目的:初步探索影响脑卒中后认知功能障碍疾病进展的潜在生物... 背景:认知功能障碍是脑卒中后的常见并发症,其严重程度与患者的预后密切相关。如果能尽早识别患者的认知功能障碍严重程度并进行针对性治疗,那么患者的预后可以得到显著改善。目的:初步探索影响脑卒中后认知功能障碍疾病进展的潜在生物标志物,为其病理生理机制研究提供更为丰富和独特的参考依据。方法:采用高效液相色谱-质谱联用技术,对轻度与中度脑卒中后认知功能障碍患者的血清样本进行非靶向代谢组学分析,筛选出两组间差异代谢物,为了进一步验证差异代谢物的诊断效能,运用受试者工作特征曲线分析,评估它们在区分疾病严重程度方面的准确性和敏感性,此外还进行了差异代谢物通路分析。结果与结论:(1)轻度与中度脑卒中后认知功能障碍患者代谢谱存在显著差异,通过受试者工作特征曲线筛选出9个差异代谢物;(2)差异代谢物通路分析发现,影响轻、中度脑卒中后认知功能障碍患者疾病进展的代谢途径包括色氨酸代谢、D-氨基酸代谢、生物素代谢、视黄醇代谢、氨酰-tRNA生物合成、赖氨酸降解、蛋白质的消化和吸收、嘧啶代谢、半胱氨酸和甲硫氨酸代谢、ABC转运蛋白、氨基酸的生物合成、2-氧代羧酸代谢。结果筛选出影响轻、中度脑卒中后认知功能障碍患者疾病进展的潜在生物标志物9个,涉及色氨酸代谢、D-氨基酸代谢和视黄醇代谢等12条代谢途径。 展开更多
关键词 脑卒中后认知功能障碍 非靶向代谢 超高效液相色谱-质谱联用技术 生物标志物 差异代谢 曲线下面积 变量投影重要度
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蛹虫草提取物改善糖尿病肾病的药效及代谢组学
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作者 金鑫 孙雪琳 +5 位作者 刘虹拴 马庆云 李志浩 李申莹 黄盛 张琪 《生物加工过程》 2025年第1期77-85,共9页
基于气相色谱联用质谱(GC-MS)的代谢组学和药效学,评估蛹虫草提取物中虫草素与虫草寡糖联合用药对小鼠糖尿病肾病的改善作用及其作用机制。采用链脲佐菌素(STZ)联合高脂饮食建立2型糖尿病小鼠模型,将小鼠随机分为空白组、模型组、虫草... 基于气相色谱联用质谱(GC-MS)的代谢组学和药效学,评估蛹虫草提取物中虫草素与虫草寡糖联合用药对小鼠糖尿病肾病的改善作用及其作用机制。采用链脲佐菌素(STZ)联合高脂饮食建立2型糖尿病小鼠模型,将小鼠随机分为空白组、模型组、虫草素组、虫草寡糖组和联用组。给药8周,其间每两周测定各组小鼠血糖浓度。8周后,测定肾脏指数;苏木精-伊红(HE)染色评估小鼠肾组织形态。同时通过气相色谱联用质谱(GC-MS)进行血清代谢组学研究。结果表明:成功建立了小鼠糖尿病肾病的模型;虫草寡糖组和联用组均有降血糖作用;虫草素组、虫草寡糖组和联用组均能显著降低肾脏指数,同时显著改善肾组织形态。代谢组学结果表明:空白组和模型组能够很好地分离,虫草素组、虫草寡糖组和联用组更趋近于空白组。与空白组比较,模型组血清内L-酪氨酸、L-丙氨酸和焦磷酸盐等代谢物差异显著[变量投影重要性(VIP)>1,P<0.05]。本研究表明:蛹虫草提取物中虫草素与虫草寡糖的联合用药对糖尿病肾病具有降血糖作用,能显著降低肾脏指数,还可以改善肾组织形态,这为蛹虫草提取物的临床应用提供了一定的理论基础,并为改善糖尿病肾病的治疗提供了新的思路。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 蛹虫草提取物 代谢 虫草素
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